Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc10g080210.2.1

CDS Infomation

polygalacturonase

Sequence

ATGGTTATCCAAAGGAATAGTATTCTCCTTCTCATTATTATTTTTGCTTCATCAATTTCA
ACTTGTAGAAGCAATGTTATTGATGACAATTTATTCAAACAAGTTTATGATAATATTCTT
GAACAAGAATTTGCTCATGATTTTCAAGCTTATCTTTCTTATTTGAGCAAAAATATTGAA
AGCAACAATAATATTGACAAGGTTGATAAAAATGGGATTAAAGTGATTAATGTACTTAGC
TTTGGAGCTAAGGGTGATGGAAAAACATATGATAATATTGCATTTGAGCAAGCATGGAAT
GAAGCATGTTCATCTAGAACACCTGTTCAATTTGTGGTTCCTAAAAACAAGAATTATCTT
CTCAAGCAAATCACCTTTTCAGGTCCATGCAGATCTTCTATTTCAGTAAAGATTTTTGGA
TCCTTAGAAGCATCTAGTAAAATTTCAGACTACAAAGATAGAAGGCTTTGGATTGCTTTT
GATAGTGTTCAAAATTTAGTTGTTGGAGGAGGAGGAACTATCAATGGCAATGGACAAGTA
TGGTGGCCAAGTTCTTGCAAAATAAATAAATCACTGCCATGCAGGGATGCACCAACGGCC
TTAACCTTCTGGAATTGCAAAAATTTGAAAGTGAATAATCTAAAGAGTAAAAATGCACAA
CAAATTCATATCAAATTTGAGTCATGCACTAATGTTGTAGCTTCAAATTTGATGATCAAT
GCTTCAGCAAAGAGCCCAAATACTGATGGAGTCCATGTATCAAATACTCAATATATTCAA
ATATCTGATACTATTATTGGAACAGGTGATGATTGTATTTCAATTGTTTCTGGATCTCAA
AATGTGCAGGCCACAAATATTACTTGTGGTCCAGGTCATGGTATAAGTATTGGAAGCTTA
GGATCTGGAAATTCAGAAGCTTATGTGTCTAATGTTACTGTAAATGAAGCCAAAATTATC
GGTGCCGAAAATGGAGTTAGGATCAAGACTTGGCAGGGAGGATCTGGACAAGCTAGCAAC
ATCAAATTTCTGAATGTGGAAATGCAAGACGTTAAGTATCCCATAATTATAGACCAAAAC
TATTGTGATCGAGTTGAACCATGTATACAACAGTTTTCAGCAGTTCAAGTGAAAAATGTG
GTGTATGAGAATATCAAGGGCACAAGTGCAACAAAGGTGGCCATAAAATTTGATTGCAGC
ACAAACTTTCCATGTGAAGGAATTATAATGGAGAATATAAATTTAGTAGGGGAAAGTGGA
AAACCATCAGAGGCTACGTGCAAAAATGTCCATTTTAACAATGCTGAACATGTTACACCA
CACTGCACTTCACTAGAAATTTCAGAGGATGAAGCTCTTTTGTATAATTATTAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc10g080210.2.1

PEP Infomation

polygalacturonase

Sequence

MVIQRNSILLLIIIFASSISTCRSNVIDDNLFKQVYDNILEQEFAHDFQAYLSYLSKNIE
SNNNIDKVDKNGIKVINVLSFGAKGDGKTYDNIAFEQAWNEACSSRTPVQFVVPKNKNYL
LKQITFSGPCRSSISVKIFGSLEASSKISDYKDRRLWIAFDSVQNLVVGGGGTINGNGQV
WWPSSCKINKSLPCRDAPTALTFWNCKNLKVNNLKSKNAQQIHIKFESCTNVVASNLMIN
ASAKSPNTDGVHVSNTQYIQISDTIIGTGDDCISIVSGSQNVQATNITCGPGHGISIGSL
GSGNSEAYVSNVTVNEAKIIGAENGVRIKTWQGGSGQASNIKFLNVEMQDVKYPIIIDQN
YCDRVEPCIQQFSAVQVKNVVYENIKGTSATKVAIKFDCSTNFPCEGIIMENINLVGESG
KPSEATCKNVHFNNAEHVTPHCTSLEISEDEALLYNY*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc10g080210.2.1

