Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc11g006130.2.1

CDS Infomation

Methyltransferase (AHRD V3.3 *** F1DGA0_COFAR),Pfam:PF13489

Sequence

ATGGCAGCGGCAAACTACTACTCGAAGGACTTTGAATGGGATCAACTTCGGCAAGAGATT
GAGAATAATCCTTCTCTTGCTCACCATTTGCTTCCTTTTCCTAATTCTTCGATCAATCAA
AATCAACATACCCTTTTGTCTTCTCCACTTTCTTTATGTTCTCCGCAGGAAGATTCTGAA
GCATGGAACAACTTCCACACTCGCCATTCCACTGGAAAATTCTTCAAGGAGCGTCGGTAC
TTGCTTAAAGAGTTCCCAGAGCTAGCCTCTTGTGGGGAATGCTGGACAGTTTTGGAGATT
GGATGTGGAAATGGTAGTACAGCTCTGGCAATACTTCGTGGAAACAAGAGCATCTCTCTG
TATGCCTGTGACTGCAGCAAAGAGGCTCTTGAGAGGGCTAAAGAGAATATTGAAGCTGCT
GATATAAACTTGGCTAAAGAACGTTTTTACCCATTCCAATGTGATTTTTCTGCAAGTGGA
TTTCCAAATTGGTTACTCAGCACTTCTTGCCGTGAAAGTTCCTTCCAGAAGCAGAATATG
TGCTCCTCAGGTGCAGGAAGCTGCAGCAAGCAAGCTTTCCCCGATCCACCGATATCTGCC
AAGTACAATAGCTGCCTTGCCGGAGTAGATTTTGTCACCTTAATATTTACGCTATCAGCT
GTGCCACTTCACAGGATGTCGAGAGCAATCACTGAATGTTTCTCTGTTCTAAAGCCCGGA
GGACTGTTGTTATTCAGGGATTATGGTCTTTATGATATGACCATGCTTCGGTTCGAGCCA
GAGCAAAGAGTAGGATACAGGGAGTACATACGTTCTGATGGAACAAGGTCTTACTTTTTT
TGCTTGGATAGTGTAAGAGATCTCTTTTGCAGCTCAGGATTCATCGAGCTTGAGCTTGAA
TATTGCTGTGTCCAGTCAGTGAATCGACGGAATGGGAAGATCATGCGAAGAGTATGGATT
CATGGGAAGTTCCAGAAGCCACATGTCCAAGTAGGTCCATAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc11g006130.2.1

PEP Infomation

Methyltransferase (AHRD V3.3 *** F1DGA0_COFAR),Pfam:PF13489

Sequence

MAAANYYSKDFEWDQLRQEIENNPSLAHHLLPFPNSSINQNQHTLLSSPLSLCSPQEDSE
AWNNFHTRHSTGKFFKERRYLLKEFPELASCGECWTVLEIGCGNGSTALAILRGNKSISL
YACDCSKEALERAKENIEAADINLAKERFYPFQCDFSASGFPNWLLSTSCRESSFQKQNM
CSSGAGSCSKQAFPDPPISAKYNSCLAGVDFVTLIFTLSAVPLHRMSRAITECFSVLKPG
GLLLFRDYGLYDMTMLRFEPEQRVGYREYIRSDGTRSYFFCLDSVRDLFCSSGFIELELE
YCCVQSVNRRNGKIMRRVWIHGKFQKPHVQVGP*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc11g006130.2.1

