Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc11g064890.2.1
CDS Infomation

hypoxia-induced protein L31
Sequence

ATGGGCTGTGAGTCTTCTAAACTCGCCTCGTGTTGCTGGAGTGGACAGAATGGTCCTGTT
CATGAGGCTCAGAATCCTGGTGATGAAGAAAGAGCTGAAGTTAGTGATTTGCCTACATTC
CGCGAGTTTACTGTTGAGCAGCTGAGAATATCTACTTCTGGATTTGCTGTAGAGAATATA
GTTTCAGAACATGGTGAAAAAGCTCCTAATGTTGTTTATAAAGGAAAGTTAGAGAACCAG
AGGAGAGTTGCTGTCAAACGCTTTAATAGATCTGCATGGCCTGATTCCCGACAGTTCTTA
GAAGAAGCCAGATCAGTTGGTCAACTCCGCAACAATAGGTTAGCAAATCTTCTTGGTTGT
TGTTGCGAAGGTGATGAGAGGTTGCTTGTGGCAGAATTTATGCCCAATGAGACACTTGCA
AAGCATCTCTTTCACTGGGAGACACAACCCATGAAATGGGCAATGCGGTTAAGGGTGGCT
TTGTATCTTGCACAGGCTCTCGAGTATTGTACAATCAGAGGGAGGGCACTTTATCATGAT
CTTAATGCATATAGAATATTATTTGATGAAGAAGGCGACCCCCGTCTCTCTTGCTTTGGT
TTGATGAAAAATAGTCGAGATGGAAAAAGTTACAGCACAAACTTGGCATTTACTCCTCCT
GAATATTTGAGGACAGGGAGAATCACCCCGGAGAGTGTCATGTATAGCTTCGGAACACTC
TTGCTTGACCTTCTCAGTGGAAAACATATTCCTCCAAGTCATGCCCTTGATCTGATTAAA
GACCGGAATCTTCAGATGCTTACGGATTCTTGCTTGGAAGGTCAATTTTCTTCTGATGAT
GGGACTGAATTGGTAAGGATAGCTTCAAGATGTCTGCAGTACGAGCCACGTGAGCGTCCA
AATCCAAAGTCACTGGTTGCTGCTTTATTTCCTCTTCAGAAAGAGACCGAGGTTCCTTCT
CATGCTTTGATGGGTATCTCACGTGATGGTGGAACTATGCCTCTGTCTCCACTTGGTGAA
GCCTGCTTGAGAATGGATCTAACAGCCATCCATGAGATTTTAGAACAGCTTGGGTACAAA
GACGATGAAGGAGCAGCTACTGAGCTTTCATTCCAGATGTGGACAAATCAGATGCAGGAA
ACGTTGAACTCCAAGAAAAAGGGTGATTCTGCTTTCAGGCACAAAGATGCTAAGGCCGCC
ATCGAATGCTATACACTGTTTATCGATGTTGGAACTATGGTCTCCCCAACTGTGTATGCA
CGGCGTAGTCTGTCTTATCTCATGAATGATATGCCACTGGAAGCCCTCAATGATGCAGTA
CAGGCACAAGTAATATCTCCTGTATGGCATGTTGCTTCGTATTTACAAGCTGCTTCTCTC
TTTGCACTTGGAAGGGAAAATGAGGCACAAATTGCACTCAAGGAAGGTTCTGTTCTTGAA
GAAAAGAAGAACACAAATTCCTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc11g064890.2.1
PEP Infomation

hypoxia-induced protein L31
Sequence

MGCESSKLASCCWSGQNGPVHEAQNPGDEERAEVSDLPTFREFTVEQLRISTSGFAVENI
VSEHGEKAPNVVYKGKLENQRRVAVKRFNRSAWPDSRQFLEEARSVGQLRNNRLANLLGC
CCEGDERLLVAEFMPNETLAKHLFHWETQPMKWAMRLRVALYLAQALEYCTIRGRALYHD
LNAYRILFDEEGDPRLSCFGLMKNSRDGKSYSTNLAFTPPEYLRTGRITPESVMYSFGTL
LLDLLSGKHIPPSHALDLIKDRNLQMLTDSCLEGQFSSDDGTELVRIASRCLQYEPRERP
NPKSLVAALFPLQKETEVPSHALMGISRDGGTMPLSPLGEACLRMDLTAIHEILEQLGYK
DDEGAATELSFQMWTNQMQETLNSKKKGDSAFRHKDAKAAIECYTLFIDVGTMVSPTVYA
RRSLSYLMNDMPLEALNDAVQAQVISPVWHVASYLQAASLFALGRENEAQIALKEGSVLE
EKKNTNS*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc11g064890.2.1
Transcript Infomation

