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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc10g081880.2.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A118JSG8_CYNCS)

Sequence

ATGATACAATGGACGGCGTTGCCTACTCCATTTCCATTTCGTTCAGAAGAATCAGAACCC
ATTTCCATTGACCCCCTTTCTTCTCAGCTTCTCAATCTCCTTTCACACCCAAATTGGCAA
AAACACCCATCTCTCAAGAATCTAATTCCTTCACTTTCCCCTTCTCGTCTATCTTCTTTT
CTCTCACAAAACCCAAATCTTAACCCCCATATCGCGTTTTCCTTCTTTGATTACCTCTCC
CGGATACCCTCATTCAAACCCAGTGTTCAATCTTATGCACCCCTTTTGCGTATTTTGATT
TCCAATAAGCTTTTTCAGGTCGCGGAAAAAACGAGACTTTCTATGATTAAATCATGTGGA
ACAACTGAGGATGTCGTTTTTGTGATGGGTTTTGTGCGGGAGATGAATAAATGTGAAGAT
GGGTTTAGGTTTAAGCTTAATGGGTGGGGTTATAATACATTGTTGATGGCGTTATCTCGG
TTTGTTATGGTTGATGATATGAAATGTGTGTATAATGAGATGTTGAGTGATATGATTAAA
CCTGATGTTTATACTTTTAATACGATGATTAATGGTTATTGTAAATTGGGTAATGTAGTT
GAGGCTGAGGTTTATTTGAGTAAGATTTTTCAAGCTGGTTTGATGCCGGATACACATACG
TACACGTCGTTTATATTGGGTCATTGTAGGAGAAAGGATGTAAATAGTGCTTTTAAGGTT
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CATGGATTGTGTGAAACGAGGAGGATTAATGAAGCGATGAAGCTGTTTTTGGAAATGGCA
GATGATGGTTGTTCTCCAAATGTCCGGACATATACAATTCTCATTGATGCGTTGTGTCGG
TTGGATAGGAGGGTAGAGGCATTGAGTTTGTTTGATGAGATGAGGGAGAAAGGTTGTGAG
CCCAATGTTCATACTTACACTGTTCTCATCGATGGTTTGTGTAAAGACTCTAAGCTTGAC
GAAGCAAGAGAGTTACTAAATGTTATGTCGGAAAAGGGGCTAGTTCCGAGTGCGGTGACA
TACAATGCTCTGATTGATGGATACTGTAAGAAAGGTTTGGTTCATGTTGCATTAAGTATT
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TCTGGCTTTTGTAGGGCGAAAAAGGTGCATAAGGCAATGTCACTACTTGATAAGATGCTT
GAGCGCAAACTATCTCCTAGTAATGTCACTTTTAACTTGTTAGTTCATGGACAGTGTAAA
GATGGTGAAATAGATAGTGCATTTAGGTTGCTTAGATTGATGGAGGAGAATGGATTAGCT
CCTGATGAGTGGAGTTATGGTACTCTAGTTGATGGCTTATGTGAAAGAGGTAGAGTTGAA
GAAGCTAACACCATTTTTAGTTCTCTGAAAGAGAAGGGTATAAAGGTTAATGTTGCAATG
TACACTGCTCTAATTGATGGACATTGCAACGCTGAAAAATTTGATTTTGCCTTCACATTA
TTTAAGAAGATGATCAAGGAAGGTTGCTCCCCAAACGCATGTACTTATAATGTGCTGATT
AACGGGTTGTGTAAACAGGGTAAGCAACTAGAAGCGGCACAATTACTTGAAAGCATGGCA
GAAAGTGGTGTAGAACCCACAATCGAATCCTACAGTATTTTGATTGAGCAACTATTAAAA
GAATGTGCCTTTGACCATGCTGACAAAGTTTTTAGTTTAATGATGTCTAGGGGACATAAG
CCGGATGTCTGCATTTACACTTCATTTCTAGTTGCATATCACAATGAAGGTAAATTGAAA
GAAGCGGAAGATGTGATGGCTAAGATGGCAGAGGCGGGAATTAGGCCAGATTTGATGACC
TATACAGTAATGATTGATGGTTATGGTCGTGCAGGATTATTAAATCGAGCCTTTGATATG
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AAACATTTGTCCCAAGGAGGACTTGATCTCAAAATAGAGGCCAGTTCCATTAATATTGCT
GATGTGTGGAAAGTAGTAAAATATGAAACTTTGCTTAAACTCTTAAATAAAATGGAGGAA
CATGGATGTCCTCCTAATACAAACGGTTTTAGTTCGCTTGCTATTGGTCTCTGTAGAGAA
GGACGTCTTGAGGAGGCTTCGAGGTTACTTGATCATATGCAGAGTTGCGGAATGTCTGCT
TCTGAAGATATGTACACCTCAATGGTAAATTGTTGTTGCAAGTTGAAAATGTATGAGGAT
GCAACAAGATTTCTTGACACAATGCTTACACAAGGTTTCTTACCACGCTTAGAGTCGTAC
AAGCTCCTTATATGTGGGTTGTATGATAATGGAAACAATGATAAAGCTAAGGCAGCCTTC
TTTCGACTTCTTGATTGTGGGTACAATAATGATGAAGTAGCTTGGAAGCTTCTAATTGAT
GGCTTACTTAAGAGGGGACTTGTAGATAGATGTTCTGAGTTGTTGGATATTATGGAGAAA
AATGGTTCTCGGCTTAGTTCCCAGACATATACATTTCTGCTAGAGGGACTTGATAGAACA
GACAACAAATGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc10g081880.2.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A118JSG8_CYNCS)