Transcript Infomation

Methyltransferase (AHRD V3.3 *** F1DGA0_COFAR),Pfam:PF13489

Sequence

ACATGTATCATATTACAAGTGGAAAGACCTTAAATGAAAGTGACATTATAATCAATCATA
ATATCATACTCATTTTTTTGCCATTTTTATAAATATTTATTGCCTTAATGACTTAATAGA
ATGTCTACGCCATAAATAAATTCCACTGACAATATCTAAGAGAAAAGACCAAATAATCAC
GTAATACCTCATATAATACTAATTCAATTGGTTTGCATTTAAACACGATTAGGAGTTTTA
TTTTCTTTTGCATTATCTTTTTTCGGGTAGATAAATGTGTAAATAATTATATGTAGACAA
ATATATCTTAAATCTAATATAAAAATTGTGTGGAATGTTCTATAAAAAAAACACTTTAAA
GATAACATATATGCATATTTAATATAAAGTAACTATTATATAAATAGTACTAAAACTACC
TTAATTTATATTTCAACTTCAAATATTAAATTAATTTTGAATGTAAGTGTAAGGAGGATT
AAAAATATAAGATTAATATTCACGATGCTTAGAAACTTATATTTTTTGATATATTTTAAT
ATTTATTTTTATCATCTAACATATCAATTGAAGTTAGCCAGGCTAAACAATTTACATTGA
GAAAAATAAGAAAACGAACTCATCATCTCCGAGTCTCAAAAGTTGAGATCAGTAAGAATT
GATACCTAACGAATTTCTCCGTAAACAATGATTTCAATCTAATTGACGTCATAGTAACTC
AAATTTTGATAGATTATAAACTCATACATTAAACAAGAAAGAGTAAAAAATACCTTTCAA
AATTGGGACTATGACAAGATTTTTGATCCTTTTCTATTTAAAAAATTATAATTCAACTTT
AATATACCTATAATCTTTTAGACTTATCATTAAATTTTATTTAGCCACTTTAATTATTAT
ATCGTTTTAGTCAAAATTTATATTTTCAAATTTAAACAAGATCTAGAATAAGCACAAATT
TTGAGAAGATTGAGAGAGAGGAAATCATGGCAGCGGCAAACTACTACTCGAAGGACTTTG
AATGGGATCAACTTCGGCAAGAGATTGAGAATAATCCTTCTCTTGCTCACCATTTGCTTC
CTTTTCCTAATTCTTCGATCAATCAAAATCAACATACCCTTTTGTCTTCTCCACTTTCTT
TATGTTCTCCGCAGGAAGATTCTGAAGCATGGAACAACTTCCACACTCGCCATTCCACTG
GAAAATTCTTCAAGGAGCGTCGGTACTTGCTTAAAGAGTTCCCAGAGCTAGCCTCTTGTG
GGGAATGCTGGACAGTTTTGGAGATTGGATGTGGAAATGGTAGTACAGCTCTGGCAATAC
TTCGTGGAAACAAGAGCATCTCTCTGTATGCCTGTGACTGCAGCAAAGAGGCTCTTGAGA
GGGCTAAAGAGAATATTGAAGCTGCTGATATAAACTTGGCTAAAGAACGTTTTTACCCAT
TCCAATGTGATTTTTCTGCAAGTGGATTTCCAAATTGGTTACTCAGCACTTCTTGCCGTG
AAAGTTCCTTCCAGAAGCAGAATATGTGCTCCTCAGGTGCAGGAAGCTGCAGCAAGCAAG
CTTTCCCCGATCCACCGATATCTGCCAAGTACAATAGCTGCCTTGCCGGAGTAGATTTTG
TCACCTTAATATTTACGCTATCAGCTGTGCCACTTCACAGGATGTCGAGAGCAATCACTG
AATGTTTCTCTGTTCTAAAGCCCGGAGGACTGTTGTTATTCAGGGATTATGGTCTTTATG
ATATGACCATGCTTCGGTTCGAGCCAGAGCAAAGAGTAGGATACAGGGAGTACATACGTT
CTGATGGAACAAGGTCTTACTTTTTTTGCTTGGATAGTGTAAGAGATCTCTTTTGCAGCT
