Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc11g008860.2.1
CDS Infomation

L-ascorbate oxidase homolog (AHRD V3.3 *** ASOL_TOBAC)
Sequence

ATGGTCCTCGCGGGTGATTGGTACACCAAGAGCCACGTCGAATTGAAAAGGATGTTGGAC
AGTGGACGTGCTCTTGGTAGGCCAACGGGCGTTCTTATAAATGGTAAGAGTGGTAAAGGT
GATGGTAAAGACGAGCCGATGTTTACTGTGATCGCTGGAAAGACGTATAGGTTTAGGTTT
TGTAATGTTGGAATGAAGGATTCTATTAACGTAAGGATGCAAGGACACACAATGAAGCTT
GTGGAGATTGAAGGTTCACACACAGTGCAAAATGTGTATGAGTCTATTGATATCCATTTG
GGACAATGCTTCTCTGTTTTGGTTACTGCTAACCAGGAACCAAAAGACTATTACCTCGTG
GTGTCCACGAGGTTCACTAAAGACTCACATGTGGCCACAGCCACTATCCGTTACGCTAAT
GGTAAGGGCCCCGCCTCACCTGAGTTGCCTAAGGCACCCGAAGGGTGGGCGTGGTCCCTT
AACCAGTTCCGTTCATTCCGTTGGAATTTGACAGCTAGTGCAGCTAGACCTAACCCTCAG
GGATCTTACCACTATGGTCAAATCAACATCACCCGAACCATTAAGCTAGTCACATCAGCT
GGACAAGTTGATGGTAAACTACGTTACGCGTTGAACGGTGTGTCCCATGTGGACACCGCG
ACCCCAATCAAGTTGGCTGAGTATTATGGTGCAGGGGACAAGGTGTTCAAGTATAATCTG
ATCAAGGATGAATATGAACCTAATCCAGGACAAGATAAGATCACAGTTGCACCTAATGTG
GTCAATGCCACTTACCGCAACTATGTTGAGATAGTCATTGAGAATCATGGCAAAACTGTT
CAATCATGGCATTTGTCAGGACACTCATTCTTTGCTGTTGGAATCGAACCAGGGAGGTGG
GCCCCAGAGAGGAGAAAGAACTACAACTTGCTTGATGCTGTGAGTAGAAACACAATCCAA
GTTTACCCAAAATCATTTGCAGTTATAATGACAACACTTGACAATGCTGGATTATGGAAT
TTAAGATCAAATTCATTGGAGAGAAATTATTTGGGACATCAATTATATTTCAGTGTCCTT
TCTCCAAATAAATCAATTAAAGATGAGTACAACATGCCTGATAATGATTTATTATGTGGC
ATAGTTAAGGATATGCCAAAACCTACTCCTTACAAAGCTAATTAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc11g008860.2.1
PEP Infomation

L-ascorbate oxidase homolog (AHRD V3.3 *** ASOL_TOBAC)
Sequence

MVLAGDWYTKSHVELKRMLDSGRALGRPTGVLINGKSGKGDGKDEPMFTVIAGKTYRFRF
CNVGMKDSINVRMQGHTMKLVEIEGSHTVQNVYESIDIHLGQCFSVLVTANQEPKDYYLV
VSTRFTKDSHVATATIRYANGKGPASPELPKAPEGWAWSLNQFRSFRWNLTASAARPNPQ
GSYHYGQINITRTIKLVTSAGQVDGKLRYALNGVSHVDTATPIKLAEYYGAGDKVFKYNL
IKDEYEPNPGQDKITVAPNVVNATYRNYVEIVIENHGKTVQSWHLSGHSFFAVGIEPGRW
APERRKNYNLLDAVSRNTIQVYPKSFAVIMTTLDNAGLWNLRSNSLERNYLGHQLYFSVL
SPNKSIKDEYNMPDNDLLCGIVKDMPKPTPYKAN*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc11g008860.2.1
Transcript Infomation

