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EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc10g005080.3.1

CDS Infomation

Late elongated hypocotyl (AHRD V3.3 *** J9PV71_NICAT)

Sequence

ATGGACCCTTATTCCTCAGGGGAGGAACTTGTTGTTAAGACAAGGAAACCTTATACAATC
ACTAAGCAACGAGAGCGATGGACGGAGGAGGAGCACAATAGGTTCCTAGAAGCTTTGAAA
CTTTATGGGCGTGCTTGGCAGCGCATAGAAGAACACATAGGAACTAAAACTGCTGTGCAG
ATCAGAAGTCATGCGCAAAAGTTTTTTACAAAGTTAGAAAAGGAGGCTCTTACAAAGGGG
GTCCCAACAAGTCAAGCACTTGACATTGAAATTCCTCCTCCACGACCTAAAAGGAAACCA
AGTAATCCTTATCCTCGTAAGACAAGCGCAGCAGGTCACTCATCACAGGTGGGAGCAAAA
GATGGGAAATATTCGACAACTTTTTCTTCCATCTGTGAGGAAAGGAACTTATTTGACCTG
GAGAAAGAACCGATTACTGAGAAACCTGGCGGAAACGAGAAGCTGGGCAATGTAAAAGAA
ACCCAGAACAAGAAAAACTGCTCCCAAGGGTTAACTAAGGAAGGTGCTTCTGCAGCCTCT
ATGTCTTCAGGAAAGTCCTTGCAAGCACATGTGGCACCTACAGATGTGTGTGCCTTTAGT
GAGTCTGTGTCTGTCACCAAAGGAGTGGTTAACAATGATAACGCAAATAAATCTTTTCTC
ATTGTTGAATCCAAAGAACATCAACAGTCAGAAATACTCGATATCAGACAGTCCTTTCAA
GGTAACAGCTCCTGTAACACCTTTGACGGGGGGAAATCTTGCCAGTCGAGTGAAAAGTTG
GCACAAGGTGAGAAAAAACATCCATCGTTTCAGCCAAACCATTTGGGGGAATTCTCAAGA
AATGATATGCAAGTGCTACACAACTATCCAAGACATGTGCCAGTGCATATTCTTGATGGA
ACAAATGGTTCTCAAATAGCCCCAGATATGTTTAATCATGAATCTACGAGTCAGCAGATA
AATGGGGTCCCGGGGCTCCCAAATTTGTATTCTAACCCTGCTTCATCCACCACATCTGAG
CACCACAGTAACGCTCCACAGTCATCCATTCATCAGTCATTTTCTTGTTTCCACCCCATT
TTCACCCCTATTCGTGATCCAGATGATTACCGATCGTTTTTTCAATTATCCTCCACCTTC
TCCAGCCTTATTGTTTCTGCTTTATTGCAAAACCCAGCAGCACATGTCGCAGCAAGTTTT
GCCGCTAGCTTTTGGCCTTATGCAAATATGGAACGTCCAACGGATTCTCCAACTGATAAC
ACCGCTAGCCAGATTAACTCAGCTCCTAGTATGGCAGCAATTGCTGCTGCCACAGTAGCA
GCTGCAACTGCATGGTGGGCAGCCCATGGGCTCTTACCATTGTGCTCTCAATTTCAAAGC
AGTTTTACCTGTGTTCCTACATCAGCAACATCAATGCAAGTGGATGCCTGTCAACCTAGA
GTAGACAAGAACGAAGGAAGAGAGGGAACTCATGATTCTCCCCATGTTCAGGAACCTGTC
CCAGAATGCTCTGAAGCTTTGCAAGAACAACAATCAGGTTCTAAGTTGCCACCTTCTCTA
TCATCAGAATCGGAGGAGAGTGAAGGTAGGAAGCTAAAAACTGGGTTAACGGCCACTGAT
ACTGAGCAAGGAGCTGCAGTTACTAAAATTAATGAGCCAAACGCAGAAAAGGGCGGGAAG
CAGGTAGATCGCTCTTCCTGTGGATCCAACACACCTTCAAGTAGTGAAATTGAGACAGAT
GCTTTGGAGAAGGATGAGAAAGGTAAAGAAGAGCCCCAAGAATCTAATATTAACCTTCTA
GCTGGAGAGGCTGCGAATCGGCGTTATAGAAATTTCATCAGTCCAACCGAATCTTGGAAA
GAAGTCTCCGAAGAGGGACGGATAGCTTTCCAGGCTCTTTTCACCAGAGAAGTGTTGCCT
CAAAGTTTTTCTCCTTCACTTGATCTGAAAAATAAGGGAAAGATCATTCTTGAAAAGTTG
AAGCAAAAGCCAGACGAGAAAGTTCAATGTGGACCGCAGTTAGATCTTAATGATATGGCA
TCCAATATCTGTTCCAGTCACCAAACAATGGAAGACAATGTGTTATTAATTGGCAACAAA
GAAGATGTAGAAACATGCCTACCAATGATAGAACTTGGACAAGTAAGGTTGAAAGCTCGC
CGTACTGGATTTAAGCCTTACAAGAGGTGCTCATTGGAGGCAAATGATAGCAGGGTGACA
AGTTCTAACTGTCAGGATGAAGAAAAAAGCTCGAAAAGACTTCGGTTGGAAGGAGAAGCT
TCTACTTAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc10g005080.3.1

