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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc11g005960.1.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103YER7_CYNCS)

Sequence

ATGAATGCAAGACAAGCTCAATCTCTACGTGTATTGGATAGCCTTATGCCCAACACCATT
CTTAGCCTCATTGCAAGATCATCATCGCTATCCCAAACGCAGCAAGTTCATGCTCATATC
CTCAAAACTGGCCATTCCAGTGACACCCATTTCACCAACAAGGTCCTTTCCCTCTACGCC
AACTTCAATTGCTTTGCTAATGCAGAATCTCTTCTTCACTCGCTTCCCAACCCCAATATC
TTCTCTTTCAAATCTCTCATTCACGCTTCATCAAAATCTAATCTTTTTAGTTACACCCTT
GTTTTATTTTCTCGGTTACTATCGAAGTGTATTTTACCTGATGTACATGTACTTCCTAGT
GCTATTAAAGCGTGTGCTGGGTTATCGGCGTCAGAAGTTGGGAAACAAGTTCATGGATAT
GGTTTAACAACTGGGTTGGCGTTGGATTCTTTTGTTGAAGCTTCTTTAGTTCATATGTAT
GTGAAATGTGATCAGTTGAAATGTGCACGTAAGATGTTTGATAAAATGCGTGAGCCGGAT
GTGGTTTCGTGGAGTGCTTTATCTGGTGGTTATGCGAAGAAAGGGGATGTTTTTAATGCT
AAAATGGTGTTTGATGAAGGTGGGAAGTTGGGTATTGAGCCGAATCTTGTTTCGTGGAAT
GGGATGATTGCGGGGTTTAATCAGAGTGGATGTTATTTGGAGGCGGTTTTGATGTTTCAG
AGGATGAATTCGGACGGGTTTAGGAGTGATGGGACGAGTATTTCGAGTGTTCTTCCTGCA
GTAAGTGACTTGGAGGATCTCAAGATGGGTGTTCAAGTTCATAGTCATGTCATTAAAACG
GGTTTTGAGTCTGATAACTGTATTATCAGCGCGTTAGTTGATATGTATGGGAAGTGTAGG
TGTACTTCGGAGATGTCACGAGTGTTTGAAGGGGCAGAGGAAATAGATTTGGGTGGTTTT
AATGCTTTGGTTGCTGGGCTATCACGGAATGGTCTTGTTGATGAGGCTTTTAAAGTTTTC
AAAAAGTTTAAGCTCAAAGTGAAGGAATTGAATGTAGTCTCGTGGACTTCGATGATTTCT
TCCTGCTCGCAACATGGCAAAGACCTTGAAGCGCTGGAGATTTTTAGAGAAATGCAGTTG
GCTAAGGTGAGGCCTAATTCTGTAACTATCTCTTGTTTGCTTCCCGCATGTGGCAATATC
GCAGCACTAGTACATGGAAAGGCAACACATTGCTTCTCTTTGAGAAATTGGTTTTCAGAT
GACGTCTATGTCAGTAGTGCATTAATAGATATGTATGCCAATTGTGGAAGGATTCAGTTG
GCTCGCGTCATTTTTGACAGGATGCCAGTACGTAATTTGGTTTGTTGGAATGCAATGACC
AGTGGATACGCAATGCATGGTAAGGCTAAGGAAGCTATTGAAATCTTTGACTCAATGCGA
AGAAGTGGGCAGAAACCTGACTTCATTAGTTTCACGAGTGTTTTATCTGCATGCAGTCAA
GCAGGCCTTACAGAGCAAGGGCAGCATTACTTCGATTGTATGTCTAGAATTCATGGACTT
GAGGCCAGAGTAGAGCACTATGCTTGTATGGTCAGCCTTCTTGGTCGCACAGGAAAGCTT
AAAGAAGCCTATGATATGATTTCCACAATGCCAATTGAACCAGATGCATGTGTTTGGGGT
GCTTTGCTGAGTTCTTGTAGAACACATCGTAATATGAGTTTGGGTGAGATTGCTGCTGAT
AAACTATTTGAACTTGAACCCAAGAATCCTGGAAATTACATCTTACTATCCAATATTTAT
GCGTCTAACAACAGATGGAATGAGGTAGACAAGGTAAGGGACATGATGAAACATGTGGGC
TTGAGTAAAAATCCAGGATGTAGTTGGATTGAAATCAAAAACAAAGTACACATGCTATTA
GCAGGAGATGATTTACATCCTCAAATGCCACAGATTATGGAAAAGTTGCGAAAATTAAGC
ATGGACATGAAGAATACAGGTGTTTCACATGATACAGAACTTGTTTTGCAAGATGTTGAA
GAACAGGATAAGGAGTTGATCTTGTGTGGGCATAGTGAGAAGTTGGCTGTCGTTTTAGGA
ATTTTGAACACTAACCCAGGGACTTCTCTAAGAGTCATTAAGAACCTTAGAATTTGTGGT
GACTGCCATACTTTTATCAAATTCATCTCCAGCTTTGAAGGGAGAGAAATTTATGTTAGA
GATGCTAACCGTTATCATCACTTCAATGAAGGTATCTGCTCATGTGGAGATTATTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc11g005960.1.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103YER7_CYNCS)

