Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc09g082450.1.1
CDS Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing family protein (AHRD V3.3 *** B9HUS7_POPTR)
Sequence	ATGGCAGCAACCATAAATCTATCTCTTTCTCCGCTTCTCTCTACTACACAAACTCAATCG AATCGAATATCAACAACAACTGACTTAATAAAATCCTCCAAAAATCTGAACGAAATCAAA CAACTACACGCCCATTTCACAAAACAGGGGTTCAATCAGGACCCTGGTTTTCTCGGTAAA CTCATTGCTAAATGCTCCGAATTGGGTTCCTATAATAGCATGGAATATGCACAAATAGCT TTTGACAGTTTCTGTAGTGGTAATGAAGAAGGTTATGATAATACATACAAGTTCAATTCT TTGATTAAAGGGTATTCCTTAGCGGGTTTGTTTCATGATGCTGTATTGATTTATGTAAGA ATGGTTGTTGAATGCGTGGAGCCTGATGGGTATACTTTTCCTTTGATTTTGAGTGCTTGT GCGAAGGATGGGAGGTTTTTTACAGGAATTCAAGTTATGGGTTTGGCTTTGAAATGGGGT TTTGGTGATGATGTGTTTGTTTTGAATTCAGTGATACATTTATATGGTGAATGTGGGGAG GTGGATAAAGCAAGGAAAGTGTTTGATAAAATGTCTGAGAGAAATTTAGTGTCTTGGACT TGTTTGATTTGCGGGTATGCGAAGAGTGAGAATGCTGAAGAGGCGGTTGCTTTGTTTTTC GAGATGGTAGAGGAGGGTGTTATGCCGAATTCTGTGACAATGGTGTGTGTGATATCGGCT TGTGCAGAGTTGGGGGATTTGAGATTGGCGGAAAGAGTGTGTGATTATATTGGGAAGGCG GGATTGAAGGTCAATAGTGTTATGGTAAATGCCCTTATTGATATGTATATGAAATGTGGA TCTATGGATAAGGCAAAAAGGCTTTTTGAGGAATGTGTTGATCGTAATTTGGTACTATAC AATACAGTTTTATCAAACTATGTACGTAAACGGATGGTAAGGGAAGCGCTCGAGGTCTTA GGGGAAATGCTATCCTGTGGAGGACCTCGTCCGGATAGAGTAACTTTGTTGTCTTCTATA TCAGCTTCCACAGAGATGGCTGATGTTTTCTTAGGAAAGCAGTGTCACGCTTATGTTTTG AGGAACGGGTTAGCGAATTGGGATTCCATTGGTAATGCTATTATTGATATGTACATGAAG TGTGGGAGTCAAGAATGGGCTTGCAGAGTTTTTGATCAGATGTCAAACAAGACAGTAGTC TCATGGAATTCACTCATTGCTGGATTTATGAGAAATGGTGATGTGGAGGCTGCTTACAGA ACTTTCAATGAGATGCCTGAGAGTGATCTTGTATCATGGAACACCATGATCGGTGGTTTG GTACAGCAGAGCATGTTTGAGGATGCAATTCATCTATTTCGTGTAATGCAGAATGAGGGG ATTAAAGCAGATAGAGTGACAATGGTCAGTGTTGCATCTGCCTGTGGATATTTAGGTGCT AATGATCTTGCTAAGTGGATATACAATTACATTGAGAAGTACGAAATTCATCTAGATATG CAGCTAAGTACCGCACTTGTTGACATGTTTGCTAGGTGTGGTGATCCTTCAAGTGCAATG AAAGTGTTCAACAAAATGAAAGAGAGGGATGTTTCTGCCTGGACTGCAGCGATAGGGGCC ATGGCTATGGAAGGAAATGGTAAGCGGGCAGTCGAACTATTCTATGAGATGCTTCGGGAA GGGGTGGAACCTGATCAAGTTGTGTTTGTAGCTGTACTAACAGCATGTAGCCATGGGGGC TTAGTAGGAGAAGGAATGGAAATTTTTACGAGTATGAAAGAGATACATGGCATCTCACCA CAGATAGTGCATTATGGGTGCATTGTTGATATGCTTGGCCGCGCTGGGTTATTGAAAGAA GCTGTTGGTATAATAAAAAGCATGCCAATGAAGCCCAATGATGCAGTTTGGGGGGCTTTT CTTGCTGCTTGTAAAATGCACAAAAACGAGGAGATAGCAACTTATGCAGTTGATATGATC