Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc09g083110.2.1
CDS Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103XDL5_CYNCS)
Sequence	ATGTATGTGAAGTTTCAGTATGTTGACACCAGTAATTGTTTCTATATACTGAACTCAACT AAACCCACTCCCAGTATTGGAATTTCAATTCCACCCACCAAGAAATATAAGGACCAGAAC AAATTGAATGACCCAAATGGAAGAATTGAGAAAAGCAAGAATCTTGGGGTCAAATTCAGG CCGGGTGTTGGGTATGGTAATGATGTAAAAGAGAAGTTGGATTATCAAATTGGGAAAAGC TCGCATACCCGTGTTTGGAAAAATGGTGATTTGAAGACCCAAAATGGTTTCTTGAGTAAA CCAGTTGATAGAACTGAGTGTGAGGAGAAAATTGATGGTCAGTGGAGTTCGAGTAATGGG GTGCAGACCAAGTGTTCGAAAAAATGGCGCAATGAAGTGAAGGAGACCCAAAATGGTGTT TTAAAGACCCAAAATGATTTCTTGACAAAACCAGTTGATAGAACTGAGAGTGAGGAGAAA ATTGATGGGAAATTGAGCTTGGTAAATATGGTGCAGCCCAACTGTTCGACAAAATGGTGT AATGGCGTGAAGGAGATCCAAAATGGTGTTTCTAGGAAACCTGTTGATAGAACTGAAAAT AAGAAAAAAGTTGGTGGTCAATTAAGCTTGGGGAATGTGGTAGAGAAAGTACAGACTAAG GGTTCGAAAAAATGGGCCAGATATGGAGGATGTATTCCTGTTATGCTGGAAGCTTTGGAG ACAGTTAGTAATTTGGATGAGGCATTGAAGCCATGGGAAAAGAGTTTGACTAAAAAAGAA AGGACTATTATATTGAAGGAGCAGGTGCAGTGGCAACGAGCAATGGAGATTTTTGAGTGG TTTAAGAGAAGAGGATGCCATGAATTGAATGTTATACATTATAATATTGTACTTAGGATT CTTGGGAAATCACAGAGGTGGGATGAGATTCAGAGACTGTGGGACGAAATGAGGAAAAGG AGAGTTGAGCCTATAAATTCAACTTATGGGACTCTGATTGATGTCTACAGCAAGGGTGGG CGTAGGGAGCAGGCAATGGAATGGTTGAAGTTGATGAATGAAAGAGGTATGGTACCAGAT GAGGTGACAATGGGAATTGTTGTTCAGATGTATAAAATGGCGGGGGAGTTTAAGAAAGCG GAAGAGTTTTTGAAAAAGTGGTCTTTATGCAAATTCCAAGTGGAGGAACGTGTAAATGGT GGACCAAGAAGTGGTATTAGGGTCAATGGTTCTTCTGGTTCAAGTGTTTGTTTGAGCTCG CATACCTATAACAATTTAATTGACACTTATGGAAAGGCAGGACAAGTGAAAGAAGCATAC GAGACTTTTCACCAGATGCTGAGGGAAGGGATCCTACCAACAACAGTTACTTTCAATACA ATGATTCACATGTGTGGTAATAATGGCCGAATGGAAGAAGTTGCTTCCTTGATGAGGAAG ATGGAGGGGCTTCAGTGTCATCCTGATACAAGAACATACAACATTCTTATTTCCCTACAC GCCAAGCATGACAACATAGAAATGGCTGCCACCTACTTTAAAATTATGAAAGATGCTTCT CTAGAGCCAGATGCCGTGACCTATCGCACTCTTTTGTATGCATTTTCCATAAGGAATATG GTTAGTGAAGCAGAGAAGCTCATTTTGGAGATGGATAAGAAAGATCTGCAGATTGACGAA