Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc11g006700.1.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A124SG91_CYNCS)

Sequence

ATGAAAGCCTTACAAAGATACAATTTTTTCAATCTCTGTAATGCTCGCCGGAGAAATTTA
TCCTCCGTCGCCGATGCTACACTTCATAAATCCGACGATGAAGAACACAGCGTTAAAGGG
GAATCCAAAAATTCAATTATTCTACCATATTTGCACCGGGCAGTACAAGAATGTGCGAAA
CAGAAGACTGCGATGAATGGAAAATCGGTGCATACCCAGATTATAAAATGTGGATATGAA
GCTGATATATTGACAACAAACATGCTTATGAATATGTATGCAAAGTGCGGCATTGTTGAT
TTTGCTCGCAAGGTGTTCGACGAAATGTCTCAGAGAAGTCTTGTTTCGTGGAACACTCTA
ATGGGTTCGTGTATACAGAGCAGAGATGAAGATGAAGCTTTGCGTCTTTTCGTTCGAATG
CAAAGGGAAGGTAGTCAGGTTAGTGGGTTTACTGTTTCAGGTGTTCTTTGTGCTTGTGCT
GCTAAGTTTGCTGTTTTAGAAAGTAAACAATTGCATGGTTTTGCTATTAAGGTATCAGCG
GAATCTAATGTTTTTGTGTCAACTGCTTTGCTTGATGTTTATGCTAAATGTGGGTTGATG
AAAGATGCTTTTCGTGTTTTTGATTCTATGAATGAGAGAAATGAGGTTACTTGGAGTTCA
ATGGTTGCTGGATATGTTCAAAATGAGTTATATGAGGAGGCTATAATGTTTTTTCATAGG
CTACAAAAGTCCGGGATAGAGCATAATCAGTTTATTCTTTCTTCGGTTATATCTGCTTGT
GCTGCGATGGCTGCTTTGTTAGAAGGGAACGAAACGCATGCTATAGTATGGAAAACGGGT
TTTGGTGCCAATGTTTATGTGGCTTCATCTCTTGTGGATTTATATGCAAGATGTGGAAGT
GTTGACGAAGCGTATATTGTTTTCTCAAATGCTGAGGTGAAGAATGATGTAATATGGAAT
TCAATGATTTCTGGCTTTGCTAGAAATGCACGGTCTTTAGATTCTATGACGTTGTTTGAG
AAAATGCAGTTAGCGGGATTTTTCCCGAATGAAAGGACATACGTCTCTGTGTTATCTGCT
TGTAGTCATATGGGTCTTGTTGACAAGGGGCGGATATATTTTGACAAGATGAAGAAAGAA
CATAACTTGTCTCCCAATTTATATCATTATTCATGTATGGTTGACATTCTTGGTAGAAAA
GGTTTGGTTGAAGAAGCTAAGGATTTAATAGAAACTATGCCGTTTGCTGCAACTGCTTCC
ATGTGGGGTTCTGTCTTGGCCTCTTGCAGGGTGTGTGGAAATGTTGAGGTGGCTGAAATT
GCTGCTAAGCATTTGTTCGAGCTCGAGCCTAATAATGCTGGGAACCACGTCTTGCTTTCA
AACATATATGCTTCCAAGAAAAGGTGGGGTGACGTTGCATCAACAAGAAAACTTCTTAAA
GACAGTGAAGCGAAGAAAGAAAGAGGCAAGAGTTGGATACAGATAAAAGACAAGGTTCAC
ACGTTCATGGTCGGGGAAAGAAATCATCCAAGCATTACAGAGGTTTATTCAAGATTGGAT
GAATTGTTGGTAGGTATGGAGAAGTTAGGTTACAAAGGTGAAACCGAACACGATCTGCAT
GATGTGGAAGTGAGCAGAAAACATGAGTTTCTGAGACATCATAGTGAGAAGCTTGCTTTT
ACATATGGATTGATGTGTTTGCCCTTAAATGCTCCTATAAGAATTATGAAGAACCTCAGG
ATCTGCGGGGACTGTCATTCCTTCATGAAGTTTGCTTCAAAAGTAACACGGAGGGAAATC
ATCGTTAGAGATGTTAATCGTTTTCATCACTTTACTAATGGATCATGTTCATGTGGAGAA
TTTTGGTAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc11g006700.1.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A124SG91_CYNCS)