Sequence

MIQWTALPTPFPFRSEESEPISIDPLSSQLLNLLSHPNWQKHPSLKNLIPSLSPSRLSSF
LSQNPNLNPHIAFSFFDYLSRIPSFKPSVQSYAPLLRILISNKLFQVAEKTRLSMIKSCG
TTEDVVFVMGFVREMNKCEDGFRFKLNGWGYNTLLMALSRFVMVDDMKCVYNEMLSDMIK
PDVYTFNTMINGYCKLGNVVEAEVYLSKIFQAGLMPDTHTYTSFILGHCRRKDVNSAFKV
FREMQIKGCQRNVVSYNNLIHGLCETRRINEAMKLFLEMADDGCSPNVRTYTILIDALCR
LDRRVEALSLFDEMREKGCEPNVHTYTVLIDGLCKDSKLDEARELLNVMSEKGLVPSAVT
YNALIDGYCKKGLVHVALSILDTMESKSCLPNVRTYNELISGFCRAKKVHKAMSLLDKML
ERKLSPSNVTFNLLVHGQCKDGEIDSAFRLLRLMEENGLAPDEWSYGTLVDGLCERGRVE
EANTIFSSLKEKGIKVNVAMYTALIDGHCNAEKFDFAFTLFKKMIKEGCSPNACTYNVLI
NGLCKQGKQLEAAQLLESMAESGVEPTIESYSILIEQLLKECAFDHADKVFSLMMSRGHK
PDVCIYTSFLVAYHNEGKLKEAEDVMAKMAEAGIRPDLMTYTVMIDGYGRAGLLNRAFDM
LKCMFDSGYEPSHYTYSVLIKHLSQGGLDLKIEASSINIADVWKVVKYETLLKLLNKMEE
HGCPPNTNGFSSLAIGLCREGRLEEASRLLDHMQSCGMSASEDMYTSMVNCCCKLKMYED
ATRFLDTMLTQGFLPRLESYKLLICGLYDNGNNDKAKAAFFRLLDCGYNNDEVAWKLLID
GLLKRGLVDRCSELLDIMEKNGSRLSSQTYTFLLEGLDRTDNK*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc10g081880.2.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A118JSG8_CYNCS)

