Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc11g007270.2.1
CDS Infomation	Alkaline/neutral invertase (AHRD V3.3 *** A0A0X8AZR5_CAMSI)
Sequence	ATGGCCACCTCTGAAGCATTTCTGCAAGTTTTAGGTGGTTCACTACCTAGTCTTTTTGGA TCTGATGATTCCTTTAGGAAATTGGGATCGTCACATACCTCCAGATCCTTCATAAGAATC AGAAAGAAGAGGGGTCCAATATGTGTGAACTTCCTCAACTGTTCACACATATCATACCGT GCTATTAGGGTAGATTGCTTTCAGAGCACCAGACAATGTGTGCATGGAGATATTGGTCAT TCCAATTTACGATCTGTGAACTGCAAATGCCAGCAAGCTGACAGTGCGAGTAGTTTTGCA TCAGAAAAGGGAAATGGGTCATGGACTATTGACAATGACCAGAGCTTCGATACAGTTCAT GGTAATACACCAAGTGTAATGCAGTTTGAGACAGTAAGAGAGCTTAAAGTAGGAGAGGAG AACTTTCAATCCAATGGGAGTTTACCTCCAAATGGCTTAGTGGAAGATACCTTGAATAGA ATAGCTGGAAACTCTATCGAAGATGAAGCATGGGAACTACTACGAGAATCTATGGTTTAT TATTGTGGTAGTCCTGTCGGAACAATTGCTGCTAAGGACCCAACTAGTTCCACCGCCGAT GTTCTAAACTATGATCAAGTCTTTATCCGTGACTTTATACCTTCTGGTATTGCTTTCCTT CTGAAGGGAGAATATGAGATTGTTCGCAACTTCATCCTTCACACTCTTCAGCTGCAGTTA GGGATGGATTCCTGGGGAAATTTCATGTTTATCACTGGATATAGTTGGGAGAAAACTATG GATTGTCATAGTCCTGGTCAAGGTCTGATGCCTGCTAGTTTCAAGGTTCGTACAGTCCCA TTGGATGGTGATGACTCTGCAACAGAAGAAGTACTGGATCCAGACTTTGGAGAAGCAGCA ATTGGCCGAGTTGCCCCAGTTGATTCCGGACTATGGTGGATTATTTTGTTACGTGCGTAT GGGAAGTCCTCTGGTGATCTCTCGGTTCAGGAGAGAATTGATGTTCAGACTGGAATAAAA ATGATACTAAGACTATGTCTTGCTGATGGCTTTGATATGTTTCCAACATTGTTGGTGACT GATGGTTCGTGCATGATAGACCGCCGTATGGGAATTCATGGTCACCCTTTGGAGATTCAG GCACTGTTTCATTCAGCACTGCTTTGTGCTCGAGAAATGCTTACACCAGAGGATGGATCA GCTGACCTTATCCGAGCATTAAATAATCGTCTTGTTGCCTTATCATTTCATATCAGAGAA TATTATTGGATTGATATGAAAAAGCTAAATGAGATTTACCGGTACCAGACGGAGGAGTAC TCCTATGATGCCGTTAACAAGTTCAATATTTATCCAGATCAGATTTCTCCTTGGCTGGTG GACTGGATGCCAAGTAAAGGAGGATACTTGATTGGAAATTTGCAACCTGCTCACATGGAT TTTCGATTCTTTTCTCTAGGAAACTTGTGGTCTATAGTCTGCAGTCTGACAACAGATGAT CAATCACATGCTATATTGGATCTCATTGAGGCCAAGTGGACAGATCTGGTAGCTGATATG CCTTTTAAAATATGCTACCCTGCTCTTGAGGGTCAGGAGTGGAAGATAATTACAGGATGT GATCCCAAGAATACTCCTTGGTCCTACCATAATGGAGGTTCCTGGCCAACTTTACTCTGG CAGCTGGCTGTTGCTAGTATTAAGATGAATAGACCTGAGATTGCTGCAAAAGCTGTTGAA GTTGCAGAAAAGCGCATCTCACAAGACAAGTGGCCAGAATATTACGACACTAAAAAGGCA CGGTTCATAGGGAAACAAGCGCGCCTTTTCCAAACTTGGTCTATAGCTGGATACCTCGTC GCCAAACTCCTCCTTGCCAATCCAAGTTCTGCTAAGATTCTCATTTCCCAAGAAGACTCC GAGCTTCTCAACGCCTTCTCCTGTGCTATCAGTTCTAATCCCAGAAGAAAAAAACGCGGT CCAAAAAGTCCCCAGAAAACCTACATAGTGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc11g007270.2.1
