Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc10g052880.1.1
CDS Infomation	LOW QUALITY:Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase family protein (AHRD V3.3 *** A0A061DFG6_THECC)
Sequence	ATGCTCTGTTTCTCTCAATTTCCTATCCCTCTCTTCTTTTTCCTCTCTATCCTCCTTATC CTCCAACACCATTGCCTCGCAAACTGCCACGTGGACGATGAGACCGGGTTGTTAGGATTC AAATCGGGTATCAAATCTGACCCGTCAGGTCTTCTGTCAAGCTGGAAATCAGGTACTGAT TGTTGTAAATGGTCGGGTATATCTTGTGGGGAAAACAATCGGGTCACAAGTCTATCAATT GATGGACAACCGGGGAAAAACCAAGTCTTATCTGGTACCATCTCACCATCTCTCTCCAAA CTAAAAATGCTAACCAGTATTTCTCTTACAAATCTTAAAAACTTAGCTGGTACACCAAAT TTCCTCCTTTCTTTTCCTAATATTCAAATAGTTTATCTCGAAAACAATAATTTGTCAGGT CAAATATCCCCAAAAATTGGTAACTTGACCCAACTTTTTGCACTTAGTTTTTTGGGTAAC AAGTTAACCGGGCCGATACCAAGTTCGATAGGGCAGTTAACTCAGTTGAGTCAGCTCAAA CTCGGTGATAACCTGCTCACTGGCACAATTCCCAATACATTCGACAAACTCAAAGGCTTA ACTTATTTAAGCTTAGAAAAAAATCAACTTAGTGGGTCGATACCAAATTTTTTCAATTCC TTATCTAATCTCAGAATATTAACACTTTCTCACAACAAATTTACTGGCAATTTTCCAAGT AGTATAACTACTTTGGCTCCAATATTAAGGTTCCTTGAGGTAGGGCACAATTATTTATCC GGGAAAATCCCAGATTTTCTCGGAAAATTTCGTTCCCTAGACACATTAGATCTTTCTTAT AACAAATTCTCGGGAACAGTGCCAAAAACTTTTGCGAATCTTACCAAAATCTTTAATCTC AATCTATCTCATAATCTTCTAGTGGATCCATTCCCAGCATTATTTGTAAAAGGCATTGAA TCTCTAGATTTGTCGTATAATAATTTCCATTTAAATACGATACCAAGTTGGGTGACTTCA TCTCCGATTATATACTCATTGAAGCTAGCAAAATGCGGGATCAAGATCAAATTGGATGAT TGGAACCCAAAAACAACGTATTTTTACGACTATATTGATTTATCGGATAATGACATTACT GGAAGTCCGATTGGGCTGTTGAATAAGACTGATTTCTTAATTGGATTTTATGCTGCTGGG AATAAATTAAAGTTTGATTTGGAGAAAATGAAGATTGTTAAGACACTTAAGGAATTGGAT TTGTCTAGAAATATGGTTTATGGGGAAGTTCCAAAGGAAATTAGTGGACTAAACAAGTTG AATTTGAGTAATAATCATTTGAGTGGTCAACTTCCACCAACAAAGTTTAAGGCTAATTCA TTTGCTGGAAATAAAGGACTTTGTGGTTCACCGTTGCCCCCTTGCAGAAAGTTTTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc10g052880.1.1
PEP Infomation	LOW QUALITY:Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase family protein (AHRD V3.3 *** A0A061DFG6_THECC)
