Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc10g044640.2.1
CDS Infomation	magnesium transporter NIPA (DUF803) (AHRD V3.3 *** AT4G13800.8)
Sequence	ATGGATACGCAAAGCTGGAAAGATGTGTACAAGGGCATGTCATCTGACAATATCAAAGGA TTGGTTCTCGCTTTGTCCTCGAGTTTATTCATTGGTGCTAGCTTTATTATTAAGAAAAAA GGGTTAAAGAAAGCTGGTGCTTCCGGTGTCAGAGCTGGTGTTGGAGGATACTCATACCTG TATGAGACACTTTGGTGGGTGGGCATGATAACAATGATTGTTGGAGAGGTTGCTAATTTT GCTGCTTATGCATTTGCCCCTGCTATTTTAGTTACTCCTCTTGGTGCACTCAGTATTATT ATCAGTGCTGTGCTCGCTCGTATTATTTTGAGAGAGAAGCTACACACCTTTGGAATTTTA GGTTGTGCTTTATGTGTTGTTGGGTCCATCACAATAGTGCTGCATGCTCCACAAGAACGT GAGATTCAATCTGTGAAGGAAGTGTGGGATCTTGCTACTGAACCAGCTTTTCTCCTCTAC GCAGTGGCGGTGATAATAGCTGTCCTAATTCTTATATTCCACTATCTTCCCCAATATGGG CAAACACACATTATGTTTTATATAGGAGTGTGCTCACTAATGGGTTCTTTATCGGTTATG AGTGTCAAAGCACTTGGAATTGCTTTGAAATTGACATTATCAGGAACAAATCAGCTAATA TATCCACAGACTTGGGCTTTTACTTTGATTGTCATTGTGTGTGTTCTTACCCAAATGAAT TACTTAAATAAGGCCCTGGATACATTCAATACAGCAGTTGTCTCTCCTATATACTATGTC ATGTTTACCTTTTTGACTATCTTAGCCAGTATAATCATGTTCAAGGACTGGGATAGACAA AACCCAACTCAAATAGTAACAGAAATGTGTGGATTTGTGACTATTCTTTCTGGAACTTTT CTTCTTCACAAAACCAAAGACATGGTTGATGGTCCTGCCATGCTGCCTGTGCGACTTCCC AAGCATGGTGATGATGAGAATGGTTTTGGGCAAGAGGGTATTCCCTTGAGGCGGCAAGAT TCCTTGAGATCACCATAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc10g044640.2.1
PEP Infomation	magnesium transporter NIPA (DUF803) (AHRD V3.3 *** AT4G13800.8)
Sequence	MDTQSWKDVYKGMSSDNIKGLVLALSSSLFIGASFIIKKKGLKKAGASGVRAGVGGYSYL YETLWWVGMITMIVGEVANFAAYAFAPAILVTPLGALSIIISAVLARIILREKLHTFGIL GCALCVVGSITIVLHAPQEREIQSVKEVWDLATEPAFLLYAVAVIIAVLILIFHYLPQYG QTHIMFYIGVCSLMGSLSVMSVKALGIALKLTLSGTNQLIYPQTWAFTLIVIVCVLTQMN YLNKALDTFNTAVVSPIYYVMFTFLTILASIIMFKDWDRQNPTQIVTEMCGFVTILSGTF LLHKTKDMVDGPAMLPVRLPKHGDDENGFGQEGIPLRRQDSLRSP*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc10g044640.2.1
Transcript Infomation	magnesium transporter NIPA (DUF803) (AHRD V3.3 *** AT4G13800.8)
