Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc09g083110.2.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103XDL5_CYNCS)

Sequence

ATGTATGTGAAGTTTCAGTATGTTGACACCAGTAATTGTTTCTATATACTGAACTCAACT
AAACCCACTCCCAGTATTGGAATTTCAATTCCACCCACCAAGAAATATAAGGACCAGAAC
AAATTGAATGACCCAAATGGAAGAATTGAGAAAAGCAAGAATCTTGGGGTCAAATTCAGG
CCGGGTGTTGGGTATGGTAATGATGTAAAAGAGAAGTTGGATTATCAAATTGGGAAAAGC
TCGCATACCCGTGTTTGGAAAAATGGTGATTTGAAGACCCAAAATGGTTTCTTGAGTAAA
CCAGTTGATAGAACTGAGTGTGAGGAGAAAATTGATGGTCAGTGGAGTTCGAGTAATGGG
GTGCAGACCAAGTGTTCGAAAAAATGGCGCAATGAAGTGAAGGAGACCCAAAATGGTGTT
TTAAAGACCCAAAATGATTTCTTGACAAAACCAGTTGATAGAACTGAGAGTGAGGAGAAA
ATTGATGGGAAATTGAGCTTGGTAAATATGGTGCAGCCCAACTGTTCGACAAAATGGTGT
AATGGCGTGAAGGAGATCCAAAATGGTGTTTCTAGGAAACCTGTTGATAGAACTGAAAAT
AAGAAAAAAGTTGGTGGTCAATTAAGCTTGGGGAATGTGGTAGAGAAAGTACAGACTAAG
GGTTCGAAAAAATGGGCCAGATATGGAGGATGTATTCCTGTTATGCTGGAAGCTTTGGAG
ACAGTTAGTAATTTGGATGAGGCATTGAAGCCATGGGAAAAGAGTTTGACTAAAAAAGAA
AGGACTATTATATTGAAGGAGCAGGTGCAGTGGCAACGAGCAATGGAGATTTTTGAGTGG
TTTAAGAGAAGAGGATGCCATGAATTGAATGTTATACATTATAATATTGTACTTAGGATT
CTTGGGAAATCACAGAGGTGGGATGAGATTCAGAGACTGTGGGACGAAATGAGGAAAAGG
AGAGTTGAGCCTATAAATTCAACTTATGGGACTCTGATTGATGTCTACAGCAAGGGTGGG
CGTAGGGAGCAGGCAATGGAATGGTTGAAGTTGATGAATGAAAGAGGTATGGTACCAGAT
GAGGTGACAATGGGAATTGTTGTTCAGATGTATAAAATGGCGGGGGAGTTTAAGAAAGCG
GAAGAGTTTTTGAAAAAGTGGTCTTTATGCAAATTCCAAGTGGAGGAACGTGTAAATGGT
GGACCAAGAAGTGGTATTAGGGTCAATGGTTCTTCTGGTTCAAGTGTTTGTTTGAGCTCG
CATACCTATAACAATTTAATTGACACTTATGGAAAGGCAGGACAAGTGAAAGAAGCATAC
GAGACTTTTCACCAGATGCTGAGGGAAGGGATCCTACCAACAACAGTTACTTTCAATACA
ATGATTCACATGTGTGGTAATAATGGCCGAATGGAAGAAGTTGCTTCCTTGATGAGGAAG
ATGGAGGGGCTTCAGTGTCATCCTGATACAAGAACATACAACATTCTTATTTCCCTACAC
GCCAAGCATGACAACATAGAAATGGCTGCCACCTACTTTAAAATTATGAAAGATGCTTCT
CTAGAGCCAGATGCCGTGACCTATCGCACTCTTTTGTATGCATTTTCCATAAGGAATATG
GTTAGTGAAGCAGAGAAGCTCATTTTGGAGATGGATAAGAAAGATCTGCAGATTGACGAA
