Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc10g012060.3.1

CDS Infomation

Mechanosensitive ion channel protein (AHRD V3.3 *** AT4G00290.1)

Sequence

ATGGCTGCTATTAGGCTTTCAACTTTGAAGAGAACCCTTAATTTCTCTTATAAATTAGCA
AATCAGATTGATGTCAGACCTTCATATGCTTGCATAAATGGTAATCTTCATTCTAGAGAA
CCCACCTATTCAAAAAATTATGCTGACCCAAAATGTTTTAATACAAGGGAGATACACTCT
GCTAGTGGGACAATTCATGTTACCTCATATCTCAGTGGGAGATCTGATAATAAAAGTCTG
TGGGGAAGTAAATCAATTGTTGTAACTAGCCCCATTTGGAATTATCGATGGTATTCGTCG
TCTTTTAGTAGTAAAGGAGATAGTCCTAAAGGTTCAGAAGTTTCAACTGGTGCAAGTGGG
TCTGATATGGATACAGGCGGTGTAAGTGGAAGTGAATGGGTTGGAAATATTAAGGAAGCT
TGGCGAACTGCCACAGATGCTGTGACTTCTACTGGGGAAAAAGTGAAAGAGGCATCTTCG
GAAATGACTCCTTATGTTGAACAAGTGCTTAATGCACACCCTTATCTGAGAGATGTAATT
GTTCCTGTTGCTGGCACTTTAACTGGTACCTTAATGGCTTGGGTGGTGCTTCCAAGACTT
TTGAGGAGATTTCACAAGTATTCTATGCAAGGACCAGCTGCTTTGTTGCCTGGAAGCTCG
ATATGGGGGCAGGTGTCTTATGAGAGAAGTATTTGGGGTGCTATGGAGGATCCAGTTCGA
TATTTAATCACTTTCATGGCATTTTCACAGATTGCAGTGATGGTGGCACCTAGCACTATT
GCATCACAATATCTTCTCCAGACTTGGAGAGGTGCTGCTATTCTTTCATTTGTCTGGTTT
CTACAACGATGGAAAACAAATGTGATCAGCAGAGCTTTGGCTGTAAAGAGTCTTGAAGTA
GGTGACCGTGATCGGTTGTTGACTTTGGACAGATTCTCTTCGGTTGGCCTCTTCATCCTT
GGGCTAATGACTTTAGCTGAAGCTTGTGGAGTAGCTGTCCAATCTATTTTGACCGTTGGT
GGAATTGGAGGAGTGGCTACTGCTTTTGCTGCTAGAGACATCCTTGGAAATGTTCTTAGT
GGGCTCTCCGTACAGCTTTCACAACCGTTTTCAGTTGGTGACACGATAAAAGCTGGATCA
GTGGAAGGTCAAGTGGTTGAAATGGGGCTCACTACTACATCATTGTTGACTGCAGAAAAA
TTCCCTGTTATTGTCCCAAATTCACTATTTTCCAGTCAAGTGATTGTGAATAAATCACGT
GCTCAATGGCGTGCCATGGTCACTACAGTTCCTTTCCAAATTGAAGATTTTGATATTATT
GTCCAGATATCAGATGATGTAAAGAGCATGCTTAAATCTAATCCAAATGTTTTCTTGGAA
AAGGAGGCACCATACTGCTACTTGTCTAAAATTGAAAAATCATTTGCAGAGCTAACTCTT
GGGTGCAACTTAAGATATGCGAGCAAGGACAAACTGTTTTCTGCCCAACAGGATATTCTT
CTGCAAGCAGTTCGAATAGTCAAGCAGCATGGGGGCACACTGGCTGATCCTTGGAGTCAG
TGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc10g012060.3.1

PEP Infomation

Mechanosensitive ion channel protein (AHRD V3.3 *** AT4G00290.1)