Sequence

ATGATACAATGGACGGCGTTGCCTACTCCATTTCCATTTCGTTCAGAAGAATCAGAACCC
ATTTCCATTGACCCCCTTTCTTCTCAGCTTCTCAATCTCCTTTCACACCCAAATTGGCAA
AAACACCCATCTCTCAAGAATCTAATTCCTTCACTTTCCCCTTCTCGTCTATCTTCTTTT
CTCTCACAAAACCCAAATCTTAACCCCCATATCGCGTTTTCCTTCTTTGATTACCTCTCC
CGGATACCCTCATTCAAACCCAGTGTTCAATCTTATGCACCCCTTTTGCGTATTTTGATT
TCCAATAAGCTTTTTCAGGTCGCGGAAAAAACGAGACTTTCTATGATTAAATCATGTGGA
ACAACTGAGGATGTCGTTTTTGTGATGGGTTTTGTGCGGGAGATGAATAAATGTGAAGAT
GGGTTTAGGTTTAAGCTTAATGGGTGGGGTTATAATACATTGTTGATGGCGTTATCTCGG
TTTGTTATGGTTGATGATATGAAATGTGTGTATAATGAGATGTTGAGTGATATGATTAAA
CCTGATGTTTATACTTTTAATACGATGATTAATGGTTATTGTAAATTGGGTAATGTAGTT
GAGGCTGAGGTTTATTTGAGTAAGATTTTTCAAGCTGGTTTGATGCCGGATACACATACG
TACACGTCGTTTATATTGGGTCATTGTAGGAGAAAGGATGTAAATAGTGCTTTTAAGGTT
TTTAGGGAAATGCAGATAAAGGGTTGTCAAAGAAATGTGGTTTCATACAATAATTTGATT
CATGGATTGTGTGAAACGAGGAGGATTAATGAAGCGATGAAGCTGTTTTTGGAAATGGCA
GATGATGGTTGTTCTCCAAATGTCCGGACATATACAATTCTCATTGATGCGTTGTGTCGG
TTGGATAGGAGGGTAGAGGCATTGAGTTTGTTTGATGAGATGAGGGAGAAAGGTTGTGAG
CCCAATGTTCATACTTACACTGTTCTCATCGATGGTTTGTGTAAAGACTCTAAGCTTGAC
GAAGCAAGAGAGTTACTAAATGTTATGTCGGAAAAGGGGCTAGTTCCGAGTGCGGTGACA
TACAATGCTCTGATTGATGGATACTGTAAGAAAGGTTTGGTTCATGTTGCATTAAGTATT
TTAGACACAATGGAATCGAAAAGTTGTCTCCCAAATGTACGTACATACAATGAATTGATT
TCTGGCTTTTGTAGGGCGAAAAAGGTGCATAAGGCAATGTCACTACTTGATAAGATGCTT
GAGCGCAAACTATCTCCTAGTAATGTCACTTTTAACTTGTTAGTTCATGGACAGTGTAAA
GATGGTGAAATAGATAGTGCATTTAGGTTGCTTAGATTGATGGAGGAGAATGGATTAGCT
CCTGATGAGTGGAGTTATGGTACTCTAGTTGATGGCTTATGTGAAAGAGGTAGAGTTGAA
GAAGCTAACACCATTTTTAGTTCTCTGAAAGAGAAGGGTATAAAGGTTAATGTTGCAATG
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GAAAGTGGTGTAGAACCCACAATCGAATCCTACAGTATTTTGATTGAGCAACTATTAAAA
GAATGTGCCTTTGACCATGCTGACAAAGTTTTTAGTTTAATGATGTCTAGGGGACATAAG
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GAAGCGGAAGATGTGATGGCTAAGATGGCAGAGGCGGGAATTAGGCCAGATTTGATGACC
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TTTCGACTTCTTGATTGTGGGTACAATAATGATGAAGTAGCTTGGAAGCTTCTAATTGAT
GGCTTACTTAAGAGGGGACTTGTAGATAGATGTTCTGAGTTGTTGGATATTATGGAGAAA
AATGGTTCTCGGCTTAGTTCCCAGACATATACATTTCTGCTAGAGGGACTTGATAGAACA
GACAACAAATGA