Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc11g005560.2.1
CDS Infomation	Cellulose synthase (AHRD V3.3 *** M0ZXJ5_SOLTU)
Sequence	ATGAGTTTGTGCTTATCAAAGCTGATGAATTTGGAAGGTGTTCTTGATGACTATTCTGTT GTTCAGGTAGAGTCCGTGCATGAGCTCAGTGAACAGATGTGCCAGATTTGTGGGGATGAA CTTGAGACTAGTGATGGAGAGCTGTTTGTTGCCTGCAATGAATGTGCTTTCCCCGTTTGT AGACTTTGCTATGAGTATGAAAGAAGAGAAGGAACCCAAGCTTGCCCTCAGTGCAAAACT AGATACAAGCGGATTAAAGGTAGTCCACGCGTTGAGGGTGATGAGGAAGAGGATGATACT GATGACATAGAGCACGAGTTTGATTATGGCGTTGAGATTTTACGCCAAGGTTCAGGTCCA GTTTCCTTTGTTTATGGCAGAAGCGGTCATGCTGGTACATATGAATATGGCTCGTCCTCG AGACAAGGTTCATCCACTGATGGTATGGAAATACCTCTTTTGACCTATGGTGAAGAGGAT TCTCAGATTTCTTCCAATCAGCATGCTCTCATAGTGCCTCCTTCGAATGGCTTCGGAAAT GGAATTTATCTAAATCCTCGTACTGAGTCATCGGTATCCTTGCTTCCGAGACCAATGGTT CCAGAGAAAGACATTGCACTATATGGCTATGGAAGTGTTTCTTGGAAGGACAGAATGGAA GACTGGAAGAAAAAGCAGAATGAGAATCTCCCGATGGTCAAGCATCAAGGAGATGGTGGT GGGAGCTTTCAATATTTGCCTATGATGGATGAAGGAAGGCAGCCACTATCAAGAAAATTG CCCATATCCTCAAGCAAGATTAATCCGTACAGAATTCTAATCATACTCCGTCTCACAATT CTTGGCCTCTTCTTCCATTATAGAATTCTTCATCCGGTAAATGATGCAACTGGCCTGTGG TTGACATCAGTTATTTGTGAGATATGGTTTGCTGCTTCATGGATTCTTGATCAGTTCCCG AAGTGGTGCCCTATAGTTCGAGAAACATACCTTGATCGGCTTTCACTCAGGTATGAAAAA GAAGGGAAACCTTCAGAGTTAGCTCCTATTGACATTTTTGTCAGCACAGTCGATCCCTTG AAAGAACCACCATTAATCACTGCAAACACTGTTCTATCCATTCTTGCTGTGGATTATCCA GTGGACAAAGTTACATGCTATGTGTCAGATGATGGTGCAGCAATGCTTACTTTTGAAGCC CTTTCTGAGACATCTAGCTTTGCAAGAAAATGGGTTCCTTTCTGCAAGAAGTATAATATT GAACCTCGTGCTCCAGAATGGTATTTTTCACTAAAGATGGACTATCTGAAAAATAAAGTT CATCCTGCATTTGTAAGGGAACGGCGTGCCATGAAGAGAGAATATGAAGAATTCAAAGTC AAGATAAATGCTCTTGTGGCAACTGCTCAAAGGGTTCCTGACGAAGGTTGGACTATGCAG GATGGCACAGTATGGCCCGGGAACAATGTCCGAGACCATCCTGGTATGATCCAGGTATTA ATGGGTAATGATGGTGTCCACGATGTTGAAGGAAATGATTTACCTTGCCTGGTTTATGTT TCCCGTGAAAAGAGGCCTGGGTTTGATCACCATAAAAAAGCAGGCGCCATGAATGCTCTG