Sequence

MAAIRLSTLKRTLNFSYKLANQIDVRPSYACINGNLHSREPTYSKNYADPKCFNTREIHS
ASGTIHVTSYLSGRSDNKSLWGSKSIVVTSPIWNYRWYSSSFSSKGDSPKGSEVSTGASG
SDMDTGGVSGSEWVGNIKEAWRTATDAVTSTGEKVKEASSEMTPYVEQVLNAHPYLRDVI
VPVAGTLTGTLMAWVVLPRLLRRFHKYSMQGPAALLPGSSIWGQVSYERSIWGAMEDPVR
YLITFMAFSQIAVMVAPSTIASQYLLQTWRGAAILSFVWFLQRWKTNVISRALAVKSLEV
GDRDRLLTLDRFSSVGLFILGLMTLAEACGVAVQSILTVGGIGGVATAFAARDILGNVLS
GLSVQLSQPFSVGDTIKAGSVEGQVVEMGLTTTSLLTAEKFPVIVPNSLFSSQVIVNKSR
AQWRAMVTTVPFQIEDFDIIVQISDDVKSMLKSNPNVFLEKEAPYCYLSKIEKSFAELTL
GCNLRYASKDKLFSAQQDILLQAVRIVKQHGGTLADPWSQ*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc10g012060.3.1

Transcript Infomation

Mechanosensitive ion channel protein (AHRD V3.3 *** AT4G00290.1)