Sequence

MNARQAQSLRVLDSLMPNTILSLIARSSSLSQTQQVHAHILKTGHSSDTHFTNKVLSLYA
NFNCFANAESLLHSLPNPNIFSFKSLIHASSKSNLFSYTLVLFSRLLSKCILPDVHVLPS
AIKACAGLSASEVGKQVHGYGLTTGLALDSFVEASLVHMYVKCDQLKCARKMFDKMREPD
VVSWSALSGGYAKKGDVFNAKMVFDEGGKLGIEPNLVSWNGMIAGFNQSGCYLEAVLMFQ
RMNSDGFRSDGTSISSVLPAVSDLEDLKMGVQVHSHVIKTGFESDNCIISALVDMYGKCR
CTSEMSRVFEGAEEIDLGGFNALVAGLSRNGLVDEAFKVFKKFKLKVKELNVVSWTSMIS
SCSQHGKDLEALEIFREMQLAKVRPNSVTISCLLPACGNIAALVHGKATHCFSLRNWFSD
DVYVSSALIDMYANCGRIQLARVIFDRMPVRNLVCWNAMTSGYAMHGKAKEAIEIFDSMR
RSGQKPDFISFTSVLSACSQAGLTEQGQHYFDCMSRIHGLEARVEHYACMVSLLGRTGKL
KEAYDMISTMPIEPDACVWGALLSSCRTHRNMSLGEIAADKLFELEPKNPGNYILLSNIY
ASNNRWNEVDKVRDMMKHVGLSKNPGCSWIEIKNKVHMLLAGDDLHPQMPQIMEKLRKLS
MDMKNTGVSHDTELVLQDVEEQDKELILCGHSEKLAVVLGILNTNPGTSLRVIKNLRICG
DCHTFIKFISSFEGREIYVRDANRYHHFNEGICSCGDYW*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc11g005960.1.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103YER7_CYNCS)

