Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc11g013120.2.1
CDS Infomation

Camphor resistance CrcB family protein (AHRD V3.3 *** B9GUE1_POPTR)
Sequence

ATGGATTGTGAGAATAAGGATTCTGAGCTTAGAAAATTCGGATCATCTCGCACAAGCAGT
GCCAGTTCTTCTCTCAGGAGGCGTTCGTTGAGTTTATCACTTTCTCTTCCTAAACATCTG
AATGACGATGATGATGAAAATGAATCTGTATCAGAAGCAGGAGATATCGGGGATCGTGAG
CTTCAAAGCAATAGGTACAGTGGGAGTGGCAGGCTAAGATTAATCGGTGAAAATGCACCA
GAACATAGAGTGGTTGTTCCCATTTCAGAGGACACGATGTTGGGGTCCAATGCTATGAGT
AGTGTTACTCCAGTATCCCCGATAAAATTGATCTCTCAACCCGATCATAAAGAGAATGAT
GAAAAAACAGAGGTGCCATGGGTTTTGGAGTATACTTCATGCCTCTTGTTTCTAGCTGTA
TTTGGTATATTGGGGGTTTTGCTGAGGTATGGTCTCCAAAAATTATTCGGACCAGGAATA
GTTGGTGCCACAAGTGATCATAGTTATATGTATCTGGACCTGCCTTCTAACATGGTCGGT
TCGTTCTTGATGGGTTGGTTTGGTATGGTCTTTAAAGAGGACATTTCCAGAATTTCAAGT
CAATTAGCAATTGGATTGTCAACTGGTTTTCTAGGAAGCCTTACTACTTTCAGTGGTTGG
AACCAAAAGATGCTCGAGCTTAGTGTTGAAGGGCAGTGGGTTTTTGTAGTTCTTGGCTAT
CTTCTAGGTTTATTTCTTGTTGCCTACTCAATCATATTTGGAATTGAGACTGCGAAAGGT
GTCAATTGGCTCTACAGAAGAGCCAATATGAATTCATCCAACTCAGGCACAGACTACCAT
TGGAGAGTAGATAGCTGTAAGCGCCATTTAATTGTTATACTCTTTCTCCTACTCATTCTA
GCATCGCTATGGGGTATGAGCATAGGACTGGAGGTACATGAATTCAGCAGCAGCAGCCCA
AAAGCACAGTTGTGGCTGGCCTGCATAGTTGGTCCATTTGGTGTGTGGATCAGATGGTTC
TTAGCACGACTAAATGGACGTGGCTTAGGAAAATCAGGCCAGCTCAAATGGGTGCCCTTC
GGTACTTTGATTGCCAATGTATCTGCAGCTTGTGTCATGGCAGCACTTGCGACCTTGAAG
AAAGCAGTCAACACAGAGACATGTGATACTGTTGCTTCTGGTATCCAGTTTGGTCTATTG
GGTTGTTTAAGTACAGTTTCCACTTTCATTGCTGAATTCCATGCAATGAGAGGAAGCAAG
TATCCATGGAGAGCATATGTGTACGCTTTGTGTACAACGCTTATATCATTCGTCCTGGGG
ACACTTATATACTTTGTGCCTGTCTGGGTTGAAAATTTCAACTAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc11g013120.2.1
PEP Infomation

Camphor resistance CrcB family protein (AHRD V3.3 *** B9GUE1_POPTR)
Sequence

MDCENKDSELRKFGSSRTSSASSSLRRRSLSLSLSLPKHLNDDDDENESVSEAGDIGDRE
LQSNRYSGSGRLRLIGENAPEHRVVVPISEDTMLGSNAMSSVTPVSPIKLISQPDHKEND
EKTEVPWVLEYTSCLLFLAVFGILGVLLRYGLQKLFGPGIVGATSDHSYMYLDLPSNMVG
SFLMGWFGMVFKEDISRISSQLAIGLSTGFLGSLTTFSGWNQKMLELSVEGQWVFVVLGY
LLGLFLVAYSIIFGIETAKGVNWLYRRANMNSSNSGTDYHWRVDSCKRHLIVILFLLLIL
ASLWGMSIGLEVHEFSSSSPKAQLWLACIVGPFGVWIRWFLARLNGRGLGKSGQLKWVPF
GTLIANVSAACVMAALATLKKAVNTETCDTVASGIQFGLLGCLSTVSTFIAEFHAMRGSK
YPWRAYVYALCTTLISFVLGTLIYFVPVWVENFN*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc11g013120.2.1
Transcript Infomation

