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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc11g005970.1.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A118JUV1_CYNCS)

Sequence

ATGACAAAGGCTATACACCTGAGAAATTGCGCCACAAATCCATCAATTTTCAATTCAATC
ATCTCCATAGCTCGGCAATTTTTCTCTACAACATGTGCAGCAGCAGGATATGAAGGTGTA
CGTAAATTATTTGGTTCATCTATTGGTGTTTTACAAGACAAAGATCTTCTCAAAAAGGCT
CCAAATGGGGAGCTTTTAGTACTATATCTTATTGATAATGGAGCAATGGATGCAGATGCT
AGTTTATACAATCAGCTTCTGAAGAAATGTACGGAATGGAAACGATTGAAAGAAGGTAGA
GTAGTTCATGAACACTTCTTGAGGTCGAGGTTTAGTCATTATACTGTTCCGAATAACACG
TTGATTAATATGTACGCCAAGTGTGAGAGTATGGGTGATGCTCGGAAGGTGTTTGATGAA
ATGCCTGAGAGAGATATGGTTTCTTGGACTGCGTTGATTACTGGGTATTCGCAGAATGAG
GGTGCTAAGGAGGGGTTGGTTTTGTTTACTGAGATGTTGAGGTTTGGGTTTATGCCGAAT
CAGTTTACGTTTGGGAGTGTTATTAAGGCTGCTGGAGCGTTGGAGAGTGACAGTACGGGT
AGGCAATTGCATGGGGCATGTGTGAAGTGTGGATATGAAGATAATGTTTATGTTGGGAGT
GCTCTTGTGGATATGTATGCAAGGTGTGGACTAATGGATGAAGGGAAGATCGTGTTTGAC
AAGTTAAGTTGCAAGAATGAGGTTTCGTGGAACGGTTTGATTGCGGGGCATGCGAGGAAA
GGTGAGGGAGAAATTGCTCTGAAGCTTTTCTGTGAGATGAAAAGAGGCGGTTTTCAGCCG
ACGCACTTCACGTTTTCTAGTGTTTATGCAGCCTGTGCAAACATTGGAGCTCTAGAGCCC
GGGAAATGGGTGCATGTTCATATGATCAAATCAGGGTTGGAACTTATTGCTTTTATTGGT
AATACTCTGCTTGATATGTATGCTAAGTCTGGTAGCATTGATGATGCTCGAAAGGTTTTT
GATCGATTAGTGAAAAAGGATGTGGTCTCTTGGAACTCGATGCTTACCGCCTATGCTCAG
CATGGACTTGGAATAGAAACCGTAGAGTGCTTTGAGGAGATGTGTAGGATAGGACCTGAA
CCTAATGAAGTGACTTTTCTTTGTGCTCTCACAGCTTGCAGTCATGCTGGGCTTCTAGAC
AATGGAATGCATTATTTTGAATTGATGAAGAAATTTAAAATAGAACCTAATATTTCACAT
TATGTGACCATTGTTGATCTCCTTGGTCGATCAGGTCAACTTGACCGTGCTGAAAAGTTC
ATTAATGAAATGCCAATTGAACCAAGTGCAGCCATTTGGAAAGCTTTGCTTGGAGCTTGT
AGGATGCATAAAAAATTGGAGTTGGGTGTTTATGCAGCTGAACGCGTGTTTGAACTTGAT
CCACATGATTCGGGGCCACATATTTTGCTGTCCAACATCTATGCCTCTGCTGGTAGAAGA
AGTGATGCTGCAAGAGTTAGAAAAATGATGAACCAGAGTGGAGTTAAGAAAGAACCTGCT
TGTAGTTGGGTGGAGATTGAGAATGCTGTTCATATGTTTGTAGCAAATGACGATGCTCAT
CCACAGAGAGAGGAGATCCGTAACATGTGGGAGAAGATAACTGATAAAATTAAGGAAATT
GGCTATGTTCCAGACACTAGCCACGTGCTTTGGTTTATGGATCAGCAGGAGAGGGAAGAG
AGGTTGCAATACCATAGTGAACGACTTGCTTTAGCATTTGCACTTCTCAATTCTCCATCT
GGATCCCCTATCCGAATAAAGAAGAATATCAGAGTTTGTGGTGATTGCCATACTGCATTT
AAGTTTGTTTCAAAGGTGGTAGACAGGGAAATCATCCTGAGAGACACTAATCGGTTCCAT
CATTTTCGTAATGGTTCTTGTTCCTGTGGAGACTACTGGTAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc11g005970.1.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A118JUV1_CYNCS)