Sequence

MKALQRYNFFNLCNARRRNLSSVADATLHKSDDEEHSVKGESKNSIILPYLHRAVQECAK
QKTAMNGKSVHTQIIKCGYEADILTTNMLMNMYAKCGIVDFARKVFDEMSQRSLVSWNTL
MGSCIQSRDEDEALRLFVRMQREGSQVSGFTVSGVLCACAAKFAVLESKQLHGFAIKVSA
ESNVFVSTALLDVYAKCGLMKDAFRVFDSMNERNEVTWSSMVAGYVQNELYEEAIMFFHR
LQKSGIEHNQFILSSVISACAAMAALLEGNETHAIVWKTGFGANVYVASSLVDLYARCGS
VDEAYIVFSNAEVKNDVIWNSMISGFARNARSLDSMTLFEKMQLAGFFPNERTYVSVLSA
CSHMGLVDKGRIYFDKMKKEHNLSPNLYHYSCMVDILGRKGLVEEAKDLIETMPFAATAS
MWGSVLASCRVCGNVEVAEIAAKHLFELEPNNAGNHVLLSNIYASKKRWGDVASTRKLLK
DSEAKKERGKSWIQIKDKVHTFMVGERNHPSITEVYSRLDELLVGMEKLGYKGETEHDLH
DVEVSRKHEFLRHHSEKLAFTYGLMCLPLNAPIRIMKNLRICGDCHSFMKFASKVTRREI
IVRDVNRFHHFTNGSCSCGEFW*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc11g006700.1.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A124SG91_CYNCS)

Sequence

ATGAAAGCCTTACAAAGATACAATTTTTTCAATCTCTGTAATGCTCGCCGGAGAAATTTA
TCCTCCGTCGCCGATGCTACACTTCATAAATCCGACGATGAAGAACACAGCGTTAAAGGG
GAATCCAAAAATTCAATTATTCTACCATATTTGCACCGGGCAGTACAAGAATGTGCGAAA
CAGAAGACTGCGATGAATGGAAAATCGGTGCATACCCAGATTATAAAATGTGGATATGAA
GCTGATATATTGACAACAAACATGCTTATGAATATGTATGCAAAGTGCGGCATTGTTGAT
TTTGCTCGCAAGGTGTTCGACGAAATGTCTCAGAGAAGTCTTGTTTCGTGGAACACTCTA
ATGGGTTCGTGTATACAGAGCAGAGATGAAGATGAAGCTTTGCGTCTTTTCGTTCGAATG
CAAAGGGAAGGTAGTCAGGTTAGTGGGTTTACTGTTTCAGGTGTTCTTTGTGCTTGTGCT
GCTAAGTTTGCTGTTTTAGAAAGTAAACAATTGCATGGTTTTGCTATTAAGGTATCAGCG
GAATCTAATGTTTTTGTGTCAACTGCTTTGCTTGATGTTTATGCTAAATGTGGGTTGATG
AAAGATGCTTTTCGTGTTTTTGATTCTATGAATGAGAGAAATGAGGTTACTTGGAGTTCA
ATGGTTGCTGGATATGTTCAAAATGAGTTATATGAGGAGGCTATAATGTTTTTTCATAGG
CTACAAAAGTCCGGGATAGAGCATAATCAGTTTATTCTTTCTTCGGTTATATCTGCTTGT
GCTGCGATGGCTGCTTTGTTAGAAGGGAACGAAACGCATGCTATAGTATGGAAAACGGGT
TTTGGTGCCAATGTTTATGTGGCTTCATCTCTTGTGGATTTATATGCAAGATGTGGAAGT
GTTGACGAAGCGTATATTGTTTTCTCAAATGCTGAGGTGAAGAATGATGTAATATGGAAT
TCAATGATTTCTGGCTTTGCTAGAAATGCACGGTCTTTAGATTCTATGACGTTGTTTGAG
AAAATGCAGTTAGCGGGATTTTTCCCGAATGAAAGGACATACGTCTCTGTGTTATCTGCT
TGTAGTCATATGGGTCTTGTTGACAAGGGGCGGATATATTTTGACAAGATGAAGAAAGAA
CATAACTTGTCTCCCAATTTATATCATTATTCATGTATGGTTGACATTCTTGGTAGAAAA
GGTTTGGTTGAAGAAGCTAAGGATTTAATAGAAACTATGCCGTTTGCTGCAACTGCTTCC
ATGTGGGGTTCTGTCTTGGCCTCTTGCAGGGTGTGTGGAAATGTTGAGGTGGCTGAAATT
GCTGCTAAGCATTTGTTCGAGCTCGAGCCTAATAATGCTGGGAACCACGTCTTGCTTTCA
AACATATATGCTTCCAAGAAAAGGTGGGGTGACGTTGCATCAACAAGAAAACTTCTTAAA
GACAGTGAAGCGAAGAAAGAAAGAGGCAAGAGTTGGATACAGATAAAAGACAAGGTTCAC
ACGTTCATGGTCGGGGAAAGAAATCATCCAAGCATTACAGAGGTTTATTCAAGATTGGAT
GAATTGTTGGTAGGTATGGAGAAGTTAGGTTACAAAGGTGAAACCGAACACGATCTGCAT
GATGTGGAAGTGAGCAGAAAACATGAGTTTCTGAGACATCATAGTGAGAAGCTTGCTTTT
ACATATGGATTGATGTGTTTGCCCTTAAATGCTCCTATAAGAATTATGAAGAACCTCAGG
ATCTGCGGGGACTGTCATTCCTTCATGAAGTTTGCTTCAAAAGTAACACGGAGGGAAATC
ATCGTTAGAGATGTTAATCGTTTTCATCACTTTACTAATGGATCATGTTCATGTGGAGAA
TTTTGGTAA