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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc10g007940.1.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing family protein (AHRD V3.3 *** U7E1K1_POPTR)

Sequence

ATGTTACGCGTAAATGGGCGGCGAATAGTTAACATAAGTTGGAATTTTAGCCAAGAACCT
TACTATAATTACATTTGGATTCTTGATGCCTGCATAGAAACTAAGCAATTAGTTATAGGC
AAATCAATCCATCAGCATATCATCAAGCACAATCATTGTAACGACAATCGTTCGAATTTA
TTAGATAAGTTAACGCGATTTTATGTTTCGTGCAGCAGAGTTGATCTTGCACGCCAAGTG
TTTGATTCAATTCCTGAGTCAGATAGAAATGACAGAGTTATATTATGGAACCAAATGATT
AGAGCTTATGCTTGGAATGGACCCTTTGAGAAGGGTATTGATTTGTATTATGAAATGGTG
GAGTATGGTATTAGACCGACGAATTATACATACCCTTTTGTGATTAAGGCTTGTTCTGCT
TTGCAAGATGTAGAAAATGGGGAAAAGATTCATGAACATGTGAAAAGGCAGGGGCTTGAT
GGTGATGTTTATGTTTGTACAGCTTTGGTTGATTTTTATGCAAAGTGTGGGTTGTTGGTT
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ATTTCAGGGTGCTCGGTGAATGGTTTGTATTTGGAGATGAAGGGTTTGGTGTTGGAGATG
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GAAGCTAATAAGTTGAGTGAAGGGAAGGCTGTTCATGGGTTTTCTATGAGAAGGGGGTTT
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AACTACGCGAAGAGGATTTTCGGAGTCATGAGTTTGAAGAATGAGATCACGCGGAGTGCG
ATGATAGGAGCATACGTAACATGTGATTCTACTCAAGAAGGATTGGAACTGTTTGAGCAC
ATGAGGACGGAAGATACTGAGTCTCCGTCTCCTGTCATGCTTGCCACTGTAATTCGAGCT
TGTGCTAAGCTGAATTATATGAGAAGAGGAAGAAAGATGCATGGTTATACTGTTAAGTTA
GGGTCCTATTTGGATTTGATGGTGAGTAATACTCTTCTTTCTATGTATGCAAAGTGCGGG
AGAATAGATGATGCGCTTACCTTCTTTGAGGAGATGGATTTGAAAGATTCTGTTTCTTTC
AGTGCGATAATTGCAGGGTGCGTCCAGAATGGACATGCAGAAGAAGCTTTGCAGATTTTA
CGAATGATGCAATCGTCTGGTGTTGAACCAGAATCTGCAACAGTGATGGGAATTTTACCA
GCTTGTTCACATTTGGCAGCTCTACAACTTGGCGTTTGCACCCATGGTTACTCGATTGTG
TGTGGATTTACAGAGGATGTTTCTGTATGTAATGCTCTAATTGACATGTATTCCAAATGT
GGTAAAAACGACATTGCTAGGATTGTCTTCGATAAGATGAATAAAAGGGATGTCGTCTCA
TGGAATGCAATGATTGCTGGATATGGAGTTCACGGTCGTGGAAAGGAAGCAATATCACTG
TTCTATGACATGCAGTCTATAGGTCAAATACCAGATGACATAACTTTTATTGGTCTCTTA
TTTGCTTGCAGCCATTCAGGTCTTGTTGCTGAAGGGAAATATTGGTTCTTAAGAATGTCC
GAAGAATTCAAAATTAGCCCTAGAATGGATCATTACTTGTGCATGGTGGACCTTTTGGGA
CGTGCTGGTCTTCTGGACGAGGCCTATGGTTTCGTCCAGAATATGCCTTTTATACCTGAT
GTGCGTATCTGGAGTGCCTTGCTTGCCGCGTGTAGAATCCATAAACATATTGTTCTAGCA
GAAGAAGTATCCAATAAGATCCAATATCTAGGACCTGAAAGTCCGGGTAATTTCGTTCTT
TTATCTAATTTATATACTACTGCTGGGAGATGGGATGACGCTGCTCATGTTAGAGTTAAG
CAGAAGGATTCTGGCTTTAAGAAGAGCCCCGGATGTAGTTGGATTGAAATAAATGGTGTT
ATCCATGCATTTGTTGGTGGGGATCAGTCCCACCCTCAGTCCGCTAAAATAAATGAGAAA
CTGAAGGAACTTTCGAAAGAGATGAAAAAGCTGGGGTATAGTGCAGAATCCAGTTTTGTG
TACCAAGATGTGGAGGAAGAAGAGAAGGAACAGATTCTTCTTTATCACAGCGAGAAGCTT
GCTGTTGCATTTGCGTTGCTAAATCTGGATCCTAGCAAGTCCATACTCGTTACTAAGAAC
TTACGAGTTTGTGTTGACTGCCATAGTACAATGAAATATATAAGTCTAATAACAAAAAGA
GAAATTACAGTGAGGGATGCTAGTCGATTCCATCATTTCAGAGATGGAATATGCAGCTGC
GGAGATTTCTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc10g007940.1.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing family protein (AHRD V3.3 *** U7E1K1_POPTR)

