Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc11g008970.1.1
CDS Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103Y632_CYNCS)
Sequence	ATGTTAAGAACTAAACTTCAAAATCTTCACCACAAAATCAACACATTCTTCTCCATTAAT GGCTTTTCTTCAAACCTCAAATCCCTTCTTCAATCTCACGCCTTCATAATCACAACTGGC CATACCCAGAACGTGTACATAGCAGCAAAGCTCATCTCTCTTTATGCTTCGAACAATGAC CTCATTTCTTCAAGGAAAGTGTTTGATTTCATCAATTTTAAAGACCCTTTTCTTTGGAAT TCGATTATCAAAGCTTATTTTTCTAACGGGAAATACACAGAATCGCTTGAGTTTTACTCC GGTATGCGGTGTTTTAATGCTCTGCCTAATCAGTTTACGATACCAATGGTTGTTTCTGCT TGTGCGGAACTTGGGTTGGTTGAAATTGGGATGGGGGTTCATGGGTTGGTGTTAAAATTG AATCTTTTTGATGGTAATAGTGCTGTTGGAGCTTCGTTGGTATATATGTACTCGAAATGT GGGGTTATGGGGTATGCGTGTGATGTGTTTGATGAAATGCCTGTGAGAGATGTTGTCTCT TGGACTGCGATTATAAAAGGGTGTGTAGAGAATGGAGAGAGTGGTAAAGGGTTGGAGTAT TTTTGTTTGATGTGTAAGAATGGAGAAGGTGAGGTGAGGCCGAATTTTCGCACTTTGGAA GGTGGATTTCAAGCTTGTGGGAATTTAGGTGCATTGGTAGAAGGTAAGTGTTTTCATGGG TTGGGTATGAAAACTGGTTTTGGTTATCATCAAGTTGTTCAGTCTTCTGTTTTGTTAATG TACTCGAAATGTGGTTCGGTTGAAGAAACATATCGTTCGTTTTGTGAGGTCGATGAGAAG GATTTGTTTTCCTGGACGGTAGTAATTGGCGTTTATGCAAAATATGAGTGTATAGGTGAA TGTGTTGATATGTTCTTGAGAATGCTGGCTAGTGGGATTACCCCGGATGGGATGGTAATT AGTTGTGTGCTTTCTGGTTTAGGTAATGTCGCGATGATTTTGGAAGCTAAGACTTTCCAT GGATTCATCTTGAGAAGAAACTACGATGAGGATCACATGGTTGGTAACGCATTACTGGCC ATGTATTGCAAGCTTAGACTCTTGAATTTGGCAGAAAAGATATTTAATGGAGGGAATGAA CAAAACACAGAGGCTTGGAACGTGATGACGATTGGCTATTGGAAGGCCGGATTAGAAGCC AACTGCATTGATTTATTCAGAGATATGCAATACTTGGGAATGGAATCTGATGTCAACAGC CTGATATCTGTGATTTCTTCTTGCTCTCGGTTGGAAAAATTCCGTTTAGGTGAATCTCTG CATTGTCATATTATAAAAAACCTGATGCTTGGAAATGTTTCTGTTGCCAATTCTCTAATA GATATGTATGGAAGAAGAAAGAATCTTACTTTATCATGGAGAGTCTTTTGTATGATGACC GATAAGGATGTTGTTACGTGGAACACAATGATGACTTCCTATATTAGTTGTGGAAACATT GCGGAGGCTTTTGGTCTTTTTGATGAGATGAGAGCAGAAAGTTACAAGCCTAATATTGCA ACGCTGGTGATTTTGCTCTCCGCTTCTTCTCAAGTGTCTTCCCTGGAGAAAGGAGAGAAA GTTCATCAATACATCAAGGAAGTTGGGTTCGGAAATAATACTTTGCTTGATACTGCATTG ACTGATATGTACGCAAAATGTGGACAGCTAACAAAGTCCAGAGAAATATTTGATTCAATG GAAAAGAAAGACATCGTTTCTTGGAACGTACTGATATCAGGCTATGCTATGTATGGAGAA