ATGAGGGTTTCAGCTGTTATATCAAATGCTCCTTTCTTGTTAAATGTTGATTGTGATCAT TACATCAACAATAGCAAGGCATTGAGGGAAGCCATGTGTTTCTTGATGGACCCCATTTCA GGAAAGAAAATCTGCTATGTGCAGTTTCCACAAAGGTTTGATGGGATTGATCGTCATGAC AGATACTCAAACAGAAATGTTGTGTTCTTTGATATTAACATGAAAGGTTTGGATGGTATA CAAGGACCAATATATGTTGGTACAGGGTGTGTTTTCAGAAGGCATGCACTTTATGGATAT GATGCTCCTGTCAAGAAGAAGAGACCTAGCAAGACCTGCAACTGCTTGCCGAAATTGTGC TCTTGCTGTTGCTGTTTCAGATCGAAAACGAACAAGAAAGGGAAAACAAAGAAATTGAAG AAGCCAAAGCACTGGGAGGCATCAAGTCAAATACATGCTCTTGAAACCATTGAAGAAGGA GTTAAAGAAGCTAATGTGGATTCACGCCCGACTTCCCAAGTGAAACTAGAGAAAAGATTT GGGCAGTCTTCTGTTTTTGTTGCCTCAACACTTCTGGAAAATGGTGGTGTTCCAAAGGAA GCCAGTGCCTCGTCACTTTTGCAGGAAGCCGTTCATGTTATTTGCTGTGGTTATGAAGAT AAAACAGAATGGGGGAAGGAGGTTGGCTGGATTTATGGCTCTGTCACAGAAGATATCTTG ACTGGATTCAAGATGCATTGCCATGGATGGAGGTCCGTGTATTGTATGCCTCAGCTACCT GCTTTCAAGGGTTCAGCCCCTATAAATCTTTCAGACCGTCTCCATCAGGTTCTTAGATGG GCGCTGGGATCAGTTGAAATTTTGTTGAGCAAGCATTGCCCCATCTGGTATGGCTATGGT GGTGGATTGAAGAGGCTTGAGAGGCTCTCTTACATAAACTCTGTTGTGTATCCTTTGACG TCCATTCCCTTGATTGTCTACTGTTCCTTGCCGGCTCTCTGCCTTATCACTGGAAAATTC ATTGTTCCTGAGATCAGTAATTATGCCAGCATTATATTTATCGCACTCTTCATCTCTATT GCTGCCACCGGTATCCTTGAAATGCAGTGGGGTGGTGTTGGTATAGAGGATTGGTGGAGA AATGAGCAGTTTTGGGTTATTGGAGGTGCTTCTGCGCACTTTTTTGCTCTCTTTCAAGGA TTGTTCAAGGTTTTAGCTGGTGTGGAAACAAGATTTACCGTCACCACCAAAGCAGGTGAC GATGGAGAATTTTCGGAGCTCTATATGTTCAAGTGGACATCATTATTGATCCCACCAACG ACTTTGCTAATAGTGAACATAGTTGGAGTTGTGGTTGGTATCTCGGATGCAATAAACAAC GGTTATGACTCTTGGGGACCCTTATTTGGTAGGCTCTTCTTTGCCTTGTGGGTTATTATT CATCTCTACCCATTCCTCAAAGGATTGATGGGAAGACAAGAACGAACCCCTACCATAGTC ATCGTATGGTCTATTCTTCTTGCTTCAGTCTTGACATTATTGTGGGTACGAGTCAATCCG TTTGTCTCAAAAGATGGTCCTCTCCTAGAAGTCTGCGGATTGGATTGTGACGATTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc11g005560.2.1
PEP Infomation	Cellulose synthase (AHRD V3.3 *** M0ZXJ5_SOLTU)
