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JA

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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc11g011460.2.1

CDS Infomation

ATP-dependent RNA helicase (AHRD V3.3 *** AT5G39840.1)

Sequence

ATGGCAATAAGACCAGCAAGAAATCTTTTTTATCTGTATTTATCCAAGAATAATGTATCA
AAGTTGAGATTTTTATCAGTTTCTAGTGGATTCCTGCATACCCATTTTGCAGAACCAAAA
AAAGTTCAAGATTTTGATGTTTATGGACACAGAATACCAACCCCACCTCAGTTTTCATCT
TTATGGTGTAATCAATGGAAAAAATTGAATCTTTTTCATTTTTATGGACACCCTTTTTCT
ACAGTGGTGGAAAATGGGGATAACGAATTAGAAGTTTGTGATGTGGATGTGGAAGAGAAT
GAGTGTGGAGATGGAGGATTAGGGTCTGAGAAAAGATTGAATTTTGTTCAAATAGCTAGT
CGTGATCCGGTAGAAATATATAGGGAGCTTAGGGATGCTACCAAGTGTGAAAAGCAAACA
CGAGCTGATTGGGATACTTCGATTGAGATATTTAGATGTTTTGCTAAGTCTGGATGGGCT
TCTAATCAGGCGCTAGCTGTGTATATTGGGGCTTCATTTTTTCCTACAGCAGCTCAGAAG
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GGTCCGTGTATTGAATCTGAGAAGTTTCTGTTTCCGATCTTTGTGGAGTTCTGCTTAGAG
GAGTTTCCTGATGAGATTAAGAACTTCCGGAAAATGGTTGAGTCGGCGGATTTGACAAAA
CCTCATACTTGGTTTCCATTTGCCAGGGCGATGAAACGCAAGATCATATATCACTGTGGT
CCCACTAATAGTGGTAAAACATATAATGCATTGCAAAGTTTCATGGAAGCAAAGAAGGGT
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GGGGTATACTGTAGTCTTCTTACAGGGCAGGAGAAGAAGCATGTCCCATTTTCTAATCAC
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GAAATCCAAATGATGGCGGACACACATAGAGGTTATGCATGGACGAGGGCTCTACTAGGA
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GTGGTTGAAGCAAAGACCCTTTTAGGTGATCTCACGAAAGTGAAGTCCGGGGACTGTGTT
GTTGCCTTTTCAAGAAGAGAGATATTTGAAGTAAAATTGGCGATTGAGAAGCATTCTAAT
CACCGTTGTTGTGTAATTTATGGTGCCTTACCACCAGAGACACGACGACAGCAAGCTACC
TTATTTAACGATCCAAACAATGAGTTTGATGTCTTGGTTGCCAGTGACGCAGTCGGAATG
GGTTTAAACCTAAACATTCGGAGAATCATCTTCTATACCTTGTCGAAGTACAACGGTGAC
CGGATTGTTCCTGTTCCTGCATCACAGGTGAAGCAGATTGCTGGAAGAGCTGGTCGAAGA
GGAAGTCGCTATCCTGAAGGACTAGCAACCACTTTGCAGCTGGAGGATTTAGACTACTTA
ATTGAGTGTCTGAAGAAGCCATTTGAAGAAGTTAACAAAGTTGGGCTCTTTCCTTTCTAT
GAGCAGGTGGAGTTATTTGCGGGGCAAATTTGTAACTCTACATTCGCCGAGCTGCTTGAT
AGATTTGGTGAAAATTGCCGTTTGGATGGTTCTTACTTCTTGTGCCAGTATAACCACATA
AAAAAGATAGCTAATATGCTGGAGAAAGTTCAAGGATTATCTCTTGAAGATCGTTTCAAT
TTTTGCTTTGCCCCTGTTAACATTAGAGACCCAAAAGCAATGTACCATCTTCTGAAGTTT
GCTTCATCGTATGCACAAGCACTGCCTGTTAATATAGCAATGGGTATGCCAAATTGTTCT
GCTCGTAATGATTCAGAGCTCTTGGATCTTGAGACTAAGCACCAAGTGTTGTCCATGTAC
ATGTGGTTATCTAATCATTTTGAGGGGGAGAAGTTTCCATATTTCAAAAAGGCCGAGGCA
ATGGCAACAGGGATTGCTGAGTTACTAGGTGAATCACTTGCAAATGCTCGTTGGAAACCA
GAGTCGAGGAATGGGAAACAACAAAAAGTGGTAAAGAAAGACCAAGGAGAAACCAAGGAA
CAGCTTTGTCTCAACACCAGCAGCCACAGAAGATTGCAGCATGATACTGCTGGTTTAGCG
CTTCGTGTCCCATAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc11g011460.2.1