PEP Infomation

Late elongated hypocotyl (AHRD V3.3 *** J9PV71_NICAT)

Sequence

MDPYSSGEELVVKTRKPYTITKQRERWTEEEHNRFLEALKLYGRAWQRIEEHIGTKTAVQ
IRSHAQKFFTKLEKEALTKGVPTSQALDIEIPPPRPKRKPSNPYPRKTSAAGHSSQVGAK
DGKYSTTFSSICEERNLFDLEKEPITEKPGGNEKLGNVKETQNKKNCSQGLTKEGASAAS
MSSGKSLQAHVAPTDVCAFSESVSVTKGVVNNDNANKSFLIVESKEHQQSEILDIRQSFQ
GNSSCNTFDGGKSCQSSEKLAQGEKKHPSFQPNHLGEFSRNDMQVLHNYPRHVPVHILDG
TNGSQIAPDMFNHESTSQQINGVPGLPNLYSNPASSTTSEHHSNAPQSSIHQSFSCFHPI
FTPIRDPDDYRSFFQLSSTFSSLIVSALLQNPAAHVAASFAASFWPYANMERPTDSPTDN
TASQINSAPSMAAIAAATVAAATAWWAAHGLLPLCSQFQSSFTCVPTSATSMQVDACQPR
VDKNEGREGTHDSPHVQEPVPECSEALQEQQSGSKLPPSLSSESEESEGRKLKTGLTATD
TEQGAAVTKINEPNAEKGGKQVDRSSCGSNTPSSSEIETDALEKDEKGKEEPQESNINLL
AGEAANRRYRNFISPTESWKEVSEEGRIAFQALFTREVLPQSFSPSLDLKNKGKIILEKL
KQKPDEKVQCGPQLDLNDMASNICSSHQTMEDNVLLIGNKEDVETCLPMIELGQVRLKAR
RTGFKPYKRCSLEANDSRVTSSNCQDEEKSSKRLRLEGEAST*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc10g005080.3.1

Transcript Infomation

Late elongated hypocotyl (AHRD V3.3 *** J9PV71_NICAT)

