Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc10g055650.2.1
CDS Infomation	Protein phosphatase 2c, putative (AHRD V3.3 *** B9S5K3_RICCO)
Sequence	ATGTTATCTGGATTAATGAACTACTTGAGGGCTTGTTTTCAGCCAAGGGCCAATCGACAC GTTCATACAGGTTCTGATGCCAGTGGACGTCAAGATGGGCTACTATGGTACAAGGATACA GGGCAACATTTTAATGGAGACTTCTCAATGGCTGTAGTTCAGGCTAATAATCTATTAGAG GATCAGAGCCAAGTTGAATCAGGGTGTTTGGGATTGAATGATTCAGGTCCTTATGGTACC TTTGTTGGAATTTATGATGGACATGGTGGCCCTGAGACTTCAAGGTTCATCAATGATAAC CTCTTTCAGCATCTCAAGAGGTGTACATCTGACCAGCAAACTATGTCTGTGGAGGTGATC CGGAAGGCATTTCAAGCCACAGAAGAGGGTTTCCTCTCTATTGTCACAAGGCGATGGCCA ACACAACCTCAGATTGCTGCTGTTGGATCATGCTGCCTTGTTGGAGTAATCTGCAGTGGG ACATTATATGTTGCCAACCTTGGCGACTCTCGAGCAGTCTTGGGGAGGCTTGTCAAGGCA ACTGGAGAGATTATTGCTATACAGCTTTCTGCAGAACACAATGCAAGTATTGAATCTGTA AGGCAGGAAATGCAGTCTTTGCATCCAGATGACTCGCAAATTGTAGTTTTAAAGCACAAT GTTTGGCGTGTGAAGGGTATTATACAAATCACAAGATCCATTGGTGATGTGTACTTAAAG AAAGCTGAATTCAACAGGGAACCGTTGTACGCTAAGTTTCGGCTCCGTGAATCATTTCAA AGGCCCATATTGAGCGCAGATCCAGCTATTTTGGTGCACCCGGTACAACCTCAGGATCAG TTTATTATATTTGCCTCGGATGGTCTCTGGGAGCACCTAAGTAACCAAGATGCTGTTGAC ATTGTACAAAATCACCCACGCAATGGGATTGCGAAAAGGCTAGTAAAAACTGCATTGCAA GAAGCAGCAAAGAAAAGGGAGATGAGGTACTCAGACTTGAAGAAAATTGATCGTGGAGTA CGTCGACATTTCCATGATGACATCTCCGTTGTGGTAATATTCCTCGACTCAGATTTTGCG AGCAGGGCTAGCTCTGGGAAGGTACCAAACGTATCTGTAAAAGGTGGCGGGATAAGTCTG CCTCGAAACACACTTGCCCCAACCTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc10g055650.2.1
PEP Infomation	Protein phosphatase 2c, putative (AHRD V3.3 *** B9S5K3_RICCO)
Sequence	MLSGLMNYLRACFQPRANRHVHTGSDASGRQDGLLWYKDTGQHFNGDFSMAVVQANNLLE DQSQVESGCLGLNDSGPYGTFVGIYDGHGGPETSRFINDNLFQHLKRCTSDQQTMSVEVI RKAFQATEEGFLSIVTRRWPTQPQIAAVGSCCLVGVICSGTLYVANLGDSRAVLGRLVKA TGEIIAIQLSAEHNASIESVRQEMQSLHPDDSQIVVLKHNVWRVKGIIQITRSIGDVYLK KAEFNREPLYAKFRLRESFQRPILSADPAILVHPVQPQDQFIIFASDGLWEHLSNQDAVD IVQNHPRNGIAKRLVKTALQEAAKKREMRYSDLKKIDRGVRRHFHDDISVVVIFLDSDFA SRASSGKVPNVSVKGGGISLPRNTLAPT*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc10g055650.2.1
Transcript Infomation	Protein phosphatase 2c, putative (AHRD V3.3 *** B9S5K3_RICCO)
Sequence	TTGAATAGTGAATTATTTGTGTAATAAAGTATTTGTTGATAGCCACCCCCACCACCAAAA GAGAAAAAGAGCACATGATGGAGTAGTAGTTTAGATGGATAAATAAATGATGTTATTCAT TATTTTCTTGATAACCAGCCAATGTTACCTGATATGAGGATATTTCATGGAAATTCCAAT TCCAACTTGCAAAATATATTATTATATCCAAACAAAAATAAAAAATACTCATTGACTCTT TTGGAGTGTCTCTGTGTATTGGCTACTTTCTTCTCTCTAGATTTTCTCTCTCTCTATCCT CAACTCTATATGTGTATGTGTGGAGCCCAAAGCTGGTCCTATGCTTTGCTGGCTTCAAGC TCTCCATTCTTGATTTATAATATAATGGGGGTTTTCTCTTCAAAGAGTTTCACTTGGTCC AATGGAAACAAATAACTCAAAACACTAATTGATAACTCCTTTTCACTCTTTTTTTTTTAT TTCATCACAATCTTAAATCTTCAAGAAAAGTGAGAAAAAATACAAAAAGGGTTATCAAAA