PEP Infomation	Alkaline/neutral invertase (AHRD V3.3 *** A0A0X8AZR5_CAMSI)
Sequence	MATSEAFLQVLGGSLPSLFGSDDSFRKLGSSHTSRSFIRIRKKRGPICVNFLNCSHISYR AIRVDCFQSTRQCVHGDIGHSNLRSVNCKCQQADSASSFASEKGNGSWTIDNDQSFDTVH GNTPSVMQFETVRELKVGEENFQSNGSLPPNGLVEDTLNRIAGNSIEDEAWELLRESMVY YCGSPVGTIAAKDPTSSTADVLNYDQVFIRDFIPSGIAFLLKGEYEIVRNFILHTLQLQL GMDSWGNFMFITGYSWEKTMDCHSPGQGLMPASFKVRTVPLDGDDSATEEVLDPDFGEAA IGRVAPVDSGLWWIILLRAYGKSSGDLSVQERIDVQTGIKMILRLCLADGFDMFPTLLVT DGSCMIDRRMGIHGHPLEIQALFHSALLCAREMLTPEDGSADLIRALNNRLVALSFHIRE YYWIDMKKLNEIYRYQTEEYSYDAVNKFNIYPDQISPWLVDWMPSKGGYLIGNLQPAHMD FRFFSLGNLWSIVCSLTTDDQSHAILDLIEAKWTDLVADMPFKICYPALEGQEWKIITGC DPKNTPWSYHNGGSWPTLLWQLAVASIKMNRPEIAAKAVEVAEKRISQDKWPEYYDTKKA RFIGKQARLFQTWSIAGYLVAKLLLANPSSAKILISQEDSELLNAFSCAISSNPRRKKRG PKSPQKTYIV*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc11g007270.2.1
Transcript Infomation	Alkaline/neutral invertase (AHRD V3.3 *** A0A0X8AZR5_CAMSI)
Sequence	ATGTTAAGAAATAATAAAGAAAAGCAAACAAAACTAACCACATATTTGATCAATCAATTT ATTCACGTTTATTTGAAGAAAAAGAAAAAACTGTTTACATTTTTTAGAAATTGTTTAAGC TTGTAGCTATAACTTGCAAGTTGTAACTAAGCTATAAGACATTGATTTCTTCATTCATTT GTGCTGGTGGCTGTGAAGTTTCAAGTTCTTCAACAATATTTATAAGTCTCTTTTGTTCAC GAGCTGAAAAATATAAGATTCTGCTGATAGTTTGACGTGTGACAGTCGTAATCAGTTACC TGACCTGATTATTTTGCTTATAGTGGTTCTTGATATGTAAGGTACTGGTTATTTTCAAAG TTCCATTTCATTCTGATAGTAACCGTTCTATGGATGTCCAGAACCATAAGGTATTTTCCA TTGGAGTTGGAGGTATTAAATTCTTCTGGGTGTAGAAACTGTTCCTTGCCTTAACATCAG GATTGATGGCCACCTCTGAAGCATTTCTGCAAGTTTTAGGTGGTTCACTACCTAGTCTTT TTGGATCTGATGATTCCTTTAGGAAATTGGGATCGTCACATACCTCCAGATCCTTCATAA GAATCAGAAAGAAGAGGGGTCCAATATGTGTGAACTTCCTCAACTGTTCACACATATCAT ACCGTGCTATTAGGGTAGATTGCTTTCAGAGCACCAGACAATGTGTGCATGGAGATATTG GTCATTCCAATTTACGATCTGTGAACTGCAAATGCCAGCAAGCTGACAGTGCGAGTAGTT TTGCATCAGAAAAGGGAAATGGGTCATGGACTATTGACAATGACCAGAGCTTCGATACAG TTCATGGTAATACACCAAGTGTAATGCAGTTTGAGACAGTAAGAGAGCTTAAAGTAGGAG AGGAGAACTTTCAATCCAATGGGAGTTTACCTCCAAATGGCTTAGTGGAAGATACCTTGA ATAGAATAGCTGGAAACTCTATCGAAGATGAAGCATGGGAACTACTACGAGAATCTATGG TTTATTATTGTGGTAGTCCTGTCGGAACAATTGCTGCTAAGGACCCAACTAGTTCCACCG CCGATGTTCTAAACTATGATCAAGTCTTTATCCGTGACTTTATACCTTCTGGTATTGCTT TCCTTCTGAAGGGAGAATATGAGATTGTTCGCAACTTCATCCTTCACACTCTTCAGCTGC