PEP Infomation

ATP-dependent RNA helicase (AHRD V3.3 *** AT5G39840.1)

Sequence

MAIRPARNLFYLYLSKNNVSKLRFLSVSSGFLHTHFAEPKKVQDFDVYGHRIPTPPQFSS
LWCNQWKKLNLFHFYGHPFSTVVENGDNELEVCDVDVEENECGDGGLGSEKRLNFVQIAS
RDPVEIYRELRDATKCEKQTRADWDTSIEIFRCFAKSGWASNQALAVYIGASFFPTAAQK
FRNFFFKKCKVDVVKYLVSLGPCIESEKFLFPIFVEFCLEEFPDEIKNFRKMVESADLTK
PHTWFPFARAMKRKIIYHCGPTNSGKTYNALQSFMEAKKGIYCSPLRLLAMEVFDKVNGL
GVYCSLLTGQEKKHVPFSNHIACTVEMVSTDEMYDVAVIDEIQMMADTHRGYAWTRALLG
LKADEIHVCGDPSVLNIVRKVCSETGDELVEQHYERFKPLVVEAKTLLGDLTKVKSGDCV
VAFSRREIFEVKLAIEKHSNHRCCVIYGALPPETRRQQATLFNDPNNEFDVLVASDAVGM
GLNLNIRRIIFYTLSKYNGDRIVPVPASQVKQIAGRAGRRGSRYPEGLATTLQLEDLDYL
IECLKKPFEEVNKVGLFPFYEQVELFAGQICNSTFAELLDRFGENCRLDGSYFLCQYNHI
KKIANMLEKVQGLSLEDRFNFCFAPVNIRDPKAMYHLLKFASSYAQALPVNIAMGMPNCS
ARNDSELLDLETKHQVLSMYMWLSNHFEGEKFPYFKKAEAMATGIAELLGESLANARWKP
ESRNGKQQKVVKKDQGETKEQLCLNTSSHRRLQHDTAGLALRVP*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc11g011460.2.1

Transcript Infomation

ATP-dependent RNA helicase (AHRD V3.3 *** AT5G39840.1)