TTCACTCAGTCAGCTTTGACTAGGATGTATCTAGAAGCTGGGATGGTAGAAATGTCATGG
TCCTGGTTCCAGAGGTTTCATTTTGGAGGAAAAATGTCTTCTGAATGTTATTCTGCGAAC
ATTGATGCCTTCGGTGAACGTGGCCATATTTCGGAAGCTGAGAGAGCTTTTAACTGTTGT
AGTGAGGGAAAAAGGCTAACTGTTCTTGAGTTCAATGTAATGATCAAAGCGTATGGAATC
AGCAAAAAATACAACGAGGCGTGCTACTTGTTTGATAGCATGGAGAAGCATGGCTTATCT
CCTGATAAATGCAGTTACAGTTCACTCATCCAAATGCTAGCTGGTGCAGATCTGCCTCTG
AAAGCAGCATCTTATGTGAGGGAAATGCAGGAGGCGGGATTAGTTAATGATTGTATCCCT
TATTGTGCTGTGATATCTAGCTTTGTTAAAGTAGGTCAGCTGGAAATGGCAGTAAGCTTA
TTCGATGAAATGATTGTGTTTGGCATCAAACCTGATGTTGTTCTTTATGGTGTACTGATA
AATGCCTTTGCTGACATGGGAAGTGTTAAAGACGCTACAAAATACTTGGTTGAAATGAGA
AACTCTGGTTTAGAGGCAAATGCTGTTATATACACTTCCTTAATTAAGCTATACACCAAG
GTTGGGTATTTGAGAGAAGCACAAGAAACGTATAAAATGCTTCAGTCGTTCGAGGCAGGG
CTTGATGTATATTCTTCAAATTGCATGATTGACTTGTACAGCGAGCGCTCTATGGTTAAA
CAAGCAGAAGAGATTTTTGAACACCTGAAGAAAAAGGGAAATGCAAATGAATTTTCTTAT
GCAATGATGCTTTGCATGTACAGGAGAAATGGAATGTTTAAGGAAGCCATTCAAAATGCC
CGGAAAATGAAAGAACTAGGACTTCTGACTGACTTGTTGAGTTACAACAATGTGCTTGGA
TTGTGTGCAACTGATGGGAGGTATAAAGAAGCTTTGGCTACTTACAAGGAAATGCTTTCT
TCTGCCATCCAACCTGATGATTCAACATTCAAATCACTCGGAATTGTTCTTCTTAAATGC
GGTGTTCCAAAGGAGGCTATTAATAAGCTGGAATCTATGAGGAAAAAGGATCCTCAGAGT
GGCGTGCAAGAGTGGACTTCAGCCCTATCTTCCGTTATCGGTGTGCTTGATACTGACTCT
CCTGATAGTAAAGATATGTACCGTTTAAAAAAAGGATAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc09g083110.2.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103XDL5_CYNCS)

Sequence

MYVKFQYVDTSNCFYILNSTKPTPSIGISIPPTKKYKDQNKLNDPNGRIEKSKNLGVKFR
PGVGYGNDVKEKLDYQIGKSSHTRVWKNGDLKTQNGFLSKPVDRTECEEKIDGQWSSSNG
VQTKCSKKWRNEVKETQNGVLKTQNDFLTKPVDRTESEEKIDGKLSLVNMVQPNCSTKWC
NGVKEIQNGVSRKPVDRTENKKKVGGQLSLGNVVEKVQTKGSKKWARYGGCIPVMLEALE
TVSNLDEALKPWEKSLTKKERTIILKEQVQWQRAMEIFEWFKRRGCHELNVIHYNIVLRI
LGKSQRWDEIQRLWDEMRKRRVEPINSTYGTLIDVYSKGGRREQAMEWLKLMNERGMVPD
EVTMGIVVQMYKMAGEFKKAEEFLKKWSLCKFQVEERVNGGPRSGIRVNGSSGSSVCLSS