TTCACTCAGTCAGCTTTGACTAGGATGTATCTAGAAGCTGGGATGGTAGAAATGTCATGG TCCTGGTTCCAGAGGTTTCATTTTGGAGGAAAAATGTCTTCTGAATGTTATTCTGCGAAC ATTGATGCCTTCGGTGAACGTGGCCATATTTCGGAAGCTGAGAGAGCTTTTAACTGTTGT AGTGAGGGAAAAAGGCTAACTGTTCTTGAGTTCAATGTAATGATCAAAGCGTATGGAATC AGCAAAAAATACAACGAGGCGTGCTACTTGTTTGATAGCATGGAGAAGCATGGCTTATCT CCTGATAAATGCAGTTACAGTTCACTCATCCAAATGCTAGCTGGTGCAGATCTGCCTCTG AAAGCAGCATCTTATGTGAGGGAAATGCAGGAGGCGGGATTAGTTAATGATTGTATCCCT TATTGTGCTGTGATATCTAGCTTTGTTAAAGTAGGTCAGCTGGAAATGGCAGTAAGCTTA TTCGATGAAATGATTGTGTTTGGCATCAAACCTGATGTTGTTCTTTATGGTGTACTGATA AATGCCTTTGCTGACATGGGAAGTGTTAAAGACGCTACAAAATACTTGGTTGAAATGAGA AACTCTGGTTTAGAGGCAAATGCTGTTATATACACTTCCTTAATTAAGCTATACACCAAG GTTGGGTATTTGAGAGAAGCACAAGAAACGTATAAAATGCTTCAGTCGTTCGAGGCAGGG CTTGATGTATATTCTTCAAATTGCATGATTGACTTGTACAGCGAGCGCTCTATGGTTAAA CAAGCAGAAGAGATTTTTGAACACCTGAAGAAAAAGGGAAATGCAAATGAATTTTCTTAT GCAATGATGCTTTGCATGTACAGGAGAAATGGAATGTTTAAGGAAGCCATTCAAAATGCC CGGAAAATGAAAGAACTAGGACTTCTGACTGACTTGTTGAGTTACAACAATGTGCTTGGA TTGTGTGCAACTGATGGGAGGTATAAAGAAGCTTTGGCTACTTACAAGGAAATGCTTTCT TCTGCCATCCAACCTGATGATTCAACATTCAAATCACTCGGAATTGTTCTTCTTAAATGC GGTGTTCCAAAGGAGGCTATTAATAAGCTGGAATCTATGAGGAAAAAGGATCCTCAGAGT GGCGTGCAAGAGTGGACTTCAGCCCTATCTTCCGTTATCGGTGTGCTTGATACTGACTCT CCTGATAGTAAAGATATGTACCGTTTAAAAAAAGGATAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc09g083110.2.1
PEP Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103XDL5_CYNCS)
Sequence	MYVKFQYVDTSNCFYILNSTKPTPSIGISIPPTKKYKDQNKLNDPNGRIEKSKNLGVKFR PGVGYGNDVKEKLDYQIGKSSHTRVWKNGDLKTQNGFLSKPVDRTECEEKIDGQWSSSNG VQTKCSKKWRNEVKETQNGVLKTQNDFLTKPVDRTESEEKIDGKLSLVNMVQPNCSTKWC NGVKEIQNGVSRKPVDRTENKKKVGGQLSLGNVVEKVQTKGSKKWARYGGCIPVMLEALE TVSNLDEALKPWEKSLTKKERTIILKEQVQWQRAMEIFEWFKRRGCHELNVIHYNIVLRI LGKSQRWDEIQRLWDEMRKRRVEPINSTYGTLIDVYSKGGRREQAMEWLKLMNERGMVPD EVTMGIVVQMYKMAGEFKKAEEFLKKWSLCKFQVEERVNGGPRSGIRVNGSSGSSVCLSS