Sequence

AGTAAAGAATAACTAGCTAGGACATAAAGCATCCGGTCTAGCATGGTAGCGGCATCAGGG
TTCTTACAGTTAGGCATGTGAGACACAATTTCTAAAGCAGATAGTTTAGTGGCGGCTTTA
TCTTTTGCGAGTATGTCAAAAACATCCAATTGGATAGTTGAGTGCAAAACGAAGGGAAGC
ACTGACGATGAGAGTAGTTGCATGGCGTACGTGCAATTACGCTCTTCGTCTTCCGATTGT
GTTGCTAACTGGATATTTGCTGTCGATCCCATAGCTAAAAAGAACTTAGAGATGAACAAG
AAAATGTTATTTTTGCTGCTTGGAGTGTTTTGTTAGGCCTCAAGATGATGTATAATGGGG
TTAGACTACCCTTTTATAAATATCAAACCAAGAATTGTTGTTTTGTCAAAGATTGGTCAT
AATTGATTTCTTGGTGGGAATATTAGTAATGCGTCTGCTTTTCATTCGTTTTTTGTTCTT
TTTCAATTGCATAGTGGCATTCTATCTGTTCTGATTTATTTAAAAATTAATTTGTTATTA
AATATAAAAATATTTTCTTTTTTTTTGTTTACTGATGAAAAAGAAAAATAATTATATAAA
TGGAGACTAATGAAGTATATATCACTCCCTCTATCTGCCTAATATTATTATTTTATCTCA
CGTTCATGACTTGAAAGCAGTATATTCAGTTCAATCTGAAAATTGTAATAATAACATCTC
GAAGCAGCAGTGGATCGCTCCATTTCCTTCTTCCATTGTGCACAGTTACTTCCTGTATAT
GTGAGTTGGTGGTATGTTTTTTTTTTTGTTTACTGTTTGGATTAAAAATTATTGCTTTTG
GTAAAAAAAAAAAAGTTAGTGAAGCATAAGGTCCACTAAAAAAGTGGAGAGTAGGCCACT
TAACATGTGATTGGCTGTCTGCTTTACTGAACAAGAGAATTCAGTCATTTTCTTCATATT
TTCCTCATACAATATTACTATAACATGTTTTCTTCACCTAACCATCATATTAACATACAA
TTAGTTAATTGACTCTTAGATAATTAAATACATAAAGTTTGTTTTATCTCTTGACTTTTA
ACGATGGATATACAAATTCCTATTGTATTCTATTAATTTACTTCTCATTACTTTATCAAA
ATTGTGAATACAAACAATGTAATTGTCTAGTTGAAGTAGAATATCGATATTTACAAATTT
TATTTCTCTATTATATTGTTTAATATGTTCAAGGTTGATATGACCACATTAATATATGAA
GATACATTGAATTGCTGTTAGTTTTTTTTGAATGTATTACTAAATTCTAACTAACCCCTT
CTATTTAATGATGACATATGAAGATACATTACATGTGTTATTTTTTTTTTTTTACCTTGA
TACGTTGCTTGTTGAAATTTGCAAGAAAGAGTCTTCAACTAGAGATTTTTCTTTTTTTTA
AAAACAATAAATAAATAAAATCTTTGTTTGGTATAACAAAAAATAAATATGTATGTATAT
ATCAAATCATGAAATCTCCTTTATGATTATTCTTTTTCAGTCCACTTTTTCTCTGTGATG
ATTTAAAGTTGTTGCACCTAACATTACTAGATTTATTTTTTCAATCACTTTCTAGATGGA
AAGATAACCTACTTTAAGGTTTTCTTTTAGCTTCCTAAGTAAGTGATGTTTACCATTTTG
AATGATTCTCTTGTCACTTGAAATAATCCTATTAATGCTAAACTTCTATTAATTCTAAAC
CGAATTCCACCAAAAGAATTTCGTGACGCTACTTATAGTCCCATTAACTAGTATCTTGGC
TAATGTGCTTTAACAAAATGGTATCAACACTACATTATTTTTATGTAAAAATATCCAGTT
CACAAAAATCACATGTACATCTACAACATTTAACCACAACTTTTCTAAAGCACAATGAGC
CTTTCAACAAGACATTATGAACTCTAATTCTTAACAATTCTAAACCACAAAATTATGAAC
TCTAATTCTTAACAACTCACAAACCTCTCAAGATATATGTCCTCAAATCTTTAAGTTATC
CCAACTTGAAGATTATAATCCAATAACACACTAAAATTAAGATTTGCATTAATATTACAA
CTCAAATGAACACATGAAGGCTAAAACTTGTAGTTGCATTAGGACCTGATTCTTCAATGT