Sequence

MLRVNGRRIVNISWNFSQEPYYNYIWILDACIETKQLVIGKSIHQHIIKHNHCNDNRSNL
LDKLTRFYVSCSRVDLARQVFDSIPESDRNDRVILWNQMIRAYAWNGPFEKGIDLYYEMV
EYGIRPTNYTYPFVIKACSALQDVENGEKIHEHVKRQGLDGDVYVCTALVDFYAKCGLLV
EARRVFDGMLRRDIVAWNAMISGCSVNGLYLEMKGLVLEMQENGLTLNSSTVVAILPAIA
EANKLSEGKAVHGFSMRRGFVNDVVVDTGILDVYAKCGLLNYAKRIFGVMSLKNEITRSA
MIGAYVTCDSTQEGLELFEHMRTEDTESPSPVMLATVIRACAKLNYMRRGRKMHGYTVKL
GSYLDLMVSNTLLSMYAKCGRIDDALTFFEEMDLKDSVSFSAIIAGCVQNGHAEEALQIL
RMMQSSGVEPESATVMGILPACSHLAALQLGVCTHGYSIVCGFTEDVSVCNALIDMYSKC
GKNDIARIVFDKMNKRDVVSWNAMIAGYGVHGRGKEAISLFYDMQSIGQIPDDITFIGLL
FACSHSGLVAEGKYWFLRMSEEFKISPRMDHYLCMVDLLGRAGLLDEAYGFVQNMPFIPD
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QKDSGFKKSPGCSWIEINGVIHAFVGGDQSHPQSAKINEKLKELSKEMKKLGYSAESSFV
YQDVEEEEKEQILLYHSEKLAVAFALLNLDPSKSILVTKNLRVCVDCHSTMKYISLITKR
EITVRDASRFHHFRDGICSCGDFW*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc10g007940.1.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing family protein (AHRD V3.3 *** U7E1K1_POPTR)

Sequence

ATGTTACGCGTAAATGGGCGGCGAATAGTTAACATAAGTTGGAATTTTAGCCAAGAACCT
TACTATAATTACATTTGGATTCTTGATGCCTGCATAGAAACTAAGCAATTAGTTATAGGC
AAATCAATCCATCAGCATATCATCAAGCACAATCATTGTAACGACAATCGTTCGAATTTA
TTAGATAAGTTAACGCGATTTTATGTTTCGTGCAGCAGAGTTGATCTTGCACGCCAAGTG
TTTGATTCAATTCCTGAGTCAGATAGAAATGACAGAGTTATATTATGGAACCAAATGATT
AGAGCTTATGCTTGGAATGGACCCTTTGAGAAGGGTATTGATTTGTATTATGAAATGGTG
GAGTATGGTATTAGACCGACGAATTATACATACCCTTTTGTGATTAAGGCTTGTTCTGCT
TTGCAAGATGTAGAAAATGGGGAAAAGATTCATGAACATGTGAAAAGGCAGGGGCTTGAT
GGTGATGTTTATGTTTGTACAGCTTTGGTTGATTTTTATGCAAAGTGTGGGTTGTTGGTT
GAGGCACGAAGAGTGTTTGATGGAATGTTGAGAAGAGATATTGTGGCGTGGAATGCGATG
ATTTCAGGGTGCTCGGTGAATGGTTTGTATTTGGAGATGAAGGGTTTGGTGTTGGAGATG
CAAGAAAATGGGTTAACGTTGAATTCGTCTACAGTTGTGGCGATTCTTCCTGCAATTGCG
GAAGCTAATAAGTTGAGTGAAGGGAAGGCTGTTCATGGGTTTTCTATGAGAAGGGGGTTT
GTTAATGATGTAGTTGTTGATACTGGTATTTTGGATGTGTATGCAAAATGTGGTTTGTTG
AACTACGCGAAGAGGATTTTCGGAGTCATGAGTTTGAAGAATGAGATCACGCGGAGTGCG
ATGATAGGAGCATACGTAACATGTGATTCTACTCAAGAAGGATTGGAACTGTTTGAGCAC
ATGAGGACGGAAGATACTGAGTCTCCGTCTCCTGTCATGCTTGCCACTGTAATTCGAGCT
TGTGCTAAGCTGAATTATATGAGAAGAGGAAGAAAGATGCATGGTTATACTGTTAAGTTA
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GGTAAAAACGACATTGCTAGGATTGTCTTCGATAAGATGAATAAAAGGGATGTCGTCTCA
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CGTGCTGGTCTTCTGGACGAGGCCTATGGTTTCGTCCAGAATATGCCTTTTATACCTGAT
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TTACGAGTTTGTGTTGACTGCCATAGTACAATGAAATATATAAGTCTAATAACAAAAAGA
GAAATTACAGTGAGGGATGCTAGTCGATTCCATCATTTCAGAGATGGAATATGCAGCTGC
GGAGATTTCTGGTGA