Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc10g047810.2.1
CDS Infomation	Clade XVII lectin receptor kinase (AHRD V3.3 *** K4D043_SOLLC)
Sequence	ATGGCTTCTTTTGCATACCTTGTTTGTCTTTTATTAATAATCCCCTTTGTCAATTCATTG TCCTTCAATTTTGATAGTTTTAACACAAATGATCAGAATTTAACATATGAAGCAGATGCA TATCCAGCAAACAGTGTAATTCAGCTCACCAAAAACCAGCGAGATAGTGCTTCAAATGAT AGCATAGGCAGAGTCACATATTCAGAAGCTCTCTATCTTTGGGACAAGGCCTCTAGGAAT CTCACTGATTTCACAACGCATTTCTCCTTTGGGATCAACTCACAGGGCAGAAATAATTAC GCTGACGGTCTTGCCTTCTTCCTTGCTCCTGCAGGTTCAAGAATTCCTGATAACTCAGCC GTAGGAGGCAGCCTTGGCCTTGCAGTTAGTGGTCAACAAAATACATCGAGAAATCACTCT TTTGTTGCTGTGGAGTTTGACACCTTTAAGAACTTTTATGATCCAAAGGGTGATCATGTA GGTGTAGATATCAACTCTATGGTATCTGTTGTTAATGTGACCTGGTTTAGTAGCATTCCA AATGGTAAGAGAACTGATGCCTGGATTACTTATAATTCAACTTCAAAAAATCTTAGTGTT GTCTTCACCGGTTTCCAACAACAAGGTAATACTACACTCACAGTCCTGCAGAACCTATCT TACAATATTGATCTGAGGGAATATTTGCCAGAATGGGTCACTTTTGGCTTCTCAGGTGCA ACAGGAACTCTCTTTGCATTACAAACCATATACTCTTGGAATTTTACTTCTTCTTTAAAG CATAATGACAATATAACAGATCCAGATGTGCCCCTACCAAGACCTGTGCCAGAGGATACT TCAAGCAAAAATAAGTCAGGACTAGTGATTGGATTGATTTCTGGCGGTTGTGTTTTGGTA GCACTATCTGTTATAATATTGTTTGCATTTAGGAGAAAGAGGAAGGTGCGAGAAGATGAA GATGAAGATGAAGATGATGATATTATTGATGGTTCCATGACTAATGAATTTGAAAGAAGC ACAGGACCAAAGAAGTTTTTGTACAGTGAGTTGGTCAGATGTACAAATAACTTTTCGCGG GAAGAGATGCTTGGCCAGGGCGGGTTCGGAGGTGTTTATAAAGGATATCTCAGTGAATCC AACTCCTATATTGCTGTTAAGAGGGTTTCAAGGGAGTCAAAGCAAGGAATAAAAGAGTAT GCATCAGAAGTCAGGATCATCAGCCGGTTAAGACATAAACATTTGGTGCAACTCATTGGT TGGTGCCATCAAAAAAGAGAACTTCTACTTGTCTACGAGTTTATGCCTAATGGAAGCTTA GATTACCATCTTTTCAAAGGAAGAAGCCATTTGACATGGCCAATAAGATTCAAGATTGCT CAAGGTTTGGCCTCAGCGTTGCTTTATCTACACGAAGAATGGGAACAGATTGTGGTTCAT AGGGACATAAAGTCCAGCAATATTATGTTGGATTCCAATTTTAATGCTAAACTTGGGGAT TTTGGTTTAGCTAGGCTAGTTGACCATGATAAGGAATCCCAAACAACAGTTTTGGCAGGC ACGATGGGTTACATGGCTCCTGAATGTGTCACCACTGGCAAAGCTAGCAAGGAAACAGAT GTCTATAGCTTTGGTGTTGTCGTGTTAGAAATAGGTTGTGGAAGGAAATCTATTGAAAAT AAAGCTGAGGAGCATCAAGTAAATATTATCCAATGGGTTTGGAGACTTTATGGGATGGGA AATCTTCGTGAAGCAGTTGATCCTAGACTCTCATCAGAGTTCAATGAAGAGGAGATGGAG CACTTGCTAATTGTTGGCTTATGGTGTTCTCATCCAGATAATAATTGCAGACCTTCTATA AGGCAAGCAATTCAGGTGCTTAATTTAGAAGCTCCGTTGCCCATACTCCCTCCAAACATG CCTGTACCGACATATTGCAGTCGGTCACAATATGGATCAACTACTTCTTTTACATCACCG TATGACTCCAACGCTCCTTGGAATTCTGAAATACAGTCTTCAGTGACTAGAGACTACACT GGTTCTTCAAATAACACAGTTGATATTCTCTTATAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc10g047810.2.1
PEP Infomation	Clade XVII lectin receptor kinase (AHRD V3.3 *** K4D043_SOLLC)