GTTCCTTCAATAGTCAAACAACATTGGCGAAGCCAATTGGTTTTTGCTCTGTGAGTGCAC
ACCTTGTTCTGAGTGACTCTCAAGCACAACTCTTCAGAGTGTTACTCAAAACTCTCTTGA
TTTAAAATTCTACATCAAGTAAAGTTCTTTCTTAAAATCAAACTCCTTGATTTCAGTATT
TCCTTGACTTAATCCGAAGTAACCATTATTCGTTTATTGGTTTTTGCACGCTTATCTTTA
TAATGTTAGTACAGTATATATATATATATATGACCTTGTTACAAATTCAGCTCCTTGTAA
CAATAAGTATTATGTGAACTAGTTATATAGGGAACCTAACAGTGAGGTCCATATGCAATT
GCTAAGCCCATATTCGCTGAGTTCTGGCCCAAGTATGTTCCATTTTATTTTGAAAGTTAA
TGGCTAAGTGGGCTCATAAAATAATGCCACCCGATACCTATATGCCTTCTTATTTCATGC
TACAGATTACTAGTATTTCATATTCTACAACTAAACCCCTTAAAATTTGTACAACATCGG
GTTTTATCAAAATTTCTCTCCAAATGCCTATCTTTATATCATGTTGAAAATTGATATATA
GAAAAAATTTTTGGAGGGTTGGGGGAGTAGATTATCATAGATGTGTTATGTATATTGATG
AATCTACTTGATTTATATATACATATTTTGATACCATGTTATACAATGTGTATAAAATGA
TTACGAGCAAGCCTTATAATGTGGTAGAATATTGATTGTCACTACTGTAACATTTAGGAA
ATACTACATCTGTCATCAAGATGCACCATGCATGTGTTCACTTGCGTTTTCTTGGAGGAA
AAAAAAAAATCCCTCAGGGCTAAAAAAAAAGGGGGTGGATAATAAATTTGTTGACTATTT
GGGTTTGGATTTCATTTTTTATTTTATAAAAATATAAATATAGACACTCAAAAGAAGATT
CGTGAACTATATTTTTTTTAAAAAAGCAGTCGCCAAGTGGCGTTTTGTGCAACCACAATT
TTTTCAGTAGAAAAATTTTGACTTCACGAACTTCCTTCGCAGAGTAGTCAGCACGCGCTC
TTGCCAACATTCCACGTCATCTGTATTTGATTACGTGGCAGCACTTTTAATACCCTTTTG
TTATATAAATAAACTGAGCGAGTTAACTCACTTACTCGGTTTCCAATTGAGAGTCCAACC
CAGTTTGTGGTTGAGATTACGATTTGTAACCCTTCCGCTTTCTATCGTTTCGAAAAAGTG
CAACCTGGGTCCCACCGAATAGACTGAAACCACTCATTTCAAGCCACGTGGAATTTCTTC
TACTTGCTCTTCTCTCTTATTCATTTTCTAGCCTCTAATTTATTTCCTATTTATTGAAAT
TGAATCAACTCCGAAAAATACTAGTGGCTGAGATTTTTCTTTGAGATTTTATGGGAAATG
AAAAACCTCTTACCTGTACTAGTTTAGTGCTTGCTACCTCTGCCTCAAACCTGCTTCCTT
CCTCTTCATACTTTTTCTTCTTCTTCAATTATTGATTAATTTCTACTTGTGAAATGGTTT
TCTCCGATCTACCATTGCTGTTGGATGACTTTTCACTTCATGCATGACCGAAACAACAAC
TAGTGTTTGTTTACAACATGGCTTTCTTCGAAGGTTTAGGCATCATGCGGTTCGTTTTGT
AGTGTTACATTATCAGGTTCTTTTGTACAACACCACGGATAGACTATATTTGATAGTAAC
TGATGTTGTGGGGAGAATCGGAAGAAGATTTGTTCTGTATCCCCTGTTTGTCCCTGAGGA
TTTGAAGCAGAGATAGCTAGCTTTGGTTCCTTTATTTTGATGGACCCTTATTCCTCAGGG
GAGGAACTTGTTGTTAAGACAAGGAAACCTTATACAATCACTAAGCAACGAGAGCGATGG
ACGGAGGAGGAGCACAATAGGTTCCTAGAAGCTTTGAAACTTTATGGGCGTGCTTGGCAG
CGCATAGAAGAACACATAGGAACTAAAACTGCTGTGCAGATCAGAAGTCATGCGCAAAAG
TTTTTTACAAAGTTAGAAAAGGAGGCTCTTACAAAGGGGGTCCCAACAAGTCAAGCACTT
GACATTGAAATTCCTCCTCCACGACCTAAAAGGAAACCAAGTAATCCTTATCCTCGTAAG
ACAAGCGCAGCAGGTCACTCATCACAGGTGGGAGCAAAAGATGGGAAATATTCGACAACT