hypoxia-induced protein L31
Sequence

TTCTTTTTCTCTATTCACATCTCTCTCTCTCTCTATCCTCTTTACTATATATATATATAT
GCTCTTCTTCACCTGACTCCATTTTCACTTTTCTTGATCTCTCTCTCAAGAGATTTATCT
GCTGCACTTTTTTGAATCAATCAATCTTAAAGAAAGATCTTCTAAGCTGAAGAACATGTG
GTGGTTGTGATACAAACAAACAAGTTGCAGTTATATCTCTAAAGTAGGGCGGGTAGTAGA
ATGGGCTGTGAGTCTTCTAAACTCGCCTCGTGTTGCTGGAGTGGACAGAATGGTCCTGTT
CATGAGGCTCAGAATCCTGGTGATGAAGAAAGAGCTGAAGTTAGTGATTTGCCTACATTC
CGCGAGTTTACTGTTGAGCAGCTGAGAATATCTACTTCTGGATTTGCTGTAGAGAATATA
GTTTCAGAACATGGTGAAAAAGCTCCTAATGTTGTTTATAAAGGAAAGTTAGAGAACCAG
AGGAGAGTTGCTGTCAAACGCTTTAATAGATCTGCATGGCCTGATTCCCGACAGTTCTTA
GAAGAAGCCAGATCAGTTGGTCAACTCCGCAACAATAGGTTAGCAAATCTTCTTGGTTGT
TGTTGCGAAGGTGATGAGAGGTTGCTTGTGGCAGAATTTATGCCCAATGAGACACTTGCA
AAGCATCTCTTTCACTGGGAGACACAACCCATGAAATGGGCAATGCGGTTAAGGGTGGCT
TTGTATCTTGCACAGGCTCTCGAGTATTGTACAATCAGAGGGAGGGCACTTTATCATGAT
CTTAATGCATATAGAATATTATTTGATGAAGAAGGCGACCCCCGTCTCTCTTGCTTTGGT
TTGATGAAAAATAGTCGAGATGGAAAAAGTTACAGCACAAACTTGGCATTTACTCCTCCT
GAATATTTGAGGACAGGGAGAATCACCCCGGAGAGTGTCATGTATAGCTTCGGAACACTC
TTGCTTGACCTTCTCAGTGGAAAACATATTCCTCCAAGTCATGCCCTTGATCTGATTAAA
GACCGGAATCTTCAGATGCTTACGGATTCTTGCTTGGAAGGTCAATTTTCTTCTGATGAT
GGGACTGAATTGGTAAGGATAGCTTCAAGATGTCTGCAGTACGAGCCACGTGAGCGTCCA
AATCCAAAGTCACTGGTTGCTGCTTTATTTCCTCTTCAGAAAGAGACCGAGGTTCCTTCT
CATGCTTTGATGGGTATCTCACGTGATGGTGGAACTATGCCTCTGTCTCCACTTGGTGAA
GCCTGCTTGAGAATGGATCTAACAGCCATCCATGAGATTTTAGAACAGCTTGGGTACAAA
GACGATGAAGGAGCAGCTACTGAGCTTTCATTCCAGATGTGGACAAATCAGATGCAGGAA
ACGTTGAACTCCAAGAAAAAGGGTGATTCTGCTTTCAGGCACAAAGATGCTAAGGCCGCC
ATCGAATGCTATACACTGTTTATCGATGTTGGAACTATGGTCTCCCCAACTGTGTATGCA
CGGCGTAGTCTGTCTTATCTCATGAATGATATGCCACTGGAAGCCCTCAATGATGCAGTA
CAGGCACAAGTAATATCTCCTGTATGGCATGTTGCTTCGTATTTACAAGCTGCTTCTCTC
TTTGCACTTGGAAGGGAAAATGAGGCACAAATTGCACTCAAGGAAGGTTCTGTTCTTGAA
