Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc11g020910.2.1

CDS Infomation

2-isopropylmalate synthase (AHRD V3.3 *** A0A0B0NSJ4_GOSAR)

Sequence

ATGGGTTCTAAGAGAAAATCCAAGAGCTCAAACCATTTCAAAAAACGAAACCTAGGTTGT
GATGATTCTGGCATTTTCCAGCATCTTATCTCAGTCCTTCAAACTCCACAGGGTGTGAAG
TTACCTGTGTTGAAAAGTTTGTATTGTCTGCTTGTCTATTTCTCCTTGAACTCATTAGAA
AGTCCAACATATAAACTTGATTTTGATGATTTGGACATGGATGTTGATCACAATGGGTTT
AAAGCATCATCAAAGGATATAGAGACCCTCTCTGGCATATTATTTGAAGAAATGTATGAG
CGGTTTGACCATTTATTCTCTGCTCCCCGTGATACTTCTGTGAATGATCAGAGACAAGGT
ATTTTACAGAAGAATATGTCCAAAGATGCTGAAACTTTTTATTTGCTGCTGAGGTGTTGT
ATGGTAACCTTGACCTTGCTTGTGTCCCAACATAATCTTCTTTTAGAAAAAGGGAAGATC
CTTTTGGTGTTGCTCCGAAAGTTATGTTCAATAAACACATTTGCAGCAGGAAATAGGACA
AAAATTACTTTTCAAAAATCAGTTTCTCATGCAGTCACATCTGAGGATAATGATTGTAGA
ACAACCTCCACAGAGGACATTGTTGCATCCCTCCATCTTGTTGAGCCATCTGATCCTCAC
ACTTCTTTCTTGTGTGCAACATTTGAGGTTTTTGTGGATGAGCTTCTGGTACATGGACAA
TTGAGACAGTATTTTAAGCTTATCGATTCTCTAGCTTCTTCTGATGAAGTTTTATTTACG
CCTCAATCTGGTCAGGGTGATATAGGAATAGTAATGGAAGTTTTGTCTAGGTACTTCTTA
TTATCATGGTCTAATGAGCTTAGGTCTGGAGATCATCTTAACAGATTATTATTGGTAAAC
AATGAATATTTCAAATCTTCATTAAAAGCTCATGAGTTGAGTCTGTCTGCGGCCATATCT
CTGCTTCTCAACCCGATCATTCTTTCTGCCCCAAAACTAATGCAAGCACAATTGATTTCA
ATGATTCACGAGGCCACCTTTCTGCTAGTAGATATTCAAAACCTTAAGACAAATCATAGA
CCTCTCAAATTCTTCCTCTCACTGTTTGAAAAATCCGTAGCTTTGTACATGAAGCACTTG
TCCGTGTTGCAAAATGCCTGTCAGTCTTCATCTGTTAGTCATTCTTCTACAACAGGTGTA
GAAGGGAAGGGTATTCATCCCCTTTTTGAATTGTGTATATTAGCAAGGACAAGAAATGAG
ATCAATAATTTAGTTTTGAAGTTTGAGGATTCATCACAACCTCACTTTCTTAAACTTTTT
TTTGAAATGAAATCTGACCTGATAAGTTCCTGTGTTAACTATGTAAAAGAGAGTCGCTAT
CTTCTAGAGAACTCCTGCCAGGATGAGATTATGTCCACCTTAAGTTGCCTAATTTTAAGA
GCTTCGGACAGTTTCGAAGAGAACGCAATAGTGGATGCAAGTCTGGAAGATATTTGCCTT
CTGGTTTCTACACTGAAGCTAATGAGCTCTTCCTTGTTACAACTGGTCTGGTGCCTCAGA
TGCAACTTGAATTCTGCTTCTTCAAAAACCTTGAAAGATTTTTCATCCTGTGGGGAATAC
AATTCTATCTTGGGAATAATTGACTGTTTTAGAGAGCTCAGCATATACGGTTCAGTCCAA
AATTTATCACGCCAAATGATGGAAATAGACTCTGAGAAGCATAAAGTTTCCAAGATGATG
TTTCTTCATTTTTCAGGAATGCTTTCATTCAGTTTCTTTAAGAGGCTTGATTGTTTAGCA
AAAGGCTGCTTGTTTGCTGTTATAACTCTGCTGAATTTATTCATCTTTGAAGAAGGTAAT
TTGGATATATTCCAGTCACTAGTTGATCCAACTCCAGACTCCTTTTCATATGGATTATCG
GCTGTTAGAATCCAGGAGGCTGTAGTGGACAAGAGATCTAGTCTTGTGGTTGCATCAAAG
TTTCAGAAGGCAAGGACTCTGTGTTCAAGTTCCAGAAGGAAGGGATATAGCTCAGCAATA
AGCAGTTCTGAGGTTTATAACAAAGAAGATGTGGTAGCAATGGAAGAGGAGATGGAGGAA
ACTACCAATGGGAAAATATTTCTCAAGTGCAGATCAGAAGCTGGACAAGTCCCTGATTTT
GATGACTTAGCTGATTTTATCGAGTGCAAGCAAGGAAAGGACTACCCTTTGTGGCTAAAG
CATCGCCAAGAATATCGAAAGTTGAAATGTAACAAGATAGCACTGTTAAGGTGGAAAAGG
AAAAAGAAATCTTGGAAAGTCATGAAAAGGAATAAACCTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc11g020910.2.1

