Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc11g011560.2.1
CDS Infomation	PHD finger protein family (AHRD V3.3 *** A0A151RBP6_CAJCA)
Sequence	ATGGCTACAGAGAAGATGAAGAAGGGAGTGTCGAATATCTATGAGTTTCATAGTTTTCTT GATCCGGGATGTCCGATTACGCCAATGGGTCCGTTTCGTGATAATATTCGGTATTTTCTT CAGGAATGTGCTGAGGTTAAGGAGTATACAGTTGAAGGAATGCCAATTTGGTGTACGTTT TTGGTGCATAAGAGTAAAGGTGTGCTGATTCCTCTTTACACCATTGAAGAGAATGTGAAG AGCTCTGTTAGAACTTTCTGTGATCACTGTAGATGTGCTGGTTGGAGTCATCATCTTGTT TCGAAGAGGAAATACCATTTGATTATACCAGCTGATAGTGAATGGAAAAAGCATCTTGAT GATGGTGTTTTTGATGATCAAACACACATTTTGCATGGTTTGATTCATTCTAATGGATTT GGGCATTTGATTTCACTTAATGGAATTGAGGGTGGATCGAAATATCTCTGTGGACGTGAA GTAATGGATCTCTGGGAACGTATTTGCACGAGTTTTCGAGCTCGGAAAATCACTGTTGAA GATGTATCCAGGAAGCATATGATGGATTTGCGCTTGTTGTATGGGGTTGCTTATGGGCAT ACATGGTTTGGCCGGTGGGGTTACAAGTTTAGCCATGGAAGTTTTGGGATAATGGAACAC CACTATGAAAAAGCTATTGAAATGTTAAGCTCAATTGAGCTTGATCAGGTGATTGATGAT TTCAGATACATCAGTAGATCCAATGTTATGAAGCAGGTGATTGCTTGTTATAGAGGTTTG AGCAACACTCCTTTGATCACGGTCCGTGACCTCTTCAGGTTCATCCTTGTTGTCAAGTCC TGCAATTCAGTTAAGGAGAAGCCAAATGTTACTGCTCCTGTTTTACGAGCATGTTCTGCA CGATACTTGATAAGAAATGCTGCACCAAACAAGTCTGTGGGGAAGGAAAAATCAGTGAGG TATAGAAAGTTTTCAAACGTTGCAGCATCTCTTGACAGTAGATGGCCAGTGAGGAGACTT GAGTTCACTGCAGATGTGATTGTTGAGGCGTTGAGAGAAAAAAGAGAAGCAATCAGATTT GGAAGTTGTGGGATGAGTAGGCAAGAGGCGAGGGATGCTGCTCGTCTCCACATTGGCGAT ACAGGATTGATTGACTACGTGCTGAAATCAATGAACAATGTGATTATTGGAGGCTATGTA GTTCGTCGTGCAGTGAACCGAGCCACGAGGGTGTTGGAGTACACGATTCAGGAACTTCGG AATTGTGATCAGCCTGAACAAGAAAAGCTCCCCGAGCCATTTCAGGACTACAATGTTAAT CCTGGAGCTGATGCGTACACTGATGTTCTGTGCTTGTATAATAATCTTCTTTTGAGCTTC GCGGAATCTGATGAGTTAAGCCTGGCTGTTAGGATAGTATTGGACAGTAAGCAATTTTTG AAGGAATGGCCATTTAGTGATGATCCAAATGACAGCTTGTTGAGGTTCATTTGTTGCATT TTGCCTAATTCTAATGGTTTGGAAGCTGTATTTACAAAGGGATATCCCCCAGGAGAGGTG GTTGAAGTTCCGCTACACTCAACAATTGGTGATCTAAAGATAGCAGTTGAGTCTGCAATG AGGGACACTTATTGCATTATGGACAATTTGATGATAACAGATATTGTAGGGATGGAACAA CTGGAAGATTATGAAGTGCTCTTTGGCATCGTCCAGTCTGGCTCAGAACTTTGGGTGAGG GGCTTCGGGTTGGATTTGGACAGCGAGTTGAAAAATGAAGGAGGGTCTGATAACTGGACA GTGAACTGTAGGTGTGGTGCTCGGGATGATGATGGTGAAAGGATGGTTTCATGTGATATA TGTGAGATATGGCAGCATACTCGCTGCTGTGGCATAGAAGATTCTGAGGTTGTGCCACCA TTGTTTGTGTGTGAGGCTTGCTGCACTTCACTTGCACCACCAAGAGCACAGAACAGCTTT GAGTTTGGTCATTATGGGACTGCTGCAGCACTAGTGCCTTGTGCTTCTCACTTTGGCATG GACCTGATATACTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc11g011560.2.1
PEP Infomation	PHD finger protein family (AHRD V3.3 *** A0A151RBP6_CAJCA)
