Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc11g040150.2.1
CDS Infomation	Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase (AHRD V3.3 *** A0A0B0P2Z2_GOSAR)
Sequence	ATGGGATCTTATCAACTAATTAGAGAGAAGAAAGATGCAAGATTAAGATGGGATCCACAA CAATTACAACTAGGGGATATTATAGTTGAAGGAGAAGGGAAGAATTTATCTCCTAGGATT GAGGTTATTACTAGTGATGCAACAAGTAATTTAGAGAAATCACCCATATCTCCTTTGTCT ACATTGCCTAAATCCATTGGTGATCATGGTGGACCTCATTCTCATAGGTCTAAGACTGGA GGAGGGAGTGGTCGTCTTCTTTCTCTTGACATTTTTCGCGGTATCACTGTTGCGTTAATG ATATTTGTGGAATACGCTGGTGGAATTTATCCTGCTATCAATCATTCACCATGGGATGGT ATAACCCTGGCAGATTTTGTCATGCCATTTTTCCTCTTCATTGTTGGAGTGTCGCTTGCA CTTGGGTACAAGAACATACCCTGCAGACTGACTGCAACTGGAAAAGCAATTCACCGCGCG CTTAAGCTACTCATCCTTGGACTCTTTCTTCAAGGAGGCTATTTTCATGGTATCAAAAAT CTAACTTATGGAGTGGACGTTGAGAGAATCAGATGGATGGGTATATTGCAGAGAATTGCA ATATCATTTTTGTTGGCAGCAATGTGTGAAATCTGGCTCAAGGGTGATAATAAAGTCAAT TCAGGACAATCTTTGTTGAAGAGATACCATCAACAATGGGCCATGGCTATAATGGTTACT GCTTTATACCTTTCTTTGTTCTACGGTTTATATGTTTCTGACTGGGAATATCAGATGCCA ATGGACATATCTTCTTCAGAAGCAAAGATATTCACAGTGAAATGTGGTTTACGGGGAGAC AGTGGACCAGCATGTAATGCTGTTGGAATGATTGATCGAAAAATATTGGGTATTCAACAC TTATATGCAAGAGCCATTTATGGACGATCAAAAGAATGTAGTGTCAACTCCCCTAACTAC GGTCCCCTTCCGGTAGATGCTCCATCATGGTGTCAAGCTCCTTTCGACCCAGAAGGACTT TTGAGCTCATTGATGGCTATTGTTACTTGCTTCATTGGTTTACATTACGGACACATCATT GTTCATTTCAAGGATCATAAAGTTAGAATTCAGCAATGGTTGGTACCATCCTCTTGTCTC GTGCTATTGGGTGTAACATGTGACTGCCTGGGGATGCACGCAAACAAGGTTTTGTACTCC TTCAGTTATATGTGTATTACTGCTGGCTCTGCTGGCTTTCTCTTCACTGCAGTCTATATG ATGGTTGATGTGTGGGGCTATAGACACTGGACCACAATACTGAAATGGATGGGAACAAAC GCGTTGCTGATTTACATTCTTGTATCGTGCAACATCCTGCCTGTTCTTTTGCAGGGATTC TACTGGAGGCGGCCTGAAAACAACATTCTCACGGTGATTGGTGTCGGACCTAAGAAGTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc11g040150.2.1
PEP Infomation	Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase (AHRD V3.3 *** A0A0B0P2Z2_GOSAR)
Sequence	MGSYQLIREKKDARLRWDPQQLQLGDIIVEGEGKNLSPRIEVITSDATSNLEKSPISPLS TLPKSIGDHGGPHSHRSKTGGGSGRLLSLDIFRGITVALMIFVEYAGGIYPAINHSPWDG ITLADFVMPFFLFIVGVSLALGYKNIPCRLTATGKAIHRALKLLILGLFLQGGYFHGIKN LTYGVDVERIRWMGILQRIAISFLLAAMCEIWLKGDNKVNSGQSLLKRYHQQWAMAIMVT ALYLSLFYGLYVSDWEYQMPMDISSSEAKIFTVKCGLRGDSGPACNAVGMIDRKILGIQH LYARAIYGRSKECSVNSPNYGPLPVDAPSWCQAPFDPEGLLSSLMAIVTCFIGLHYGHII VHFKDHKVRIQQWLVPSSCLVLLGVTCDCLGMHANKVLYSFSYMCITAGSAGFLFTAVYM MVDVWGYRHWTTILKWMGTNALLIYILVSCNILPVLLQGFYWRRPENNILTVIGVGPKK*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc11g040150.2.1
Transcript Infomation	Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase (AHRD V3.3 *** A0A0B0P2Z2_GOSAR)