TCTGAATCATCCCCAGATAAAGCCGGGATCCATGTGCTTCTTTCAAATATTTATGCTTTG GGAGGGAAGTGGACTGATGTTGCGAAGGTAAGGATGTCCATGAAGGAAAGAGGGATAAAG AAGAACCCCGGTTCAAGCTCAATCGAGGTGAATGGGAACGTTCACGAATTTACTTCAGGT GATGAGTTTCACCTGGAACACACAAACATTTGCCTAATGCTAGACGAAATGAACTGCAGG GTTAGAGAGGCAGGTCATGTCCCTGATCTAACAAATGTTCTGTTGGATGTTGATGAACAA GAGAAAGAATTCTTGCTTAATCGACACAGCGAGAAAATAGCCATGGCATATGGACTCATC TCTACCTCTCGGAGACATCCCATTCGTATAGTCAAAAACCTTCGCATGTGCTCAGATTGC CATTCATTTGCAAAATTTGTGTCAAAAGTATATCATCGGCATATTGTTGTCCGAGATAAC AACCGTTTCCATTTTTTCCAAGGAGGGTTGTGTTCTTGTGGTGATTATTGGTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc09g082450.1.1
PEP Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing family protein (AHRD V3.3 *** B9HUS7_POPTR)
Sequence	MAATINLSLSPLLSTTQTQSNRISTTTDLIKSSKNLNEIKQLHAHFTKQGFNQDPGFLGK LIAKCSELGSYNSMEYAQIAFDSFCSGNEEGYDNTYKFNSLIKGYSLAGLFHDAVLIYVR MVVECVEPDGYTFPLILSACAKDGRFFTGIQVMGLALKWGFGDDVFVLNSVIHLYGECGE VDKARKVFDKMSERNLVSWTCLICGYAKSENAEEAVALFFEMVEEGVMPNSVTMVCVISA CAELGDLRLAERVCDYIGKAGLKVNSVMVNALIDMYMKCGSMDKAKRLFEECVDRNLVLY NTVLSNYVRKRMVREALEVLGEMLSCGGPRPDRVTLLSSISASTEMADVFLGKQCHAYVL RNGLANWDSIGNAIIDMYMKCGSQEWACRVFDQMSNKTVVSWNSLIAGFMRNGDVEAAYR TFNEMPESDLVSWNTMIGGLVQQSMFEDAIHLFRVMQNEGIKADRVTMVSVASACGYLGA NDLAKWIYNYIEKYEIHLDMQLSTALVDMFARCGDPSSAMKVFNKMKERDVSAWTAAIGA MAMEGNGKRAVELFYEMLREGVEPDQVVFVAVLTACSHGGLVGEGMEIFTSMKEIHGISP QIVHYGCIVDMLGRAGLLKEAVGIIKSMPMKPNDAVWGAFLAACKMHKNEEIATYAVDMI SESSPDKAGIHVLLSNIYALGGKWTDVAKVRMSMKERGIKKNPGSSSIEVNGNVHEFTSG DEFHLEHTNICLMLDEMNCRVREAGHVPDLTNVLLDVDEQEKEFLLNRHSEKIAMAYGLI STSRRHPIRIVKNLRMCSDCHSFAKFVSKVYHRHIVVRDNNRFHFFQGGLCSCGDYW*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc09g082450.1.1
Transcript Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing family protein (AHRD V3.3 *** B9HUS7_POPTR)
Sequence	ATGGCAGCAACCATAAATCTATCTCTTTCTCCGCTTCTCTCTACTACACAAACTCAATCG AATCGAATATCAACAACAACTGACTTAATAAAATCCTCCAAAAATCTGAACGAAATCAAA CAACTACACGCCCATTTCACAAAACAGGGGTTCAATCAGGACCCTGGTTTTCTCGGTAAA CTCATTGCTAAATGCTCCGAATTGGGTTCCTATAATAGCATGGAATATGCACAAATAGCT TTTGACAGTTTCTGTAGTGGTAATGAAGAAGGTTATGATAATACATACAAGTTCAATTCT TTGATTAAAGGGTATTCCTTAGCGGGTTTGTTTCATGATGCTGTATTGATTTATGTAAGA