GCAAATGATGCTATAGAAATGTTCAAAAACATGGAACAGACGGAAATTAAGCCGAATGAA CTTACTTTTCTTGCTGTGCTCTCAGCGTGTGCTCATGCAGGGCTGGTTGAAGAAGGAAAG TCCATATTTAGTCGAATGAAAGATTATTCGTTGATGCCCACACTGAAGCACTATTCTTGT ATGGTTGATCTTCTTGGTCGTTCTGGTAATCTGGATGACGCTGAAACTTTGGTTTTGTCC ATGCCAATAGCTCGAGATGCAGCTATCTGGGGTTCTTTACTAAGTTCTTGTAAACTTCAC AGTCAGGTTGAGAAGGGTATAAGAATCGCAAAACATGCTATTGAGTCTGATCCGGAAAAT GATGGGTACTACATCTCAATCTCAGACCTATATAGTTGTGTAGGAATGTGGGAAGAGGTA GAAATGGTGAGGAAAATAATGAAAGACAGGAAAGTGAGGAAAGAAGTTGGCTGGAGTACT GTATAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc11g008970.1.1
PEP Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103Y632_CYNCS)
Sequence	MLRTKLQNLHHKINTFFSINGFSSNLKSLLQSHAFIITTGHTQNVYIAAKLISLYASNND LISSRKVFDFINFKDPFLWNSIIKAYFSNGKYTESLEFYSGMRCFNALPNQFTIPMVVSA CAELGLVEIGMGVHGLVLKLNLFDGNSAVGASLVYMYSKCGVMGYACDVFDEMPVRDVVS WTAIIKGCVENGESGKGLEYFCLMCKNGEGEVRPNFRTLEGGFQACGNLGALVEGKCFHG LGMKTGFGYHQVVQSSVLLMYSKCGSVEETYRSFCEVDEKDLFSWTVVIGVYAKYECIGE CVDMFLRMLASGITPDGMVISCVLSGLGNVAMILEAKTFHGFILRRNYDEDHMVGNALLA MYCKLRLLNLAEKIFNGGNEQNTEAWNVMTIGYWKAGLEANCIDLFRDMQYLGMESDVNS LISVISSCSRLEKFRLGESLHCHIIKNLMLGNVSVANSLIDMYGRRKNLTLSWRVFCMMT DKDVVTWNTMMTSYISCGNIAEAFGLFDEMRAESYKPNIATLVILLSASSQVSSLEKGEK VHQYIKEVGFGNNTLLDTALTDMYAKCGQLTKSREIFDSMEKKDIVSWNVLISGYAMYGE ANDAIEMFKNMEQTEIKPNELTFLAVLSACAHAGLVEEGKSIFSRMKDYSLMPTLKHYSC MVDLLGRSGNLDDAETLVLSMPIARDAAIWGSLLSSCKLHSQVEKGIRIAKHAIESDPEN DGYYISISDLYSCVGMWEEVEMVRKIMKDRKVRKEVGWSTV*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc11g008970.1.1
Transcript Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103Y632_CYNCS)
Sequence	ATGTTAAGAACTAAACTTCAAAATCTTCACCACAAAATCAACACATTCTTCTCCATTAAT GGCTTTTCTTCAAACCTCAAATCCCTTCTTCAATCTCACGCCTTCATAATCACAACTGGC CATACCCAGAACGTGTACATAGCAGCAAAGCTCATCTCTCTTTATGCTTCGAACAATGAC CTCATTTCTTCAAGGAAAGTGTTTGATTTCATCAATTTTAAAGACCCTTTTCTTTGGAAT TCGATTATCAAAGCTTATTTTTCTAACGGGAAATACACAGAATCGCTTGAGTTTTACTCC GGTATGCGGTGTTTTAATGCTCTGCCTAATCAGTTTACGATACCAATGGTTGTTTCTGCT