Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc10g007230.2.1

CDS Infomation

TPR repeat thioredoxin TTL1-like protein (AHRD V3.3 *** A0A072V9X4_MEDTR)

Sequence

ATGTGGGGTTCTAAAAAGAAGAGTGATTCTGAAAAGGGTTCAAGCTCTTCAGCTGATCAG
ATGAGATTTGAGGAAGGCGATCCTCGAATACTGAAACTGGGTTCACCTGTTTCAACATTA
AGGAGTGGAATGAGTTCTAGTAATACAACGAGCACTTCGGGTTCATCTGCATCGGGATCA
GGTCGGAATGTGAGTTCTTCGAGTTCGTCGGGTTCAAACAGAATTAAAATAGTTCCCCCC
GGCAATATTTGCCCGTCCGGTAACGTGATAACTGGGATGCGTTGTAAGCCGGAAAGGACT
GTGTTAAATGACAGTAAGATGATACCCGGAATTTACGGCTATGGAAGCATAATGCCTGGT
GGTGCAATGCAGAGAACCCGTTGTGCGGAGGAGTTGAATACACAAGCGAATGAGATTTAC
AGGAAGGGTAATTTTGCAGAAGCGTTGAGTCTTTATGATAAAGCTATAGCAATTTCTCCG
CGCGATGGTAGATTTCATTGTAATCGAGCTGCTGCGTTAATGGGTCTTAAGCGAATAATT
GAAGCAGTGAAGGAATGTGAAGAAGCCATTAGATTATCTCCAGCATATGTTCGAGCACAC
CAGCGTTTGGGAACTTTGCTACTTTGTTTAGGACAGGTTGAAAATGCAAGGGAGTACTTA
CATTGCCTGGATCAGAAACCAGATCAAGCCACGTTGGAGAAGTTGCAGGCAGTGGAGGAA
CATATCGGCAAATGCGCTGTAGCCCGGAGATCTGAAGATTGGACGACTATGTTAAAAAAA
GCTGTTGCAGCAACTACTTCTGGAGCTGATGCGTCTCCTCAGCTGTTTGCATGTCAAGCG
GAAGCTCATTTGAAGCTGCACCAATTAAAGGATGCAGAATTGTGGATTTATAAAGCTAGG
ACGTATGAGCTATCTGCCACAGAATGCCGGTCAAAAATTTTTGGAATGCTCTCTGAAGCA
TACATATTCTTTGTCCAAGCTCAGATTGACAGCAGTCTTGGAAAGTTTGATGATGCGTGT
ACTGCCATTGAAAGAGCTGCAAGAATTGATCTTCAAAGTGCTGAAGTTACTGGTAAACTC
AAAAACATGAGGCTGGTGGGTAAAGCTCGTACTCATGGCAACGAGCATTTTAATGCTAAA
AGATATGCACAAGCTTGTACTGCTTATGGGGAAGGGATCTTGCTTGATTCTTCAAATTCA
GTTCTCTACTACAATAGAGCAAATTGCTGGTTTAAACTTGGAGAGTGGGAAAAATCTTTG
GATGATTGCACCCATGCTCTCCTTATCCGGCCACAATATACTAAAGCTCTTTTTCGAAAA
GCTGCCTCAAATATCAAGCTGGAAAGATGGGCTGATGCTGTGAGAGATTATGAGATTCTG
CGGCAGGAACTCCCAAGTAACGAAGAGGTTGCTGAAAATTTATCCCATGCCCGAGCTGAA
TTAAGGAAGTCACGCAGAGAAGGTAATGGCAAGGTGGAGTTGGTTTCAGATCTTGACAAG
TTCCGGGCTGCGATTGCATCTGGTGCATCTGTGGTCTGTTTTGATGAATTATCCAAACCA
CAAGGAACGTGGATGTCCTCGGTCATGGATAACTTGAGCGCCAAATATCGTTCAGTAATT
TTTCTCAAGGTGGACATGGAACAGAGCCCAGCAATTGCTACAGCAGAGAAAGTTACAGTA
GCACCTACATTTAAGCTTTACAAGGATGGCAATCGTCAGGTGGATACGGTTACTGCAATT
CCAGATTTTTTGGATTTCTTGATTAAGGACACCCTCTTAGATCCCATCTAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc10g007230.2.1

PEP Infomation

TPR repeat thioredoxin TTL1-like protein (AHRD V3.3 *** A0A072V9X4_MEDTR)

Sequence

MWGSKKKSDSEKGSSSSADQMRFEEGDPRILKLGSPVSTLRSGMSSSNTTSTSGSSASGS
GRNVSSSSSSGSNRIKIVPPGNICPSGNVITGMRCKPERTVLNDSKMIPGIYGYGSIMPG
GAMQRTRCAEELNTQANEIYRKGNFAEALSLYDKAIAISPRDGRFHCNRAAALMGLKRII
EAVKECEEAIRLSPAYVRAHQRLGTLLLCLGQVENAREYLHCLDQKPDQATLEKLQAVEE
HIGKCAVARRSEDWTTMLKKAVAATTSGADASPQLFACQAEAHLKLHQLKDAELWIYKAR
TYELSATECRSKIFGMLSEAYIFFVQAQIDSSLGKFDDACTAIERAARIDLQSAEVTGKL
KNMRLVGKARTHGNEHFNAKRYAQACTAYGEGILLDSSNSVLYYNRANCWFKLGEWEKSL
DDCTHALLIRPQYTKALFRKAASNIKLERWADAVRDYEILRQELPSNEEVAENLSHARAE
LRKSRREGNGKVELVSDLDKFRAAIASGASVVCFDELSKPQGTWMSSVMDNLSAKYRSVI
FLKVDMEQSPAIATAEKVTVAPTFKLYKDGNRQVDTVTAIPDFLDFLIKDTLLDPI*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc10g007230.2.1