PEP Infomation

2-isopropylmalate synthase (AHRD V3.3 *** A0A0B0NSJ4_GOSAR)

Sequence

MGSKRKSKSSNHFKKRNLGCDDSGIFQHLISVLQTPQGVKLPVLKSLYCLLVYFSLNSLE
SPTYKLDFDDLDMDVDHNGFKASSKDIETLSGILFEEMYERFDHLFSAPRDTSVNDQRQG
ILQKNMSKDAETFYLLLRCCMVTLTLLVSQHNLLLEKGKILLVLLRKLCSINTFAAGNRT
KITFQKSVSHAVTSEDNDCRTTSTEDIVASLHLVEPSDPHTSFLCATFEVFVDELLVHGQ
LRQYFKLIDSLASSDEVLFTPQSGQGDIGIVMEVLSRYFLLSWSNELRSGDHLNRLLLVN
NEYFKSSLKAHELSLSAAISLLLNPIILSAPKLMQAQLISMIHEATFLLVDIQNLKTNHR
PLKFFLSLFEKSVALYMKHLSVLQNACQSSSVSHSSTTGVEGKGIHPLFELCILARTRNE
INNLVLKFEDSSQPHFLKLFFEMKSDLISSCVNYVKESRYLLENSCQDEIMSTLSCLILR
ASDSFEENAIVDASLEDICLLVSTLKLMSSSLLQLVWCLRCNLNSASSKTLKDFSSCGEY
NSILGIIDCFRELSIYGSVQNLSRQMMEIDSEKHKVSKMMFLHFSGMLSFSFFKRLDCLA
KGCLFAVITLLNLFIFEEGNLDIFQSLVDPTPDSFSYGLSAVRIQEAVVDKRSSLVVASK
FQKARTLCSSSRRKGYSSAISSSEVYNKEDVVAMEEEMEETTNGKIFLKCRSEAGQVPDF
DDLADFIECKQGKDYPLWLKHRQEYRKLKCNKIALLRWKRKKKSWKVMKRNKP*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc11g020910.2.1

Transcript Infomation

2-isopropylmalate synthase (AHRD V3.3 *** A0A0B0NSJ4_GOSAR)

