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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc11g040330.2.1

CDS Infomation

Endo-1,4-beta-xylanase A (AHRD V3.3 *** W9QKK9_9ROSA)

Sequence

ATGAAGAGAATGAGGAGTCATGCCATGTTTTCCCTCTCTTTCTTATATTGGATGCTCTCT
GTTTCTCCTTATGATGGGCCACTCTATGATTCTTCAGCTTTCTCTGAGTGCAAACAATAT
CCAGAAAAGCCACTATATGCTGGCGGAATTCTAAAGGATAATTTGCCGGAGTTTACGAGG
GCTGATGGAATAACAACAGTCAATTTGCCTATTTTCAAACTACAAGATATCACCCCTGGC
ACCATTTATTCTTTTTCCACTTGGATTAAGATAAAAAATGCAGATTCTGCTGTCATAACA
GCAAGCGTGGGTGACCAAGATTCAGATGAATTATGTGTAGGCACTGTAGATGCTAAGCCT
GGATGTTGGTCTTTCCTCAAGGGTGGATTTGTAGCTTCGTCACTTAATATATCTTCCATA
TACTTAAAGAATTCGGATGAACAAGACTTAGAAATTGAGATTGCTAGTGCTTCATTGCAG
CCTTTCACTGAGCAGCAATGGCTGCTGAATCAACAAACAAAAATTAATATGGCAAGGAAG
CGGGCTGTTACTATCCACGTCTCAAATAAACAAGGAGTTAGACTTGAAAATGCATCTCTA
ACGGTAGAACAAGTTTCCAAAGATTTTCTCCTTGGATCTGCTATTGCGTATACCTTTATT
GGCAATATCCCCTATCAGAACTGGTTTCTCGAGCGATTCAATGCTGCAGTTTTTGAAGAC
GAAATCAAATGGTATACGACAGAGCCTAAACAGGGACAACTTAACTATACTTTAGCAGAT
GAGTTGCTAGAATTTGTTAGGAGAAACCAGATCACAGTTAGAGGTCACAATATTTTCTGG
GAGGACCCTAAATATATACCGGCCTGGGTTCAAAATCTTACAGATTCTGAGCTGAAATCA
GCTGTAAACTCCAGGATTCAGAGTCTTATGTCCAAATACAAAGATGAATTCGTTCACTGG
GACGTTAACAATGAACTACTTCACTTCAATTTCTACGAGCAAAGGCTGGGACCGGATGCC
ACACATGAATTTTACAGGACGGTACACCAACAAGACCCTTTGGCAACTTTGTTCCTCAAT
GAATTCAATGTGGTGGAAACTTGTGATTCTTCATCCACGGTTGATAAATATATCGCAAAG
ATTAGGGAGCTTAAAGAAGATCGCATGTCAATGAATGGAATTGGCCTTGAGGGTCATTTT
GGAGCTCCTAATCCCCCTCGTATAAGAGCTACTCTTGACAAATTAGCAACATTGGGGCTT
CCCATTTGGCTCACAGAAGTCGATATCAGTGATACATTTAGCAAGGAAACACAGGCCATT
TACTTGGAACAGGTATTACGGGAGGGCTTCTCACATCCAGCAGTGGATGGGATAATGTTG
TGGAGTGCCATTAGGCGAAACAAATGTTACAGAATGTGCCTTACAGATCCAGACTTAAAT
AACCTACCAACCGGTAATGTAGTGGACAAGCTGCTCAAGGAATGGGACACTGGAGTTCTC
AAGGGCCAAACAGATGAACATGGCTCTTACAGCTTCTATGGTTTCCTTGGTGAATACAAA
CTTACTGCTAGTTATGACGGTAAAGTTGTCGATGCAGCATTCTCCCTTAGCCCCAGTCAT
GAGACTAAACATTTTAGCGTTCAACTATGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc11g040330.2.1

PEP Infomation

Endo-1,4-beta-xylanase A (AHRD V3.3 *** W9QKK9_9ROSA)

Sequence

MKRMRSHAMFSLSFLYWMLSVSPYDGPLYDSSAFSECKQYPEKPLYAGGILKDNLPEFTR
ADGITTVNLPIFKLQDITPGTIYSFSTWIKIKNADSAVITASVGDQDSDELCVGTVDAKP
GCWSFLKGGFVASSLNISSIYLKNSDEQDLEIEIASASLQPFTEQQWLLNQQTKINMARK
RAVTIHVSNKQGVRLENASLTVEQVSKDFLLGSAIAYTFIGNIPYQNWFLERFNAAVFED
EIKWYTTEPKQGQLNYTLADELLEFVRRNQITVRGHNIFWEDPKYIPAWVQNLTDSELKS
AVNSRIQSLMSKYKDEFVHWDVNNELLHFNFYEQRLGPDATHEFYRTVHQQDPLATLFLN
EFNVVETCDSSSTVDKYIAKIRELKEDRMSMNGIGLEGHFGAPNPPRIRATLDKLATLGL
PIWLTEVDISDTFSKETQAIYLEQVLREGFSHPAVDGIMLWSAIRRNKCYRMCLTDPDLN
NLPTGNVVDKLLKEWDTGVLKGQTDEHGSYSFYGFLGEYKLTASYDGKVVDAAFSLSPSH
ETKHFSVQL*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc11g040330.2.1

