Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc09g097830.3.1
CDS Infomation	Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT3G04240.1)
Sequence	ATGAAGACCAGGGTTAAAACAACATTTACTGTCATTCTTGTTCCTTCCGGTTTCGAGAAG AAAACAACCATGTCAGATTACAATATGTGCATGTACGATATGAATCAGGCTTGTGCAGTC AAGCGAAGTGCACAACCTGGCTTTGACTGGGCTTTAGAGCTTAAGCGCACCTCAAACAAG CCTTACAGAGGAGTCTTAAACTTTGGCACAACAAGGGATGAAGCAATGTGTGTCGATGAG GATGCTCTTTTAACTCTTGCTCATCAGAACTACAAAGCTGGGAACTATAAACAGGCACTA GAGCACAGCAAGGCAGTTTATGAGAGAAATCCAGTGCGCACTGATAATCTTCTTCTTTTT GGGGCTATATATTATCAGTTGCATGATTTTGATATGTGTATCGCAAAAAATGAAGAAGCC CTAAGTATCGAGCCACATTTTGCTGAGTGCTATGGAAATATGGCGAATGCTTGGAAGGAA AAAGGCAATATTGATGTTGCAATACGCTATTATTTAATTGCAATTGAGCTCCGTCCTAAT TTTGCGGATGCATGGTCAAATTTAGCCAGTGCATACATGAGGAAAGGAAGGCTGAATGAG GCAGTTCAATGTTGCCGTCAGGCTCTAGCATTAAATCCACGTTTGGTGGATGCTCACAGC AATCTCGGCAATCTCATGAAAGCACAAGGTTTAGTCCAAGAGGCGTACAATTGTTATGTT GAAGCACTGCGTATACAGCCTGCATTTGCCATAGCATGGTCCAACCTTGCTGGCCTTTTC ATGGAGGCAGGCGATCTTAACAGGGCTTTGCAGTACTACAAGGAAGTGATCAAGCTGAAA CCGAACTTCTCAGATGCATATCTGAACCTAGGAAATGTATACAAGGCTTTGGGAATGCCC CAGGAGGCCATAGTGTGTTATCAGCGTGCGCTCCAAGTACGACCAGACTATGCCATGGCT TTTGGCAACTTAGCTAGTGTGTACTATGAACAAGGAAATATGGAAATGGCAATATTTAAC TACAGGAGAGCTATTACATGTGATACTGAATTCTTTGAGGCATATAACAATCTGGGTAAT GCTCTAAAAGATGCTGGTAGAGTGGAGGAAGCAATTCATTGCTATCGTCAATGCCTCTCT CTTCAACCTAACCACCCACAAGCGCTTTCTAATATAGGGATCATTTATATGCAGTGGAAC ATGATGAGTGCGGCTGCACAATGTTTTAAAGCGACTTTAGCTGTGACTACAGGGCTCTCA GCTCCTTTAAACAATCTAGCCATAATATACAAGCAACAGGGAAATTATGCAGAAGCCATA TCGTGCTATAATGAGGTACTACGTATTGACCCCATGGCAGCAGATGGGCTGGTCAATAGA GGCAACACATACAAAGAGATTGGTAGGGTTAATGAAGCTGTACAAGATTACATGCGAGCT ATTACCGTTAGACCTACCATGGCAGAGGCTCATGCAAATTTGGCTTCTGCTTACAAGGAC AGTGGCAATGTTGAAGCAGCCATAAAAAGCTATAGACAAGCTTTGATGCTACGTCCTGAC TTCCCCGAAGCAACTTGTAATCTTCTCCACACGTTACAGTGTGTGTGTGATTGGGATAAC CGGGAGAAGATGTTTATTGAAGTTGAGGGGATACTAAGAAGACAAATTAAGATGTCCATT