GAAAAGAAGAACACAAATTCCTGAAAGTGGCAAGTTAAGCCACTCTGATCGTTATTTAAT
TGCTCCGTTGCTAATGGTGTTTGGACATGGATCACAAAAAGTTCACCGGTGAGAGGCTAT
TCAATCTATTGCCTCGTGCATGCGATCATTAAGTAGGTTTGGTTTTACTTCAGAGCATTC
TTTTGCTACATATAATTGGATGGGGTTGGTTTTGGTCACAGCTTTTGTGGACAGGTTATC
TAAGCGCTCCGGTTGAAATGGATTGACATTTTCCAATAAACAAACTATTCTCTGTGGGAA
TAATCAAATGCCGTTGGTTCCATAAGGATCCAACATCTGTGGGGGGAAAAAGGAAAGCTG
GAGAAACTTCCTGTGCTGTAATTTATGTACAGTGCTATTTAGCTGCTCAAATTGTTTCGT
CTCTCTCTCTCTCTCTCTCCGTCTTGTTAACTTCTTGAAATCGTCCTTCTCGTGTCTTTC
TCTCTTGTAGTTGGGGGTTAATGTCCTTTCTTTGTGGTGGTAATTTTACTTTTGCAGTGC
TTATGTTAAGTAAGTAAAACTTGTAACTGGTCTAACTTTCTGAATGTTGTTTGTAAGGTT
TGAATCTTTATGTCAACAGTTAATCAGTTTGAATGCTTTTGTGGATAATTATTTGTACAG
CTGGTAGCTCCAAGTCATATATTGTTGAAATTTAAGTTCTTGTCTTCTTAATTTTCTTAT
ATTGCCTCATATAGGTTGAGGGATCAAGTGTTCTCCCCTTATATATGTTTTTTGGGGTAA
TTCTCACCGCAACGTTGAATATCGTGCTGAGTTAGGTTTGAGATTTAATTTTAACTGTAA
GGTCGATTTTCTTATCATAGTATAAGAGTTGGGGGTGTGTTTGGTAAGGAGGCGAATATT
TGATGACTTATTATTGCTTTGCTGGTCAATATCTTTTGAAAACATTTTTTCTAGAAAAAT
TAGTTTTTTCTTATAAAGAAATTGGTTTGTACTTATAAATTTTAAGTATCTATTAACAAA
AAGATTTATATTAATTGTATACACAAATTATGAACTCTTTTTAGACTCTTTAGCAGAATC
CCAATAGAGTACTCATGAGTTTTAAATTCTCATATCTTTTACAAAAAAATTGATTTTAGG
AAAAATGATAGTAACAATATACATTAAACATTCATGAAATTTTAAAACATCATGAATGTT
TTTTACAAAATTAATCTTTGATCTTTCTCAAGTATCAAACTTTGGAAAAAATATTTTTTT
AATCTTGATTTTTTTTGTTAAAAAATATTCACTATGAAAATTTATACGACAAATGACTCC
CTTCTTTTTTTTATATTTGCTGTTGTTTCTGGACTTCCTTTTCTCATCATAGCTGCAAAT
TCATCATAATTAATTCGACCATCCTGCACAATAAGAATTAAATCATTAGAATATAAAAAA
ATTCATAATTAAATAATTTATACGGTTATTATATGTGTATAATAATTATGATAAATATTA
ATTGATAATATGATTAAAAAAAATGGGAGTGTTTCAAATTTTACATTATTTGAGTCAACT
TCAGCAACAATATCTTGTATGTCCTTTCCATCATCAATACCAAATTCTCTTAAAGCTTGC
TCTAACTCTTCTATTGTGATGTACCTGAAAATATTTAAAAAATTAAAATCTAGAAGAGGG
TAAAAATAATAATAATTTAAGATTTGAATACTT