Sequence

MTKAIHLRNCATNPSIFNSIISIARQFFSTTCAAAGYEGVRKLFGSSIGVLQDKDLLKKA
PNGELLVLYLIDNGAMDADASLYNQLLKKCTEWKRLKEGRVVHEHFLRSRFSHYTVPNNT
LINMYAKCESMGDARKVFDEMPERDMVSWTALITGYSQNEGAKEGLVLFTEMLRFGFMPN
QFTFGSVIKAAGALESDSTGRQLHGACVKCGYEDNVYVGSALVDMYARCGLMDEGKIVFD
KLSCKNEVSWNGLIAGHARKGEGEIALKLFCEMKRGGFQPTHFTFSSVYAACANIGALEP
GKWVHVHMIKSGLELIAFIGNTLLDMYAKSGSIDDARKVFDRLVKKDVVSWNSMLTAYAQ
HGLGIETVECFEEMCRIGPEPNEVTFLCALTACSHAGLLDNGMHYFELMKKFKIEPNISH
YVTIVDLLGRSGQLDRAEKFINEMPIEPSAAIWKALLGACRMHKKLELGVYAAERVFELD
PHDSGPHILLSNIYASAGRRSDAARVRKMMNQSGVKKEPACSWVEIENAVHMFVANDDAH
PQREEIRNMWEKITDKIKEIGYVPDTSHVLWFMDQQEREERLQYHSERLALAFALLNSPS
GSPIRIKKNIRVCGDCHTAFKFVSKVVDREIILRDTNRFHHFRNGSCSCGDYW*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc11g005970.1.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A118JUV1_CYNCS)

Sequence

ATGACAAAGGCTATACACCTGAGAAATTGCGCCACAAATCCATCAATTTTCAATTCAATC
ATCTCCATAGCTCGGCAATTTTTCTCTACAACATGTGCAGCAGCAGGATATGAAGGTGTA
CGTAAATTATTTGGTTCATCTATTGGTGTTTTACAAGACAAAGATCTTCTCAAAAAGGCT
CCAAATGGGGAGCTTTTAGTACTATATCTTATTGATAATGGAGCAATGGATGCAGATGCT
AGTTTATACAATCAGCTTCTGAAGAAATGTACGGAATGGAAACGATTGAAAGAAGGTAGA
GTAGTTCATGAACACTTCTTGAGGTCGAGGTTTAGTCATTATACTGTTCCGAATAACACG
TTGATTAATATGTACGCCAAGTGTGAGAGTATGGGTGATGCTCGGAAGGTGTTTGATGAA
ATGCCTGAGAGAGATATGGTTTCTTGGACTGCGTTGATTACTGGGTATTCGCAGAATGAG
GGTGCTAAGGAGGGGTTGGTTTTGTTTACTGAGATGTTGAGGTTTGGGTTTATGCCGAAT
CAGTTTACGTTTGGGAGTGTTATTAAGGCTGCTGGAGCGTTGGAGAGTGACAGTACGGGT
AGGCAATTGCATGGGGCATGTGTGAAGTGTGGATATGAAGATAATGTTTATGTTGGGAGT
GCTCTTGTGGATATGTATGCAAGGTGTGGACTAATGGATGAAGGGAAGATCGTGTTTGAC
AAGTTAAGTTGCAAGAATGAGGTTTCGTGGAACGGTTTGATTGCGGGGCATGCGAGGAAA
GGTGAGGGAGAAATTGCTCTGAAGCTTTTCTGTGAGATGAAAAGAGGCGGTTTTCAGCCG
ACGCACTTCACGTTTTCTAGTGTTTATGCAGCCTGTGCAAACATTGGAGCTCTAGAGCCC
GGGAAATGGGTGCATGTTCATATGATCAAATCAGGGTTGGAACTTATTGCTTTTATTGGT
AATACTCTGCTTGATATGTATGCTAAGTCTGGTAGCATTGATGATGCTCGAAAGGTTTTT
GATCGATTAGTGAAAAAGGATGTGGTCTCTTGGAACTCGATGCTTACCGCCTATGCTCAG
CATGGACTTGGAATAGAAACCGTAGAGTGCTTTGAGGAGATGTGTAGGATAGGACCTGAA
CCTAATGAAGTGACTTTTCTTTGTGCTCTCACAGCTTGCAGTCATGCTGGGCTTCTAGAC
AATGGAATGCATTATTTTGAATTGATGAAGAAATTTAAAATAGAACCTAATATTTCACAT
TATGTGACCATTGTTGATCTCCTTGGTCGATCAGGTCAACTTGACCGTGCTGAAAAGTTC
ATTAATGAAATGCCAATTGAACCAAGTGCAGCCATTTGGAAAGCTTTGCTTGGAGCTTGT
AGGATGCATAAAAAATTGGAGTTGGGTGTTTATGCAGCTGAACGCGTGTTTGAACTTGAT
CCACATGATTCGGGGCCACATATTTTGCTGTCCAACATCTATGCCTCTGCTGGTAGAAGA
AGTGATGCTGCAAGAGTTAGAAAAATGATGAACCAGAGTGGAGTTAAGAAAGAACCTGCT
TGTAGTTGGGTGGAGATTGAGAATGCTGTTCATATGTTTGTAGCAAATGACGATGCTCAT
CCACAGAGAGAGGAGATCCGTAACATGTGGGAGAAGATAACTGATAAAATTAAGGAAATT
GGCTATGTTCCAGACACTAGCCACGTGCTTTGGTTTATGGATCAGCAGGAGAGGGAAGAG
AGGTTGCAATACCATAGTGAACGACTTGCTTTAGCATTTGCACTTCTCAATTCTCCATCT
GGATCCCCTATCCGAATAAAGAAGAATATCAGAGTTTGTGGTGATTGCCATACTGCATTT
AAGTTTGTTTCAAAGGTGGTAGACAGGGAAATCATCCTGAGAGACACTAATCGGTTCCAT
CATTTTCGTAATGGTTCTTGTTCCTGTGGAGACTACTGGTAG