Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc11g064920.2.1
CDS Infomation

Dihydropyrimidinase (AHRD V3.3 *** DPYS_ARATH)
Sequence

ATGGAGTTTTTCTTCAGAGTTCAACTTTTGATTCCTTTGATTTCAGTGCTTCTTGCCCTT
TTCCCTCTTTCTGAATCCAATAATATCCAGTTTTGTGATGCCACAAATATTTATGGAGAT
TCTGGGTGCGATTTTATGTCGTCAGTTTCATCAAAGATACTTATAAAAGGAGGAACTGTA
GTGAATGCTCATCATAAGGAGGTCGCTGATGTGTATATAGAGGATGGAACAATTGTGGCA
GTGCAGCCTAACATCAAGGTTAGTGACGATATCAAAGTCATTGATGCAACTGGAAAGTTT
GTCATGCCAGGAGGAATTGATCCTCATACACACCTTGCTATGGAATTTATGGGATCGGAG
ACAATTGATGACTTCTTCAGTGGACAGGCAGCCGCATTAGCTGGTGGAACAACAATGCAT
ATTGACTTTGTTATTCCGGTAGATGGAAGCTTATCTGCAGGTTATGAAGCTTATGTAGAG
AAAGCTAAGAGGTCATGCATGGATTATGGTTTTCACATGGCAATTACAAAATGGAATGAA
ACTGTATCTGAGGAGATGGAAATTATGGTCAAGGAGAAAGGTATCAACTCTTTCAAATTT
TTCCTTGCCTACAAAGGTTCCTTCATGGTTAATGATGAGCTTCTAATGGAGGGATTGAAG
AAGTGCAAGTCCCTTGGTGCCTTAGCTATGGTTCATGCAGAAAATGGGGATGCTGTATTT
GAAGGTCAAAAAAGAATGATCGAACTTGGTATTACTGGTCCAGAGGGACATGCATTATCA
AGGCCTCCAGTGCTGGAGGGAGAGGCTACTGCTCGAGCTATTCGTTTGGCCAGCTTTGTG
AACACTCCATTGTATGTTGTTCATGTCATGAGTATTGACGCGATGGAAGAAATTGCCAGA
GCTCGGAAGTCAGGTCAAAGAATTGTTGGGGAGCCAGTCGTTTCAGGTTTACTTCTTAAT
GATTCAGTACTTTGGGATCCTGACTTCCATTTTGCAGCAAGGTACGTCATGAGCCCACCA
ATCAGAGCAGCAGGTCATGGAACAGCTCTTCAAGCAGCTCTTGCTGCAGGGGTTCTGCAG
CTGGTAGGAACTGATCACTGCACCTTCAACTCAACTCAGAAAGCGCTAGGAATTGGTGAT
TTCCGGAAAATACCAAATGGTGTTAATGGTATGGAGGAGAGAATGCATTTGGTTTGGAAT
ACAATGGTGGCTTCTGGTCAGATATCTGTCACTGATTATGTTCGCATAACAAGCACAGAA
TGTGCTCGGATTTTCAATATCTATCCAAGGAAGGGAGCAATACTTGTTGGGTCTGATGCA
GATATAATCATTTTAAATCCCAATTCAAGCTTCAAGATTAGTTCAAAGTCACACCATTAT
AGGACAGATACCAATGTCTATGAGGGTTGGACAGGCATGGGAAAGGTTGAAACTACAATT
GCAGGAGGAAGGGTTGTTTGGGAAAATGATGAGCTGAAAGTCATCCCTGGTGCTGGCAAG
TACATTGAAATGCCACCTTTCAGTTATCTTTTTGACGGGATAGACAAGGCAGATGCAAAG
TACCTCTCTTCCTTAAGAGCACCCGTAGAACGATCAACGACTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc11g064920.2.1
PEP Infomation

Dihydropyrimidinase (AHRD V3.3 *** DPYS_ARATH)
Sequence

MEFFFRVQLLIPLISVLLALFPLSESNNIQFCDATNIYGDSGCDFMSSVSSKILIKGGTV
VNAHHKEVADVYIEDGTIVAVQPNIKVSDDIKVIDATGKFVMPGGIDPHTHLAMEFMGSE
TIDDFFSGQAAALAGGTTMHIDFVIPVDGSLSAGYEAYVEKAKRSCMDYGFHMAITKWNE
TVSEEMEIMVKEKGINSFKFFLAYKGSFMVNDELLMEGLKKCKSLGALAMVHAENGDAVF
EGQKRMIELGITGPEGHALSRPPVLEGEATARAIRLASFVNTPLYVVHVMSIDAMEEIAR
ARKSGQRIVGEPVVSGLLLNDSVLWDPDFHFAARYVMSPPIRAAGHGTALQAALAAGVLQ
LVGTDHCTFNSTQKALGIGDFRKIPNGVNGMEERMHLVWNTMVASGQISVTDYVRITSTE
CARIFNIYPRKGAILVGSDADIIILNPNSSFKISSKSHHYRTDTNVYEGWTGMGKVETTI
AGGRVVWENDELKVIPGAGKYIEMPPFSYLFDGIDKADAKYLSSLRAPVERSTT*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc11g064920.2.1
Transcript Infomation