TCAAACCCCACTTCAGTTTTTGCTTTGATTTGATGGATCCACAGATCTAATACTCTTTCA CTTTCAGATCTTCCATTTCCCATAGTAAAGGTAAGTTTTTTCATATACCCTTATCTTTAA TTAGTATTTGTGTGATTCTTGAAATTTTGGAGATCAAGAAAGTTGGTTTCTTTATTTGAT GTAAAACTGGCTGACCATAGACAGTTCTTTGTTGAAAAAGTGATTTTGACTACTTCAAAG TTCCTATATTTTTTTTATTGATGTTGAATTTTGGTATTGGATACTTTGGTTTCTTAGTTT TATAGTAAAGATTTGTACTTGCTTTGAGGAGGAACCTATGCAAAGTTTAGGTTTATTTAG TGTGTCCTGTTAGATGTGGAGAGTTTAGATGGTGTATTGGAGGAGATGAGGTATGTTATC TGGATTAATGAACTACTTGAGGGCTTGTTTTCAGCCAAGGGCCAATCGACACGTTCATAC AGGTTCTGATGCCAGTGGACGTCAAGATGGGCTACTATGGTACAAGGATACAGGGCAACA TTTTAATGGAGACTTCTCAATGGCTGTAGTTCAGGCTAATAATCTATTAGAGGATCAGAG CCAAGTTGAATCAGGGTGTTTGGGATTGAATGATTCAGGTCCTTATGGTACCTTTGTTGG AATTTATGATGGACATGGTGGCCCTGAGACTTCAAGGTTCATCAATGATAACCTCTTTCA GCATCTCAAGAGGTGTACATCTGACCAGCAAACTATGTCTGTGGAGGTGATCCGGAAGGC ATTTCAAGCCACAGAAGAGGGTTTCCTCTCTATTGTCACAAGGCGATGGCCAACACAACC TCAGATTGCTGCTGTTGGATCATGCTGCCTTGTTGGAGTAATCTGCAGTGGGACATTATA TGTTGCCAACCTTGGCGACTCTCGAGCAGTCTTGGGGAGGCTTGTCAAGGCAACTGGAGA GATTATTGCTATACAGCTTTCTGCAGAACACAATGCAAGTATTGAATCTGTAAGGCAGGA AATGCAGTCTTTGCATCCAGATGACTCGCAAATTGTAGTTTTAAAGCACAATGTTTGGCG TGTGAAGGGTATTATACAAATCACAAGATCCATTGGTGATGTGTACTTAAAGAAAGCTGA ATTCAACAGGGAACCGTTGTACGCTAAGTTTCGGCTCCGTGAATCATTTCAAAGGCCCAT ATTGAGCGCAGATCCAGCTATTTTGGTGCACCCGGTACAACCTCAGGATCAGTTTATTAT ATTTGCCTCGGATGGTCTCTGGGAGCACCTAAGTAACCAAGATGCTGTTGACATTGTACA AAATCACCCACGCAATGGGATTGCGAAAAGGCTAGTAAAAACTGCATTGCAAGAAGCAGC AAAGAAAAGGGAGATGAGGTACTCAGACTTGAAGAAAATTGATCGTGGAGTACGTCGACA TTTCCATGATGACATCTCCGTTGTGGTAATATTCCTCGACTCAGATTTTGCGAGCAGGGC TAGCTCTGGGAAGGTACCAAACGTATCTGTAAAAGGTGGCGGGATAAGTCTGCCTCGAAA CACACTTGCCCCAACCTAATCGTGGTGCGTGTGACTCGATGAAGCTCTCTTTCAAATGAT GTTGTACTATTTTCTTGTGAATACCAGGTAGCTTCTGAAAAGATAACAGCAGGCCTGCAA TTTTAATTTTCTTTTAAAAAATTAATGTACACCTTAGTTTAACTTGAGACTAATACAAAT TTAGTTCCTATGCTCAAGGGACTTGAAAAAAAGAGATCTACACCATTAGGCTTCTTTTGC TTCCTCTCAAACCTTTTTTCATTTGGATTTTGTAAATTATGTGACCTTGCTGCTGTAAAT GTTTTTATGCCTTTATTATTCTTTAATCTCTATTGCTAAGTGTCAAGTGGAGTGATGGTT TGAATTTAACTTGTATGCTTTGATCGTATAATTCTTATATGACGTAGCAGGTAATATGTC CTATTTTCCCCTCACATTCTCACTGTTATGTGTCCCCTTTTTTTATGTGATCTAACTATT TTACGTGATCAGTGTATAGAAGTTAAACTTGGCCTTTCCGTTGTAGATTTGTGCATCATT CATGGTGAAGCCATCCAGACAGCTTTTAATTAAAATAAAACATCTTGATTAGTTACATTT GCATGTATAAATTGTAGTAGCTTGCTCTTTTGTACTCTAAATTTGAATATCTTTGTTTAA TTTGTCATCTTAGTTGTATAGTATAGTGATCAAATAGTGTTGGTGTATGAATAACAGTAT CTTATTATTTTAACCAAAAAAAAACACCATATTATGGTCAAATGAATTACATAAATGAGT ACCAAACACAAATTTAAAATAGTCGGACTAACTTCAAAGTCCAAATTAATTGGCAGTGGG TAGGGAATACGAAACAAGTTACAAACTGTTTCTAACTTTAGAATTGTCAAAATCTATTTT CCATTTCTTTTATTTAGTGGCAAGAAAGGGTCAGGCG