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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc10g005110.3.1

CDS Infomation

Coproporphyrinogen III oxidase (AHRD V3.3 *** AT1G03475.1)

Sequence

ATGTTTTCTGCAGTTCTGTCCTCTCCTTCATCCTCTTCCACTTCCACTTTCCCACTCAGA
TATTCCTCTCTTTCATCAGTAGCCAATCTTTCATCACTTCCACTTACCATTGGATGCAGA
AGCACAAGTAAAAAATCAACACACAACAACTGCTCCATCAAAGTCCAAGTGTCATCAAGG
ATGATTGAGAAGGAAACCCCAGAAACTGAACGACCACATACATTTCTAAGAGAATCTGAT
GAAGGGTCATCGGGGGATGAGTCGAATTCGGTTAGAGCACGTTTTGAGAAGATGATTAGG
GAGGTTCAAGACAGTGTTTGTGCTGCTTTGGAAGATGTAGATGGAGGGGGTAAATTCAAG
GAAGATGTTTGGTCCAGGCCTGGTGGGGGTGGTGGGATTAGTAGGGTATTGCAAGATGGG
AATGTTTTTGAGAAGGCTGGTGTTAATGTTTCTGTTGTTTATGGTGTTATGCCTCCTGAA
GCTTATCGAGCTGCTAGGCCAGTTGATAATGGAAATACTAAACCTGGTCCTATCCCCTTT
TTTGCTGCTGGCGTTAGCTCGGTTATACATCCAAAAAACCCCTTTGCACCAACTGTACAT
TTCAATTATCGCTACTTCGAGACTGATGCTCCTAAAGATACTCCAGGAGCACCTAGGCAA
TGGTGGTTTGGAGGTGGCACTGATCTGACACCTGCTTACATTTTCGAGGAGGATGTGAAG
CACTTCCATTCGGTGCAAAAAGGTGCTTGTGACAAATTTGATGCTAGTTTCTACCCTCGT
TTCAAGAAGTGGTGTGATGATTATTTCTATATAAAGCACCGTGATGAGAGGCGAGGTCTT
GGAGGAATTTTTTTTGACGATTTAAACGACTATGATCAGGAGATGCTTCTCTCCTTTTCT
ACAGAGTGTGCCAATTCCGTCATTCCAGCATATATACCTATCATAGAGAAGAGGAAGGAT
ACCCCATTCACCGATGAACACAAGGCATGGCAACAGTTACGGAGGGGGCGCTATGTGGAA
TTCAACTTGGTTTATGACCGTGGAACTACATTTGGTCTCAAGACAGGAGGTAGGATTGAG
AGTATTCTTGTTTCTCTTCCATTAAGTGCACGTTGGGAGTACGACCATCAACCAGTAGAG
GGGTCTGAAGAATGGAAACTCTTGGATGCTTGTATCAACCCTAAGGAATGGATCTGTTAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc10g005110.3.1

PEP Infomation

Coproporphyrinogen III oxidase (AHRD V3.3 *** AT1G03475.1)

Sequence

MFSAVLSSPSSSSTSTFPLRYSSLSSVANLSSLPLTIGCRSTSKKSTHNNCSIKVQVSSR
MIEKETPETERPHTFLRESDEGSSGDESNSVRARFEKMIREVQDSVCAALEDVDGGGKFK
EDVWSRPGGGGGISRVLQDGNVFEKAGVNVSVVYGVMPPEAYRAARPVDNGNTKPGPIPF
FAAGVSSVIHPKNPFAPTVHFNYRYFETDAPKDTPGAPRQWWFGGGTDLTPAYIFEEDVK
HFHSVQKGACDKFDASFYPRFKKWCDDYFYIKHRDERRGLGGIFFDDLNDYDQEMLLSFS
TECANSVIPAYIPIIEKRKDTPFTDEHKAWQQLRRGRYVEFNLVYDRGTTFGLKTGGRIE
SILVSLPLSARWEYDHQPVEGSEEWKLLDACINPKEWIC*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc10g005110.3.1

Transcript Infomation

Coproporphyrinogen III oxidase (AHRD V3.3 *** AT1G03475.1)

