Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc09g091440.3.1
CDS Infomation

Histone deacetylase (AHRD V3.3 *** K4CWH0_SOLLC)
Sequence

ATGGATGTTGGAGGAAACTCCTTAGCATCTGGTGCAGATGGAAAGAAGAGAAAAGTAAGT
TATTTCTATGATCCTGAAGTTGGTAATTACTATTATGGACAAGGCCATCCAATGAAGCCA
CATAGAATGCGGATGACACATGCTCTTCTTGCCCACTATGGTCTATTACAACACATGCAT
GTTCTGAAGCCAAATCCTGCTAGAGATAAGGATCTCTGTAGGTTTCATGCTGATGATTAT
ATTGCTTTCTTGAGAAGCGTAACACCAGAAACACAGCAAGATCAGCTGAGGCAGCTGAAG
AGGTTCAATGTCGGGGAGGACTGTCCAGTTTTTGATGGTCTTTATTCCTTCTGCCAAACC
TACGCTGGAGGTTCTGTTGGTGGGGCAGTTAAGTTGAACCATGGACACTGTGATATCGCT
GTAAATTGGGCTGGTGGATTGCATCATGCCAAGAAATGTGAAGCATCTGGTTTCTGCTAT
GTGAACGATATCGTGTTGGCTATTCTGGAGCTACTCAAAGTCCATGAGAGAGTATTGTAT
GTGGATATTGATATCCATCATGGTGATGGCGTGGAAGAGGCCTTCTATACTACAGATAGG
GTCATGACAGTTTCCTTTCATAAATTTGGAGATTACTTTCCTGGTACAGGGGATGTACGT
GATATTGGTTATGGAAGTGGAAAATACTACTCTCTAAATGTTCCACTAGATGATGGAATT
GATGATGAGAGCTATCAGTCCCTCTTTAAGCCTATTATGGGCAAAGTGATGGAAGTTTTT
AAGCCTGGTGCTGTGGTTTTGCAATGTGGTGCAGATTCCTTGTCTGGCGATCGGCTAGGC
TGCTTTAATCTCTCTATTAAAGGTCATGCTGAATGTGTCAAGTACATGAGGTCTTTCAAT
GTGCCATTGTTGTTGCTTGGTGGAGGCGGCTACACAATACGTAATGTTGCTCGTTGCTGG
TGTTACGAAACAGGAGTTGCATTAGGAATAGAGCTTGAAGATAAGATGCCGCAACATGAA
TATTATGAATACTTTGGTCCAGATTATACCTTGCATGTCGCTCCAAGTAACATGGAGAAC
AAAAATTCTCGTCAGATTTTAGAAGATATAAGATCAAAGCTGCTTGATAATCTTTCAAAG
CTTCAGCATGCCCCAAGTGTGCAGTTCCAGGAGCGACCACCGGATACTGAATTGCCTGAG
GCTGATGAAGATCTAGAGGATGCAGATTCAAGATGGGATGCTGATTCTGACACAAATGGC
GAAGAACGTAAGCCCAATCCTAGCAGAGTGAGGAGGGAACATGTTGAACCTGAAGGAAAA
GGCACGGACGATATGAAAACAGAAGAGCACCTAAGAGAAGTAGAATCGACATTCGCAGAG
TCAACAAGTTTGAAGGGTGGCAATTCAAGTTCTACACTGATAGATGGAGGACAGATTAAA
GTGGAACAAGGAAACTCTAACAAGCTTTTTGATCAACCAACTGATATTATCTCCTAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc09g091440.3.1
PEP Infomation

Histone deacetylase (AHRD V3.3 *** K4CWH0_SOLLC)
Sequence

MDVGGNSLASGADGKKRKVSYFYDPEVGNYYYGQGHPMKPHRMRMTHALLAHYGLLQHMH
VLKPNPARDKDLCRFHADDYIAFLRSVTPETQQDQLRQLKRFNVGEDCPVFDGLYSFCQT
YAGGSVGGAVKLNHGHCDIAVNWAGGLHHAKKCEASGFCYVNDIVLAILELLKVHERVLY
VDIDIHHGDGVEEAFYTTDRVMTVSFHKFGDYFPGTGDVRDIGYGSGKYYSLNVPLDDGI
DDESYQSLFKPIMGKVMEVFKPGAVVLQCGADSLSGDRLGCFNLSIKGHAECVKYMRSFN
VPLLLLGGGGYTIRNVARCWCYETGVALGIELEDKMPQHEYYEYFGPDYTLHVAPSNMEN
KNSRQILEDIRSKLLDNLSKLQHAPSVQFQERPPDTELPEADEDLEDADSRWDADSDTNG
EERKPNPSRVRREHVEPEGKGTDDMKTEEHLREVESTFAESTSLKGGNSSSTLIDGGQIK
VEQGNSNKLFDQPTDIIS*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc09g091440.3.1
Transcript Infomation