ATCCCAAGCGTTCAGCCTTTCCATGCAATTGCCTACCCTCTTGATCCAATGCTTGCTCTA GATATCAGTTGCAAGTATGCCCAGCACTGCTCTGTGGTAGCAACTCGCTACTCACTTCCT CCCTTCACCCATCCACCGCCGCTGCCAATTAAAGGAGGTGGCAGGATCAACAGGCTGAGG GTTGGATATGTGAGCAGTGATTTTGGCAACCATCCACTATCACATCTAATGGGTTCCGTT TTTGGGATGCATGACAAAGAGAACGTTGAGGTGTTCTGCTATGCTTTAAGTCCAAATGAT GGTACAGAGTGGAGGATTCGCACTCAGACAGAAGCTGAGCATTTTATTGATGTATCGTCC TTGACATCTGATGTGATAGCAAGGATGATTAATGAGGATCAAATACAGATACTTATCAAT CTCAATGGTTATACCAAGGGGGCAAGAAACGAGATATTCGCCATGCAGCCAGCTCCAATC CAGGTTTCATACATGGGTTTCCCTGGAACCACAGGAGCAACATACATAGATTATTTGGTT ACAGATGAGTTCGTTTCACCTATGAAGTATGCACATATTTACTCAGAGAAGCTTGTACAT CTCCCTCATTGCTATTTTGTCAACGATTATAAGCAAAAAAACTGTGACGTGCTAGATCCA AACAGCCAACTGAAGCGCTCAGATTATGGGCTGCCGGAGGATAAATTCATATTTGCATGT TTTAATCAGCTTTACAAGATGGATCCTGAGATTTTTATTACATGGTGCAATATCCTTAAG CGTGTACCAAACAGTGCTCTTTGGCTTCTCAGATTTCCAGCTGCAGGAGAGATGAGGCTC CGCGCACATGCTGCTGCCCAAGGCCTGCAACCAGACCAAATTATTTTCACAGATGTTGCA ATGAAACAAGAGCACATCAAGCGCAGCTCCTTGGCTGATCTTTTCTTGGACACGCCACTG TGCAATGCACATACCACAGGAACTGATGTTCTTTGGGCTGGTCTACCAATGGTAACCCTT CCCCTTGAGAAGATGGCTACTAGAGTTGCTGGCTCTCTGTGTTTGGCGACAGGACTTGGT GCTGAGATGATTGTCAGCAGTATGAAGGAATATGAGGAGAAGGCGGTGTCACTGGCACTC AATCGTCCAAAGCTCCAAGATCTCACCAATAGACTCAAGGCTGTACGAATGAGTTGCCCT TTATTTGATACAACACGTTGGATGTGGAATCTCTATTGCTCCGGCCAGCATCCTCAGCCC TTCCAAGTGACCGAGAATGACTCAGAATTTCCTTTTGACCGCTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc09g097830.3.1
PEP Infomation	Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT3G04240.1)
Sequence	MKTRVKTTFTVILVPSGFEKKTTMSDYNMCMYDMNQACAVKRSAQPGFDWALELKRTSNK PYRGVLNFGTTRDEAMCVDEDALLTLAHQNYKAGNYKQALEHSKAVYERNPVRTDNLLLF GAIYYQLHDFDMCIAKNEEALSIEPHFAECYGNMANAWKEKGNIDVAIRYYLIAIELRPN FADAWSNLASAYMRKGRLNEAVQCCRQALALNPRLVDAHSNLGNLMKAQGLVQEAYNCYV EALRIQPAFAIAWSNLAGLFMEAGDLNRALQYYKEVIKLKPNFSDAYLNLGNVYKALGMP QEAIVCYQRALQVRPDYAMAFGNLASVYYEQGNMEMAIFNYRRAITCDTEFFEAYNNLGN ALKDAGRVEEAIHCYRQCLSLQPNHPQALSNIGIIYMQWNMMSAAAQCFKATLAVTTGLS