Sequence	ACACATAAAAAACAATTAAAACATTTGTGTACCCTCTACCATTTTTTTTAGTTTTGTGTA AAACAGAGGGGTTTTTTTTGGTACATTATTGTCCCCTCTGGTGCTGGTTCTTGCAAAAAT TTTTGTTGGTGGGGTGAGTTTTTCTTGTTTTCAGATACCCATTATGTTATTGGATAGAAA TTAAAGACTAATAAAAATTTGATGTTTTTTTTTTTTTGCAGTGAAGATTTTGTTGGTGCA ATGGTGTAAATCAAAATTAGTAGAGAGAAAAAAATGGGATCTTATCAACTAATTAGAGAG AAGAAAGATGCAAGATTAAGATGGGATCCACAACAATTACAACTAGGGGATATTATAGTT GAAGGAGAAGGGAAGAATTTATCTCCTAGGATTGAGGTTATTACTAGTGATGCAACAAGT AATTTAGAGAAATCACCCATATCTCCTTTGTCTACATTGCCTAAATCCATTGGTGATCAT GGTGGACCTCATTCTCATAGGTCTAAGACTGGAGGAGGGAGTGGTCGTCTTCTTTCTCTT GACATTTTTCGCGGTATCACTGTTGCGTTAATGATATTTGTGGAATACGCTGGTGGAATT TATCCTGCTATCAATCATTCACCATGGGATGGTATAACCCTGGCAGATTTTGTCATGCCA TTTTTCCTCTTCATTGTTGGAGTGTCGCTTGCACTTGGGTACAAGAACATACCCTGCAGA CTGACTGCAACTGGAAAAGCAATTCACCGCGCGCTTAAGCTACTCATCCTTGGACTCTTT CTTCAAGGAGGCTATTTTCATGGTATCAAAAATCTAACTTATGGAGTGGACGTTGAGAGA ATCAGATGGATGGGTATATTGCAGAGAATTGCAATATCATTTTTGTTGGCAGCAATGTGT GAAATCTGGCTCAAGGGTGATAATAAAGTCAATTCAGGACAATCTTTGTTGAAGAGATAC CATCAACAATGGGCCATGGCTATAATGGTTACTGCTTTATACCTTTCTTTGTTCTACGGT TTATATGTTTCTGACTGGGAATATCAGATGCCAATGGACATATCTTCTTCAGAAGCAAAG ATATTCACAGTGAAATGTGGTTTACGGGGAGACAGTGGACCAGCATGTAATGCTGTTGGA ATGATTGATCGAAAAATATTGGGTATTCAACACTTATATGCAAGAGCCATTTATGGACGA TCAAAAGAATGTAGTGTCAACTCCCCTAACTACGGTCCCCTTCCGGTAGATGCTCCATCA TGGTGTCAAGCTCCTTTCGACCCAGAAGGACTTTTGAGCTCATTGATGGCTATTGTTACT TGCTTCATTGGTTTACATTACGGACACATCATTGTTCATTTCAAGGATCATAAAGTTAGA ATTCAGCAATGGTTGGTACCATCCTCTTGTCTCGTGCTATTGGGTGTAACATGTGACTGC CTGGGGATGCACGCAAACAAGGTTTTGTACTCCTTCAGTTATATGTGTATTACTGCTGGC TCTGCTGGCTTTCTCTTCACTGCAGTCTATATGATGGTTGATGTGTGGGGCTATAGACAC TGGACCACAATACTGAAATGGATGGGAACAAACGCGTTGCTGATTTACATTCTTGTATCG TGCAACATCCTGCCTGTTCTTTTGCAGGGATTCTACTGGAGGCGGCCTGAAAACAACATT CTCACGGTGATTGGTGTCGGACCTAAGAAGTAACTGAGAGCAATAACCGGCGCTAAAGCA ATTATCACCAATGCTTGATAATTTTTTCGCGTAATGAAATCTTCAGAGCTTAGTACAAGG CATAATCTCTCCATCTTTCGCGTGACACTCTCTATATGTAAATTTATGTATATGTATTAT TGACTTACGAGTGCACGAAACACACACACACATCATATTTTATTAGCTCGAAACGCGGTT TTTTTATGAATGAGAAATCTGCTCAAAGAAGCAGCAGAGGTATTACCTCAGGACAATGAA TATTTTCTCTTTGGTAAACTGCAGTAGTTAGTTTTTAGGTCCACTGAGATTGACTTCTCA TCACACACTACTTCTTGCTGTATCAAATATCGGACTAGTTGAGTTGAGGTCGGATACATG AATCCTCTGTTATCTAGTTTTCTCTATTCATGTTCGATATAGCCTGTAGGTGGGCACAAA TTCATCATAGTTTCACGTTGGTTGTCAACATATTGCAATAACATTTGTCCTTACAGTCTA AGAAATTATTTTACTTTTAAATTTCTATGTAAAATTGAAATCTATTTCTTTGTATAGTCC AATATTATGTCAATTTTGAACACTACTATAATGTACAAATATTACTAACATAAAAATTAC ATGGTGTGGTTTCACAAAGAGGTGTCCGAAGAAAATAGAGTATAAATAAATTTTATTTTT ACCATTATTTTTAATAGATATTCGACTCGAAGAAAAATGATTTAGAAAAAAAAAACAAAA AAACAAATAGTAACATATAAAAATTATATAACAAAATAATAGGGTAATCAGCATAAAAAA ATTACCATATATTGAGTGATAAAAGTCAAAGGATACGAAATTCCAGGCACATTAATACCA ACCCACACCAATTTATGCATGTAACAAATAGTAACATAACACGAAACTACACTATAATGT ATAAAAATTAAGTCATATTAAGTGTATATACAGAATCCAAGTTGAAAAGTAGGTGCATAT TAATACCAACCACCATCAATTTATTTAAAGACAAAATTAGTTCAACAATCAAAATCTCAA AGTTAATATAGTGATGAAATAGTAGAAAACTAGAAGTTAATTCATTTACTAAAAGCCCAA TAGAAAACTAGAAGTTAATTCATTTACTAAAAGCCCAAGTCTTTTTTTAAAAAAAAAGTT TTAATAAGGTGCTTCCTGGTAGATAGTTTTTAAAATTTTAAATTGATTTTTAAAAAATGC ATCACAAAATCTGAACTAACAACGATCTCAAAATGTGAACTCATTATAAGTAAATTCTTC GTTCATTATTAAAGGTTTTGGATTCAAGTCTTAAATATGTAAAAATTTAGTTACTGGTAT TTGGTAG