Sequence

TCTATTGAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAAAGCTCATGCTTCCCTCGTTCCTTGTTTTT
CCATTTTCATTTTGATTCGGTGCCTGCCTGAACAAATCCAAATCTTGCCGAGCAAGTTAC
ACTTTGGCTTGTTCTGATTCTGCGTTAATTTGGCTGCTTCACAGTTGCTGCTTGCATTGA
TTGCACTTTCTGATCGAAGATGAGCATTGTAGCTTGAAGTTAACAGAATTTCGTTTGAGA
TATACATTTCTTGGTCAAACTCTACACATTGATGGCTGCTATTAGGCTTTCAACTTTGAA
GAGAACCCTTAATTTCTCTTATAAATTAGCAAATCAGATTGATGTCAGACCTTCATATGC
TTGCATAAATGGTAATCTTCATTCTAGAGAACCCACCTATTCAAAAAATTATGCTGACCC
AAAATGTTTTAATACAAGGGAGATACACTCTGCTAGTGGGACAATTCATGTTACCTCATA
TCTCAGTGGGAGATCTGATAATAAAAGTCTGTGGGGAAGTAAATCAATTGTTGTAACTAG
CCCCATTTGGAATTATCGATGGTATTCGTCGTCTTTTAGTAGTAAAGGAGATAGTCCTAA
AGGTTCAGAAGTTTCAACTGGTGCAAGTGGGTCTGATATGGATACAGGCGGTGTAAGTGG
AAGTGAATGGGTTGGAAATATTAAGGAAGCTTGGCGAACTGCCACAGATGCTGTGACTTC
TACTGGGGAAAAAGTGAAAGAGGCATCTTCGGAAATGACTCCTTATGTTGAACAAGTGCT
TAATGCACACCCTTATCTGAGAGATGTAATTGTTCCTGTTGCTGGCACTTTAACTGGTAC
CTTAATGGCTTGGGTGGTGCTTCCAAGACTTTTGAGGAGATTTCACAAGTATTCTATGCA
AGGACCAGCTGCTTTGTTGCCTGGAAGCTCGATATGGGGGCAGGTGTCTTATGAGAGAAG
TATTTGGGGTGCTATGGAGGATCCAGTTCGATATTTAATCACTTTCATGGCATTTTCACA
GATTGCAGTGATGGTGGCACCTAGCACTATTGCATCACAATATCTTCTCCAGACTTGGAG
AGGTGCTGCTATTCTTTCATTTGTCTGGTTTCTACAACGATGGAAAACAAATGTGATCAG
CAGAGCTTTGGCTGTAAAGAGTCTTGAAGTAGGTGACCGTGATCGGTTGTTGACTTTGGA
CAGATTCTCTTCGGTTGGCCTCTTCATCCTTGGGCTAATGACTTTAGCTGAAGCTTGTGG
AGTAGCTGTCCAATCTATTTTGACCGTTGGTGGAATTGGAGGAGTGGCTACTGCTTTTGC
TGCTAGAGACATCCTTGGAAATGTTCTTAGTGGGCTCTCCGTACAGCTTTCACAACCGTT
TTCAGTTGGTGACACGATAAAAGCTGGATCAGTGGAAGGTCAAGTGGTTGAAATGGGGCT
CACTACTACATCATTGTTGACTGCAGAAAAATTCCCTGTTATTGTCCCAAATTCACTATT
TTCCAGTCAAGTGATTGTGAATAAATCACGTGCTCAATGGCGTGCCATGGTCACTACAGT
TCCTTTCCAAATTGAAGATTTTGATATTATTGTCCAGATATCAGATGATGTAAAGAGCAT
GCTTAAATCTAATCCAAATGTTTTCTTGGAAAAGGAGGCACCATACTGCTACTTGTCTAA
AATTGAAAAATCATTTGCAGAGCTAACTCTTGGGTGCAACTTAAGATATGCGAGCAAGGA
CAAACTGTTTTCTGCCCAACAGGATATTCTTCTGCAAGCAGTTCGAATAGTCAAGCAGCA
TGGGGGCACACTGGCTGATCCTTGGAGTCAGTGAATTGGAACAAAGATGTCTTAGTCTAG
TGGGTCTCAGAGGAAGGGCTTTATTCAGTCATGGAGGTGGAGTTTGAGGATTTTTGTGCT
GTTCCATTGGAAGTTTCGCTTGAAGTTCATAACTTTGTCATAAGATTCTACTATTGAGCT
ACGTAGTACTTGAATCTGCGAATTTTTCTTGGAACTTTCGCGTTCTATAGCGGCCCAACC
TTATAACCAAATTGTGTCCATATTTTCAATCTTATCCGAAATAGTCCATTTTGTATGTAT
CTTGCAAAAAAAACAAAGAAGGATTTTATCCCTAACCTGCAGTGAAGAAGAGATGCTGGG
GATTGAATATCCCTATGTTCCAAGTGGTACAACCTCCTTAATTCATTTTCTTCGATACTT
AAGAGTAATTTCCAATACATCTGCCATTGTTATATGATATGTGCCTCAAACTCCATTGTC
ATTAATTGGTTTATGAAGAGAGTTGGTTTGACCAAAAGTTGAGGAAATTGGAAAACCTAT
TTGGAATTGACAACGTGAAAAATCATGGTTGAAATTGTGGTTTGAGATTTTGTTTTTTTG
TATTTTTAGATACTTAGAAAATGATCGAGAGTGATACTTGTATTGATCATCATTGATTGT
ACACTGAGTTCTGTGATTTGTTAACGTTTTTGATAAGTTGATGACTGATGTTCGTTGGGA
TTGTTATTTTGAAGTTGTTAAATATTGAAGCTACTTGGGGATGTTTTGACCTATTTTAGA
GTGTAGTTTTGTGAGTTCAACTTTTACAGGAAAAAAGTTCAGTGTTTGCACAATTTTATA
CAATAATGTAAATGCTTGTTTGATACGACAGATAAGGGATACTAATCTCGAAATTAAATT
TAGGATATGTTTATCCCATGTTTGGCTGGGATAAAATCATGAAACAAATTTATCCTGAAA