CAGGATTCATCGAGCTTGAGCTTGAATATTGCTGTGTCCAGTCAGTGAATCGACGGAATG
GGAAGATCATGCGAAGAGTATGGATTCATGGGAAGTTCCAGAAGCCACATGTCCAAGTAG
GTCCATAGCCCTGTGGTTTTGATGGGAGAAAATGAGCTTGCAAGCAGCTGAATTAATGTT
CCTTGAGCTTAAGAAACTGAAAAAAGAAGAAGATGAACTTCTGTTATTTTATACCCTTAA
TCGTCCTCCAACAGAGCTAAATCAATGATGCTTAGAAGCGGCACTTTGTCTCGTGAAACA
TATAAAGTAGTGCTGCTGGAAGTGAAAGATGTGTGTTGTCAATTAAACGGTTTTTTTTTC
TTGTCGTTATCAGACATTCAAAATTGGAATAGAATATATTGTCATGCTACATTTATCGTC
TGAATGAATTGCTGAGCAGTTTTTTTCCTGCAATCATGCATGCCATCATACAAATGGAGG
AGGAAATTTTGAGGATTCATATAGCTGACCCAACTAGTTTAAGGCTTGGTAATTGTTGTA
TGTCATATCATTATTCACTTTGCAACAATTATTTCAGAACTAAAAATCACTTGCTAAGTT
CTGGCTGTGCAGAACCAAACAGGCTGACAGCAAAGCTCTTGTGAGCTACTCATTGTTTCT
GAAGAATTTTGTTCTTCATGTCTTCTATGAATTGAGTGAGATTCTTACCTGAATATCCCT
CATCAGAAAGTGCTTTCTGAAGGATCATCTTGCAAGTTCGTTGGTGTAATCTGATGCTGG
TAGCAGGTTTGTTGAAATTATTCTCTTGGTGAAGCTTGTGGAGAGTGGGCCAATTGCATA
GTAGGGTTGCTTCTCTTGCAAGGCCGAGATAGGTGAAGACTCTAGCTCTTGCACTGTATT
ACCGATGACAAAGTCTGCTTTCTGTGCATCTTCAAGACACTTGAACACAAAACGGTGCAT
CACGGTGCTTGGATCAGCATCTTGAATATATGAAGGTAAATCTGCTGGTTCAATGGCTTG
TACTCCAGGCTGTGATCAGACAGTAATAGCTTCAAGATATTTGGTTCATACCATGACACC
CAAAGTGGCCATTACTCTTGAGCAGGTCCATGTGATAGTAGACTGTAAGCACTGTTGCTG
GTTCAGTCCAAAATGAAACATTGACAAGATTATATTTCTTGGCGATCGTTGATCCCCAAA
CGTGGAAACTATCAGCTATTATACAAGAAATTGGCGGGTTTGGTTTTGAGAGGACTAGAT
TTTCAATGAAGTCATCCACATGAGCTTGGAAAACATGAACGAAACCTTCCACAAATTGGC
TTGCATTGGCACTCCAATCGAAACTCAGTGGAAATCCATCACTATTTTGGCATATCGAAT
GTCAAGACCACATTTCTGTCCGTGGGAAAAAAGGTTGTCGTCATCTTTAAGTGACTGAGC
TTTAGCTATCTGCTGATGAGTTGATTCTGTGTTGACAAAGGTGATGGTAAAACCTTTTGA
GGCGAGCTTCATGGCAAGATGTGTGAATGGAGTTATATGGCCTTGAAGAGGAAGTGGTAT
GAGTACTTCATGTGGCTGTAGGTGTTCTTTCAGTTCCATTTAGTCCCAAAAATGTAGGAG
ATGGTTGCCTTTTTTGAGAAAAGTTAAGTGTATGATTGTTAATATTGTGTGTTTATGTAA
GAGCTTGTAGCTGCATTTATTTGAATTTGGAGCCTTTTATATGTCATTCCTTAGGTATTT
AAAGATAGTGAGATAGACATGTCTTTTGTTTGGTGTGAATCCCGGCTCGTGGCTCACAGT
TGTTCTGTATTCATTTGCTTGATGTAAATACTCATTGCAGGTAAATTTTTCGGTTAATCT
ATTCTCAAAGAAATTGGACTTGCTAAGAGGTTGTTGTGT