ATGGTTGTTGAATGCGTGGAGCCTGATGGGTATACTTTTCCTTTGATTTTGAGTGCTTGT GCGAAGGATGGGAGGTTTTTTACAGGAATTCAAGTTATGGGTTTGGCTTTGAAATGGGGT TTTGGTGATGATGTGTTTGTTTTGAATTCAGTGATACATTTATATGGTGAATGTGGGGAG GTGGATAAAGCAAGGAAAGTGTTTGATAAAATGTCTGAGAGAAATTTAGTGTCTTGGACT TGTTTGATTTGCGGGTATGCGAAGAGTGAGAATGCTGAAGAGGCGGTTGCTTTGTTTTTC GAGATGGTAGAGGAGGGTGTTATGCCGAATTCTGTGACAATGGTGTGTGTGATATCGGCT TGTGCAGAGTTGGGGGATTTGAGATTGGCGGAAAGAGTGTGTGATTATATTGGGAAGGCG GGATTGAAGGTCAATAGTGTTATGGTAAATGCCCTTATTGATATGTATATGAAATGTGGA TCTATGGATAAGGCAAAAAGGCTTTTTGAGGAATGTGTTGATCGTAATTTGGTACTATAC AATACAGTTTTATCAAACTATGTACGTAAACGGATGGTAAGGGAAGCGCTCGAGGTCTTA GGGGAAATGCTATCCTGTGGAGGACCTCGTCCGGATAGAGTAACTTTGTTGTCTTCTATA TCAGCTTCCACAGAGATGGCTGATGTTTTCTTAGGAAAGCAGTGTCACGCTTATGTTTTG AGGAACGGGTTAGCGAATTGGGATTCCATTGGTAATGCTATTATTGATATGTACATGAAG TGTGGGAGTCAAGAATGGGCTTGCAGAGTTTTTGATCAGATGTCAAACAAGACAGTAGTC TCATGGAATTCACTCATTGCTGGATTTATGAGAAATGGTGATGTGGAGGCTGCTTACAGA ACTTTCAATGAGATGCCTGAGAGTGATCTTGTATCATGGAACACCATGATCGGTGGTTTG GTACAGCAGAGCATGTTTGAGGATGCAATTCATCTATTTCGTGTAATGCAGAATGAGGGG ATTAAAGCAGATAGAGTGACAATGGTCAGTGTTGCATCTGCCTGTGGATATTTAGGTGCT AATGATCTTGCTAAGTGGATATACAATTACATTGAGAAGTACGAAATTCATCTAGATATG CAGCTAAGTACCGCACTTGTTGACATGTTTGCTAGGTGTGGTGATCCTTCAAGTGCAATG AAAGTGTTCAACAAAATGAAAGAGAGGGATGTTTCTGCCTGGACTGCAGCGATAGGGGCC ATGGCTATGGAAGGAAATGGTAAGCGGGCAGTCGAACTATTCTATGAGATGCTTCGGGAA GGGGTGGAACCTGATCAAGTTGTGTTTGTAGCTGTACTAACAGCATGTAGCCATGGGGGC TTAGTAGGAGAAGGAATGGAAATTTTTACGAGTATGAAAGAGATACATGGCATCTCACCA CAGATAGTGCATTATGGGTGCATTGTTGATATGCTTGGCCGCGCTGGGTTATTGAAAGAA GCTGTTGGTATAATAAAAAGCATGCCAATGAAGCCCAATGATGCAGTTTGGGGGGCTTTT CTTGCTGCTTGTAAAATGCACAAAAACGAGGAGATAGCAACTTATGCAGTTGATATGATC TCTGAATCATCCCCAGATAAAGCCGGGATCCATGTGCTTCTTTCAAATATTTATGCTTTG GGAGGGAAGTGGACTGATGTTGCGAAGGTAAGGATGTCCATGAAGGAAAGAGGGATAAAG AAGAACCCCGGTTCAAGCTCAATCGAGGTGAATGGGAACGTTCACGAATTTACTTCAGGT GATGAGTTTCACCTGGAACACACAAACATTTGCCTAATGCTAGACGAAATGAACTGCAGG GTTAGAGAGGCAGGTCATGTCCCTGATCTAACAAATGTTCTGTTGGATGTTGATGAACAA GAGAAAGAATTCTTGCTTAATCGACACAGCGAGAAAATAGCCATGGCATATGGACTCATC TCTACCTCTCGGAGACATCCCATTCGTATAGTCAAAAACCTTCGCATGTGCTCAGATTGC CATTCATTTGCAAAATTTGTGTCAAAAGTATATCATCGGCATATTGTTGTCCGAGATAAC AACCGTTTCCATTTTTTCCAAGGAGGGTTGTGTTCTTGTGGTGATTATTGGTAG