Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc11g012120.2.1
CDS Infomation

DUF506 family protein (AHRD V3.3 *** G7JKH5_MEDTR)
Sequence

ATGGCCAGAATTGTACCGGTGAAGTTTAAGAGAGTAGCCGAAGCGTTTGATGAGGTGGTG
AAAACTCGGATCTGCGAGAGCAGCGGCAGTGAACACTCTCCACCACCTGAGAGCTTGGCG
AATTTATCGCAACTTGTGAATTCGTTTCTAGAAGGGGAGGTAATTACTGTTAATGAGAAA
TTGGAAGAGATTGATGGAAATGTTGAAACTAATTGCTTTGACGAATCGGAGATTAAGGAG
AATTTAAGGAATCTGTTGGATCCCGATGGAAATTCCGGTGATGATTTGAAGAAAAATGTT
ATTAATGCTGTGGAAAATGCTTTGCTTGCTGAAGAAGCAAGCTCACCGGAGTTTAAACGA
TGGTTGATGACTCGATTGCGTGATCAGGGATTCGATGCTGGATTGTGCAAATTAAAATGG
GAGAAAGCTGTTAATCGTACTTCAGGAAGTTACGAGTATATAGATGTTAATATTGGTGTT
ACTCGTTACATAATCGAGGTTTCATTAGTGGAAGAATTTGAAATTGCTCGAGCAACGCCT
TGCTACACCTCGTTGCTGGAAAATTTCCCTCACGTTTTTGTTGGAAAAGTGGAAGAGTTG
AAGCAAGTGGTGAGAATTATGAGTAGAGCCATGAAGAGATCTATGAAGAAAATGAATATT
TATGTGGCTCCATGGAGAAGACTGGCTTATATGGAAGCTAAGTGGTTTGGATCTTATAAG
AGAACAACAAATGAACAAAAAGATTATCAAAAGAATAGTTTTGATTCATCTTCAAAGAAG
AGAAATGTTGGATTTGTGCCTAAGCAAGCAATTTCTTTCTATTGTAGAGAGAATGTTGTT
GCTTCTAATAGTGGCATTAAAATTGGAAATTTGGCTGCCGCTTTGAATGGATAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc11g012120.2.1
PEP Infomation

DUF506 family protein (AHRD V3.3 *** G7JKH5_MEDTR)
Sequence

MARIVPVKFKRVAEAFDEVVKTRICESSGSEHSPPPESLANLSQLVNSFLEGEVITVNEK
LEEIDGNVETNCFDESEIKENLRNLLDPDGNSGDDLKKNVINAVENALLAEEASSPEFKR
WLMTRLRDQGFDAGLCKLKWEKAVNRTSGSYEYIDVNIGVTRYIIEVSLVEEFEIARATP
CYTSLLENFPHVFVGKVEELKQVVRIMSRAMKRSMKKMNIYVAPWRRLAYMEAKWFGSYK
RTTNEQKDYQKNSFDSSSKKRNVGFVPKQAISFYCRENVVASNSGIKIGNLAAALNG*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc11g012120.2.1
Transcript Infomation