AGTTAGGGATGGATTCCTGGGGAAATTTCATGTTTATCACTGGATATAGTTGGGAGAAAA CTATGGATTGTCATAGTCCTGGTCAAGGTCTGATGCCTGCTAGTTTCAAGGTTCGTACAG TCCCATTGGATGGTGATGACTCTGCAACAGAAGAAGTACTGGATCCAGACTTTGGAGAAG CAGCAATTGGCCGAGTTGCCCCAGTTGATTCCGGACTATGGTGGATTATTTTGTTACGTG CGTATGGGAAGTCCTCTGGTGATCTCTCGGTTCAGGAGAGAATTGATGTTCAGACTGGAA TAAAAATGATACTAAGACTATGTCTTGCTGATGGCTTTGATATGTTTCCAACATTGTTGG TGACTGATGGTTCGTGCATGATAGACCGCCGTATGGGAATTCATGGTCACCCTTTGGAGA TTCAGGCACTGTTTCATTCAGCACTGCTTTGTGCTCGAGAAATGCTTACACCAGAGGATG GATCAGCTGACCTTATCCGAGCATTAAATAATCGTCTTGTTGCCTTATCATTTCATATCA GAGAATATTATTGGATTGATATGAAAAAGCTAAATGAGATTTACCGGTACCAGACGGAGG AGTACTCCTATGATGCCGTTAACAAGTTCAATATTTATCCAGATCAGATTTCTCCTTGGC TGGTGGACTGGATGCCAAGTAAAGGAGGATACTTGATTGGAAATTTGCAACCTGCTCACA TGGATTTTCGATTCTTTTCTCTAGGAAACTTGTGGTCTATAGTCTGCAGTCTGACAACAG ATGATCAATCACATGCTATATTGGATCTCATTGAGGCCAAGTGGACAGATCTGGTAGCTG ATATGCCTTTTAAAATATGCTACCCTGCTCTTGAGGGTCAGGAGTGGAAGATAATTACAG GATGTGATCCCAAGAATACTCCTTGGTCCTACCATAATGGAGGTTCCTGGCCAACTTTAC TCTGGCAGCTGGCTGTTGCTAGTATTAAGATGAATAGACCTGAGATTGCTGCAAAAGCTG TTGAAGTTGCAGAAAAGCGCATCTCACAAGACAAGTGGCCAGAATATTACGACACTAAAA AGGCACGGTTCATAGGGAAACAAGCGCGCCTTTTCCAAACTTGGTCTATAGCTGGATACC TCGTCGCCAAACTCCTCCTTGCCAATCCAAGTTCTGCTAAGATTCTCATTTCCCAAGAAG ACTCCGAGCTTCTCAACGCCTTCTCCTGTGCTATCAGTTCTAATCCCAGAAGAAAAAAAC GCGGTCCAAAAAGTCCCCAGAAAACCTACATAGTGTGAAGATCACACACAACCCCACAAA TGATTGAATGTACAGTCATTGAGCCAGTTAAAGTGTATTGATAACTACATATAATTGTTT TGCCTGGTGTTCACAAGCTGGAATTCTATTTAATATTTCAGCTTATAATATAATGTTCTT CTGTAAACCTCAAACGAGTAAGCATCGTCATCGATGCTTGAATATGAAATAATTCATGAT GAATTTTCTCTTAGAGTTCTCTTCTCCATATGGAAGTGCCTAAAATTGTTTTTGTATAAA TTTTTCTGTTGTTCTACAGGGAAAAAAAGCCAGCATAGGCCTTATTTTATAGATTTGGCT ATTTTCTGCAAATTCCTATATAATATTGTAACACTAAAGTATTCATTTTACACTTTACTT TTGTTGAATCTTGTGAGAAATGCTACGGAAGCGGCCACAGGAGTTTAGAACGAAACTATT TTTGACTTGGAAGACAAAGAAGTGTGATAAAGATGAGACCGTATAAAATGAATATTCGCG GTCGAAGCTTGGCTCTAGCCGATAGGCTAGCTGTAAGCTTGGCTACAGCGAAGCGCTTAC CAAGCGCGAAGGATTCACACCAATTCTTCGATTTTTTATAGAAAAACTACGGATTCAGGT CGGCTCGGGTCGATAGTAGCCGTGATAGTAATGCCCCGGAGCCCAGTTTCAAACCCCGGT TCGAACAGGAGGAGTAGGCGCCGACCCATGAGGCGGACCTTGGAAAGTTTTAACATAAGC AGAAATCATATTCGTAAAGCAGAAACATAAACGCACTCCTATGAACGTGGAAAATATACC GAATTCAATTGGTCGATTCGAATTGG