Sequence	MSLCLSKLMNLEGVLDDYSVVQVESVHELSEQMCQICGDELETSDGELFVACNECAFPVC RLCYEYERREGTQACPQCKTRYKRIKGSPRVEGDEEEDDTDDIEHEFDYGVEILRQGSGP VSFVYGRSGHAGTYEYGSSSRQGSSTDGMEIPLLTYGEEDSQISSNQHALIVPPSNGFGN GIYLNPRTESSVSLLPRPMVPEKDIALYGYGSVSWKDRMEDWKKKQNENLPMVKHQGDGG GSFQYLPMMDEGRQPLSRKLPISSSKINPYRILIILRLTILGLFFHYRILHPVNDATGLW LTSVICEIWFAASWILDQFPKWCPIVRETYLDRLSLRYEKEGKPSELAPIDIFVSTVDPL KEPPLITANTVLSILAVDYPVDKVTCYVSDDGAAMLTFEALSETSSFARKWVPFCKKYNI EPRAPEWYFSLKMDYLKNKVHPAFVRERRAMKREYEEFKVKINALVATAQRVPDEGWTMQ DGTVWPGNNVRDHPGMIQVLMGNDGVHDVEGNDLPCLVYVSREKRPGFDHHKKAGAMNAL MRVSAVISNAPFLLNVDCDHYINNSKALREAMCFLMDPISGKKICYVQFPQRFDGIDRHD RYSNRNVVFFDINMKGLDGIQGPIYVGTGCVFRRHALYGYDAPVKKKRPSKTCNCLPKLC SCCCCFRSKTNKKGKTKKLKKPKHWEASSQIHALETIEEGVKEANVDSRPTSQVKLEKRF GQSSVFVASTLLENGGVPKEASASSLLQEAVHVICCGYEDKTEWGKEVGWIYGSVTEDIL TGFKMHCHGWRSVYCMPQLPAFKGSAPINLSDRLHQVLRWALGSVEILLSKHCPIWYGYG GGLKRLERLSYINSVVYPLTSIPLIVYCSLPALCLITGKFIVPEISNYASIIFIALFISI AATGILEMQWGGVGIEDWWRNEQFWVIGGASAHFFALFQGLFKVLAGVETRFTVTTKAGD DGEFSELYMFKWTSLLIPPTTLLIVNIVGVVVGISDAINNGYDSWGPLFGRLFFALWVII HLYPFLKGLMGRQERTPTIVIVWSILLASVLTLLWVRVNPFVSKDGPLLEVCGLDCDD*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc11g005560.2.1
Transcript Infomation	Cellulose synthase (AHRD V3.3 *** M0ZXJ5_SOLTU)
Sequence	GTACACATTTCAATACTTTTTTCTGAACTTTTGGTGTCATTGTGATAAAGAGTGTTTTCA CTCTTTTTGGTTCTTTCTTTTCCTACATTAAGCCAGATTACAGTCAAGACATAGCTTGTA AAGAAGAAATTTTGATACTACAAGCATTGCCAGCATCATCTTTTTTGGGGGGTTCCTACT TTATTGTATGTAACAATATTGTAATATTGTATTTTTCCTTGTGGGAGTTTCCTTATTTTT ATATGTAATGTTGAGTTTATTAATGTTGGGGTTGTTTGGTTTGGGTATTTTCTGATGGGG GTTACATAGTTTTCCAAGATTTAGTTTTTAGTGCATAAAGGTGGCACCTTTATTGATTTT GGGCACTGAAAGGTTGAATCTTTGAGTGGGGTTTTTGAGGAATTTTTTTAAAAAAGTTTT ATCTGGTATTTGGATTGTGAGTGATTGTGGAAAATGGCAATGATGGATACTGGTGGAAGG CTTATTGCTGGTTCTCACATTAGAAATGAGTTTGTGCTTATCAAAGCTGATGAATTTGGA AGGTGTTCTTGATGACTATTCTGTTGTTCAGGTAGAGTCCGTGCATGAGCTCAGTGAACA