Sequence	MASFAYLVCLLLIIPFVNSLSFNFDSFNTNDQNLTYEADAYPANSVIQLTKNQRDSASND SIGRVTYSEALYLWDKASRNLTDFTTHFSFGINSQGRNNYADGLAFFLAPAGSRIPDNSA VGGSLGLAVSGQQNTSRNHSFVAVEFDTFKNFYDPKGDHVGVDINSMVSVVNVTWFSSIP NGKRTDAWITYNSTSKNLSVVFTGFQQQGNTTLTVLQNLSYNIDLREYLPEWVTFGFSGA TGTLFALQTIYSWNFTSSLKHNDNITDPDVPLPRPVPEDTSSKNKSGLVIGLISGGCVLV ALSVIILFAFRRKRKVREDEDEDEDDDIIDGSMTNEFERSTGPKKFLYSELVRCTNNFSR EEMLGQGGFGGVYKGYLSESNSYIAVKRVSRESKQGIKEYASEVRIISRLRHKHLVQLIG WCHQKRELLLVYEFMPNGSLDYHLFKGRSHLTWPIRFKIAQGLASALLYLHEEWEQIVVH RDIKSSNIMLDSNFNAKLGDFGLARLVDHDKESQTTVLAGTMGYMAPECVTTGKASKETD VYSFGVVVLEIGCGRKSIENKAEEHQVNIIQWVWRLYGMGNLREAVDPRLSSEFNEEEME HLLIVGLWCSHPDNNCRPSIRQAIQVLNLEAPLPILPPNMPVPTYCSRSQYGSTTSFTSP YDSNAPWNSEIQSSVTRDYTGSSNNTVDILL*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc10g047810.2.1
Transcript Infomation	Clade XVII lectin receptor kinase (AHRD V3.3 *** K4D043_SOLLC)
Sequence	ATGGCTTCTTTTGCATACCTTGTTTGTCTTTTATTAATAATCCCCTTTGTCAATTCATTG TCCTTCAATTTTGATAGTTTTAACACAAATGATCAGAATTTAACATATGAAGCAGATGCA TATCCAGCAAACAGTGTAATTCAGCTCACCAAAAACCAGCGAGATAGTGCTTCAAATGAT AGCATAGGCAGAGTCACATATTCAGAAGCTCTCTATCTTTGGGACAAGGCCTCTAGGAAT CTCACTGATTTCACAACGCATTTCTCCTTTGGGATCAACTCACAGGGCAGAAATAATTAC GCTGACGGTCTTGCCTTCTTCCTTGCTCCTGCAGGTTCAAGAATTCCTGATAACTCAGCC GTAGGAGGCAGCCTTGGCCTTGCAGTTAGTGGTCAACAAAATACATCGAGAAATCACTCT TTTGTTGCTGTGGAGTTTGACACCTTTAAGAACTTTTATGATCCAAAGGGTGATCATGTA GGTGTAGATATCAACTCTATGGTATCTGTTGTTAATGTGACCTGGTTTAGTAGCATTCCA AATGGTAAGAGAACTGATGCCTGGATTACTTATAATTCAACTTCAAAAAATCTTAGTGTT GTCTTCACCGGTTTCCAACAACAAGGTAATACTACACTCACAGTCCTGCAGAACCTATCT TACAATATTGATCTGAGGGAATATTTGCCAGAATGGGTCACTTTTGGCTTCTCAGGTGCA ACAGGAACTCTCTTTGCATTACAAACCATATACTCTTGGAATTTTACTTCTTCTTTAAAG CATAATGACAATATAACAGATCCAGATGTGCCCCTACCAAGACCTGTGCCAGAGGATACT TCAAGCAAAAATAAGTCAGGACTAGTGATTGGATTGATTTCTGGCGGTTGTGTTTTGGTA GCACTATCTGTTATAATATTGTTTGCATTTAGGAGAAAGAGGAAGGTGCGAGAAGATGAA GATGAAGATGAAGATGATGATATTATTGATGGTTCCATGACTAATGAATTTGAAAGAAGC ACAGGACCAAAGAAGTTTTTGTACAGTGAGTTGGTCAGATGTACAAATAACTTTTCGCGG GAAGAGATGCTTGGCCAGGGCGGGTTCGGAGGTGTTTATAAAGGATATCTCAGTGAATCC AACTCCTATATTGCTGTTAAGAGGGTTTCAAGGGAGTCAAAGCAAGGAATAAAAGAGTAT GCATCAGAAGTCAGGATCATCAGCCGGTTAAGACATAAACATTTGGTGCAACTCATTGGT TGGTGCCATCAAAAAAGAGAACTTCTACTTGTCTACGAGTTTATGCCTAATGGAAGCTTA GATTACCATCTTTTCAAAGGAAGAAGCCATTTGACATGGCCAATAAGATTCAAGATTGCT CAAGGTTTGGCCTCAGCGTTGCTTTATCTACACGAAGAATGGGAACAGATTGTGGTTCAT AGGGACATAAAGTCCAGCAATATTATGTTGGATTCCAATTTTAATGCTAAACTTGGGGAT TTTGGTTTAGCTAGGCTAGTTGACCATGATAAGGAATCCCAAACAACAGTTTTGGCAGGC ACGATGGGTTACATGGCTCCTGAATGTGTCACCACTGGCAAAGCTAGCAAGGAAACAGAT GTCTATAGCTTTGGTGTTGTCGTGTTAGAAATAGGTTGTGGAAGGAAATCTATTGAAAAT AAAGCTGAGGAGCATCAAGTAAATATTATCCAATGGGTTTGGAGACTTTATGGGATGGGA AATCTTCGTGAAGCAGTTGATCCTAGACTCTCATCAGAGTTCAATGAAGAGGAGATGGAG CACTTGCTAATTGTTGGCTTATGGTGTTCTCATCCAGATAATAATTGCAGACCTTCTATA AGGCAAGCAATTCAGGTGCTTAATTTAGAAGCTCCGTTGCCCATACTCCCTCCAAACATG CCTGTACCGACATATTGCAGTCGGTCACAATATGGATCAACTACTTCTTTTACATCACCG TATGACTCCAACGCTCCTTGGAATTCTGAAATACAGTCTTCAGTGACTAGAGACTACACT GGTTCTTCAAATAACACAGTTGATATTCTCTTATAA