HTYNNLIDTYGKAGQVKEAYETFHQMLREGILPTTVTFNTMIHMCGNNGRMEEVASLMRK
MEGLQCHPDTRTYNILISLHAKHDNIEMAATYFKIMKDASLEPDAVTYRTLLYAFSIRNM
VSEAEKLILEMDKKDLQIDEFTQSALTRMYLEAGMVEMSWSWFQRFHFGGKMSSECYSAN
IDAFGERGHISEAERAFNCCSEGKRLTVLEFNVMIKAYGISKKYNEACYLFDSMEKHGLS
PDKCSYSSLIQMLAGADLPLKAASYVREMQEAGLVNDCIPYCAVISSFVKVGQLEMAVSL
FDEMIVFGIKPDVVLYGVLINAFADMGSVKDATKYLVEMRNSGLEANAVIYTSLIKLYTK
VGYLREAQETYKMLQSFEAGLDVYSSNCMIDLYSERSMVKQAEEIFEHLKKKGNANEFSY
AMMLCMYRRNGMFKEAIQNARKMKELGLLTDLLSYNNVLGLCATDGRYKEALATYKEMLS
SAIQPDDSTFKSLGIVLLKCGVPKEAINKLESMRKKDPQSGVQEWTSALSSVIGVLDTDS
PDSKDMYRLKKG*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc09g083110.2.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103XDL5_CYNCS)

Sequence

ATGTATGTGAAGTTTCAGTATGTTGACACCAGTAATTGTTTCTATATACTGAACTCAACT
AAACCCACTCCCAGTATTGGAATTTCAATTCCACCCACCAAGAAATATAAGGACCAGAAC
AAATTGAATGACCCAAATGGAAGAATTGAGAAAAGCAAGAATCTTGGGGTCAAATTCAGG
CCGGGTGTTGGGTATGGTAATGATGTAAAAGAGAAGTTGGATTATCAAATTGGGAAAAGC
TCGCATACCCGTGTTTGGAAAAATGGTGATTTGAAGACCCAAAATGGTTTCTTGAGTAAA
CCAGTTGATAGAACTGAGTGTGAGGAGAAAATTGATGGTCAGTGGAGTTCGAGTAATGGG
GTGCAGACCAAGTGTTCGAAAAAATGGCGCAATGAAGTGAAGGAGACCCAAAATGGTGTT
TTAAAGACCCAAAATGATTTCTTGACAAAACCAGTTGATAGAACTGAGAGTGAGGAGAAA
ATTGATGGGAAATTGAGCTTGGTAAATATGGTGCAGCCCAACTGTTCGACAAAATGGTGT
AATGGCGTGAAGGAGATCCAAAATGGTGTTTCTAGGAAACCTGTTGATAGAACTGAAAAT
AAGAAAAAAGTTGGTGGTCAATTAAGCTTGGGGAATGTGGTAGAGAAAGTACAGACTAAG
GGTTCGAAAAAATGGGCCAGATATGGAGGATGTATTCCTGTTATGCTGGAAGCTTTGGAG
ACAGTTAGTAATTTGGATGAGGCATTGAAGCCATGGGAAAAGAGTTTGACTAAAAAAGAA
AGGACTATTATATTGAAGGAGCAGGTGCAGTGGCAACGAGCAATGGAGATTTTTGAGTGG
TTTAAGAGAAGAGGATGCCATGAATTGAATGTTATACATTATAATATTGTACTTAGGATT
CTTGGGAAATCACAGAGGTGGGATGAGATTCAGAGACTGTGGGACGAAATGAGGAAAAGG
AGAGTTGAGCCTATAAATTCAACTTATGGGACTCTGATTGATGTCTACAGCAAGGGTGGG
CGTAGGGAGCAGGCAATGGAATGGTTGAAGTTGATGAATGAAAGAGGTATGGTACCAGAT