GATGTGCCAGATTTGTGGGGATGAACTTGAGACTAGTGATGGAGAGCTGTTTGTTGCCTG CAATGAATGTGCTTTCCCCGTTTGTAGACTTTGCTATGAGTATGAAAGAAGAGAAGGAAC CCAAGCTTGCCCTCAGTGCAAAACTAGATACAAGCGGATTAAAGGTAGTCCACGCGTTGA GGGTGATGAGGAAGAGGATGATACTGATGACATAGAGCACGAGTTTGATTATGGCGTTGA GATTTTACGCCAAGGTTCAGGTCCAGTTTCCTTTGTTTATGGCAGAAGCGGTCATGCTGG TACATATGAATATGGCTCGTCCTCGAGACAAGGTTCATCCACTGATGGTATGGAAATACC TCTTTTGACCTATGGTGAAGAGGATTCTCAGATTTCTTCCAATCAGCATGCTCTCATAGT GCCTCCTTCGAATGGCTTCGGAAATGGAATTTATCTAAATCCTCGTACTGAGTCATCGGT ATCCTTGCTTCCGAGACCAATGGTTCCAGAGAAAGACATTGCACTATATGGCTATGGAAG TGTTTCTTGGAAGGACAGAATGGAAGACTGGAAGAAAAAGCAGAATGAGAATCTCCCGAT GGTCAAGCATCAAGGAGATGGTGGTGGGAGCTTTCAATATTTGCCTATGATGGATGAAGG AAGGCAGCCACTATCAAGAAAATTGCCCATATCCTCAAGCAAGATTAATCCGTACAGAAT TCTAATCATACTCCGTCTCACAATTCTTGGCCTCTTCTTCCATTATAGAATTCTTCATCC GGTAAATGATGCAACTGGCCTGTGGTTGACATCAGTTATTTGTGAGATATGGTTTGCTGC TTCATGGATTCTTGATCAGTTCCCGAAGTGGTGCCCTATAGTTCGAGAAACATACCTTGA TCGGCTTTCACTCAGGTATGAAAAAGAAGGGAAACCTTCAGAGTTAGCTCCTATTGACAT TTTTGTCAGCACAGTCGATCCCTTGAAAGAACCACCATTAATCACTGCAAACACTGTTCT ATCCATTCTTGCTGTGGATTATCCAGTGGACAAAGTTACATGCTATGTGTCAGATGATGG TGCAGCAATGCTTACTTTTGAAGCCCTTTCTGAGACATCTAGCTTTGCAAGAAAATGGGT TCCTTTCTGCAAGAAGTATAATATTGAACCTCGTGCTCCAGAATGGTATTTTTCACTAAA GATGGACTATCTGAAAAATAAAGTTCATCCTGCATTTGTAAGGGAACGGCGTGCCATGAA GAGAGAATATGAAGAATTCAAAGTCAAGATAAATGCTCTTGTGGCAACTGCTCAAAGGGT TCCTGACGAAGGTTGGACTATGCAGGATGGCACAGTATGGCCCGGGAACAATGTCCGAGA CCATCCTGGTATGATCCAGGTATTAATGGGTAATGATGGTGTCCACGATGTTGAAGGAAA TGATTTACCTTGCCTGGTTTATGTTTCCCGTGAAAAGAGGCCTGGGTTTGATCACCATAA AAAAGCAGGCGCCATGAATGCTCTGATGAGGGTTTCAGCTGTTATATCAAATGCTCCTTT CTTGTTAAATGTTGATTGTGATCATTACATCAACAATAGCAAGGCATTGAGGGAAGCCAT GTGTTTCTTGATGGACCCCATTTCAGGAAAGAAAATCTGCTATGTGCAGTTTCCACAAAG GTTTGATGGGATTGATCGTCATGACAGATACTCAAACAGAAATGTTGTGTTCTTTGATAT TAACATGAAAGGTTTGGATGGTATACAAGGACCAATATATGTTGGTACAGGGTGTGTTTT