Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc10g082000.2.1
CDS Infomation	Double Clp-N motif P-loop nucleoside triphosphate hydrolase superfamily protein (AHRD V3.3 *** A0A072VJF0_MEDTR)
Sequence	ATGCTTTCATCATCAAATGGTATATTCAAAACAGCTTGTCTTCAATCTCATTCTCATCCT CTCCAATGCAAAGCCCTAGAGCTTTGCTTCAACGTGGCACTCAATCGTCTCCCAGCATCC TCTTCTAGTCCCATGTTATTAGGTCATCAAAATCACAATCATTCTCAATATCCTTCCATT TCTAACGCGCTTGTTGCTGCTTTCAAGCGAGCCCAAGCTCATCAGAGGAGAGGCTCGCTT GAAAATCAGCAACAACCACTTCTAGCTGTGAAGATAGAGCTTGAACAACTCATAATATCT ATATTAGATGATCCTAGTGTTAGTAGAGTCATGAGGGAAGCTGGTTTTGATAGTACTCAA GTTAAAACAAATGTTGAACAAGTTGTTTCTTTAGAGCTTTGTTCTCAAAACCCTAAGGAA ATAAACAAAAAAGCTAATCCCATTATTAGTGCTAAAGATGAGGATGTGATGAGTGTAGTG GAAAGTTTAATGAATAAAAATAGGAAAAATATTGTTTTGGTTAGTGAAAGTATTGATAAT TTACAAGGTGTGATTAAAGGGGTGATGAATAAAGTTGAGATTAAAGATGTGCATGATGAT TTGAAAGAAATTAAGTTTATAAGTTTACAACTTTTGAGTTTTGCTAATATTCAAAGAGAT GAAGTTGACCAAAGATTAGGAGAGTTGACTTGTCTAATTAAGAGTTTAGTGAAAAAAGGA GTTGTTTTGTACTTGGGTGATCTTAAATGGGTGGCTGATTATAGAGCTAATTATGGTGAG AAAAGAATTATTAGCTATTATTGTTCAGTGGAACATATGATTATGGAAATTGGGAGATTA GTATATAGTTTTAGTGAAAATGAGAAATTTTGGCTTGTGGGGATTGCAACATTTCAAAGC TATATGAGATGCAAAAGTGGTAAAAATTCATTGGAATCTATTTGGGGTTTGCATCCTATT ACTGTTCCTGGTGGAAGTTTGGGCCTCAGTCTCAACCCTGACAGTGATACACAAATTGAA GTTAGAAGTAAGACATTTGAAGGTGAATTCTCATGTAGAGAGGAGAAGCTGCACTTAACT AGCTGTTGTAATAGTGACTCTACATTGTCAAATCTACCTTCATGGCTTAAAGATGAGAGA CACAAAAAGGACTATGCATCAGTCAAAGATCTACACAAGAAGGGGGACACAACATGCAAT TTGCCATTTTGGGCCAATAGAAAAATATGTGAGACAAATTCTAGTACACCTAATTCTGCT TCTAATTCAAGTGATGTGATCATGGATATGGAGTACAATGTTCCAAAGTTTAAAGAATTC AACTCTGAAAACTTGAACATTTTATCCAATGCATTAGAAGAAATTGTCCCATGGCAAAAA GGAAGTGTTGTACAAGAAATTGTTGCAACAATATTGCAATGTAGGTCCAAAATGATAAGA AGAAAAGAAAAAAATTTAACCAATGAAGCAAAACAAGAAACTTGGTTATTTTTTCGAGGT CCCGATGTTCATGCCAAGGAGAAAATTGCTAGAGAATTGGCCAATGTTGTGTTTGGATCA TACTCGAATTTCGTATCGATTGGACTAAGCAATTTTTGTTCTAATTTTAGTAACAAAAGG TCAAGAGATGAAGAAAGATGGAGTTACATTGATAAATTTGGTCAAGGGGTTGCTTGTAAT TCACATTGTGTGTTTTACTTGGAGGATTTGGAGGAACTTGATTATTGTTCACTAAGGGGA ATCAAGAAGGCTATTGAAAGAGGAACAATTGTTAATTCTTCAAGTGGTGAAGAAGTGAGT CTTGATGATGCTATTATTATTTTGAGTTGTGACAAACTTGGTTATAAGTCATCAAGAGGT TGTTCACCTAATGTGAAGCAAAAGATTGAAGAAAAAATTAGCACAAGTTCTAGTTGTGTT TCTTTGGATTTGAATCTCTCTATTGATGATCAAGATTTGTCAAGTGATGATGGTGATGAT ATTGGACTTCTTCAAAGTGTTGATAGATGTATTGTTTTCCAAAATCCAACAACTATAGTA GAATAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc10g082000.2.1