Sequence	ATTTAAAAAATATTTTTCAAAAACTTTTATTTCCGTGTAACATAAAAATTGGAACACACT CTCTTACTCTCTATCTCTGTCTAAATGTGTCTCTAAATGTGGACTCAATTTCGTATGTTT AACAAAAGATGTTCGAAAAGAAAAGGAAGAAGAGTCATGGGAGAGTCATAATTTTGGTAA AACCATTTTCTTCCATATCCCACTTTTCTCACTTTCTTCTCCCACCACACCCCGATCTAT CAACCCAAAGAGAATAAACTCCCTTCACGCCTACTGCCAATTCCCTTCCTTTCCCTCTTC CGCAGATCTCTAAACCCACCAATTCTTGTATCAATTTCTCACTTACCTGTTTGCATTTTA TGCTCCCCGGTATCTATGTAGAAGCAGCTTTTAGTTGCGACCAAACATTTTTTTTTCAGG TGTATGTCAAAGGTAGTGTATATATGAAAGAGTGACGATTAGGGTTTTGGATTTTTCTTG TGGTTTGTTGATGGTATGGATACGCAAAGCTGGAAAGATGTGTACAAGGGCATGTCATCT GACAATATCAAAGGATTGGTTCTCGCTTTGTCCTCGAGTTTATTCATTGGTGCTAGCTTT ATTATTAAGAAAAAAGGGTTAAAGAAAGCTGGTGCTTCCGGTGTCAGAGCTGGTGTTGGA GGATACTCATACCTGTATGAGACACTTTGGTGGGTGGGCATGATAACAATGATTGTTGGA GAGGTTGCTAATTTTGCTGCTTATGCATTTGCCCCTGCTATTTTAGTTACTCCTCTTGGT GCACTCAGTATTATTATCAGTGCTGTGCTCGCTCGTATTATTTTGAGAGAGAAGCTACAC ACCTTTGGAATTTTAGGTTGTGCTTTATGTGTTGTTGGGTCCATCACAATAGTGCTGCAT GCTCCACAAGAACGTGAGATTCAATCTGTGAAGGAAGTGTGGGATCTTGCTACTGAACCA GCTTTTCTCCTCTACGCAGTGGCGGTGATAATAGCTGTCCTAATTCTTATATTCCACTAT CTTCCCCAATATGGGCAAACACACATTATGTTTTATATAGGAGTGTGCTCACTAATGGGT TCTTTATCGGTTATGAGTGTCAAAGCACTTGGAATTGCTTTGAAATTGACATTATCAGGA ACAAATCAGCTAATATATCCACAGACTTGGGCTTTTACTTTGATTGTCATTGTGTGTGTT CTTACCCAAATGAATTACTTAAATAAGGCCCTGGATACATTCAATACAGCAGTTGTCTCT CCTATATACTATGTCATGTTTACCTTTTTGACTATCTTAGCCAGTATAATCATGTTCAAG GACTGGGATAGACAAAACCCAACTCAAATAGTAACAGAAATGTGTGGATTTGTGACTATT CTTTCTGGAACTTTTCTTCTTCACAAAACCAAAGACATGGTTGATGGTCCTGCCATGCTG CCTGTGCGACTTCCCAAGCATGGTGATGATGAGAATGGTTTTGGGCAAGAGGGTATTCCC TTGAGGCGGCAAGATTCCTTGAGATCACCATAATGTATGATTTTTGTATTTTCCTTCCCT ATTCCCCACCAACCTGTCCAACTGTTTAACCGCCCAATTCAGCTGCACCAGTCCATTCTC ATAGTATTTTCTTCTCAGAAGGGACCACACTCATATTGTATACAATTGGGGGACTCTTTA TAATATTCAGCAAGAGAAATGAAGGCGCTTTCTCACCCTTCTTGTATCGATAGAATCATC AGAAACTTGTTCATGTGATTGCTAAGCCTATTGTACAGAAGCTCAGTTCTCTATGTATTT CCGAGCAGATTGGTTCCAGGCGCACTATCTTGACATACCTGTAAAAATAACTAGTATATT CGATCGTTTAACAAGAACTAAATCAGTTGGATTTTTGTATGCTCCATCAGCCATTAATGT AATAGCTTTATCCT