HTYNNLIDTYGKAGQVKEAYETFHQMLREGILPTTVTFNTMIHMCGNNGRMEEVASLMRK MEGLQCHPDTRTYNILISLHAKHDNIEMAATYFKIMKDASLEPDAVTYRTLLYAFSIRNM VSEAEKLILEMDKKDLQIDEFTQSALTRMYLEAGMVEMSWSWFQRFHFGGKMSSECYSAN IDAFGERGHISEAERAFNCCSEGKRLTVLEFNVMIKAYGISKKYNEACYLFDSMEKHGLS PDKCSYSSLIQMLAGADLPLKAASYVREMQEAGLVNDCIPYCAVISSFVKVGQLEMAVSL FDEMIVFGIKPDVVLYGVLINAFADMGSVKDATKYLVEMRNSGLEANAVIYTSLIKLYTK VGYLREAQETYKMLQSFEAGLDVYSSNCMIDLYSERSMVKQAEEIFEHLKKKGNANEFSY AMMLCMYRRNGMFKEAIQNARKMKELGLLTDLLSYNNVLGLCATDGRYKEALATYKEMLS SAIQPDDSTFKSLGIVLLKCGVPKEAINKLESMRKKDPQSGVQEWTSALSSVIGVLDTDS PDSKDMYRLKKG*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc09g083110.2.1
Transcript Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103XDL5_CYNCS)
Sequence	ATGTATGTGAAGTTTCAGTATGTTGACACCAGTAATTGTTTCTATATACTGAACTCAACT AAACCCACTCCCAGTATTGGAATTTCAATTCCACCCACCAAGAAATATAAGGACCAGAAC AAATTGAATGACCCAAATGGAAGAATTGAGAAAAGCAAGAATCTTGGGGTCAAATTCAGG CCGGGTGTTGGGTATGGTAATGATGTAAAAGAGAAGTTGGATTATCAAATTGGGAAAAGC TCGCATACCCGTGTTTGGAAAAATGGTGATTTGAAGACCCAAAATGGTTTCTTGAGTAAA CCAGTTGATAGAACTGAGTGTGAGGAGAAAATTGATGGTCAGTGGAGTTCGAGTAATGGG GTGCAGACCAAGTGTTCGAAAAAATGGCGCAATGAAGTGAAGGAGACCCAAAATGGTGTT TTAAAGACCCAAAATGATTTCTTGACAAAACCAGTTGATAGAACTGAGAGTGAGGAGAAA ATTGATGGGAAATTGAGCTTGGTAAATATGGTGCAGCCCAACTGTTCGACAAAATGGTGT AATGGCGTGAAGGAGATCCAAAATGGTGTTTCTAGGAAACCTGTTGATAGAACTGAAAAT AAGAAAAAAGTTGGTGGTCAATTAAGCTTGGGGAATGTGGTAGAGAAAGTACAGACTAAG GGTTCGAAAAAATGGGCCAGATATGGAGGATGTATTCCTGTTATGCTGGAAGCTTTGGAG ACAGTTAGTAATTTGGATGAGGCATTGAAGCCATGGGAAAAGAGTTTGACTAAAAAAGAA AGGACTATTATATTGAAGGAGCAGGTGCAGTGGCAACGAGCAATGGAGATTTTTGAGTGG TTTAAGAGAAGAGGATGCCATGAATTGAATGTTATACATTATAATATTGTACTTAGGATT CTTGGGAAATCACAGAGGTGGGATGAGATTCAGAGACTGTGGGACGAAATGAGGAAAAGG AGAGTTGAGCCTATAAATTCAACTTATGGGACTCTGATTGATGTCTACAGCAAGGGTGGG CGTAGGGAGCAGGCAATGGAATGGTTGAAGTTGATGAATGAAAGAGGTATGGTACCAGAT