GAGGTGACAATGGGAATTGTTGTTCAGATGTATAAAATGGCGGGGGAGTTTAAGAAAGCG
GAAGAGTTTTTGAAAAAGTGGTCTTTATGCAAATTCCAAGTGGAGGAACGTGTAAATGGT
GGACCAAGAAGTGGTATTAGGGTCAATGGTTCTTCTGGTTCAAGTGTTTGTTTGAGCTCG
CATACCTATAACAATTTAATTGACACTTATGGAAAGGCAGGACAAGTGAAAGAAGCATAC
GAGACTTTTCACCAGATGCTGAGGGAAGGGATCCTACCAACAACAGTTACTTTCAATACA
ATGATTCACATGTGTGGTAATAATGGCCGAATGGAAGAAGTTGCTTCCTTGATGAGGAAG
ATGGAGGGGCTTCAGTGTCATCCTGATACAAGAACATACAACATTCTTATTTCCCTACAC
GCCAAGCATGACAACATAGAAATGGCTGCCACCTACTTTAAAATTATGAAAGATGCTTCT
CTAGAGCCAGATGCCGTGACCTATCGCACTCTTTTGTATGCATTTTCCATAAGGAATATG
GTTAGTGAAGCAGAGAAGCTCATTTTGGAGATGGATAAGAAAGATCTGCAGATTGACGAA
TTCACTCAGTCAGCTTTGACTAGGATGTATCTAGAAGCTGGGATGGTAGAAATGTCATGG
TCCTGGTTCCAGAGGTTTCATTTTGGAGGAAAAATGTCTTCTGAATGTTATTCTGCGAAC
ATTGATGCCTTCGGTGAACGTGGCCATATTTCGGAAGCTGAGAGAGCTTTTAACTGTTGT
AGTGAGGGAAAAAGGCTAACTGTTCTTGAGTTCAATGTAATGATCAAAGCGTATGGAATC
AGCAAAAAATACAACGAGGCGTGCTACTTGTTTGATAGCATGGAGAAGCATGGCTTATCT
CCTGATAAATGCAGTTACAGTTCACTCATCCAAATGCTAGCTGGTGCAGATCTGCCTCTG
AAAGCAGCATCTTATGTGAGGGAAATGCAGGAGGCGGGATTAGTTAATGATTGTATCCCT
TATTGTGCTGTGATATCTAGCTTTGTTAAAGTAGGTCAGCTGGAAATGGCAGTAAGCTTA
TTCGATGAAATGATTGTGTTTGGCATCAAACCTGATGTTGTTCTTTATGGTGTACTGATA
AATGCCTTTGCTGACATGGGAAGTGTTAAAGACGCTACAAAATACTTGGTTGAAATGAGA
AACTCTGGTTTAGAGGCAAATGCTGTTATATACACTTCCTTAATTAAGCTATACACCAAG
GTTGGGTATTTGAGAGAAGCACAAGAAACGTATAAAATGCTTCAGTCGTTCGAGGCAGGG
CTTGATGTATATTCTTCAAATTGCATGATTGACTTGTACAGCGAGCGCTCTATGGTTAAA
CAAGCAGAAGAGATTTTTGAACACCTGAAGAAAAAGGGAAATGCAAATGAATTTTCTTAT
GCAATGATGCTTTGCATGTACAGGAGAAATGGAATGTTTAAGGAAGCCATTCAAAATGCC
CGGAAAATGAAAGAACTAGGACTTCTGACTGACTTGTTGAGTTACAACAATGTGCTTGGA
TTGTGTGCAACTGATGGGAGGTATAAAGAAGCTTTGGCTACTTACAAGGAAATGCTTTCT
TCTGCCATCCAACCTGATGATTCAACATTCAAATCACTCGGAATTGTTCTTCTTAAATGC
GGTGTTCCAAAGGAGGCTATTAATAAGCTGGAATCTATGAGGAAAAAGGATCCTCAGAGT
GGCGTGCAAGAGTGGACTTCAGCCCTATCTTCCGTTATCGGTGTGCTTGATACTGACTCT
CCTGATAGTAAAGATATGTACCGTTTAAAAAAAGGATAG