TGTGCGGAACTTGGGTTGGTTGAAATTGGGATGGGGGTTCATGGGTTGGTGTTAAAATTG AATCTTTTTGATGGTAATAGTGCTGTTGGAGCTTCGTTGGTATATATGTACTCGAAATGT GGGGTTATGGGGTATGCGTGTGATGTGTTTGATGAAATGCCTGTGAGAGATGTTGTCTCT TGGACTGCGATTATAAAAGGGTGTGTAGAGAATGGAGAGAGTGGTAAAGGGTTGGAGTAT TTTTGTTTGATGTGTAAGAATGGAGAAGGTGAGGTGAGGCCGAATTTTCGCACTTTGGAA GGTGGATTTCAAGCTTGTGGGAATTTAGGTGCATTGGTAGAAGGTAAGTGTTTTCATGGG TTGGGTATGAAAACTGGTTTTGGTTATCATCAAGTTGTTCAGTCTTCTGTTTTGTTAATG TACTCGAAATGTGGTTCGGTTGAAGAAACATATCGTTCGTTTTGTGAGGTCGATGAGAAG GATTTGTTTTCCTGGACGGTAGTAATTGGCGTTTATGCAAAATATGAGTGTATAGGTGAA TGTGTTGATATGTTCTTGAGAATGCTGGCTAGTGGGATTACCCCGGATGGGATGGTAATT AGTTGTGTGCTTTCTGGTTTAGGTAATGTCGCGATGATTTTGGAAGCTAAGACTTTCCAT GGATTCATCTTGAGAAGAAACTACGATGAGGATCACATGGTTGGTAACGCATTACTGGCC ATGTATTGCAAGCTTAGACTCTTGAATTTGGCAGAAAAGATATTTAATGGAGGGAATGAA CAAAACACAGAGGCTTGGAACGTGATGACGATTGGCTATTGGAAGGCCGGATTAGAAGCC AACTGCATTGATTTATTCAGAGATATGCAATACTTGGGAATGGAATCTGATGTCAACAGC CTGATATCTGTGATTTCTTCTTGCTCTCGGTTGGAAAAATTCCGTTTAGGTGAATCTCTG CATTGTCATATTATAAAAAACCTGATGCTTGGAAATGTTTCTGTTGCCAATTCTCTAATA GATATGTATGGAAGAAGAAAGAATCTTACTTTATCATGGAGAGTCTTTTGTATGATGACC GATAAGGATGTTGTTACGTGGAACACAATGATGACTTCCTATATTAGTTGTGGAAACATT GCGGAGGCTTTTGGTCTTTTTGATGAGATGAGAGCAGAAAGTTACAAGCCTAATATTGCA ACGCTGGTGATTTTGCTCTCCGCTTCTTCTCAAGTGTCTTCCCTGGAGAAAGGAGAGAAA GTTCATCAATACATCAAGGAAGTTGGGTTCGGAAATAATACTTTGCTTGATACTGCATTG ACTGATATGTACGCAAAATGTGGACAGCTAACAAAGTCCAGAGAAATATTTGATTCAATG GAAAAGAAAGACATCGTTTCTTGGAACGTACTGATATCAGGCTATGCTATGTATGGAGAA GCAAATGATGCTATAGAAATGTTCAAAAACATGGAACAGACGGAAATTAAGCCGAATGAA CTTACTTTTCTTGCTGTGCTCTCAGCGTGTGCTCATGCAGGGCTGGTTGAAGAAGGAAAG TCCATATTTAGTCGAATGAAAGATTATTCGTTGATGCCCACACTGAAGCACTATTCTTGT ATGGTTGATCTTCTTGGTCGTTCTGGTAATCTGGATGACGCTGAAACTTTGGTTTTGTCC ATGCCAATAGCTCGAGATGCAGCTATCTGGGGTTCTTTACTAAGTTCTTGTAAACTTCAC AGTCAGGTTGAGAAGGGTATAAGAATCGCAAAACATGCTATTGAGTCTGATCCGGAAAAT GATGGGTACTACATCTCAATCTCAGACCTATATAGTTGTGTAGGAATGTGGGAAGAGGTA GAAATGGTGAGGAAAATAATGAAAGACAGGAAAGTGAGGAAAGAAGTTGGCTGGAGTACT GTATAG