Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc11g005790.2.1
CDS Infomation	Trichome birefringence-like 7 (AHRD V3.3 *** A0A061DKB6_THECC)
Sequence	ATGAGTACTTTCGGTAGAAGTCTCTCTCATAAACAGAGGGCATTGTCAGTTAGCAGCCCT AGATTGTTTGATAAGTCGGTTAGCAGCCCTAGATTTAGTAGGAAAAGTGAGGTTTCAAGA CTTTTTCGTGTACTTATAGCAATTGGATCTGTTGTTTCCTTTTTCTTGGCAATTGGAGGA GGGTATTTGTATGTCCTTCCCAATCTTACAAAATCATTTCATGAGGAGAAATTTGTTAGT TTTAATGGTTCGGATAGTTTTTGTGACATATTTGATGGAAAATGGGTAGTTGATAACAGC TACCCCTTGTACAATGCATCAGAATGCCCCTTTGTGGAGAAAGGATTCAACTGTTTGGCT AATGGTAGAACCAATGATGATTATCTTAAGTGGAGGTGGAAGCCAAAAAATTGTGAACTC CCCAGGTTTAACGTGTATCATATGTTGGAAATTCTCCGAAATAAAAGAATTGTTTTTGTT GGAGACTCGATGAGTAGGACTCAATGGGAGTCTTTGATATGCCTTCTAATGACAGGGGTG CAAGATAAGAGAAGTGTATATGAAGTAAATGGGAATAAGATCACAAAATTAATTCGATTT CTGGGAGTGAGGTTTAGTTCCTTCAATTTCACTGTCGAATTTTATCGATCTGTATTCCTT GTCCAACATACTTGGTCTTCCAAATATGGAATAAAGAGAGTTAGATCAACCCTTACGTTA GACAAGCTTGATGATATCAGCGATGAGTGGATCAATGCAGACGTCCTCATATTCAATTCT GGACAGTGGTGGGTACCTGGGAAGCTTTTTGGAGTGGGGTGCTATTTCCAAGTAAATAGT ACACTGAGGATTGGAATGTCAATTCAGACGGCATTCAGAACTGCCCTTGAGACTTGGTCA TCCTGGATTGATACCAAAATTAACCGTAACAGGACGCGTGTTTTTTTCAGAACGTTTGAA CCTTCTCATTGGAGCAATTTAACTCAGCGGATGTGCAATGTGACAAATCAACCTCTTTCA GAGACTAATGGTCAGGAGAATAGCTCATTTTCTGATGCTGTACTAGAAGTGGCACACAGC ATGAAAGTTCCAGTTAATGTGCTACACATAACTCCCATGTCCGCGTTCAGGAAAGATGCA CATGTTGGTCTTTGGAGTGATAATCCATCTCTGTCTGATTGCAGCCACTGGTGTCTACCT GGACTTCCTGATCTTTGGAATGAAATGGTCTTCTCGTACCTGCATGATAGCTATCAACAT ACGTCATTGTATCAACAAAGAGAATTTAATTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc11g005790.2.1
PEP Infomation	Trichome birefringence-like 7 (AHRD V3.3 *** A0A061DKB6_THECC)
Sequence	MSTFGRSLSHKQRALSVSSPRLFDKSVSSPRFSRKSEVSRLFRVLIAIGSVVSFFLAIGG GYLYVLPNLTKSFHEEKFVSFNGSDSFCDIFDGKWVVDNSYPLYNASECPFVEKGFNCLA NGRTNDDYLKWRWKPKNCELPRFNVYHMLEILRNKRIVFVGDSMSRTQWESLICLLMTGV QDKRSVYEVNGNKITKLIRFLGVRFSSFNFTVEFYRSVFLVQHTWSSKYGIKRVRSTLTL DKLDDISDEWINADVLIFNSGQWWVPGKLFGVGCYFQVNSTLRIGMSIQTAFRTALETWS SWIDTKINRNRTRVFFRTFEPSHWSNLTQRMCNVTNQPLSETNGQENSSFSDAVLEVAHS MKVPVNVLHITPMSAFRKDAHVGLWSDNPSLSDCSHWCLPGLPDLWNEMVFSYLHDSYQH TSLYQQREFN*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc11g005790.2.1
Transcript Infomation	Trichome birefringence-like 7 (AHRD V3.3 *** A0A061DKB6_THECC)