Sequence	MLCFSQFPIPLFFFLSILLILQHHCLANCHVDDETGLLGFKSGIKSDPSGLLSSWKSGTD CCKWSGISCGENNRVTSLSIDGQPGKNQVLSGTISPSLSKLKMLTSISLTNLKNLAGTPN FLLSFPNIQIVYLENNNLSGQISPKIGNLTQLFALSFLGNKLTGPIPSSIGQLTQLSQLK LGDNLLTGTIPNTFDKLKGLTYLSLEKNQLSGSIPNFFNSLSNLRILTLSHNKFTGNFPS SITTLAPILRFLEVGHNYLSGKIPDFLGKFRSLDTLDLSYNKFSGTVPKTFANLTKIFNL NLSHNLLVDPFPALFVKGIESLDLSYNNFHLNTIPSWVTSSPIIYSLKLAKCGIKIKLDD WNPKTTYFYDYIDLSDNDITGSPIGLLNKTDFLIGFYAAGNKLKFDLEKMKIVKTLKELD LSRNMVYGEVPKEISGLNKLNLSNNHLSGQLPPTKFKANSFAGNKGLCGSPLPPCRKF*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc10g052880.1.1
Transcript Infomation	LOW QUALITY:Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase family protein (AHRD V3.3 *** A0A061DFG6_THECC)
Sequence	ATGCTCTGTTTCTCTCAATTTCCTATCCCTCTCTTCTTTTTCCTCTCTATCCTCCTTATC CTCCAACACCATTGCCTCGCAAACTGCCACGTGGACGATGAGACCGGGTTGTTAGGATTC AAATCGGGTATCAAATCTGACCCGTCAGGTCTTCTGTCAAGCTGGAAATCAGGTACTGAT TGTTGTAAATGGTCGGGTATATCTTGTGGGGAAAACAATCGGGTCACAAGTCTATCAATT GATGGACAACCGGGGAAAAACCAAGTCTTATCTGGTACCATCTCACCATCTCTCTCCAAA CTAAAAATGCTAACCAGTATTTCTCTTACAAATCTTAAAAACTTAGCTGGTACACCAAAT TTCCTCCTTTCTTTTCCTAATATTCAAATAGTTTATCTCGAAAACAATAATTTGTCAGGT CAAATATCCCCAAAAATTGGTAACTTGACCCAACTTTTTGCACTTAGTTTTTTGGGTAAC AAGTTAACCGGGCCGATACCAAGTTCGATAGGGCAGTTAACTCAGTTGAGTCAGCTCAAA CTCGGTGATAACCTGCTCACTGGCACAATTCCCAATACATTCGACAAACTCAAAGGCTTA ACTTATTTAAGCTTAGAAAAAAATCAACTTAGTGGGTCGATACCAAATTTTTTCAATTCC TTATCTAATCTCAGAATATTAACACTTTCTCACAACAAATTTACTGGCAATTTTCCAAGT AGTATAACTACTTTGGCTCCAATATTAAGGTTCCTTGAGGTAGGGCACAATTATTTATCC GGGAAAATCCCAGATTTTCTCGGAAAATTTCGTTCCCTAGACACATTAGATCTTTCTTAT AACAAATTCTCGGGAACAGTGCCAAAAACTTTTGCGAATCTTACCAAAATCTTTAATCTC AATCTATCTCATAATCTTCTAGTGGATCCATTCCCAGCATTATTTGTAAAAGGCATTGAA TCTCTAGATTTGTCGTATAATAATTTCCATTTAAATACGATACCAAGTTGGGTGACTTCA TCTCCGATTATATACTCATTGAAGCTAGCAAAATGCGGGATCAAGATCAAATTGGATGAT TGGAACCCAAAAACAACGTATTTTTACGACTATATTGATTTATCGGATAATGACATTACT GGAAGTCCGATTGGGCTGTTGAATAAGACTGATTTCTTAATTGGATTTTATGCTGCTGGG AATAAATTAAAGTTTGATTTGGAGAAAATGAAGATTGTTAAGACACTTAAGGAATTGGAT TTGTCTAGAAATATGGTTTATGGGGAAGTTCCAAAGGAAATTAGTGGACTAAACAAGTTG AATTTGAGTAATAATCATTTGAGTGGTCAACTTCCACCAACAAAGTTTAAGGCTAATTCA TTTGCTGGAAATAAAGGACTTTGTGGTTCACCGTTGCCCCCTTGCAGAAAGTTTTAG