DUF506 family protein (AHRD V3.3 *** G7JKH5_MEDTR)
Sequence

CATATAATAAGCTAAAAGATTGCAATATAAAAGAAATGGTTGAGATTTGTAATTTTTTAA
ATTCTTATACATAAAGATAAATTGATTCAATCGAGTTTTATTATAAATTTTTTTTATCAC
ATTTTCTACATCATCCTCTTATTTCTTTCTTTTCGGAGGTCTGATCAAAATAAAAGAAAA
CAAGAAGAAAATTTTAACAAAAAACTTATTTTATTACAAAAGATAGCTCATAATATTCGT
ATCAATTTATTATACGTATATGTTCAATTCAAGAAATTAGTTAAAGGAAATAAACCGCAT
TTTGATTTAGTTAAATAAATGTTTGAAATGATGACTAAATTTTAGCTCATAAATCAATAT
CATGATAAATATATGTTTGGCCAATTTTACGAATGACCACTCAACTTTTATTTATTACAC
AAAATTCAGTAAAATATTTTTAATGAAAAATCGATTTTCTCAATATAATAACTATCACAT
AGAATCACAAAACTATCTTTTTTGAGAAAAAAAGTTAGTCAATTTTACTTTTATTTTGTC
AAACTCGATGTGTCCAATAGAAACAATTATAGTTATTAATACTTATGCTCTATTGTGAAT
GGCAACACTTTTTGGCATTTTAGGATTATAACAAAGGAATTGAGGATTTTTAAAATTTTT
AGTGTGTATTAAACCATAGATTTTTCACAATTTTTTTTGATAGATTTCGATATGTTTCAA
ATTTAGTAGTATGTACATTTGAACATTTTGATAATCAATACTCATTGTTTCGACATGGCT
CACGACGTTCTTTTGACTTTTCATGTTTATAATAGATAATAGAGAAACTCAAGATTTTAA
AATTTTCTACGTTAATCCATCGATTTTGAATTTTTTTTTTGATAAACTTCAATCAGCCGC
AAACATGATGTGTCCATCTGAAACAATCTCGGTAATCAATAATTATTCTTCCATCACGAT
TGACATTATTTTTTGCGCTTTCAAATCATGAGAATTTAAGATTTTAGAGTTCTCCATGTA
TATTATTAGTCCATATACTCTATGTTTTTGTAATTTTTTGTTATTGCCATATCAAAATTT
GATTTCTGTTAAAACACTCGATAATAAAAGCTCTGACTAAATTATATTTGCATTAACGTA
ACTTTGTTAAAATGCTCTCTGACAAAAACTACAAAACTAAAAACCAAGTGCCTTTGAGGA
ATATTTTATTTTTATGCGGAAAAAAGTTTAATTTCAACACTCAGTACAAAATATATTTTA
TTGGAGTATTCCTCACATGAAAAATAAACTTAGCTAAATAACGAACTTATTCATAAATTA
CGTCTACATTCATTGTATTATTCACTATAACCCAAACTTCTGTGTAAAATTCACTAAAAA
AATACACATTAAAAAAATTACTTATATATATATGTTTAACTTTATCAACATAATGTCTTC
ATCTTTACTCTAAGCAAAAATAAAAACTCCAACTGATTTCTTCTCTGTGAACATTTTTTC
TTCGTGATTGCGACATAACTGAATCATAAATATTCGATTCGTCTATAAAATTCGAATAAG
AATAAGAAATTGAGATCGGAAAAGATGGCCAGAATTGTACCGGTGAAGTTTAAGAGAGTA
GCCGAAGCGTTTGATGAGGTGGTGAAAACTCGGATCTGCGAGAGCAGCGGCAGTGAACAC
TCTCCACCACCTGAGAGCTTGGCGAATTTATCGCAACTTGTGAATTCGTTTCTAGAAGGG
GAGGTAATTACTGTTAATGAGAAATTGGAAGAGATTGATGGAAATGTTGAAACTAATTGC
TTTGACGAATCGGAGATTAAGGAGAATTTAAGGAATCTGTTGGATCCCGATGGAAATTCC
GGTGATGATTTGAAGAAAAATGTTATTAATGCTGTGGAAAATGCTTTGCTTGCTGAAGAA
GCAAGCTCACCGGAGTTTAAACGATGGTTGATGACTCGATTGCGTGATCAGGGATTCGAT
GCTGGATTGTGCAAATTAAAATGGGAGAAAGCTGTTAATCGTACTTCAGGAAGTTACGAG
TATATAGATGTTAATATTGGTGTTACTCGTTACATAATCGAGGTTTCATTAGTGGAAGAA
TTTGAAATTGCTCGAGCAACGCCTTGCTACACCTCGTTGCTGGAAAATTTCCCTCACGTT
TTTGTTGGAAAAGTGGAAGAGTTGAAGCAAGTGGTGAGAATTATGAGTAGAGCCATGAAG
AGATCTATGAAGAAAATGAATATTTATGTGGCTCCATGGAGAAGACTGGCTTATATGGAA
GCTAAGTGGTTTGGATCTTATAAGAGAACAACAAATGAACAAAAAGATTATCAAAAGAAT
AGTTTTGATTCATCTTCAAAGAAGAGAAATGTTGGATTTGTGCCTAAGCAAGCAATTTCT
TTCTATTGTAGAGAGAATGTTGTTGCTTCTAATAGTGGCATTAAAATTGGAAATTTGGCT
GCCGCTTTGAATGGATAATATCATGAACAGATATAGGTCATGGTGGAGTTGATCAAAGAT
TTCGAGTTCAAATTCTGAATCTGAATTCATTGTGTTCCTTAGAAAATGATAGATTTAGTT
AGATTTCAATGCGAATGACAGATATTTGGTGAAAAGTATAAATTTAATTTGTTAAGAATT
TGAAAGTTATTCTTGTGGAGGCAATATATATTAGCATCATTTTTGGTGGGTTTGGAAAGG
AAATCATATAGTTTATTGGTGGAGGAAAAAATTATATTTCTCCAAAGTAGTTGCGGTTGA
AGATTTTAGATTTTAGTAAGTACTATATTGCATAGCAATTTGTATAAATTTTATGTGTTT
ATCAAGTAATGGAGAATATTTCAGAAAAATATGTATGTTACTATTATTTCTATTATTTAT
TTTACCTTTTTGAA