Sequence

AAAATAATGTATATATACCTTCAATAACGTATGACAAATAGATTCATATTTAATTCTTAC
CGTCTAACAAATAAAACCTATCTTGTGGAAAAATTTGCCTTACATTTTATATATTTTGAT
TTCTCATTCGATTTTCGATACACATATTGAATTATATTAGCTCTCTCTATCAAAAAAAAT
AAATTATATATTACTCAAATTCGAGACATTTGTTTAAAAAGTATTTGAGTTTTTATTATT
CTTTATAAACCACTTTTTAAATTAGCAAAAAATTTAACCCTACATGCTAAAAATCTGGGA
AAATAATTTTTTCTTTTTCCTGTCCACTGTATTTCAACTTCCTTCGTAGGGTTTTAGTTT
GTGTTCCAACATTCACCACTCTTTCTCCTTTCTTCGAGGTATGCTTAATATTTTTCTACC
TTTGTAATTTTTAGCTTCTGTATTATTTTCTTTGTTTTGCTATATGCATATTACATTCTT
GATGCAATAATCTTTTATCTCCTAAATGGCAATAAGACCAGCAAGAAATCTTTTTTATCT
GTATTTATCCAAGAATAATGTATCAAAGTTGAGATTTTTATCAGTTTCTAGTGGATTCCT
GCATACCCATTTTGCAGAACCAAAAAAAGTTCAAGATTTTGATGTTTATGGACACAGAAT
ACCAACCCCACCTCAGTTTTCATCTTTATGGTGTAATCAATGGAAAAAATTGAATCTTTT
TCATTTTTATGGACACCCTTTTTCTACAGTGGTGGAAAATGGGGATAACGAATTAGAAGT
TTGTGATGTGGATGTGGAAGAGAATGAGTGTGGAGATGGAGGATTAGGGTCTGAGAAAAG
ATTGAATTTTGTTCAAATAGCTAGTCGTGATCCGGTAGAAATATATAGGGAGCTTAGGGA
TGCTACCAAGTGTGAAAAGCAAACACGAGCTGATTGGGATACTTCGATTGAGATATTTAG
ATGTTTTGCTAAGTCTGGATGGGCTTCTAATCAGGCGCTAGCTGTGTATATTGGGGCTTC
ATTTTTTCCTACAGCAGCTCAGAAGTTCCGAAATTTTTTCTTTAAAAAGTGTAAGGTTGA
TGTTGTGAAGTACTTAGTGTCACTTGGTCCGTGTATTGAATCTGAGAAGTTTCTGTTTCC
GATCTTTGTGGAGTTCTGCTTAGAGGAGTTTCCTGATGAGATTAAGAACTTCCGGAAAAT
GGTTGAGTCGGCGGATTTGACAAAACCTCATACTTGGTTTCCATTTGCCAGGGCGATGAA
ACGCAAGATCATATATCACTGTGGTCCCACTAATAGTGGTAAAACATATAATGCATTGCA
AAGTTTCATGGAAGCAAAGAAGGGTATATATTGTAGTCCTCTAAGATTGTTGGCTATGGA
AGTTTTCGATAAAGTGAATGGATTAGGGGTATACTGTAGTCTTCTTACAGGGCAGGAGAA
GAAGCATGTCCCATTTTCTAATCACATTGCTTGCACGGTTGAGATGGTTTCGACTGATGA
GATGTATGATGTAGCAGTTATTGATGAAATCCAAATGATGGCGGACACACATAGAGGTTA
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AAGTGTTTTGAATATTGTTCGCAAAGTCTGTTCTGAAACTGGGGATGAGTTGGTAGAACA
GCATTATGAGAGGTTTAAGCCATTGGTGGTTGAAGCAAAGACCCTTTTAGGTGATCTCAC
GAAAGTGAAGTCCGGGGACTGTGTTGTTGCCTTTTCAAGAAGAGAGATATTTGAAGTAAA
ATTGGCGATTGAGAAGCATTCTAATCACCGTTGTTGTGTAATTTATGGTGCCTTACCACC
AGAGACACGACGACAGCAAGCTACCTTATTTAACGATCCAAACAATGAGTTTGATGTCTT
GGTTGCCAGTGACGCAGTCGGAATGGGTTTAAACCTAAACATTCGGAGAATCATCTTCTA
TACCTTGTCGAAGTACAACGGTGACCGGATTGTTCCTGTTCCTGCATCACAGGTGAAGCA
GATTGCTGGAAGAGCTGGTCGAAGAGGAAGTCGCTATCCTGAAGGACTAGCAACCACTTT
GCAGCTGGAGGATTTAGACTACTTAATTGAGTGTCTGAAGAAGCCATTTGAAGAAGTTAA
CAAAGTTGGGCTCTTTCCTTTCTATGAGCAGGTGGAGTTATTTGCGGGGCAAATTTGTAA
CTCTACATTCGCCGAGCTGCTTGATAGATTTGGTGAAAATTGCCGTTTGGATGGTTCTTA
CTTCTTGTGCCAGTATAACCACATAAAAAAGATAGCTAATATGCTGGAGAAAGTTCAAGG
ATTATCTCTTGAAGATCGTTTCAATTTTTGCTTTGCCCCTGTTAACATTAGAGACCCAAA
AGCAATGTACCATCTTCTGAAGTTTGCTTCATCGTATGCACAAGCACTGCCTGTTAATAT
AGCAATGGGTATGCCAAATTGTTCTGCTCGTAATGATTCAGAGCTCTTGGATCTTGAGAC
TAAGCACCAAGTGTTGTCCATGTACATGTGGTTATCTAATCATTTTGAGGGGGAGAAGTT
TCCATATTTCAAAAAGGCCGAGGCAATGGCAACAGGGATTGCTGAGTTACTAGGTGAATC
ACTTGCAAATGCTCGTTGGAAACCAGAGTCGAGGAATGGGAAACAACAAAAAGTGGTAAA
GAAAGACCAAGGAGAAACCAAGGAACAGCTTTGTCTCAACACCAGCAGCCACAGAAGATT
GCAGCATGATACTGCTGGTTTAGCGCTTCGTGTCCCATAGACTAATACGGGCGTCCAAGC
AAAGCAGGAAGTCTTGTACAGCTCCCAGATACAGCAGACTAGAATTAGAATCATAACCAG
GAAGAAGAGGCAAGTTTCATCCAAATGTTATCGTGTTTAGGTCCTTTTGGAGGATGCATA
ATTTTTGTCCTTGAACTCGCTCATGTTTAGTCTTGATGCATCATGTTTATTAAAGGATTG
AAAGATTCAGAAGAAAAGTTATCGGTGCTGATTGTTGGCTTCACTTGTACTAGACTGACC
TGTTCAATCATAAACTACAGGAGTGAAGCTGGAGACTTGACGACTATAAGAGTTTGTGAT
TCCAACACATAGAAGCTGCGTCAAAATCTAGCAACATCAAGCAAGAGATAGATT