Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc11g008200.1.1
CDS Infomation	LOW QUALITY:Major facilitator superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT2G39210.1)
Sequence	ATGACGATGAACTTATCTATCCGAGTCCTCGTGAGCCGATGGTTCATGGTGTTTGGAACC ATGTTGATCCTATCAGCCGCGGGTGCCACCTACATGTTCGGTCTATACTCCGGTGACATA AAATCTTCCTTAGGATATGACCAAACTACCCTCAATCTACTAAGTTTTTTCAAAGATTTA GGGTCAAATGTTGGTATTTTATCAGGTTTAATCAATGAAATTTCACCCCCTTGGGTTGTT CTTTCAATTGGTGCTATATTAAATTTCTTTGGTTATTTTATGATATGGATGGCCGTTACC AAAAAAATGTCAACAAAAGTTTGGTTAATGTGTTTATATATTTGTATTGGTGGTAATTCA CAATCTTTTGCTAATACTGGTGCACTTGTGACATGTGTTAAAAATTTTCCAGAGTCACGT GGTGCTGTTCTTGGATTACTCAAAGGTTTTGTTGGTTTAAGTGGTGCAATTATAACACAA ATTTATCATGCAATTTATGGTAATGATTCTAAGTCATTAATTTTACTTATTGGTTGGTTG CCAGCTGTTATTTCTCTAGTATTTTTACGTACCATAAGGATTATACAAGTCGTTCGAATC ACACACGAACTTAAAGTGTTTTATAGGTTTTTATATATGTCGCTTGTTCTAGCTGGATAT CTCATGGTGATTATCATACTTCAAAAGAAATTTAATTTCACACAGATGGAGTACGGTTTG AGTGCAGCTCTAGTGGTATTCTTGCTTTTCCTACCACTTGGTTTGGTTATAAAAGAGGAA ATCAATTCATGGAACGCGAAGAAATTAGCCTTGGATAGTATTTCCAAGGTCAAAGTTGTA ACTGAAAACCCTAAAAGTGAGGGTCCTCAATTACCACTGCCAGCACCAGCACCAGCAGCA GCATCGGTTATTACTGACACGACTTTTGAGAAACAAGATTTGGATGGTATTGTTGAGGGG AAGTCAAAAAGTAGTTTTGATGTTGACTTCAAAGATTCAGAAGTTTCGATTTCTTGCTGG AAGACGGTTTTTCAACCGCCAGCTCGGGGCGAAGACTTTACTATACTCCAAGCTCTATTC AGTCTAGACATGTTGATACTATTTGTTGCTACAATTTGTGGAGTTGGAGGGACATTAACA GCTATAGACAACTTAGGTCAAATTGGGACATCACTAGGGTACCCTAAAAAAAGTATTAGT ACATTTGTGTCCTTAGTAAGTATATGGAATTATTTAGGTAGAGTAGTGGCTGGTTTTTTA TCTGAATATTTTTTGAAAAAATACAAATTTCCAAGACCTTTAGCCCTAACCATAACACTA ATAGTCTCATGCATAGGACACATTTTAATTGCATTTAATGTGCCTAGTGGACTATATATT GCATCTATAATTATTGGATTTTGTTTTGGTGCACAATGGCCATTACTTTTTGCAATAATT TCTGAACTTTTTGGACTAAAATACTACTCAACATTATATAATTTTGGGTCAGTAGCAAGT CCAATTGGTTCATATGTGCTTAATGTAAGAGTGGCTGGTTATTTATATGATAAAGAGGCA GAAAAACAATTGAAGATATTGAGAAGAATAAGAAGAGAAGGTGAAGATTTGAATTGTGAT GGAGTTGAGTGTTTTAAATTAGCTTTTATTATTATAACATTAGTTACTATTTTTGGGGCT TTTATTTCAATTATTTTAGTGATTAGGACTAGGAAGTTTTATAAGAGTGATATTTATAAG AAATTTAGAGAAGAAGCTAATAAGAATCTTGAGATGGAAATGACATTGGGACAAAATAGT ACTAGTAAGGGGTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc11g008200.1.1
PEP Infomation	LOW QUALITY:Major facilitator superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT2G39210.1)