Histone deacetylase (AHRD V3.3 *** K4CWH0_SOLLC)
Sequence

GTGTATATATTTTCCATTAGTTTGAAGACATAAATATATTTTACATCTGGTTTTTTCTTC
TCTACTCAACCTTTAGCGATCTCTACTGTAGTGGCCGCTTCTTCTGGTTTTCACTTTCAG
GTTTATCCTTACTGGTTTATAGCTTGGGAAATGGATGTTGGAGGAAACTCCTTAGCATCT
GGTGCAGATGGAAAGAAGAGAAAAGTAAGTTATTTCTATGATCCTGAAGTTGGTAATTAC
TATTATGGACAAGGCCATCCAATGAAGCCACATAGAATGCGGATGACACATGCTCTTCTT
GCCCACTATGGTCTATTACAACACATGCATGTTCTGAAGCCAAATCCTGCTAGAGATAAG
GATCTCTGTAGGTTTCATGCTGATGATTATATTGCTTTCTTGAGAAGCGTAACACCAGAA
ACACAGCAAGATCAGCTGAGGCAGCTGAAGAGGTTCAATGTCGGGGAGGACTGTCCAGTT
TTTGATGGTCTTTATTCCTTCTGCCAAACCTACGCTGGAGGTTCTGTTGGTGGGGCAGTT
AAGTTGAACCATGGACACTGTGATATCGCTGTAAATTGGGCTGGTGGATTGCATCATGCC
AAGAAATGTGAAGCATCTGGTTTCTGCTATGTGAACGATATCGTGTTGGCTATTCTGGAG
CTACTCAAAGTCCATGAGAGAGTATTGTATGTGGATATTGATATCCATCATGGTGATGGC
GTGGAAGAGGCCTTCTATACTACAGATAGGGTCATGACAGTTTCCTTTCATAAATTTGGA
GATTACTTTCCTGGTACAGGGGATGTACGTGATATTGGTTATGGAAGTGGAAAATACTAC
TCTCTAAATGTTCCACTAGATGATGGAATTGATGATGAGAGCTATCAGTCCCTCTTTAAG
CCTATTATGGGCAAAGTGATGGAAGTTTTTAAGCCTGGTGCTGTGGTTTTGCAATGTGGT
GCAGATTCCTTGTCTGGCGATCGGCTAGGCTGCTTTAATCTCTCTATTAAAGGTCATGCT
GAATGTGTCAAGTACATGAGGTCTTTCAATGTGCCATTGTTGTTGCTTGGTGGAGGCGGC
TACACAATACGTAATGTTGCTCGTTGCTGGTGTTACGAAACAGGAGTTGCATTAGGAATA
GAGCTTGAAGATAAGATGCCGCAACATGAATATTATGAATACTTTGGTCCAGATTATACC
TTGCATGTCGCTCCAAGTAACATGGAGAACAAAAATTCTCGTCAGATTTTAGAAGATATA
AGATCAAAGCTGCTTGATAATCTTTCAAAGCTTCAGCATGCCCCAAGTGTGCAGTTCCAG
GAGCGACCACCGGATACTGAATTGCCTGAGGCTGATGAAGATCTAGAGGATGCAGATTCA
AGATGGGATGCTGATTCTGACACAAATGGCGAAGAACGTAAGCCCAATCCTAGCAGAGTG
AGGAGGGAACATGTTGAACCTGAAGGAAAAGGCACGGACGATATGAAAACAGAAGAGCAC
CTAAGAGAAGTAGAATCGACATTCGCAGAGTCAACAAGTTTGAAGGGTGGCAATTCAAGT
TCTACACTGATAGATGGAGGACAGATTAAAGTGGAACAAGGAAACTCTAACAAGCTTTTT
GATCAACCAACTGATATTATCTCCTAAATAGACTTTTTCAATCTTTTAAACTTTACTGTA
ATGTATGATTCTTTAAATTATACATTTGAGTCTACTTGTTATGCACACTAATTTACAGAT
ATGATATGATCCATGAACAATCTCCCTCACCTCACCTCCCCGAATCGAAATCGCGCTTCT
TTCATTCATATTAGTTGGAGAAAAAGAACATGCCAATATGTCAATTGACAAGAGTTTGGT
GGAAATGAGGCCCAAATAGATTGTGGTTT