Transcript Infomation

polygalacturonase

Sequence

TCTATAAATAGACAAACCCTTCCCATACCTCTTATCATAAAAAAAATAATAATCTTTTTC
AATAGACAAGTTTAAAAACCATACCATATAACAATATATCATGGTTATCCAAAGGAATAG
TATTCTCCTTCTCATTATTATTTTTGCTTCATCAATTTCAACTTGTAGAAGCAATGTTAT
TGATGACAATTTATTCAAACAAGTTTATGATAATATTCTTGAACAAGAATTTGCTCATGA
TTTTCAAGCTTATCTTTCTTATTTGAGCAAAAATATTGAAAGCAACAATAATATTGACAA
GGTTGATAAAAATGGGATTAAAGTGATTAATGTACTTAGCTTTGGAGCTAAGGGTGATGG
AAAAACATATGATAATATTGCATTTGAGCAAGCATGGAATGAAGCATGTTCATCTAGAAC
ACCTGTTCAATTTGTGGTTCCTAAAAACAAGAATTATCTTCTCAAGCAAATCACCTTTTC
AGGTCCATGCAGATCTTCTATTTCAGTAAAGATTTTTGGATCCTTAGAAGCATCTAGTAA
AATTTCAGACTACAAAGATAGAAGGCTTTGGATTGCTTTTGATAGTGTTCAAAATTTAGT
TGTTGGAGGAGGAGGAACTATCAATGGCAATGGACAAGTATGGTGGCCAAGTTCTTGCAA
AATAAATAAATCACTGCCATGCAGGGATGCACCAACGGCCTTAACCTTCTGGAATTGCAA
AAATTTGAAAGTGAATAATCTAAAGAGTAAAAATGCACAACAAATTCATATCAAATTTGA
GTCATGCACTAATGTTGTAGCTTCAAATTTGATGATCAATGCTTCAGCAAAGAGCCCAAA
TACTGATGGAGTCCATGTATCAAATACTCAATATATTCAAATATCTGATACTATTATTGG
AACAGGTGATGATTGTATTTCAATTGTTTCTGGATCTCAAAATGTGCAGGCCACAAATAT
TACTTGTGGTCCAGGTCATGGTATAAGTATTGGAAGCTTAGGATCTGGAAATTCAGAAGC
TTATGTGTCTAATGTTACTGTAAATGAAGCCAAAATTATCGGTGCCGAAAATGGAGTTAG
GATCAAGACTTGGCAGGGAGGATCTGGACAAGCTAGCAACATCAAATTTCTGAATGTGGA
AATGCAAGACGTTAAGTATCCCATAATTATAGACCAAAACTATTGTGATCGAGTTGAACC
ATGTATACAACAGTTTTCAGCAGTTCAAGTGAAAAATGTGGTGTATGAGAATATCAAGGG
CACAAGTGCAACAAAGGTGGCCATAAAATTTGATTGCAGCACAAACTTTCCATGTGAAGG
AATTATAATGGAGAATATAAATTTAGTAGGGGAAAGTGGAAAACCATCAGAGGCTACGTG
CAAAAATGTCCATTTTAACAATGCTGAACATGTTACACCACACTGCACTTCACTAGAAAT
TTCAGAGGATGAAGCTCTTTTGTATAATTATTAATTTATACTATAGATCTTCAATATATA
GCAGATATGATATATCACAATAAACAAATCTATATCTATGTATTGAATAATTATTATTAA
TATGTACGGATTGAAGTTTTAATAAGACTACTATGTATTTCTATTTTCTAGTCAAAAGTT
TGACGATTGTACTTTTTAATGTACAAAAATAATAAAATGGTTATTTATATGATGTATATA
TATCCCTTTGGTATTTCTTGTTGAACTATAATGTCATTATTTAATAACTATTATCTGTGC
AATGATTGTATTTGTTAATAATACATAATATATCTTTCATCATTGATAAT