Sequence

CTTTTTAAAAAATTGTTTCATGAAGTAAGAAAATACAAATAATATAAAAAATGATAAAAT
GATATTGAAGACAGAGAATTTATTTTTTTAAATTTCTTTTGGGAACCTACATCAAGTCTT
TAGAATTCCATTGCTCTCTGCTGCAAGGCCATTGAAAGTGGTGCTCCGCGCCAAAATCCT
CCCTTCTCTTGGGTGACATTGTTCGGGTTGGACTACTGATTTGTGCTCAGTTTTGATGGG
TTCTAAGAGAAAATCCAAGAGCTCAAACCATTTCAAAAAACGAAACCTAGGTTGTGATGA
TTCTGGCATTTTCCAGCATCTTATCTCAGTCCTTCAAACTCCACAGGGTGTGAAGTTACC
TGTGTTGAAAAGTTTGTATTGTCTGCTTGTCTATTTCTCCTTGAACTCATTAGAAAGTCC
AACATATAAACTTGATTTTGATGATTTGGACATGGATGTTGATCACAATGGGTTTAAAGC
ATCATCAAAGGATATAGAGACCCTCTCTGGCATATTATTTGAAGAAATGTATGAGCGGTT
TGACCATTTATTCTCTGCTCCCCGTGATACTTCTGTGAATGATCAGAGACAAGGTATTTT
ACAGAAGAATATGTCCAAAGATGCTGAAACTTTTTATTTGCTGCTGAGGTGTTGTATGGT
AACCTTGACCTTGCTTGTGTCCCAACATAATCTTCTTTTAGAAAAAGGGAAGATCCTTTT
GGTGTTGCTCCGAAAGTTATGTTCAATAAACACATTTGCAGCAGGAAATAGGACAAAAAT
TACTTTTCAAAAATCAGTTTCTCATGCAGTCACATCTGAGGATAATGATTGTAGAACAAC
CTCCACAGAGGACATTGTTGCATCCCTCCATCTTGTTGAGCCATCTGATCCTCACACTTC
TTTCTTGTGTGCAACATTTGAGGTTTTTGTGGATGAGCTTCTGGTACATGGACAATTGAG
ACAGTATTTTAAGCTTATCGATTCTCTAGCTTCTTCTGATGAAGTTTTATTTACGCCTCA
ATCTGGTCAGGGTGATATAGGAATAGTAATGGAAGTTTTGTCTAGGTACTTCTTATTATC
ATGGTCTAATGAGCTTAGGTCTGGAGATCATCTTAACAGATTATTATTGGTAAACAATGA
ATATTTCAAATCTTCATTAAAAGCTCATGAGTTGAGTCTGTCTGCGGCCATATCTCTGCT
TCTCAACCCGATCATTCTTTCTGCCCCAAAACTAATGCAAGCACAATTGATTTCAATGAT
TCACGAGGCCACCTTTCTGCTAGTAGATATTCAAAACCTTAAGACAAATCATAGACCTCT
CAAATTCTTCCTCTCACTGTTTGAAAAATCCGTAGCTTTGTACATGAAGCACTTGTCCGT
GTTGCAAAATGCCTGTCAGTCTTCATCTGTTAGTCATTCTTCTACAACAGGTGTAGAAGG
GAAGGGTATTCATCCCCTTTTTGAATTGTGTATATTAGCAAGGACAAGAAATGAGATCAA
TAATTTAGTTTTGAAGTTTGAGGATTCATCACAACCTCACTTTCTTAAACTTTTTTTTGA
AATGAAATCTGACCTGATAAGTTCCTGTGTTAACTATGTAAAAGAGAGTCGCTATCTTCT
AGAGAACTCCTGCCAGGATGAGATTATGTCCACCTTAAGTTGCCTAATTTTAAGAGCTTC
GGACAGTTTCGAAGAGAACGCAATAGTGGATGCAAGTCTGGAAGATATTTGCCTTCTGGT