Camphor resistance CrcB family protein (AHRD V3.3 *** B9GUE1_POPTR)
Sequence

GCAATCACTTCTCTCTTATCAAAATCAAAATAAATAAAAAGCAGAGGCTAACATGAATGC
CGTTTTGTCAATCACCACAAGAGCCACCATCAATGCTCCATATCTCATCCTTCCCCATTT
CCCAAAAAGGTCAAAAACGTAACAATAAAATAATAATTTCATCCTCCCAAAATCTCTTCA
AACAGGGTTTTTGGGTTTGGATTTTTTTTTTCTCCTTTTCAAAATAATTGCATCTCTATA
TACTCATACTTGTTCGATTCAAGGTATGAACTTAGATTTATTAATGAAAATGGTTAAATT
CACTTTATTGTTTTCTATTCCGCAGGTTGTTCCGTTAGTGGAGATCATAAATTAATTACT
TTATAATATTATGTGGGGATGCAATTGGCTGTAGAACTTTGACAAGATTTTTCTTCACTT
TTTGCCTTTGCTTAAAAAGTTACCAACCATGCAATTTGTCATTGGGTCCACTTAATTTGT
ACATAACCATTGTTTTCTTTGCTCCTAAACAAACGGGTCCATGCCTAAATCATTGATTTT
GTAATGATTTATGGTTGATGTTCAAATAATGAAGTAATTACTATGTATTTCAATCAAGTT
TTGTCATAGTAGTTGTTAGAGGTAGGTGGAATCAAACTCACGTTTAATAACATCTGGGAG
AATTATTGCACATGTATTATGTATTACAAGACATCTTTTTTGACAATAGCTAAGTTGAAA
ATGTCCTTTAGGAAGAAGTCAAGGAATGAAGTTCTGGTGAAGGATCATGGATTGTGAGAA
TAAGGATTCTGAGCTTAGAAAATTCGGATCATCTCGCACAAGCAGTGCCAGTTCTTCTCT
CAGGAGGCGTTCGTTGAGTTTATCACTTTCTCTTCCTAAACATCTGAATGACGATGATGA
TGAAAATGAATCTGTATCAGAAGCAGGAGATATCGGGGATCGTGAGCTTCAAAGCAATAG
GTACAGTGGGAGTGGCAGGCTAAGATTAATCGGTGAAAATGCACCAGAACATAGAGTGGT
TGTTCCCATTTCAGAGGACACGATGTTGGGGTCCAATGCTATGAGTAGTGTTACTCCAGT
ATCCCCGATAAAATTGATCTCTCAACCCGATCATAAAGAGAATGATGAAAAAACAGAGGT
GCCATGGGTTTTGGAGTATACTTCATGCCTCTTGTTTCTAGCTGTATTTGGTATATTGGG
GGTTTTGCTGAGGTATGGTCTCCAAAAATTATTCGGACCAGGAATAGTTGGTGCCACAAG
TGATCATAGTTATATGTATCTGGACCTGCCTTCTAACATGGTCGGTTCGTTCTTGATGGG
TTGGTTTGGTATGGTCTTTAAAGAGGACATTTCCAGAATTTCAAGTCAATTAGCAATTGG
ATTGTCAACTGGTTTTCTAGGAAGCCTTACTACTTTCAGTGGTTGGAACCAAAAGATGCT
CGAGCTTAGTGTTGAAGGGCAGTGGGTTTTTGTAGTTCTTGGCTATCTTCTAGGTTTATT
TCTTGTTGCCTACTCAATCATATTTGGAATTGAGACTGCGAAAGGTGTCAATTGGCTCTA
CAGAAGAGCCAATATGAATTCATCCAACTCAGGCACAGACTACCATTGGAGAGTAGATAG
CTGTAAGCGCCATTTAATTGTTATACTCTTTCTCCTACTCATTCTAGCATCGCTATGGGG
TATGAGCATAGGACTGGAGGTACATGAATTCAGCAGCAGCAGCCCAAAAGCACAGTTGTG
GCTGGCCTGCATAGTTGGTCCATTTGGTGTGTGGATCAGATGGTTCTTAGCACGACTAAA
TGGACGTGGCTTAGGAAAATCAGGCCAGCTCAAATGGGTGCCCTTCGGTACTTTGATTGC
CAATGTATCTGCAGCTTGTGTCATGGCAGCACTTGCGACCTTGAAGAAAGCAGTCAACAC
AGAGACATGTGATACTGTTGCTTCTGGTATCCAGTTTGGTCTATTGGGTTGTTTAAGTAC
AGTTTCCACTTTCATTGCTGAATTCCATGCAATGAGAGGAAGCAAGTATCCATGGAGAGC
ATATGTGTACGCTTTGTGTACAACGCTTATATCATTCGTCCTGGGGACACTTATATACTT
TGTGCCTGTCTGGGTTGAAAATTTCAACTAGAGTATCAAATATACACGATCAATCGTTGA
TATATATATATATATATGTATATAGTTGTTGTTGCCAAGCTCCAAAGAAACAACAAGAGA
TGCAAGAGAATATTGCAAATTGGAAATGAAAATTTTGAGGTAATGAATTAATTTATTAAG
TGCACATATTAAGGAGGTAACTTGTCAAGTTGTATTAACAAATTGTTGTAACTTCATTGT
AGCTCAATTGACCTTGACATTTATAGTGATTCTTTTAAAATGGGCTATTTTTGTACTTTC
TAATTCATATTTTCTTTTTGATAAATATCATTTTTATCAGTT