Dihydropyrimidinase (AHRD V3.3 *** DPYS_ARATH)
Sequence

GCCCATATGTCTCTTATTTCTTAATTATTAATTAATTAAAATGTTTTCTGAACTTAAAAA
GTCAAAACTGATTGCAATGGAATCTTTATCCAATTTTGATCACAACTAATAGAGATTTAC
TCAACAATTTGATTCAATGGAGTTTTTCTTCAGAGTTCAACTTTTGATTCCTTTGATTTC
AGTGCTTCTTGCCCTTTTCCCTCTTTCTGAATCCAATAATATCCAGTTTTGTGATGCCAC
AAATATTTATGGAGATTCTGGGTGCGATTTTATGTCGTCAGTTTCATCAAAGATACTTAT
AAAAGGAGGAACTGTAGTGAATGCTCATCATAAGGAGGTCGCTGATGTGTATATAGAGGA
TGGAACAATTGTGGCAGTGCAGCCTAACATCAAGGTTAGTGACGATATCAAAGTCATTGA
TGCAACTGGAAAGTTTGTCATGCCAGGAGGAATTGATCCTCATACACACCTTGCTATGGA
ATTTATGGGATCGGAGACAATTGATGACTTCTTCAGTGGACAGGCAGCCGCATTAGCTGG
TGGAACAACAATGCATATTGACTTTGTTATTCCGGTAGATGGAAGCTTATCTGCAGGTTA
TGAAGCTTATGTAGAGAAAGCTAAGAGGTCATGCATGGATTATGGTTTTCACATGGCAAT
TACAAAATGGAATGAAACTGTATCTGAGGAGATGGAAATTATGGTCAAGGAGAAAGGTAT
CAACTCTTTCAAATTTTTCCTTGCCTACAAAGGTTCCTTCATGGTTAATGATGAGCTTCT
AATGGAGGGATTGAAGAAGTGCAAGTCCCTTGGTGCCTTAGCTATGGTTCATGCAGAAAA
TGGGGATGCTGTATTTGAAGGTCAAAAAAGAATGATCGAACTTGGTATTACTGGTCCAGA
GGGACATGCATTATCAAGGCCTCCAGTGCTGGAGGGAGAGGCTACTGCTCGAGCTATTCG
TTTGGCCAGCTTTGTGAACACTCCATTGTATGTTGTTCATGTCATGAGTATTGACGCGAT
GGAAGAAATTGCCAGAGCTCGGAAGTCAGGTCAAAGAATTGTTGGGGAGCCAGTCGTTTC
AGGTTTACTTCTTAATGATTCAGTACTTTGGGATCCTGACTTCCATTTTGCAGCAAGGTA
CGTCATGAGCCCACCAATCAGAGCAGCAGGTCATGGAACAGCTCTTCAAGCAGCTCTTGC
TGCAGGGGTTCTGCAGCTGGTAGGAACTGATCACTGCACCTTCAACTCAACTCAGAAAGC
GCTAGGAATTGGTGATTTCCGGAAAATACCAAATGGTGTTAATGGTATGGAGGAGAGAAT
GCATTTGGTTTGGAATACAATGGTGGCTTCTGGTCAGATATCTGTCACTGATTATGTTCG
CATAACAAGCACAGAATGTGCTCGGATTTTCAATATCTATCCAAGGAAGGGAGCAATACT
TGTTGGGTCTGATGCAGATATAATCATTTTAAATCCCAATTCAAGCTTCAAGATTAGTTC
AAAGTCACACCATTATAGGACAGATACCAATGTCTATGAGGGTTGGACAGGCATGGGAAA
GGTTGAAACTACAATTGCAGGAGGAAGGGTTGTTTGGGAAAATGATGAGCTGAAAGTCAT
CCCTGGTGCTGGCAAGTACATTGAAATGCCACCTTTCAGTTATCTTTTTGACGGGATAGA
CAAGGCAGATGCAAAGTACCTCTCTTCCTTAAGAGCACCCGTAGAACGATCAACGACTTG
ATTTGGCAAATTCACTTTTTCATTATGAGGAAGAGGAATAGAAAGTCTCTCTCTATTTAC
TTGTAAATACAGAATATCCTTAAGGACATTCAAACTCTTGCAGTTGCTGAAAAACCCTTG
GTCACATAATGCTATTTATAAAACTTATGTTTATTCCGTAAAGGATGTTATACATTGGTG
TATAGCTGGATTACTGAATGGAGTTTGAGCATTTACCTCATAGTGAAGAATAAAAGTAGA
TCCCAGGAAACACACAGCTTTTGATTATAACGTTGCTA