APLNNLAIIYKQQGNYAEAISCYNEVLRIDPMAADGLVNRGNTYKEIGRVNEAVQDYMRA ITVRPTMAEAHANLASAYKDSGNVEAAIKSYRQALMLRPDFPEATCNLLHTLQCVCDWDN REKMFIEVEGILRRQIKMSIIPSVQPFHAIAYPLDPMLALDISCKYAQHCSVVATRYSLP PFTHPPPLPIKGGGRINRLRVGYVSSDFGNHPLSHLMGSVFGMHDKENVEVFCYALSPND GTEWRIRTQTEAEHFIDVSSLTSDVIARMINEDQIQILINLNGYTKGARNEIFAMQPAPI QVSYMGFPGTTGATYIDYLVTDEFVSPMKYAHIYSEKLVHLPHCYFVNDYKQKNCDVLDP NSQLKRSDYGLPEDKFIFACFNQLYKMDPEIFITWCNILKRVPNSALWLLRFPAAGEMRL RAHAAAQGLQPDQIIFTDVAMKQEHIKRSSLADLFLDTPLCNAHTTGTDVLWAGLPMVTL PLEKMATRVAGSLCLATGLGAEMIVSSMKEYEEKAVSLALNRPKLQDLTNRLKAVRMSCP LFDTTRWMWNLYCSGQHPQPFQVTENDSEFPFDR*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc09g097830.3.1
Transcript Infomation	Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT3G04240.1)
Sequence	ATGAAGACCAGGGTTAAAACAACATTTACTGTCATTCTTGTTCCTTCCGGTTTCGAGAAG AAAACAACCATGTCAGATTACAATATGTGCATGTACGATATGAATCAGGCTTGTGCAGTC AAGCGAAGTGCACAACCTGGCTTTGACTGGGCTTTAGAGCTTAAGCGCACCTCAAACAAG CCTTACAGAGGAGTCTTAAACTTTGGCACAACAAGGGATGAAGCAATGTGTGTCGATGAG GATGCTCTTTTAACTCTTGCTCATCAGAACTACAAAGCTGGGAACTATAAACAGGCACTA GAGCACAGCAAGGCAGTTTATGAGAGAAATCCAGTGCGCACTGATAATCTTCTTCTTTTT GGGGCTATATATTATCAGTTGCATGATTTTGATATGTGTATCGCAAAAAATGAAGAAGCC CTAAGTATCGAGCCACATTTTGCTGAGTGCTATGGAAATATGGCGAATGCTTGGAAGGAA AAAGGCAATATTGATGTTGCAATACGCTATTATTTAATTGCAATTGAGCTCCGTCCTAAT TTTGCGGATGCATGGTCAAATTTAGCCAGTGCATACATGAGGAAAGGAAGGCTGAATGAG GCAGTTCAATGTTGCCGTCAGGCTCTAGCATTAAATCCACGTTTGGTGGATGCTCACAGC AATCTCGGCAATCTCATGAAAGCACAAGGTTTAGTCCAAGAGGCGTACAATTGTTATGTT GAAGCACTGCGTATACAGCCTGCATTTGCCATAGCATGGTCCAACCTTGCTGGCCTTTTC ATGGAGGCAGGCGATCTTAACAGGGCTTTGCAGTACTACAAGGAAGTGATCAAGCTGAAA CCGAACTTCTCAGATGCATATCTGAACCTAGGAAATGTATACAAGGCTTTGGGAATGCCC CAGGAGGCCATAGTGTGTTATCAGCGTGCGCTCCAAGTACGACCAGACTATGCCATGGCT TTTGGCAACTTAGCTAGTGTGTACTATGAACAAGGAAATATGGAAATGGCAATATTTAAC TACAGGAGAGCTATTACATGTGATACTGAATTCTTTGAGGCATATAACAATCTGGGTAAT GCTCTAAAAGATGCTGGTAGAGTGGAGGAAGCAATTCATTGCTATCGTCAATGCCTCTCT