Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc09g082490.3.1
CDS Infomation	Protein XRI1-like protein (AHRD V3.3 *** A0A0B0NEL0_GOSAR)
Sequence	ATGAATTTTAATCCTGAAAGTGACATGTGGAAATGGCGTGACAGTTACTCTCTTGGAGAT GATCCCGATATTGATATATCTGATTGCTTGTTGAGCAAAGGTGAAGATATTTCCTTTATG TTTGACGATGAAAGAACTCCAGTTAAGTCTTGTGGAGAGTTGACTTACCATGGTAGCAGC TACGTACTTACAGAAAACAATGACAAGGAGACCCAGAGATACAATGAGTCATCCTCACAA GTGAAAAGGCGCAGAATGCTTCAGTTTGATACAGAAGCAGCAGATGCACCACTTAGCAAC GAGGAACTATCATCATCATTTCTAAATTCACAGGAGACTGACACTTCTGTTGATGAATTC ATCTCTGAAATGTCACAGTGGGTTTCAGTATTTTCAGAGGACATATCTTCATCTGGTAAT GAGGGGCTCGATCAGTCATCTGAAGGATGGGTTGCTAGTTGTTTAAACGATTCTCAGATG CATGTCAGCCTTGAGGATATCGCTGCCTCTGATATTCAGCTCGATGTTTCAGAGATTTGC AACACCCCACGTGAATGTGAATCTAATGTGGTTCAAGAGCGCCCTGTACAGACTCGTAAA AATGTTGTTTTCAAAGGTAGGAGATCATATATGCGGGCTCCTACAAAAGCTGCTTCCTCT GTTGTCTATCCATTTTCTTTTGTTAAACCGTGTGGCGTCCAAGGAGACGTGACTCTGAAA GACATAAACCAGAGGATACGCACCCCAAAATTGAAGACACCACAGAATGTTGAAGACCCC TCGGTTGCATACCCAAAGTCTGCTTTCTCTGGTAAGCCTGTTGTTGGAAAGACCACAATT CCAACAGAAGGAGGAAAAGGCAGCATAACCATAATGAGGACAAAGGGATAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc09g082490.3.1
PEP Infomation	Protein XRI1-like protein (AHRD V3.3 *** A0A0B0NEL0_GOSAR)
Sequence	MNFNPESDMWKWRDSYSLGDDPDIDISDCLLSKGEDISFMFDDERTPVKSCGELTYHGSS YVLTENNDKETQRYNESSSQVKRRRMLQFDTEAADAPLSNEELSSSFLNSQETDTSVDEF ISEMSQWVSVFSEDISSSGNEGLDQSSEGWVASCLNDSQMHVSLEDIAASDIQLDVSEIC NTPRECESNVVQERPVQTRKNVVFKGRRSYMRAPTKAASSVVYPFSFVKPCGVQGDVTLK DINQRIRTPKLKTPQNVEDPSVAYPKSAFSGKPVVGKTTIPTEGGKGSITIMRTKG*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc09g082490.3.1
Transcript Infomation	Protein XRI1-like protein (AHRD V3.3 *** A0A0B0NEL0_GOSAR)
Sequence	TTTTTTTTCTTTTTAATGTTCTGCCAAAACTGCTAGTGTTTTTATTGCTAGTTTCCATGG TTTAGTGTATATAAAGAAGAAGAAAGAAGACAACTTTATTTTATTATTACAGTATGATCT GTATTTAACGGCTATTCTTTTTGGTCTTAAAGTATAAAAAGAAAGAGAGATTTCGACCAG TCAAACCATTTTCTGCTGCCCCTTTTGATTTTTTTTTCTCTCTAGGTTGCAGAAAACATT CAGTATCTCTTCAAACTAACATACCCCTTATCTGAGAAAATGAATTTTAATCCTGAAAGT GACATGTGGAAATGGCGTGACAGTTACTCTCTTGGAGATGATCCCGATATTGATATATCT