L-ascorbate oxidase homolog (AHRD V3.3 *** ASOL_TOBAC)
Sequence

GTTAAATTATGTTTTAACATAAAAATATATTCTTTGACTAGTCAAATTGAAAGATAAAAT
AAAAAACCTACACTATGAATCAAGAGGGCAAAGAATATAATATATATTGTTGAAAAAAAA
TAAATGTAGTTATAAATTTTCAATAGTTTTTTTTTCTTCGATTTGATTTGACTATTTAAT
TATTATTTTTTGAATCATAGAGAAATTAAAGGAAGACCAAAACAACCGGAGATAATAAAA
AACCAAAAGAAAAACGTTATTTACGGAGAAAAAAAGGTCAATTTGAATGGCTATTACCTT
TATTTTTTACAATATAAATAGATCAAATTCATTATCAAAACATCATCATCCTTTCCTTTC
TATGTTGTAATAAATAATAATTTCCTTTTTTTTTCTCTCTCGGGTTCTCTTTTTGGTTTT
TTCGATTCGATCAAAACAAAGTTTTAAAGAATCGAAAAACCATAAGAAACACGAGAGAAA
AAAGTATAAAAAGAAAAAAAAAATGAATAAAAAGTTGGGTTGTGTGCTATCAATTTTGTT
AGCAATAACCTTGACCATTTCAGTAAATGGAGAGGATCCTTATTTGTTTCATGAATGGAA
AGTTACCTATGGCACCCTTTCTCCACTTGGTGTACCTCAAAAAGTCATATTAATCAATGG
TCAATTCCCTGGCCCTAGAATCAATGGAACTTCAAATAACAATGTTGTTGTCAATGTGTT
CAATCAATTAGATGAACCACTTTTACTCACATGGAGTGGTATCCAACAAAGGAAAAACTC
ATGGCAAGAAGGAACCCTAGGTAACAATTGCCCCATCCCTCCCGGTGCTAATTTCACTTA
TCGTTTCCAAGTCAAGGATCAAATCGGTAGTTACTATTACTACCCTACCACAAGCACCCA
TCGCGCTGCTGGTGGTTATGGTGGTATTAGTGTACTTAGTCGCGCTTTGATCCCTGTACC
ATTCGAGACCCCTGAGGCTGACCATATGGTCCTCGCGGGTGATTGGTACACCAAGAGCCA
CGTCGAATTGAAAAGGATGTTGGACAGTGGACGTGCTCTTGGTAGGCCAACGGGCGTTCT
TATAAATGGTAAGAGTGGTAAAGGTGATGGTAAAGACGAGCCGATGTTTACTGTGATCGC
TGGAAAGACGTATAGGTTTAGGTTTTGTAATGTTGGAATGAAGGATTCTATTAACGTAAG
GATGCAAGGACACACAATGAAGCTTGTGGAGATTGAAGGTTCACACACAGTGCAAAATGT
GTATGAGTCTATTGATATCCATTTGGGACAATGCTTCTCTGTTTTGGTTACTGCTAACCA
GGAACCAAAAGACTATTACCTCGTGGTGTCCACGAGGTTCACTAAAGACTCACATGTGGC
CACAGCCACTATCCGTTACGCTAATGGTAAGGGCCCCGCCTCACCTGAGTTGCCTAAGGC
ACCCGAAGGGTGGGCGTGGTCCCTTAACCAGTTCCGTTCATTCCGTTGGAATTTGACAGC
TAGTGCAGCTAGACCTAACCCTCAGGGATCTTACCACTATGGTCAAATCAACATCACCCG
AACCATTAAGCTAGTCACATCAGCTGGACAAGTTGATGGTAAACTACGTTACGCGTTGAA
CGGTGTGTCCCATGTGGACACCGCGACCCCAATCAAGTTGGCTGAGTATTATGGTGCAGG
GGACAAGGTGTTCAAGTATAATCTGATCAAGGATGAATATGAACCTAATCCAGGACAAGA
TAAGATCACAGTTGCACCTAATGTGGTCAATGCCACTTACCGCAACTATGTTGAGATAGT
CATTGAGAATCATGGCAAAACTGTTCAATCATGGCATTTGTCAGGACACTCATTCTTTGC
TGTTGGAATCGAACCAGGGAGGTGGGCCCCAGAGAGGAGAAAGAACTACAACTTGCTTGA
TGCTGTGAGTAGAAACACAATCCAAGTTTACCCAAAATCATTTGCAGTTATAATGACAAC
ACTTGACAATGCTGGATTATGGAATTTAAGATCAAATTCATTGGAGAGAAATTATTTGGG
ACATCAATTATATTTCAGTGTCCTTTCTCCAAATAAATCAATTAAAGATGAGTACAACAT
GCCTGATAATGATTTATTATGTGGCATAGTTAAGGATATGCCAAAACCTACTCCTTACAA
AGCTAATTAAAAGAACAAAATTATTTTATTCTTTTTTTTTTCTCATTATTTTGTGAATTT
TATACATTTTTGAGCCAAGAAAAAAAAAAAAAAGCTAAGGAGGAGATAAAGTATACAAAG
GGGGTCAAGCTTTTTTCAACAAGTGGAACAGTAAGTTTTTTTTTTTTG