Sequence

ATGAATGCAAGACAAGCTCAATCTCTACGTGTATTGGATAGCCTTATGCCCAACACCATT
CTTAGCCTCATTGCAAGATCATCATCGCTATCCCAAACGCAGCAAGTTCATGCTCATATC
CTCAAAACTGGCCATTCCAGTGACACCCATTTCACCAACAAGGTCCTTTCCCTCTACGCC
AACTTCAATTGCTTTGCTAATGCAGAATCTCTTCTTCACTCGCTTCCCAACCCCAATATC
TTCTCTTTCAAATCTCTCATTCACGCTTCATCAAAATCTAATCTTTTTAGTTACACCCTT
GTTTTATTTTCTCGGTTACTATCGAAGTGTATTTTACCTGATGTACATGTACTTCCTAGT
GCTATTAAAGCGTGTGCTGGGTTATCGGCGTCAGAAGTTGGGAAACAAGTTCATGGATAT
GGTTTAACAACTGGGTTGGCGTTGGATTCTTTTGTTGAAGCTTCTTTAGTTCATATGTAT
GTGAAATGTGATCAGTTGAAATGTGCACGTAAGATGTTTGATAAAATGCGTGAGCCGGAT
GTGGTTTCGTGGAGTGCTTTATCTGGTGGTTATGCGAAGAAAGGGGATGTTTTTAATGCT
AAAATGGTGTTTGATGAAGGTGGGAAGTTGGGTATTGAGCCGAATCTTGTTTCGTGGAAT
GGGATGATTGCGGGGTTTAATCAGAGTGGATGTTATTTGGAGGCGGTTTTGATGTTTCAG
AGGATGAATTCGGACGGGTTTAGGAGTGATGGGACGAGTATTTCGAGTGTTCTTCCTGCA
GTAAGTGACTTGGAGGATCTCAAGATGGGTGTTCAAGTTCATAGTCATGTCATTAAAACG
GGTTTTGAGTCTGATAACTGTATTATCAGCGCGTTAGTTGATATGTATGGGAAGTGTAGG
TGTACTTCGGAGATGTCACGAGTGTTTGAAGGGGCAGAGGAAATAGATTTGGGTGGTTTT
AATGCTTTGGTTGCTGGGCTATCACGGAATGGTCTTGTTGATGAGGCTTTTAAAGTTTTC
AAAAAGTTTAAGCTCAAAGTGAAGGAATTGAATGTAGTCTCGTGGACTTCGATGATTTCT
TCCTGCTCGCAACATGGCAAAGACCTTGAAGCGCTGGAGATTTTTAGAGAAATGCAGTTG
GCTAAGGTGAGGCCTAATTCTGTAACTATCTCTTGTTTGCTTCCCGCATGTGGCAATATC
GCAGCACTAGTACATGGAAAGGCAACACATTGCTTCTCTTTGAGAAATTGGTTTTCAGAT
GACGTCTATGTCAGTAGTGCATTAATAGATATGTATGCCAATTGTGGAAGGATTCAGTTG
GCTCGCGTCATTTTTGACAGGATGCCAGTACGTAATTTGGTTTGTTGGAATGCAATGACC
AGTGGATACGCAATGCATGGTAAGGCTAAGGAAGCTATTGAAATCTTTGACTCAATGCGA
AGAAGTGGGCAGAAACCTGACTTCATTAGTTTCACGAGTGTTTTATCTGCATGCAGTCAA
GCAGGCCTTACAGAGCAAGGGCAGCATTACTTCGATTGTATGTCTAGAATTCATGGACTT
GAGGCCAGAGTAGAGCACTATGCTTGTATGGTCAGCCTTCTTGGTCGCACAGGAAAGCTT
AAAGAAGCCTATGATATGATTTCCACAATGCCAATTGAACCAGATGCATGTGTTTGGGGT
GCTTTGCTGAGTTCTTGTAGAACACATCGTAATATGAGTTTGGGTGAGATTGCTGCTGAT
AAACTATTTGAACTTGAACCCAAGAATCCTGGAAATTACATCTTACTATCCAATATTTAT
GCGTCTAACAACAGATGGAATGAGGTAGACAAGGTAAGGGACATGATGAAACATGTGGGC
TTGAGTAAAAATCCAGGATGTAGTTGGATTGAAATCAAAAACAAAGTACACATGCTATTA
GCAGGAGATGATTTACATCCTCAAATGCCACAGATTATGGAAAAGTTGCGAAAATTAAGC
ATGGACATGAAGAATACAGGTGTTTCACATGATACAGAACTTGTTTTGCAAGATGTTGAA
GAACAGGATAAGGAGTTGATCTTGTGTGGGCATAGTGAGAAGTTGGCTGTCGTTTTAGGA
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GATGCTAACCGTTATCATCACTTCAATGAAGGTATCTGCTCATGTGGAGATTATTGGTGA