PEP Infomation	Double Clp-N motif P-loop nucleoside triphosphate hydrolase superfamily protein (AHRD V3.3 *** A0A072VJF0_MEDTR)
Sequence	MLSSSNGIFKTACLQSHSHPLQCKALELCFNVALNRLPASSSSPMLLGHQNHNHSQYPSI SNALVAAFKRAQAHQRRGSLENQQQPLLAVKIELEQLIISILDDPSVSRVMREAGFDSTQ VKTNVEQVVSLELCSQNPKEINKKANPIISAKDEDVMSVVESLMNKNRKNIVLVSESIDN LQGVIKGVMNKVEIKDVHDDLKEIKFISLQLLSFANIQRDEVDQRLGELTCLIKSLVKKG VVLYLGDLKWVADYRANYGEKRIISYYCSVEHMIMEIGRLVYSFSENEKFWLVGIATFQS YMRCKSGKNSLESIWGLHPITVPGGSLGLSLNPDSDTQIEVRSKTFEGEFSCREEKLHLT SCCNSDSTLSNLPSWLKDERHKKDYASVKDLHKKGDTTCNLPFWANRKICETNSSTPNSA SNSSDVIMDMEYNVPKFKEFNSENLNILSNALEEIVPWQKGSVVQEIVATILQCRSKMIR RKEKNLTNEAKQETWLFFRGPDVHAKEKIARELANVVFGSYSNFVSIGLSNFCSNFSNKR SRDEERWSYIDKFGQGVACNSHCVFYLEDLEELDYCSLRGIKKAIERGTIVNSSSGEEVS LDDAIIILSCDKLGYKSSRGCSPNVKQKIEEKISTSSSCVSLDLNLSIDDQDLSSDDGDD IGLLQSVDRCIVFQNPTTIVE*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc10g082000.2.1
Transcript Infomation	Double Clp-N motif P-loop nucleoside triphosphate hydrolase superfamily protein (AHRD V3.3 *** A0A072VJF0_MEDTR)
Sequence	TATGTATATATCCATTCTATAAATTACTTTCTTACCGTAAATTATTTTGATTTATTGTAA TTATTCGATGTAAATAAGTATTTTTTGAGGTACAATGAGAGACTTAAAAAGCTTTTGTTG CTCCATATCACGAGTAAAATAGATGTGTTGATCATATATATCCAATAAGTATAGTACTAT ATATTATCAGCTTTTATTAAATGATAAATTATAAATAGGTAAAAGATTAATGTATAATAA TTGCATGAAAGGGAGAGTTCCACTTGCACATTCCATATAGTCCCTAAAGTAGATTTAATT TGTTGCTATACATATATATATTCTACTAAATAAATAAAAAATCAGAGGTAAAGCTGAATT GCCTTTAATATTTGTACAATATAGTTCCTCCTCCTTGTCACCACATGCATTCCACTTTCC ACTACATATTTTCCTTTCAACCCCAAAATTTTTGCCTCACTTACAAGAAAAGAACACCCC CCCACCCCCCAAAAATACTTCCACTTTAAAAGAATTTTTTTTAATTTGTTTGAATTTATG TGTTACTTTTTTTTATCTATTTAAAAAAGAATGTCATACTTCTTTATTCAAAAATAATTT CTCCTCAATTTAATGATTTATAGCTACACAACTACTGTAATCTGTACCCATCTTTTTTTT AGTATCTTTGTTTTTTAAAAAAAATTTCATGTTCAGTCAAATATCGTAACATAAATTCAC ATCATATAAGAAAACCCCCACCCCCTTTATATTAATTACACTATGTTCTTCTTCCTCTTC TCTCTCTCTCTCTCTTTATACAATCCTAGAATAGATTTGATCTTTTAGTATAAACTTCCC AACAAAGACTTCTCATTAGGGTTTTCTTGAGTTCTTTAGCACTCAAACACAACACAAACT TTCTCTTAGTATACATGAAAACCAATTTTATTTTGTCCTAGCTAGGTCTTTCAATATCCT TCTTTTCAAAGTGAATAACTCATCATCATACAAAAGAAAAGAAGAAAAGAAATGAGAACA GGAGGTTGCACAATACAACAAGCTCTAACAACAGAAGCATCAAATGTTGTTAGACAATCT