GAGGTGACAATGGGAATTGTTGTTCAGATGTATAAAATGGCGGGGGAGTTTAAGAAAGCG GAAGAGTTTTTGAAAAAGTGGTCTTTATGCAAATTCCAAGTGGAGGAACGTGTAAATGGT GGACCAAGAAGTGGTATTAGGGTCAATGGTTCTTCTGGTTCAAGTGTTTGTTTGAGCTCG CATACCTATAACAATTTAATTGACACTTATGGAAAGGCAGGACAAGTGAAAGAAGCATAC GAGACTTTTCACCAGATGCTGAGGGAAGGGATCCTACCAACAACAGTTACTTTCAATACA ATGATTCACATGTGTGGTAATAATGGCCGAATGGAAGAAGTTGCTTCCTTGATGAGGAAG ATGGAGGGGCTTCAGTGTCATCCTGATACAAGAACATACAACATTCTTATTTCCCTACAC GCCAAGCATGACAACATAGAAATGGCTGCCACCTACTTTAAAATTATGAAAGATGCTTCT CTAGAGCCAGATGCCGTGACCTATCGCACTCTTTTGTATGCATTTTCCATAAGGAATATG GTTAGTGAAGCAGAGAAGCTCATTTTGGAGATGGATAAGAAAGATCTGCAGATTGACGAA TTCACTCAGTCAGCTTTGACTAGGATGTATCTAGAAGCTGGGATGGTAGAAATGTCATGG TCCTGGTTCCAGAGGTTTCATTTTGGAGGAAAAATGTCTTCTGAATGTTATTCTGCGAAC ATTGATGCCTTCGGTGAACGTGGCCATATTTCGGAAGCTGAGAGAGCTTTTAACTGTTGT AGTGAGGGAAAAAGGCTAACTGTTCTTGAGTTCAATGTAATGATCAAAGCGTATGGAATC AGCAAAAAATACAACGAGGCGTGCTACTTGTTTGATAGCATGGAGAAGCATGGCTTATCT CCTGATAAATGCAGTTACAGTTCACTCATCCAAATGCTAGCTGGTGCAGATCTGCCTCTG AAAGCAGCATCTTATGTGAGGGAAATGCAGGAGGCGGGATTAGTTAATGATTGTATCCCT TATTGTGCTGTGATATCTAGCTTTGTTAAAGTAGGTCAGCTGGAAATGGCAGTAAGCTTA TTCGATGAAATGATTGTGTTTGGCATCAAACCTGATGTTGTTCTTTATGGTGTACTGATA AATGCCTTTGCTGACATGGGAAGTGTTAAAGACGCTACAAAATACTTGGTTGAAATGAGA AACTCTGGTTTAGAGGCAAATGCTGTTATATACACTTCCTTAATTAAGCTATACACCAAG GTTGGGTATTTGAGAGAAGCACAAGAAACGTATAAAATGCTTCAGTCGTTCGAGGCAGGG CTTGATGTATATTCTTCAAATTGCATGATTGACTTGTACAGCGAGCGCTCTATGGTTAAA CAAGCAGAAGAGATTTTTGAACACCTGAAGAAAAAGGGAAATGCAAATGAATTTTCTTAT GCAATGATGCTTTGCATGTACAGGAGAAATGGAATGTTTAAGGAAGCCATTCAAAATGCC CGGAAAATGAAAGAACTAGGACTTCTGACTGACTTGTTGAGTTACAACAATGTGCTTGGA TTGTGTGCAACTGATGGGAGGTATAAAGAAGCTTTGGCTACTTACAAGGAAATGCTTTCT TCTGCCATCCAACCTGATGATTCAACATTCAAATCACTCGGAATTGTTCTTCTTAAATGC GGTGTTCCAAAGGAGGCTATTAATAAGCTGGAATCTATGAGGAAAAAGGATCCTCAGAGT GGCGTGCAAGAGTGGACTTCAGCCCTATCTTCCGTTATCGGTGTGCTTGATACTGACTCT CCTGATAGTAAAGATATGTACCGTTTAAAAAAAGGATAG