Sequence

AATTTTCTTCATCTACAATGTTTTCTGCAGTTCTGTCCTCTCCTTCATCCTCTTCCACTT
CCACTTTCCCACTCAGATATTCCTCTCTTTCATCAGTAGCCAATCTTTCATCACTTCCAC
TTACCATTGGATGCAGAAGCACAAGTAAAAAATCAACACACAACAACTGCTCCATCAAAG
TCCAAGTGTCATCAAGGATGATTGAGAAGGAAACCCCAGAAACTGAACGACCACATACAT
TTCTAAGAGAATCTGATGAAGGGTCATCGGGGGATGAGTCGAATTCGGTTAGAGCACGTT
TTGAGAAGATGATTAGGGAGGTTCAAGACAGTGTTTGTGCTGCTTTGGAAGATGTAGATG
GAGGGGGTAAATTCAAGGAAGATGTTTGGTCCAGGCCTGGTGGGGGTGGTGGGATTAGTA
GGGTATTGCAAGATGGGAATGTTTTTGAGAAGGCTGGTGTTAATGTTTCTGTTGTTTATG
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TTGCACCAACTGTACATTTCAATTATCGCTACTTCGAGACTGATGCTCCTAAAGATACTC
CAGGAGCACCTAGGCAATGGTGGTTTGGAGGTGGCACTGATCTGACACCTGCTTACATTT
TCGAGGAGGATGTGAAGCACTTCCATTCGGTGCAAAAAGGTGCTTGTGACAAATTTGATG
CTAGTTTCTACCCTCGTTTCAAGAAGTGGTGTGATGATTATTTCTATATAAAGCACCGTG
ATGAGAGGCGAGGTCTTGGAGGAATTTTTTTTGACGATTTAAACGACTATGATCAGGAGA
TGCTTCTCTCCTTTTCTACAGAGTGTGCCAATTCCGTCATTCCAGCATATATACCTATCA
TAGAGAAGAGGAAGGATACCCCATTCACCGATGAACACAAGGCATGGCAACAGTTACGGA
GGGGGCGCTATGTGGAATTCAACTTGGTTTATGACCGTGGAACTACATTTGGTCTCAAGA
CAGGAGGTAGGATTGAGAGTATTCTTGTTTCTCTTCCATTAAGTGCACGTTGGGAGTACG
ACCATCAACCAGTAGAGGGGTCTGAAGAATGGAAACTCTTGGATGCTTGTATCAACCCTA
AGGAATGGATCTGTTAGTTTCAATCCATGTAAAGTTTACTTGTTTTGGTCTTCTATATTT
GTTGTCTTTGCATTTCTTTGATTAGATTTCCTGTGTTTAGCCCCTTTCCTTTGGGGGTCA
TCCTGAGGGGATTGAGGAAGGATGGAAATGGTTGATGTAGAGGATATGTTAGAATCTGTA
ATGTTAACTAAAACTGAGGCTTTTAACCTAATGATGTGATGAGAGGAAAGTTTGTTATCT
TGACGTGTCTGATGCCAAAAACTGTCGATGATATGTATATATACAGATATTGGAAGCTCT
GATTGAGGAGAACATATTAGAATAGAGCAGAGACATATTGCCTCCTCAATCAACTTACAT
TACTTGTAAATGTGTCTTACCACAACCTTAGTCGTGTATTGTCTGTCCTCACACTGTACA
TATTAGACGATATAGTCTCCTTACACTTCCACTAGTAAGAATGATTTTATCGGGATGTAA
AGGCATAGATAGTAGCTATTGCAGAACAGGCCTCTGCTTGTTCACCCATGGATTCGGGGT
TTAGATGCAGTGAGTTCTGAGAAAATTCTGTCTGAACTTGTGTTAGTCAAAAGGCGCTTG
GCAGGACCAACAAGAGCAGTACTTCGGAAGTTTCAGGTTCGAGCCCCAAGTTAGGGAGTA
GTTCACCCTCCTTCCAGCTCAAATTAGACTTGGATAAGTGAGTGTTGAAGACCAATTAAA
TACGTTCAGTTTAGCTATCTCTGGAATTAAACATCCTTTCCACTTGTCATGCAGCAATCT
CAAATATCTTTGGTGGAAAAATGACAAAAAAGAAAATTATGTTCTTTTGTTATCCTTAAT
ATTAAAATTATTTATTTTTCAAGACTTGGAATTATATGTTAATATGAATATTGGTAAATT
ACTTGTACTAATCATTATTGTTTAAGAGGGCACGTGAAATTTAATGTGGACAAATAGACT
TGAGTAGAGGGAGTGCATAATACACTACACAAACTTTTTTTTATCTCACCGTAATTCGTT
ACTTAATCATGGTAAATCACGTGGTTTATTTATTAATTTTCTTATTTTGTTTTATTTTTA
ATTTGGTCACAAGTATGCTGGTAATTGCTATACTCACAGACCTTATCAGAAGCTAGAGGG
ATAGTTTCTTAT