GATTGCTTGTTGAGCAAAGGTGAAGATATTTCCTTTATGTTTGACGATGAAAGAACTCCA GTTAAGTCTTGTGGAGAGTTGACTTACCATGGTAGCAGCTACGTACTTACAGAAAACAAT GACAAGGAGACCCAGAGATACAATGAGTCATCCTCACAAGTGAAAAGGCGCAGAATGCTT CAGTTTGATACAGAAGCAGCAGATGCACCACTTAGCAACGAGGAACTATCATCATCATTT CTAAATTCACAGGAGACTGACACTTCTGTTGATGAATTCATCTCTGAAATGTCACAGTGG GTTTCAGTATTTTCAGAGGACATATCTTCATCTGGTAATGAGGGGCTCGATCAGTCATCT GAAGGATGGGTTGCTAGTTGTTTAAACGATTCTCAGATGCATGTCAGCCTTGAGGATATC GCTGCCTCTGATATTCAGCTCGATGTTTCAGAGATTTGCAACACCCCACGTGAATGTGAA TCTAATGTGGTTCAAGAGCGCCCTGTACAGACTCGTAAAAATGTTGTTTTCAAAGGTAGG AGATCATATATGCGGGCTCCTACAAAAGCTGCTTCCTCTGTTGTCTATCCATTTTCTTTT GTTAAACCGTGTGGCGTCCAAGGAGACGTGACTCTGAAAGACATAAACCAGAGGATACGC ACCCCAAAATTGAAGACACCACAGAATGTTGAAGACCCCTCGGTTGCATACCCAAAGTCT GCTTTCTCTGGTAAGCCTGTTGTTGGAAAGACCACAATTCCAACAGAAGGAGGAAAAGGC AGCATAACCATAATGAGGACAAAGGGATAATTGTTTGAGCAATTAGTCTCTTTTGTTTCG AGGTTTTGCTCCATTTCTTTTGGAGTCGGATATCCTCAGCTTTTCCGAGGGGCCTTGGAG AGTATACATGCTTTCCGGTTGGCATCATCCTTGTAGCTCATACCGTGATGTCACTTATGC ATACTTGAGTGCCCCCTCTTGTTGCCGTATACTGTGCTTTAGACATGGTACGGTCAACGT ACTAGTTGTAGTATTGTAGTTTATCCGCGGAGATCCTCTTATAATTTGACTGTACAAAAC CTTTCATTACTGTTGCTATTTTATTAATTTTAGAAAAACCTTTTGTTACTCTGGCATCTT ATAAGCTATTCAATGAACATTTATGTTGCAGGAGTTCACTTTATAGTGGCAAATTGCTAC TATAATTTTGATATCTATCACCAAATTGCAACCATTTTGTTCTTTTGAGTAGTGATGATA ATGTGCAACTCTTGTGATGATTAGTGGGTAAAAATACACCTAATTATCACTTTTATCATT TTCTCGTGAGTTTCAATATTGGAACTATTCGTTTTTTCCTTTTATTAAAAAGAGGGATTA TAGTGAAACTCTGGGTGACAACAAACACTAGTTAGCTTCTTCCAATTGCTTAAGCTTTTG ATGGATTAAGTTATCAGTTCGTGCAAGTATAAGTAGACTTAAAAATAGTTGAGATGCGCG AATGTTTGACTATGCGTACAATACGAGATGACAAGTTATTTATGAAATAATTGAAGTCCA AAAGTGAACGCAACGATAGATAGATGGATGTCATTTCTTATCGTTTGGAAAAGTTGCATA AGTAGTACCGAGTAAATATTTATAATCTAACACTATTTACTAAATTACATGTTTTTGACC CTAATATCATGAAGAAGGGTGCATGTTTGATTAGAGATCAATAATTACTCTTGATATAGG GTGGATTGTAAAATTAAAAATTAATCTCAAATTTAATAAAATATTATCATTTTTATATCG ATTGGATGTTTGATTTTTTTAGTTTAATTCAATTTTCAGTTTTCTATGAACACAGCTAGT TACAATACTAATGGTAATATGTTTAAGCTTATTTATCTGAAACATGTATTAATAGACAGC GATGCGCCGCGGTCAGCTTTGTTATTGGTTCGATTTATCGATTTTCAATTTGTGAATACG TCAAATTGATAACCAATTCAATAACATACTTC