CTTTCATGTTGTTTTTTATTCTACATTGAGGGTTACATGGCATTGTTCTCCGACTAAATA
AGCCTTAAAAGTATGCTAAACACTTCTTATACATTTTTATACAAGATTGATACATTAGTT
ATAATAAGTGAAATATTGTATGCATGAATACTATTAAAAAATGATAATCAGCTATGTATA
ATACTAAAGTGCAATATTTTGTGTTTGGATATATAATTATGCAAATTTTCAATTTTTTTC
GTAGGTTTTTAATGTTGAATTATGCCTAAATCCCAACTCCAGGCTAGTTATATCTTTATA
TGAATCCTCAATATTGACCACATTGTAATCTCATAAATCTAGTTGGAAGAATAGAACGTA
CACAAACAACCAAGCTTTGACATTGATGTATCAACTCGATAAACCACTTTATGCTTCATT
AACATAACATGACAATCCAAACATACACAACCACTCTTTTCACAATTACTATATATTTCA
GTATTTAACAGCACATGAAATTCAACCTTAAAACTGAAACACACACCACCACCCTGTATG
CACAGAACAAATCCTCTTATATCTAAGGTTCACCTCACCTCTTTCCTTTCTACATTGTTG
TTCACTTCCGCCGGGTTAGAAACAGTATTATCAATTCTAAGGTTACAGAGCAGAGAATCG
CGTCCAGTTAAAAGGATATGGAAGAATCTATCTGCTTCCTTTGCTAGCAGATCTAGTCCT
CCTGAAAGTTTTTCCGCCTTTTCAGCCAGATTTGAAGTTAAGAGCTGCAACTGCTCAGCT
TCATTAGGATCTACTCCATCCTGTATGAGTGGATAGAGCTTCTTCACACTTGTATCCACT
ACTTCAAGCTCTTTCAGTGATGTGATCCTTCCACTTGAATATATACTCCTGATTTCCTGA
CTGATAAAATCGCGAACATCAACAAATGCTTCTGTCCACAAGCAAGTTTCATGAATCTGC
AGGTCTTTCAACTCCTTTGTAGAACCGGAAAACGTGACAGCAAACATGCTTAATATAAAT
ACAGTTACTACTCTCACTCCGTACATTGCCCGCATTAGAACCTTACCTTTTGCAGAATTC
TTGATCTTAGGTAGGTTCAGTGATTCGGTGAGGCTGTCCAAGATGGCAAAACAATTCTCT
AATCTTGGGTTCTTTGAATTGATATGCTGCTTCCATCCGTCAAATGAGGAACGAGCTTTC
ATGAACTGGTTTGACGTTCCATCCAAGTTATGCAAGCCACACTGAAGATAAAGGTGGCCT
TGGTTGAGCCTTGAGATATCAGAGCTGAAAGCAATGCAAATGTCCAGTAACTTCACACTG
TTGTCCAAGTACACATCTATCCACTTCTCATCCCAGTCACATACGGGAAGTTCAAGATCA
GTAATGAAAGTTTTCACGTCTGTATGAATTGCACAAAGTGTACTTATTGCTTGTGTCATC
CATGCCAACGTGAGGGTATCTTCCTTACCTCCTGGCTTGAGACTCTTAACCCTCTCTGTC
AATGACTCCTCAAAGGCATTTAAAAGAGCAAGAAGCTTAGGAGACAAGTACGAGCCCTTA
GGTAATATAAATTTGAAAGGATTTCCAAATGGGAGAAAAGGGCGGTGTGGTTCCTGTGGA
CGACTCATTTGAATATCAAGATACTGCACAGCAAATATTATAAAGATGAGACCCAGAGAA
GGACGAAACCTGTGGAATGGAGACGAAACAAAATGCAACTACTTTTTACCAGTTACAATT
GAGGCAATTAATATACATGTTAAAAGTTACATTACATGTAGTTTACCTGAGCAACACCTA
CATCGTAAAATAGGTTTCTTGAACTTTGGAAACAAATAACATGTGAAGCCAACAAAAGAG
AATGTTTTCAACAAGCAACACATTGAATAAACCATTTGTAAATTGCTTTTTTAACAAGCC
ACACCCGACACCTTTTACTCAACCATGAAATGAGTAACCATCTTGATGTGTCATTGTGAT
ATTCTCATTGCTCAGAATTAAGAAAGACAACATACATGCCCTTATTACCTAAACATTTGT
TACTCCGTATACAAAGGGATGAAAAATAAGCTAAATATTGAGTCTAGAAAAACAACAAAC
ATTTTAACTTGTTTTAATGCCTCAATTCAATTTGACTACAGCAAAAATATTCTCCTCACC
AGGCCTCGGTCATTACAACTTCTCCAAATGAAAAGAGCAGTAGCCAAAACTAACTTCATT
CGAATTTTTTCCAGCAGAATCAGTCTTCTCTAACTACTAACCAAAATAAGCTCATATTTC
ACTATCATAATCTCTCTCTCTCTCCAAAATCTCAAGCAAGGAAGCACAAACCAACCAACT
ACCAAGCAAACAAAAAAGTGAGACCTGAGAACCTTACTCGCCTAAGCACATACCATAGCA
GAAGAATAAAAAATCTAATGTTCTAAGTTGCACCAAAATCAAGCAAATTTAACTACATAC
AACGAAAGGAAACCAATATCTGCTCAAATTAACAACCAAATCAACCCATAATCACATATA
AACCACTCACCTGATAGTCAAATATCACAAATTCAAACATTTTCCAAACAATAAACACCT
AATCCTTTCTCCGACTCACACAGCGTCACATTACAGAGTCAAACCCTAAAAAACACATAC
ATACACAAATACATAAAAAATATATGTATCCCTATAAATCTAAACACACAAACCAAATTC
TGCCCTAATTAACCATCAATTCACCTATAATCACATCTAAAACACTCACCTGCTAATCAA
ATCTTACAATTCAAACAGTTTCCAAACAGCAAACACCTAAATCATTTCGCCAACTTACAC
AAAATTACATTTCAGAGTCGA