TTTTCTTCCATCTGTGAGGAAAGGAACTTATTTGACCTGGAGAAAGAACCGATTACTGAG
AAACCTGGCGGAAACGAGAAGCTGGGCAATGTAAAAGAAACCCAGAACAAGAAAAACTGC
TCCCAAGGGTTAACTAAGGAAGGTGCTTCTGCAGCCTCTATGTCTTCAGGAAAGTCCTTG
CAAGCACATGTGGCACCTACAGATGTGTGTGCCTTTAGTGAGTCTGTGTCTGTCACCAAA
GGAGTGGTTAACAATGATAACGCAAATAAATCTTTTCTCATTGTTGAATCCAAAGAACAT
CAACAGTCAGAAATACTCGATATCAGACAGTCCTTTCAAGGTAACAGCTCCTGTAACACC
TTTGACGGGGGGAAATCTTGCCAGTCGAGTGAAAAGTTGGCACAAGGTGAGAAAAAACAT
CCATCGTTTCAGCCAAACCATTTGGGGGAATTCTCAAGAAATGATATGCAAGTGCTACAC
AACTATCCAAGACATGTGCCAGTGCATATTCTTGATGGAACAAATGGTTCTCAAATAGCC
CCAGATATGTTTAATCATGAATCTACGAGTCAGCAGATAAATGGGGTCCCGGGGCTCCCA
AATTTGTATTCTAACCCTGCTTCATCCACCACATCTGAGCACCACAGTAACGCTCCACAG
TCATCCATTCATCAGTCATTTTCTTGTTTCCACCCCATTTTCACCCCTATTCGTGATCCA
GATGATTACCGATCGTTTTTTCAATTATCCTCCACCTTCTCCAGCCTTATTGTTTCTGCT
TTATTGCAAAACCCAGCAGCACATGTCGCAGCAAGTTTTGCCGCTAGCTTTTGGCCTTAT
GCAAATATGGAACGTCCAACGGATTCTCCAACTGATAACACCGCTAGCCAGATTAACTCA
GCTCCTAGTATGGCAGCAATTGCTGCTGCCACAGTAGCAGCTGCAACTGCATGGTGGGCA
GCCCATGGGCTCTTACCATTGTGCTCTCAATTTCAAAGCAGTTTTACCTGTGTTCCTACA
TCAGCAACATCAATGCAAGTGGATGCCTGTCAACCTAGAGTAGACAAGAACGAAGGAAGA
GAGGGAACTCATGATTCTCCCCATGTTCAGGAACCTGTCCCAGAATGCTCTGAAGCTTTG
CAAGAACAACAATCAGGTTCTAAGTTGCCACCTTCTCTATCATCAGAATCGGAGGAGAGT
GAAGGTAGGAAGCTAAAAACTGGGTTAACGGCCACTGATACTGAGCAAGGAGCTGCAGTT
ACTAAAATTAATGAGCCAAACGCAGAAAAGGGCGGGAAGCAGGTAGATCGCTCTTCCTGT
GGATCCAACACACCTTCAAGTAGTGAAATTGAGACAGATGCTTTGGAGAAGGATGAGAAA
GGTAAAGAAGAGCCCCAAGAATCTAATATTAACCTTCTAGCTGGAGAGGCTGCGAATCGG
CGTTATAGAAATTTCATCAGTCCAACCGAATCTTGGAAAGAAGTCTCCGAAGAGGGACGG
ATAGCTTTCCAGGCTCTTTTCACCAGAGAAGTGTTGCCTCAAAGTTTTTCTCCTTCACTT
GATCTGAAAAATAAGGGAAAGATCATTCTTGAAAAGTTGAAGCAAAAGCCAGACGAGAAA
GTTCAATGTGGACCGCAGTTAGATCTTAATGATATGGCATCCAATATCTGTTCCAGTCAC
CAAACAATGGAAGACAATGTGTTATTAATTGGCAACAAAGAAGATGTAGAAACATGCCTA
CCAATGATAGAACTTGGACAAGTAAGGTTGAAAGCTCGCCGTACTGGATTTAAGCCTTAC
AAGAGGTGCTCATTGGAGGCAAATGATAGCAGGGTGACAAGTTCTAACTGTCAGGATGAA
GAAAAAAGCTCGAAAAGACTTCGGTTGGAAGGAGAAGCTTCTACTTAGTGTTGTATCAAT
GTGCAATTCTACGAGGGAACCTGTGTTGTTGCACGGAGAGCTCTATTCTATCCTGTTATT
ATCTTTTCCCAGTTACGTTGTCTAGTTCTAATGTACACGAAACTTGTCGTGTAGGTGTGT
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AACCTAAATGTGGATGTCTTCAACAATCATAGCAAATTTAATGGACCTTGATTGGACCAG
TTCCTCGG