Sequence	AAAATTGAATATGGGGGGAAAATTTTAAGAAAAAAAAGGGCACCCACTCTGTTCTGTTGG ATAGTCTGCATCCCACGTACCAATTTTGCAACTAATCTCTCTTTCTTTATTCAGGTGCTT ATTTCCATAATCTATTTCGATCTAATTTCAATATTCAAGATTTGCATAAAACCACTGTAA GTTGTCTAAATCATTCACAAAATCTGTATAATTTTTTCTTTAATTTGAAAAGGGTGGGAT TGTTTTGTTGTTTGAAACAATAAATGGTTGTATGTGTATATATCCATTGTTGATAGCATG GTAGTATTTTGTGTTGAAGTTTGAGTTTTTATTGATTAAGTGAATCAAGATACAGAAGGG GGTTATACTGGATTTGGTTAAATGGTATTTGGGCTGTGGTATCTTGGATGTTTTTGTGTT AAAGTTTGAGTTTTTATTGATGAAGTGAATCAAGATTCAAAAGGGGTTGTAGTAGATTTG GTTAAATGATAGTTTGTGGTAAAGTTTGAGTTTTTATTGATGAAGTGAATCAATATTCAA AAGGGGTTGTAGTAGATTTGGTTAAATGATAGTTTGTGGTAAAGTTTTGAGTTTTTATTG ATGAAGTGAATCAATATTCAAAAGGGGTTGTACTGGATTTGGTAAAAGTTGGGCTGGTGG TTACTTGGATTATTTTTGTGCTAAAGTTTGAGTTTTTATTGATTAAGTGAATCAAGATTG GAAAGGGGTTCTACTGGATTTGGTTATTGGTAGTTGGGCTAGTGGTTTCTGGGAGATTTT GCTGATGGATTAGCTTGGCGTGTGAACGATCAGTAGTGCTGACTAGAATGTGTTTTGAAG GTTATTGCATTGGTTATTGGAAGTGGTGGAACCAATAACTAGGACAAATGAGTACTTTCG GTAGAAGTCTCTCTCATAAACAGAGGGCATTGTCAGTTAGCAGCCCTAGATTGTTTGATA AGTCGGTTAGCAGCCCTAGATTTAGTAGGAAAAGTGAGGTTTCAAGACTTTTTCGTGTAC TTATAGCAATTGGATCTGTTGTTTCCTTTTTCTTGGCAATTGGAGGAGGGTATTTGTATG TCCTTCCCAATCTTACAAAATCATTTCATGAGGAGAAATTTGTTAGTTTTAATGGTTCGG ATAGTTTTTGTGACATATTTGATGGAAAATGGGTAGTTGATAACAGCTACCCCTTGTACA ATGCATCAGAATGCCCCTTTGTGGAGAAAGGATTCAACTGTTTGGCTAATGGTAGAACCA ATGATGATTATCTTAAGTGGAGGTGGAAGCCAAAAAATTGTGAACTCCCCAGGTTTAACG TGTATCATATGTTGGAAATTCTCCGAAATAAAAGAATTGTTTTTGTTGGAGACTCGATGA GTAGGACTCAATGGGAGTCTTTGATATGCCTTCTAATGACAGGGGTGCAAGATAAGAGAA GTGTATATGAAGTAAATGGGAATAAGATCACAAAATTAATTCGATTTCTGGGAGTGAGGT TTAGTTCCTTCAATTTCACTGTCGAATTTTATCGATCTGTATTCCTTGTCCAACATACTT GGTCTTCCAAATATGGAATAAAGAGAGTTAGATCAACCCTTACGTTAGACAAGCTTGATG ATATCAGCGATGAGTGGATCAATGCAGACGTCCTCATATTCAATTCTGGACAGTGGTGGG TACCTGGGAAGCTTTTTGGAGTGGGGTGCTATTTCCAAGTAAATAGTACACTGAGGATTG GAATGTCAATTCAGACGGCATTCAGAACTGCCCTTGAGACTTGGTCATCCTGGATTGATA CCAAAATTAACCGTAACAGGACGCGTGTTTTTTTCAGAACGTTTGAACCTTCTCATTGGA GCAATTTAACTCAGCGGATGTGCAATGTGACAAATCAACCTCTTTCAGAGACTAATGGTC AGGAGAATAGCTCATTTTCTGATGCTGTACTAGAAGTGGCACACAGCATGAAAGTTCCAG TTAATGTGCTACACATAACTCCCATGTCCGCGTTCAGGAAAGATGCACATGTTGGTCTTT GGAGTGATAATCCATCTCTGTCTGATTGCAGCCACTGGTGTCTACCTGGACTTCCTGATC TTTGGAATGAAATGGTCTTCTCGTACCTGCATGATAGCTATCAACATACGTCATTGTATC AACAAAGAGAATTTAATTAGCTTGGACTGATGATGTATCATAAGAAGGAACTCTACCAGC TTATGTTTTTCTATGGAGGTCTATCAATTTTGCAAAGCAATTTTGGACAAAAATGTATAG TTACAGTGAGTTTTGTACCGCGAAATTGTTCATCTTTTTTTTTGGGGGTGGTTCACTAAA TTTGTTGTAAGAGGGAAGGAGAAAAATGTATATCATTCCCAGAATGTTTGTCTTGTTTAG TGTAATATTTGGAAACAATATGTTATGTAGTTTTTCAAAAAATTATACACTAATGAGAAG AACTATTACATCTCCTCATCTTTCTGTTGTTGTTTAACTCATGAAATATCCAAACCTTCT TCTTCAGAGCTGAAAGGGACATGACCAAAATATAAATTATCAAAGGTCACAAAATCAATT AAAATGTTAGTCTGATTTAGTGTTACAATAGGTTAAAAATCACTCTTGATATATATAACA GGAAAAATATTCAGCAAATGACTTGGCTTATAATATTACTGGTATACATATGTACATGAA AAATTGTCCAAATCTCACTCAAAACACTTTCTGAGCTCTCAGATTCCCTTATAAAAGGAA ATAGAACAAAAAAAACACTGGAATTTCAGAGAACTGCCAAAAATTAATCAATGGCCATTG GTGTAATCCTCTTTCTGGCAGCCTTTATAGGAAT