Transcript Infomation

TPR repeat thioredoxin TTL1-like protein (AHRD V3.3 *** A0A072V9X4_MEDTR)

Sequence

CATTTTGTTGTTATTGATTAGTTTTCAATTTTCTAACATTGTAGGTTCAAAAAAAAATGT
GGGGTTCTAAAAAGAAGAGTGATTCTGAAAAGGGTTCAAGCTCTTCAGCTGATCAGATGA
GATTTGAGGAAGGCGATCCTCGAATACTGAAACTGGGTTCACCTGTTTCAACATTAAGGA
GTGGAATGAGTTCTAGTAATACAACGAGCACTTCGGGTTCATCTGCATCGGGATCAGGTC
GGAATGTGAGTTCTTCGAGTTCGTCGGGTTCAAACAGAATTAAAATAGTTCCCCCCGGCA
ATATTTGCCCGTCCGGTAACGTGATAACTGGGATGCGTTGTAAGCCGGAAAGGACTGTGT
TAAATGACAGTAAGATGATACCCGGAATTTACGGCTATGGAAGCATAATGCCTGGTGGTG
CAATGCAGAGAACCCGTTGTGCGGAGGAGTTGAATACACAAGCGAATGAGATTTACAGGA
AGGGTAATTTTGCAGAAGCGTTGAGTCTTTATGATAAAGCTATAGCAATTTCTCCGCGCG
ATGGTAGATTTCATTGTAATCGAGCTGCTGCGTTAATGGGTCTTAAGCGAATAATTGAAG
CAGTGAAGGAATGTGAAGAAGCCATTAGATTATCTCCAGCATATGTTCGAGCACACCAGC
GTTTGGGAACTTTGCTACTTTGTTTAGGACAGGTTGAAAATGCAAGGGAGTACTTACATT
GCCTGGATCAGAAACCAGATCAAGCCACGTTGGAGAAGTTGCAGGCAGTGGAGGAACATA
TCGGCAAATGCGCTGTAGCCCGGAGATCTGAAGATTGGACGACTATGTTAAAAAAAGCTG
TTGCAGCAACTACTTCTGGAGCTGATGCGTCTCCTCAGCTGTTTGCATGTCAAGCGGAAG
CTCATTTGAAGCTGCACCAATTAAAGGATGCAGAATTGTGGATTTATAAAGCTAGGACGT
ATGAGCTATCTGCCACAGAATGCCGGTCAAAAATTTTTGGAATGCTCTCTGAAGCATACA
TATTCTTTGTCCAAGCTCAGATTGACAGCAGTCTTGGAAAGTTTGATGATGCGTGTACTG
CCATTGAAAGAGCTGCAAGAATTGATCTTCAAAGTGCTGAAGTTACTGGTAAACTCAAAA
ACATGAGGCTGGTGGGTAAAGCTCGTACTCATGGCAACGAGCATTTTAATGCTAAAAGAT
ATGCACAAGCTTGTACTGCTTATGGGGAAGGGATCTTGCTTGATTCTTCAAATTCAGTTC
TCTACTACAATAGAGCAAATTGCTGGTTTAAACTTGGAGAGTGGGAAAAATCTTTGGATG
ATTGCACCCATGCTCTCCTTATCCGGCCACAATATACTAAAGCTCTTTTTCGAAAAGCTG
CCTCAAATATCAAGCTGGAAAGATGGGCTGATGCTGTGAGAGATTATGAGATTCTGCGGC
AGGAACTCCCAAGTAACGAAGAGGTTGCTGAAAATTTATCCCATGCCCGAGCTGAATTAA
GGAAGTCACGCAGAGAAGGTAATGGCAAGGTGGAGTTGGTTTCAGATCTTGACAAGTTCC
GGGCTGCGATTGCATCTGGTGCATCTGTGGTCTGTTTTGATGAATTATCCAAACCACAAG
GAACGTGGATGTCCTCGGTCATGGATAACTTGAGCGCCAAATATCGTTCAGTAATTTTTC
TCAAGGTGGACATGGAACAGAGCCCAGCAATTGCTACAGCAGAGAAAGTTACAGTAGCAC
CTACATTTAAGCTTTACAAGGATGGCAATCGTCAGGTGGATACGGTTACTGCAATTCCAG
ATTTTTTGGATTTCTTGATTAAGGACACCCTCTTAGATCCCATCTAGAAAGGATTTTACA
TATACCATATGGTTGTTCGTGGTCTACAGAGGGAAAGTCTAGTCTCCTTTTTTACCCATC
TCCGATACTCCTTCCATTCGTACCTTTTTGACATTTTTAGCATTAGTGATTTTGCGGCAA
TATATAGCTGAAGAGTTAGAAAGAAGAGAAAGTAACTGTGCTAATTGGAGTTAAATAAAC
ATGTATACACAAACTACTGTTGTGTATGTCTGGTGAATAAAAGTTTGTCATATTTTCCTA
TTCATTTGTCTTGTTTCAAATAGAGTACTTTATGCGACCTGTGGAATTACATTAGATTTA
TTCTTCGATGGCATACGTATTCACTGTGTTACTCTATGGTCTAGCCCTCAATCCTATCAG
TTTTGGAAAAGGACACAACAGTGTAGAAAAGGTCCAAAATAAGAGAAAGACACACTACCA
GTGATTGTGTACAAATTACGTTACACTTGAAATTTTGTAATATTCTCTACTCTTGTTTCA
TTGATAAAAC