Sequence	MTMNLSIRVLVSRWFMVFGTMLILSAAGATYMFGLYSGDIKSSLGYDQTTLNLLSFFKDL GSNVGILSGLINEISPPWVVLSIGAILNFFGYFMIWMAVTKKMSTKVWLMCLYICIGGNS QSFANTGALVTCVKNFPESRGAVLGLLKGFVGLSGAIITQIYHAIYGNDSKSLILLIGWL PAVISLVFLRTIRIIQVVRITHELKVFYRFLYMSLVLAGYLMVIIILQKKFNFTQMEYGL SAALVVFLLFLPLGLVIKEEINSWNAKKLALDSISKVKVVTENPKSEGPQLPLPAPAPAA ASVITDTTFEKQDLDGIVEGKSKSSFDVDFKDSEVSISCWKTVFQPPARGEDFTILQALF SLDMLILFVATICGVGGTLTAIDNLGQIGTSLGYPKKSISTFVSLVSIWNYLGRVVAGFL SEYFLKKYKFPRPLALTITLIVSCIGHILIAFNVPSGLYIASIIIGFCFGAQWPLLFAII SELFGLKYYSTLYNFGSVASPIGSYVLNVRVAGYLYDKEAEKQLKILRRIRREGEDLNCD GVECFKLAFIIITLVTIFGAFISIILVIRTRKFYKSDIYKKFREEANKNLEMEMTLGQNS TSKG*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc11g008200.1.1
Transcript Infomation	LOW QUALITY:Major facilitator superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT2G39210.1)
Sequence	ATGACGATGAACTTATCTATCCGAGTCCTCGTGAGCCGATGGTTCATGGTGTTTGGAACC ATGTTGATCCTATCAGCCGCGGGTGCCACCTACATGTTCGGTCTATACTCCGGTGACATA AAATCTTCCTTAGGATATGACCAAACTACCCTCAATCTACTAAGTTTTTTCAAAGATTTA GGGTCAAATGTTGGTATTTTATCAGGTTTAATCAATGAAATTTCACCCCCTTGGGTTGTT CTTTCAATTGGTGCTATATTAAATTTCTTTGGTTATTTTATGATATGGATGGCCGTTACC AAAAAAATGTCAACAAAAGTTTGGTTAATGTGTTTATATATTTGTATTGGTGGTAATTCA CAATCTTTTGCTAATACTGGTGCACTTGTGACATGTGTTAAAAATTTTCCAGAGTCACGT GGTGCTGTTCTTGGATTACTCAAAGGTTTTGTTGGTTTAAGTGGTGCAATTATAACACAA ATTTATCATGCAATTTATGGTAATGATTCTAAGTCATTAATTTTACTTATTGGTTGGTTG CCAGCTGTTATTTCTCTAGTATTTTTACGTACCATAAGGATTATACAAGTCGTTCGAATC ACACACGAACTTAAAGTGTTTTATAGGTTTTTATATATGTCGCTTGTTCTAGCTGGATAT CTCATGGTGATTATCATACTTCAAAAGAAATTTAATTTCACACAGATGGAGTACGGTTTG AGTGCAGCTCTAGTGGTATTCTTGCTTTTCCTACCACTTGGTTTGGTTATAAAAGAGGAA ATCAATTCATGGAACGCGAAGAAATTAGCCTTGGATAGTATTTCCAAGGTCAAAGTTGTA ACTGAAAACCCTAAAAGTGAGGGTCCTCAATTACCACTGCCAGCACCAGCACCAGCAGCA GCATCGGTTATTACTGACACGACTTTTGAGAAACAAGATTTGGATGGTATTGTTGAGGGG AAGTCAAAAAGTAGTTTTGATGTTGACTTCAAAGATTCAGAAGTTTCGATTTCTTGCTGG AAGACGGTTTTTCAACCGCCAGCTCGGGGCGAAGACTTTACTATACTCCAAGCTCTATTC AGTCTAGACATGTTGATACTATTTGTTGCTACAATTTGTGGAGTTGGAGGGACATTAACA GCTATAGACAACTTAGGTCAAATTGGGACATCACTAGGGTACCCTAAAAAAAGTATTAGT ACATTTGTGTCCTTAGTAAGTATATGGAATTATTTAGGTAGAGTAGTGGCTGGTTTTTTA TCTGAATATTTTTTGAAAAAATACAAATTTCCAAGACCTTTAGCCCTAACCATAACACTA ATAGTCTCATGCATAGGACACATTTTAATTGCATTTAATGTGCCTAGTGGACTATATATT GCATCTATAATTATTGGATTTTGTTTTGGTGCACAATGGCCATTACTTTTTGCAATAATT TCTGAACTTTTTGGACTAAAATACTACTCAACATTATATAATTTTGGGTCAGTAGCAAGT CCAATTGGTTCATATGTGCTTAATGTAAGAGTGGCTGGTTATTTATATGATAAAGAGGCA GAAAAACAATTGAAGATATTGAGAAGAATAAGAAGAGAAGGTGAAGATTTGAATTGTGAT GGAGTTGAGTGTTTTAAATTAGCTTTTATTATTATAACATTAGTTACTATTTTTGGGGCT TTTATTTCAATTATTTTAGTGATTAGGACTAGGAAGTTTTATAAGAGTGATATTTATAAG AAATTTAGAGAAGAAGCTAATAAGAATCTTGAGATGGAAATGACATTGGGACAAAATAGT ACTAGTAAGGGGTAG