Transcript Infomation

Endo-1,4-beta-xylanase A (AHRD V3.3 *** W9QKK9_9ROSA)

Sequence

GATCGAATGAGTATTCGTACTGTTCCTCTTGTGACTTTGCTTCCTAGTTGGTATTACATT
TATTAATAAGTACCCCCTTTTTTTTGTGTGTGTGTATATATATATATGTTGTCAAGTAGT
TTTTTCTAAAATTATTTTATGTAAAGAAGATATGAAGAGAATGAGGAGTCATGCCATGTT
TTCCCTCTCTTTCTTATATTGGATGCTCTCTGTTTCTCCTTATGATGGGCCACTCTATGA
TTCTTCAGCTTTCTCTGAGTGCAAACAATATCCAGAAAAGCCACTATATGCTGGCGGAAT
TCTAAAGGATAATTTGCCGGAGTTTACGAGGGCTGATGGAATAACAACAGTCAATTTGCC
TATTTTCAAACTACAAGATATCACCCCTGGCACCATTTATTCTTTTTCCACTTGGATTAA
GATAAAAAATGCAGATTCTGCTGTCATAACAGCAAGCGTGGGTGACCAAGATTCAGATGA
ATTATGTGTAGGCACTGTAGATGCTAAGCCTGGATGTTGGTCTTTCCTCAAGGGTGGATT
TGTAGCTTCGTCACTTAATATATCTTCCATATACTTAAAGAATTCGGATGAACAAGACTT
AGAAATTGAGATTGCTAGTGCTTCATTGCAGCCTTTCACTGAGCAGCAATGGCTGCTGAA
TCAACAAACAAAAATTAATATGGCAAGGAAGCGGGCTGTTACTATCCACGTCTCAAATAA
ACAAGGAGTTAGACTTGAAAATGCATCTCTAACGGTAGAACAAGTTTCCAAAGATTTTCT
CCTTGGATCTGCTATTGCGTATACCTTTATTGGCAATATCCCCTATCAGAACTGGTTTCT
CGAGCGATTCAATGCTGCAGTTTTTGAAGACGAAATCAAATGGTATACGACAGAGCCTAA
ACAGGGACAACTTAACTATACTTTAGCAGATGAGTTGCTAGAATTTGTTAGGAGAAACCA
GATCACAGTTAGAGGTCACAATATTTTCTGGGAGGACCCTAAATATATACCGGCCTGGGT
TCAAAATCTTACAGATTCTGAGCTGAAATCAGCTGTAAACTCCAGGATTCAGAGTCTTAT
GTCCAAATACAAAGATGAATTCGTTCACTGGGACGTTAACAATGAACTACTTCACTTCAA
TTTCTACGAGCAAAGGCTGGGACCGGATGCCACACATGAATTTTACAGGACGGTACACCA
ACAAGACCCTTTGGCAACTTTGTTCCTCAATGAATTCAATGTGGTGGAAACTTGTGATTC
TTCATCCACGGTTGATAAATATATCGCAAAGATTAGGGAGCTTAAAGAAGATCGCATGTC
AATGAATGGAATTGGCCTTGAGGGTCATTTTGGAGCTCCTAATCCCCCTCGTATAAGAGC
TACTCTTGACAAATTAGCAACATTGGGGCTTCCCATTTGGCTCACAGAAGTCGATATCAG
TGATACATTTAGCAAGGAAACACAGGCCATTTACTTGGAACAGGTATTACGGGAGGGCTT
CTCACATCCAGCAGTGGATGGGATAATGTTGTGGAGTGCCATTAGGCGAAACAAATGTTA
CAGAATGTGCCTTACAGATCCAGACTTAAATAACCTACCAACCGGTAATGTAGTGGACAA
GCTGCTCAAGGAATGGGACACTGGAGTTCTCAAGGGCCAAACAGATGAACATGGCTCTTA
CAGCTTCTATGGTTTCCTTGGTGAATACAAACTTACTGCTAGTTATGACGGTAAAGTTGT
CGATGCAGCATTCTCCCTTAGCCCCAGTCATGAGACTAAACATTTTAGCGTTCAACTATG
ACTCAGTGACTCCATCAGATGTACGTATTTTCTTTTTTCTTGTCTCAAATTCAGAGAAGA
AAGAACATAAAAAATGTATCAGACAACAAGCCTAACTAAGAAAATCTTGTTATCATCAAG
TAATTACTATCATGCATCAGCTTTGCCCTTTTAGCTGGATAA