CTTCAACCTAACCACCCACAAGCGCTTTCTAATATAGGGATCATTTATATGCAGTGGAAC ATGATGAGTGCGGCTGCACAATGTTTTAAAGCGACTTTAGCTGTGACTACAGGGCTCTCA GCTCCTTTAAACAATCTAGCCATAATATACAAGCAACAGGGAAATTATGCAGAAGCCATA TCGTGCTATAATGAGGTACTACGTATTGACCCCATGGCAGCAGATGGGCTGGTCAATAGA GGCAACACATACAAAGAGATTGGTAGGGTTAATGAAGCTGTACAAGATTACATGCGAGCT ATTACCGTTAGACCTACCATGGCAGAGGCTCATGCAAATTTGGCTTCTGCTTACAAGGAC AGTGGCAATGTTGAAGCAGCCATAAAAAGCTATAGACAAGCTTTGATGCTACGTCCTGAC TTCCCCGAAGCAACTTGTAATCTTCTCCACACGTTACAGTGTGTGTGTGATTGGGATAAC CGGGAGAAGATGTTTATTGAAGTTGAGGGGATACTAAGAAGACAAATTAAGATGTCCATT ATCCCAAGCGTTCAGCCTTTCCATGCAATTGCCTACCCTCTTGATCCAATGCTTGCTCTA GATATCAGTTGCAAGTATGCCCAGCACTGCTCTGTGGTAGCAACTCGCTACTCACTTCCT CCCTTCACCCATCCACCGCCGCTGCCAATTAAAGGAGGTGGCAGGATCAACAGGCTGAGG GTTGGATATGTGAGCAGTGATTTTGGCAACCATCCACTATCACATCTAATGGGTTCCGTT TTTGGGATGCATGACAAAGAGAACGTTGAGGTGTTCTGCTATGCTTTAAGTCCAAATGAT GGTACAGAGTGGAGGATTCGCACTCAGACAGAAGCTGAGCATTTTATTGATGTATCGTCC TTGACATCTGATGTGATAGCAAGGATGATTAATGAGGATCAAATACAGATACTTATCAAT CTCAATGGTTATACCAAGGGGGCAAGAAACGAGATATTCGCCATGCAGCCAGCTCCAATC CAGGTTTCATACATGGGTTTCCCTGGAACCACAGGAGCAACATACATAGATTATTTGGTT ACAGATGAGTTCGTTTCACCTATGAAGTATGCACATATTTACTCAGAGAAGCTTGTACAT CTCCCTCATTGCTATTTTGTCAACGATTATAAGCAAAAAAACTGTGACGTGCTAGATCCA AACAGCCAACTGAAGCGCTCAGATTATGGGCTGCCGGAGGATAAATTCATATTTGCATGT TTTAATCAGCTTTACAAGATGGATCCTGAGATTTTTATTACATGGTGCAATATCCTTAAG CGTGTACCAAACAGTGCTCTTTGGCTTCTCAGATTTCCAGCTGCAGGAGAGATGAGGCTC CGCGCACATGCTGCTGCCCAAGGCCTGCAACCAGACCAAATTATTTTCACAGATGTTGCA ATGAAACAAGAGCACATCAAGCGCAGCTCCTTGGCTGATCTTTTCTTGGACACGCCACTG TGCAATGCACATACCACAGGAACTGATGTTCTTTGGGCTGGTCTACCAATGGTAACCCTT CCCCTTGAGAAGATGGCTACTAGAGTTGCTGGCTCTCTGTGTTTGGCGACAGGACTTGGT GCTGAGATGATTGTCAGCAGTATGAAGGAATATGAGGAGAAGGCGGTGTCACTGGCACTC AATCGTCCAAAGCTCCAAGATCTCACCAATAGACTCAAGGCTGTACGAATGAGTTGCCCT TTATTTGATACAACACGTTGGATGTGGAATCTCTATTGCTCCGGCCAGCATCCTCAGCCC TTCCAAGTGACCGAGAATGACTCAGAATTTCCTTTTGACCGCTAG