CAGAAGGCATGCACTTTATGGATATGATGCTCCTGTCAAGAAGAAGAGACCTAGCAAGAC CTGCAACTGCTTGCCGAAATTGTGCTCTTGCTGTTGCTGTTTCAGATCGAAAACGAACAA GAAAGGGAAAACAAAGAAATTGAAGAAGCCAAAGCACTGGGAGGCATCAAGTCAAATACA TGCTCTTGAAACCATTGAAGAAGGAGTTAAAGAAGCTAATGTGGATTCACGCCCGACTTC CCAAGTGAAACTAGAGAAAAGATTTGGGCAGTCTTCTGTTTTTGTTGCCTCAACACTTCT GGAAAATGGTGGTGTTCCAAAGGAAGCCAGTGCCTCGTCACTTTTGCAGGAAGCCGTTCA TGTTATTTGCTGTGGTTATGAAGATAAAACAGAATGGGGGAAGGAGGTTGGCTGGATTTA TGGCTCTGTCACAGAAGATATCTTGACTGGATTCAAGATGCATTGCCATGGATGGAGGTC CGTGTATTGTATGCCTCAGCTACCTGCTTTCAAGGGTTCAGCCCCTATAAATCTTTCAGA CCGTCTCCATCAGGTTCTTAGATGGGCGCTGGGATCAGTTGAAATTTTGTTGAGCAAGCA TTGCCCCATCTGGTATGGCTATGGTGGTGGATTGAAGAGGCTTGAGAGGCTCTCTTACAT AAACTCTGTTGTGTATCCTTTGACGTCCATTCCCTTGATTGTCTACTGTTCCTTGCCGGC TCTCTGCCTTATCACTGGAAAATTCATTGTTCCTGAGATCAGTAATTATGCCAGCATTAT ATTTATCGCACTCTTCATCTCTATTGCTGCCACCGGTATCCTTGAAATGCAGTGGGGTGG TGTTGGTATAGAGGATTGGTGGAGAAATGAGCAGTTTTGGGTTATTGGAGGTGCTTCTGC GCACTTTTTTGCTCTCTTTCAAGGATTGTTCAAGGTTTTAGCTGGTGTGGAAACAAGATT TACCGTCACCACCAAAGCAGGTGACGATGGAGAATTTTCGGAGCTCTATATGTTCAAGTG GACATCATTATTGATCCCACCAACGACTTTGCTAATAGTGAACATAGTTGGAGTTGTGGT TGGTATCTCGGATGCAATAAACAACGGTTATGACTCTTGGGGACCCTTATTTGGTAGGCT CTTCTTTGCCTTGTGGGTTATTATTCATCTCTACCCATTCCTCAAAGGATTGATGGGAAG ACAAGAACGAACCCCTACCATAGTCATCGTATGGTCTATTCTTCTTGCTTCAGTCTTGAC ATTATTGTGGGTACGAGTCAATCCGTTTGTCTCAAAAGATGGTCCTCTCCTAGAAGTCTG CGGATTGGATTGTGACGATTGAGTCTAAACACTCCAAAGACTTGATTGAATCAAGAATAT TTCCAGCAAGACATTATTGGGATTTCCTTTCGCGGACGAGACATCGATGTGTAGTACTGT GAGAGGGTTTTTGCAGGAAGAGATAATACTATATAGAAGAAGGCTGTTGGTAGAATAAAA AGGGGTAGGTAGGTAGAGGAGTATAGGTGAAGAGAGTCATCAATGTAGATATGAAACACA GAGAGCTGACATATATTCATGATATTTGTTCTTTTGGGAGTTCAATCTATTTGTCAGTGA ATACTTACTAAATCATTAAAGTTATTAACCCTCTGTGAAAGGGCCATCAAATTTGTACAC TCTTGAGTTCAAAAGTTGTGATGTCCTGGTTTATCTGGACTTTAGAATCAACCAATTTTT GTCTTTGGTTATCCAAATTTTGCAGTTATTATGTATTTT