TTCTACACTGAAGCTAATGAGCTCTTCCTTGTTACAACTGGTCTGGTGCCTCAGATGCAA
CTTGAATTCTGCTTCTTCAAAAACCTTGAAAGATTTTTCATCCTGTGGGGAATACAATTC
TATCTTGGGAATAATTGACTGTTTTAGAGAGCTCAGCATATACGGTTCAGTCCAAAATTT
ATCACGCCAAATGATGGAAATAGACTCTGAGAAGCATAAAGTTTCCAAGATGATGTTTCT
TCATTTTTCAGGAATGCTTTCATTCAGTTTCTTTAAGAGGCTTGATTGTTTAGCAAAAGG
CTGCTTGTTTGCTGTTATAACTCTGCTGAATTTATTCATCTTTGAAGAAGGTAATTTGGA
TATATTCCAGTCACTAGTTGATCCAACTCCAGACTCCTTTTCATATGGATTATCGGCTGT
TAGAATCCAGGAGGCTGTAGTGGACAAGAGATCTAGTCTTGTGGTTGCATCAAAGTTTCA
GAAGGCAAGGACTCTGTGTTCAAGTTCCAGAAGGAAGGGATATAGCTCAGCAATAAGCAG
TTCTGAGGTTTATAACAAAGAAGATGTGGTAGCAATGGAAGAGGAGATGGAGGAAACTAC
CAATGGGAAAATATTTCTCAAGTGCAGATCAGAAGCTGGACAAGTCCCTGATTTTGATGA
CTTAGCTGATTTTATCGAGTGCAAGCAAGGAAAGGACTACCCTTTGTGGCTAAAGCATCG
CCAAGAATATCGAAAGTTGAAATGTAACAAGATAGCACTGTTAAGGTGGAAAAGGAAAAA
GAAATCTTGGAAAGTCATGAAAAGGAATAAACCTTGAACTAACTTGAAGAGTTTTCCTTG
GAAAGGAAACTGGCGAGTTGAGCTTCATTGTGTGATCTGGACATATGTTAGGATATCTCC
AACTGAACAATTGCTGTAGAATGATGTTTTGACAATGCTTTCCTCAGTGCATGTAAGACA
ATTGCTTAAAGAAGATTTTTGTTTAATGTCTGCGGTCGCGTATAAGTAAGGTGAAATCTG
AAGACTGATATACTTGGAAGTTCGATCTTAGCAAGTTAACGGAGCTTCTTTTTGTCCTAG
TTAAGGCGGTGAAATGGCTATAGAATCCATGAAACATACCGCTGCAACATGATTAAGCTG
ATATTACATCTTGATTTAGGTATAGCAGATTTTAGCATGCTGAACTCTAACTAGGATCAA
GAGAACCCTGAAGTTCTTGTAAAGGAGTCGGGAGGTGTTTGCAGGATTCAGCCTTCTCTG
TTCTTGTCTCTTAATGCAAAAGCAACATTCTGATTAAAGCTTTTAAACTGGCGACATCAT
ATGCGCAATCAAAACGAACTTAATATGCAGTACTCCTGTTATTGATTAGAGGAACATTGC
AGGATCATGCTTGAAAGTTGGAGAATTCTATGATATTGCACCATCATTGGTATTTTTGTT
GAGTACATTCCTGTTAAGTTCCTATCAAAATGCTTTGGAAAGTGAGGTCCAGTTGCCCTA
GTCTAATGTGTTCCCTTTTCTTTTCCTACTGATCCTATCAAAGTTAAGGTTAAAGAGATG
ATTAAACATTGGAATACTGATCTGGTAAATGTTTTGTAATTGTAGGCTAATCTGCCAAAA
ACCTTTGGACCATTTTGCTGATTCTACTTTCAGCTTTGTGATGGTTTGCAAAGTGTGTGT
TGTCTTCATTCGGGGGACCAAATTAACAGTGTCCTCCTTTATTTATTTACTATTATTTAG