Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc11g045330.2.1

CDS Infomation

GPI-anchored protein (AHRD V3.3 *** AT2G30700.1)

Sequence

ATGACTTGTGTAAAGATTGTCAGTCGTCTCAAGGGTTCTTTTTGCCACCTGCTGCTAGTA
ATTGCTCTCTGGTTGTGTAGCTATCAGAATGTAGTGGCTCTTCCTCTGTTACCTAAACCA
GGGCATATTTCTTCCACATCTGAACTACCTAGCTCACCTAATAGTGCAAATTTTCAGCCA
ATTGAAATATCACCAACTATGATCCCTCATTATCCTTTTCATGGAGAACCAATGCCACCA
ATGTACCCTTCCTTCCCAAAGACATATGACCCTGTCTTGACTGGAAGATGCCCTGTAAAT
TTTTCAGTCATTTCAAGCATCACAACGAAAACAGCATCTGATTGTACTCAATCTTTGTCA
ACAGTTGTAGGGAACGTAATATGCTGCCCACAGTTTAATAGCTTACTCCACATATTCCAG
GGATTTTACAGCAACAATTCCGATACTTTAGTTTTACAAAATGCGGTGGCTGATGATTGT
TTTAAAGATATCATCAGTATACTAGCCAGCAGAGGAGCAAACAGCTCATTATCTAGCATG
TGTTCTGTAAAGTCTTCTAATCTGACTGGTGGGTCTTGCCCCGTGAAGGACATCAGTACT
TTTGAGAAAGCTGTAAATACAAGCAAACTGTTAGATTCTTGCAGCACAGTTGATCCGCTG
AAAGAGTGCTGCAGACCTTTTTGCCAGCCTGCAATTTCAGAGGCTGCACTTCAGATATCA
GGGATAAAAATGACTCTCAGTGATAACAAAAACATAGTTGAAGCACCTAGTGAAATTGAT
ACCCTTAATGATTGTAAGGGAGTGGTCTATTCATGGATTGCTAGGAAACTAAGGTTTGAG
GATGCCAATAATGCATTTCGGTTGTTGTCTTCCTGCAAAGTCAACAAAGCTTGTCCCCTG
GACTTCAAGCAGCCATCAGAAGTGATCAATGCATGCAGAAATTTAGCTGCTCCCAGTCCT
TCATGTTGTAGCTCGTTAAATGGCTACATCACGGGGATACAGAAGCAAATGTTGATCACT
AATAGGCAAGCAATTATATGTGCTGCTGTATTTGGTTATATGTTACAGAAGGCTGGAGTC
ATGACAAATGTTTATGAGCTTTGTGATGTTGACCTGAAGGATTTTAGTCTTCAAGCGTAT
GGGCAAGAAGGTTGCTTGCTTCGAAGCTTACCTGCAGATCTGGTATATGACAATTCAACC
GGGTTCAGTTTTACTTGCGACTTAAATGACAATATTGCTGCTCCGTGGCCTTCATCATCG
TCCGTCACATCCTTGTCTCTTTGTGCTCCTGAGATGTCTTTGCCAGCTTTACCAACATCA
CAAACATTGAGTAGTTCTGGCTGTCACCTGGATGGAGTTCATGTCCTTTTGTCCACTATT
TTGATTTTTGTTTCAACATTGTTGTACTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc11g045330.2.1

PEP Infomation

GPI-anchored protein (AHRD V3.3 *** AT2G30700.1)

Sequence

MTCVKIVSRLKGSFCHLLLVIALWLCSYQNVVALPLLPKPGHISSTSELPSSPNSANFQP
IEISPTMIPHYPFHGEPMPPMYPSFPKTYDPVLTGRCPVNFSVISSITTKTASDCTQSLS
TVVGNVICCPQFNSLLHIFQGFYSNNSDTLVLQNAVADDCFKDIISILASRGANSSLSSM
CSVKSSNLTGGSCPVKDISTFEKAVNTSKLLDSCSTVDPLKECCRPFCQPAISEAALQIS
GIKMTLSDNKNIVEAPSEIDTLNDCKGVVYSWIARKLRFEDANNAFRLLSSCKVNKACPL
DFKQPSEVINACRNLAAPSPSCCSSLNGYITGIQKQMLITNRQAIICAAVFGYMLQKAGV
MTNVYELCDVDLKDFSLQAYGQEGCLLRSLPADLVYDNSTGFSFTCDLNDNIAAPWPSSS
SVTSLSLCAPEMSLPALPTSQTLSSSGCHLDGVHVLLSTILIFVSTLLY*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc11g045330.2.1