Sequence	MATEKMKKGVSNIYEFHSFLDPGCPITPMGPFRDNIRYFLQECAEVKEYTVEGMPIWCTF LVHKSKGVLIPLYTIEENVKSSVRTFCDHCRCAGWSHHLVSKRKYHLIIPADSEWKKHLD DGVFDDQTHILHGLIHSNGFGHLISLNGIEGGSKYLCGREVMDLWERICTSFRARKITVE DVSRKHMMDLRLLYGVAYGHTWFGRWGYKFSHGSFGIMEHHYEKAIEMLSSIELDQVIDD FRYISRSNVMKQVIACYRGLSNTPLITVRDLFRFILVVKSCNSVKEKPNVTAPVLRACSA RYLIRNAAPNKSVGKEKSVRYRKFSNVAASLDSRWPVRRLEFTADVIVEALREKREAIRF GSCGMSRQEARDAARLHIGDTGLIDYVLKSMNNVIIGGYVVRRAVNRATRVLEYTIQELR NCDQPEQEKLPEPFQDYNVNPGADAYTDVLCLYNNLLLSFAESDELSLAVRIVLDSKQFL KEWPFSDDPNDSLLRFICCILPNSNGLEAVFTKGYPPGEVVEVPLHSTIGDLKIAVESAM RDTYCIMDNLMITDIVGMEQLEDYEVLFGIVQSGSELWVRGFGLDLDSELKNEGGSDNWT VNCRCGARDDDGERMVSCDICEIWQHTRCCGIEDSEVVPPLFVCEACCTSLAPPRAQNSF EFGHYGTAAALVPCASHFGMDLIY*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc11g011560.2.1
Transcript Infomation	PHD finger protein family (AHRD V3.3 *** A0A151RBP6_CAJCA)
Sequence	ATGGCTACAGAGAAGATGAAGAAGGGAGTGTCGAATATCTATGAGTTTCATAGTTTTCTT GATCCGGGATGTCCGATTACGCCAATGGGTCCGTTTCGTGATAATATTCGGTATTTTCTT CAGGAATGTGCTGAGGTTAAGGAGTATACAGTTGAAGGAATGCCAATTTGGTGTACGTTT TTGGTGCATAAGAGTAAAGGTGTGCTGATTCCTCTTTACACCATTGAAGAGAATGTGAAG AGCTCTGTTAGAACTTTCTGTGATCACTGTAGATGTGCTGGTTGGAGTCATCATCTTGTT TCGAAGAGGAAATACCATTTGATTATACCAGCTGATAGTGAATGGAAAAAGCATCTTGAT GATGGTGTTTTTGATGATCAAACACACATTTTGCATGGTTTGATTCATTCTAATGGATTT GGGCATTTGATTTCACTTAATGGAATTGAGGGTGGATCGAAATATCTCTGTGGACGTGAA GTAATGGATCTCTGGGAACGTATTTGCACGAGTTTTCGAGCTCGGAAAATCACTGTTGAA GATGTATCCAGGAAGCATATGATGGATTTGCGCTTGTTGTATGGGGTTGCTTATGGGCAT ACATGGTTTGGCCGGTGGGGTTACAAGTTTAGCCATGGAAGTTTTGGGATAATGGAACAC CACTATGAAAAAGCTATTGAAATGTTAAGCTCAATTGAGCTTGATCAGGTGATTGATGAT TTCAGATACATCAGTAGATCCAATGTTATGAAGCAGGTGATTGCTTGTTATAGAGGTTTG AGCAACACTCCTTTGATCACGGTCCGTGACCTCTTCAGGTTCATCCTTGTTGTCAAGTCC TGCAATTCAGTTAAGGAGAAGCCAAATGTTACTGCTCCTGTTTTACGAGCATGTTCTGCA CGATACTTGATAAGAAATGCTGCACCAAACAAGTCTGTGGGGAAGGAAAAATCAGTGAGG TATAGAAAGTTTTCAAACGTTGCAGCATCTCTTGACAGTAGATGGCCAGTGAGGAGACTT GAGTTCACTGCAGATGTGATTGTTGAGGCGTTGAGAGAAAAAAGAGAAGCAATCAGATTT GGAAGTTGTGGGATGAGTAGGCAAGAGGCGAGGGATGCTGCTCGTCTCCACATTGGCGAT ACAGGATTGATTGACTACGTGCTGAAATCAATGAACAATGTGATTATTGGAGGCTATGTA GTTCGTCGTGCAGTGAACCGAGCCACGAGGGTGTTGGAGTACACGATTCAGGAACTTCGG AATTGTGATCAGCCTGAACAAGAAAAGCTCCCCGAGCCATTTCAGGACTACAATGTTAAT CCTGGAGCTGATGCGTACACTGATGTTCTGTGCTTGTATAATAATCTTCTTTTGAGCTTC GCGGAATCTGATGAGTTAAGCCTGGCTGTTAGGATAGTATTGGACAGTAAGCAATTTTTG AAGGAATGGCCATTTAGTGATGATCCAAATGACAGCTTGTTGAGGTTCATTTGTTGCATT TTGCCTAATTCTAATGGTTTGGAAGCTGTATTTACAAAGGGATATCCCCCAGGAGAGGTG GTTGAAGTTCCGCTACACTCAACAATTGGTGATCTAAAGATAGCAGTTGAGTCTGCAATG AGGGACACTTATTGCATTATGGACAATTTGATGATAACAGATATTGTAGGGATGGAACAA CTGGAAGATTATGAAGTGCTCTTTGGCATCGTCCAGTCTGGCTCAGAACTTTGGGTGAGG GGCTTCGGGTTGGATTTGGACAGCGAGTTGAAAAATGAAGGAGGGTCTGATAACTGGACA GTGAACTGTAGGTGTGGTGCTCGGGATGATGATGGTGAAAGGATGGTTTCATGTGATATA TGTGAGATATGGCAGCATACTCGCTGCTGTGGCATAGAAGATTCTGAGGTTGTGCCACCA TTGTTTGTGTGTGAGGCTTGCTGCACTTCACTTGCACCACCAAGAGCACAGAACAGCTTT GAGTTTGGTCATTATGGGACTGCTGCAGCACTAGTGCCTTGTGCTTCTCACTTTGGCATG GACCTGATATACTGA