GTTACACTAGCCAAACGTCGCGGCCATGCACAAGTAACACCTCTTCATGTAGCAAACACC ATGCTTTCATCATCAAATGGTATATTCAAAACAGCTTGTCTTCAATCTCATTCTCATCCT CTCCAATGCAAAGCCCTAGAGCTTTGCTTCAACGTGGCACTCAATCGTCTCCCAGCATCC TCTTCTAGTCCCATGTTATTAGGTCATCAAAATCACAATCATTCTCAATATCCTTCCATT TCTAACGCGCTTGTTGCTGCTTTCAAGCGAGCCCAAGCTCATCAGAGGAGAGGCTCGCTT GAAAATCAGCAACAACCACTTCTAGCTGTGAAGATAGAGCTTGAACAACTCATAATATCT ATATTAGATGATCCTAGTGTTAGTAGAGTCATGAGGGAAGCTGGTTTTGATAGTACTCAA GTTAAAACAAATGTTGAACAAGTTGTTTCTTTAGAGCTTTGTTCTCAAAACCCTAAGGAA ATAAACAAAAAAGCTAATCCCATTATTAGTGCTAAAGATGAGGATGTGATGAGTGTAGTG GAAAGTTTAATGAATAAAAATAGGAAAAATATTGTTTTGGTTAGTGAAAGTATTGATAAT TTACAAGGTGTGATTAAAGGGGTGATGAATAAAGTTGAGATTAAAGATGTGCATGATGAT TTGAAAGAAATTAAGTTTATAAGTTTACAACTTTTGAGTTTTGCTAATATTCAAAGAGAT GAAGTTGACCAAAGATTAGGAGAGTTGACTTGTCTAATTAAGAGTTTAGTGAAAAAAGGA GTTGTTTTGTACTTGGGTGATCTTAAATGGGTGGCTGATTATAGAGCTAATTATGGTGAG AAAAGAATTATTAGCTATTATTGTTCAGTGGAACATATGATTATGGAAATTGGGAGATTA GTATATAGTTTTAGTGAAAATGAGAAATTTTGGCTTGTGGGGATTGCAACATTTCAAAGC TATATGAGATGCAAAAGTGGTAAAAATTCATTGGAATCTATTTGGGGTTTGCATCCTATT ACTGTTCCTGGTGGAAGTTTGGGCCTCAGTCTCAACCCTGACAGTGATACACAAATTGAA GTTAGAAGTAAGACATTTGAAGGTGAATTCTCATGTAGAGAGGAGAAGCTGCACTTAACT AGCTGTTGTAATAGTGACTCTACATTGTCAAATCTACCTTCATGGCTTAAAGATGAGAGA CACAAAAAGGACTATGCATCAGTCAAAGATCTACACAAGAAGGGGGACACAACATGCAAT TTGCCATTTTGGGCCAATAGAAAAATATGTGAGACAAATTCTAGTACACCTAATTCTGCT TCTAATTCAAGTGATGTGATCATGGATATGGAGTACAATGTTCCAAAGTTTAAAGAATTC AACTCTGAAAACTTGAACATTTTATCCAATGCATTAGAAGAAATTGTCCCATGGCAAAAA GGAAGTGTTGTACAAGAAATTGTTGCAACAATATTGCAATGTAGGTCCAAAATGATAAGA AGAAAAGAAAAAAATTTAACCAATGAAGCAAAACAAGAAACTTGGTTATTTTTTCGAGGT CCCGATGTTCATGCCAAGGAGAAAATTGCTAGAGAATTGGCCAATGTTGTGTTTGGATCA TACTCGAATTTCGTATCGATTGGACTAAGCAATTTTTGTTCTAATTTTAGTAACAAAAGG TCAAGAGATGAAGAAAGATGGAGTTACATTGATAAATTTGGTCAAGGGGTTGCTTGTAAT TCACATTGTGTGTTTTACTTGGAGGATTTGGAGGAACTTGATTATTGTTCACTAAGGGGA ATCAAGAAGGCTATTGAAAGAGGAACAATTGTTAATTCTTCAAGTGGTGAAGAAGTGAGT CTTGATGATGCTATTATTATTTTGAGTTGTGACAAACTTGGTTATAAGTCATCAAGAGGT TGTTCACCTAATGTGAAGCAAAAGATTGAAGAAAAAATTAGCACAAGTTCTAGTTGTGTT TCTTTGGATTTGAATCTCTCTATTGATGATCAAGATTTGTCAAGTGATGATGGTGATGAT ATTGGACTTCTTCAAAGTGTTGATAGATGTATTGTTTTCCAAAATCCAACAACTATAGTA GAATAGGATTTTTACATTATTATGTTGATGATGTTATTTACTTAATTTCTTTGTTTTTTT TTCTTTTCCTCTAATGTTCAAATAGTAGGTCAAAAGAGTTTGATATCTCTTTTTTCTTTT ATGTACTAAAGTTTTG