Transcript Infomation

GPI-anchored protein (AHRD V3.3 *** AT2G30700.1)

Sequence

AAATGCACGAAAACTTCAACTTCAACTTAATTAATGGATTCTTACACTATACAACGGGCA
AAAGAGGAACGTAACATAAACACCCCTTTCCCCCTTACCTACCCAGACACCCTCAAGCCG
CAGCGGCCCACTTTATCCATCATTGAGTTCGACACCTTTTTCCCCTTCTCTCTGATCATT
GGAGGACGATTTTTGACATTTTCTCAGACATATAGTATACCCACTTCACAAGCCTGCTCA
ATATAGTGAAATCAAGAACCCCATTTTGTGGGTTGATTTTAACTTAGAAAATGATCTTTG
CTTGTTGATTTTCTTGAACTTTTGCCATTCTTAAATGACAAGTGATCAAAAAACTTTCTG
TTCTTTACTGGGTTTTCACTTCAGGTATTGGCACGTCTTAGTACTTATGTGATCAGCTCA
ATTGCTGTACCATCAGTGTTCCTGTTGCAAGTCCCCATGTTGCCGGAGGGTTAGTGGAGT
CATGACTTGTGTAAAGATTGTCAGTCGTCTCAAGGGTTCTTTTTGCCACCTGCTGCTAGT
AATTGCTCTCTGGTTGTGTAGCTATCAGAATGTAGTGGCTCTTCCTCTGTTACCTAAACC
AGGGCATATTTCTTCCACATCTGAACTACCTAGCTCACCTAATAGTGCAAATTTTCAGCC
AATTGAAATATCACCAACTATGATCCCTCATTATCCTTTTCATGGAGAACCAATGCCACC
AATGTACCCTTCCTTCCCAAAGACATATGACCCTGTCTTGACTGGAAGATGCCCTGTAAA
TTTTTCAGTCATTTCAAGCATCACAACGAAAACAGCATCTGATTGTACTCAATCTTTGTC
AACAGTTGTAGGGAACGTAATATGCTGCCCACAGTTTAATAGCTTACTCCACATATTCCA
GGGATTTTACAGCAACAATTCCGATACTTTAGTTTTACAAAATGCGGTGGCTGATGATTG
TTTTAAAGATATCATCAGTATACTAGCCAGCAGAGGAGCAAACAGCTCATTATCTAGCAT
GTGTTCTGTAAAGTCTTCTAATCTGACTGGTGGGTCTTGCCCCGTGAAGGACATCAGTAC
TTTTGAGAAAGCTGTAAATACAAGCAAACTGTTAGATTCTTGCAGCACAGTTGATCCGCT
GAAAGAGTGCTGCAGACCTTTTTGCCAGCCTGCAATTTCAGAGGCTGCACTTCAGATATC
AGGGATAAAAATGACTCTCAGTGATAACAAAAACATAGTTGAAGCACCTAGTGAAATTGA
TACCCTTAATGATTGTAAGGGAGTGGTCTATTCATGGATTGCTAGGAAACTAAGGTTTGA
GGATGCCAATAATGCATTTCGGTTGTTGTCTTCCTGCAAAGTCAACAAAGCTTGTCCCCT
GGACTTCAAGCAGCCATCAGAAGTGATCAATGCATGCAGAAATTTAGCTGCTCCCAGTCC
TTCATGTTGTAGCTCGTTAAATGGCTACATCACGGGGATACAGAAGCAAATGTTGATCAC
TAATAGGCAAGCAATTATATGTGCTGCTGTATTTGGTTATATGTTACAGAAGGCTGGAGT
CATGACAAATGTTTATGAGCTTTGTGATGTTGACCTGAAGGATTTTAGTCTTCAAGCGTA
TGGGCAAGAAGGTTGCTTGCTTCGAAGCTTACCTGCAGATCTGGTATATGACAATTCAAC
CGGGTTCAGTTTTACTTGCGACTTAAATGACAATATTGCTGCTCCGTGGCCTTCATCATC
GTCCGTCACATCCTTGTCTCTTTGTGCTCCTGAGATGTCTTTGCCAGCTTTACCAACATC
ACAAACATTGAGTAGTTCTGGCTGTCACCTGGATGGAGTTCATGTCCTTTTGTCCACTAT
TTTGATTTTTGTTTCAACATTGTTGTACTGAATAGAGTCCATAGGAAGACAGACACTAAA
TGACCAGATCACATGTATATGTTTTGAGCTTCCTTATGTATAGCTGCTGGTTTTTGCTTA
CCGATTCATGCTTTTTGACTACAATTGCCTAAAAATTGCATGCACCGTGCAATTTATTCT
TCTG