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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc09g082400.2.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein, putative (AHRD V3.3 *** B9SPW3_RICCO)

Sequence

ATGCCCTCTAGCTTTAGTGTGCAACGCAGTAACCTTCTTCTTTCCCAAATTCAGAAGTTC
ATACCTAAAAAGTGGACAAGTGTAAGAGAATCAAACACCCGAAAAAACTGTGGCCAAACC
TTGCTGTGTAGCTCACATGAATGTATTTCAGGGCCTTGTAAAGGAAGTAATGAATCAATG
GTGGATTGCTTACTGACAACCTTGAAGGACTTTGCAGGCCAAGGCCACATATGCAAAGCC
TTTAGAACCTTTTCTCTAATACGGACTCATGTCTCTTCTCAAACCCCTTGTGATCTTGTT
ATACAGTCATTATCATCTCTTTTATTATGTTGTACTAATAGCAAGTCACTCTCTGAAGGG
AAACAAATTCATGCATGCATTATTAATTTGGGCATTGCACATAGTTGGAATTTGGTGCCG
AGGATAATCACCTTTTATACGACCTCTGGTTTAGTTGATGATGCTCATGTAATTGCTGAA
ACTTCAAATATCTTGCACCCGCTTCCTTGGAATCTCCTTATTTCTTCTTATGTTAAAAAG
CGGCAAAATGAGGAGGCATTCTCTGCCTATAGGCAGATGGTGAATAGAGGTATAAGACCT
GATGATTTCACTTATCCGTCTGTTCTTAAGGCCTGTGGTGAACAACTAAATCTTGCTTTT
GGCCGTGATATTCACAACTCTATAGATGCTAGTTTACTAGAGCATAACTTGTTTGTCCAG
AATGCTTTAGTTTCTATGTATGCAAAGTGTGGGGAAGTGGATGTTGCACATGATATATTT
GAAAGGATGCCAGTTAAGGATGCAGTTTCTTGGAATTCGATGATCTCTGGTTATGCTTCC
AAAGGTAGGTGGAGTAAAGCTTTTGAGATTTTTGATAGAATGAGGGCTACTGATGCTGAA
TTCGATATTATTACTTGGAACACCATAGCTGGAGGTTGCTTGAAGACAGGTAACTTTGTT
GGGGCTCTTAAATTGTTATCTCAAATGAGAACTTGTGGAATTCAGCTAGAAACTGTGGCA
ACACTTATTGGCTTGGGTGCATGTTCCCACACTGGTTTGTTAGAAATTGGAAAACAGATT
CATGGCTTAGTGATCCGAAGTCACCTTGATGATTTTGATAATGTAAGAAATGCTTTAATC
AATATGTATGCCAGATGCAAGGCACTCAAGCAGGCACATCTTTTGTTTCAGTTTGTTGAC
TCTAAGACTGTAATTACTTGGAATACAATCATATCTGGCTTTGCACATTGGGACAGGTCT
GAGGAAACTTCCTTTCTTTTCCGAGAAATGCTGCTTTCTGGTGTTGAGCCGAATTATATC
ACTATAGCAGGCATTCTTCCCCTGTGTGCTAGGGTGGCAAATTTACAACATGGTAAAGAA
TTTCACTGCTATCTTACAAGACGTGAAGGGTTTGAGGAATATTTGCTCTTGTGGAATTCT
CTTGTGGATATGTATGCAAGATCTGGAAAGGTATTAGCAGCCAGAAAATTATTTAATTTG
ATGAGCAAGAAAGATGCAGTTACCTACACTTCGCTGATAGCAGGATATGGTATTCAAGGT
GAAGGAAGAGAAGCAATTGAACTATTTAATGAAATGATAAGGCTCCACATAAAACCAGAC
CATGTGACCATGGTTGCTGCTTTGTCAGCCTGTAGTCATTCAGGCCTTGTGATGCAGGGC
CAGAAACTATTTGAACAGATGCAAAGTACTTATGGTATAAATCCTCATTTGCAACACTTC
TCTTGCATGGTTGACCTCTTTGGTAGGGCTGGTCTACTTAAAAAAGCAAAGGAAATCATT
ATAAAGATGCCTTTTGAGCCGACACCTGAAATGTGGGCAACTCTCCTTGGAGCATGTAGG
ATTCATAGGAATACTGAGATAGGAGAGTGGGCAGCCGAGAAACTGCTGGAGCTGAGGCCT
GATAAGCCTGGATACTATGTGTTGATTGCTAATATGTATGCAGATGCTGGGCGTTGGAAC
AAACTGGCAAAAGTGAGGACCGTCATGCGAGATTTTGGTGTAAGAAAGTCTCCAGGATGT
GCTTGGGTTGATACTGGTTCTGGCTTTTCCCCCTTTTTGGTTTCAGATACCTCCAGTGGC
CAAACAAATGAAATTTACTGTCTACTGGGAGGACTGAATAGGCTAATGAAAGACACTGGT
CATTTGACTACAGAGGATTCGTCTTCCGAAGAAGAACTTTGTGAAGGACTTCTTTTGTAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc09g082400.2.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein, putative (AHRD V3.3 *** B9SPW3_RICCO)

Sequence

MPSSFSVQRSNLLLSQIQKFIPKKWTSVRESNTRKNCGQTLLCSSHECISGPCKGSNESM
VDCLLTTLKDFAGQGHICKAFRTFSLIRTHVSSQTPCDLVIQSLSSLLLCCTNSKSLSEG
KQIHACIINLGIAHSWNLVPRIITFYTTSGLVDDAHVIAETSNILHPLPWNLLISSYVKK
RQNEEAFSAYRQMVNRGIRPDDFTYPSVLKACGEQLNLAFGRDIHNSIDASLLEHNLFVQ
NALVSMYAKCGEVDVAHDIFERMPVKDAVSWNSMISGYASKGRWSKAFEIFDRMRATDAE
FDIITWNTIAGGCLKTGNFVGALKLLSQMRTCGIQLETVATLIGLGACSHTGLLEIGKQI
HGLVIRSHLDDFDNVRNALINMYARCKALKQAHLLFQFVDSKTVITWNTIISGFAHWDRS
EETSFLFREMLLSGVEPNYITIAGILPLCARVANLQHGKEFHCYLTRREGFEEYLLLWNS
LVDMYARSGKVLAARKLFNLMSKKDAVTYTSLIAGYGIQGEGREAIELFNEMIRLHIKPD
HVTMVAALSACSHSGLVMQGQKLFEQMQSTYGINPHLQHFSCMVDLFGRAGLLKKAKEII
IKMPFEPTPEMWATLLGACRIHRNTEIGEWAAEKLLELRPDKPGYYVLIANMYADAGRWN
KLAKVRTVMRDFGVRKSPGCAWVDTGSGFSPFLVSDTSSGQTNEIYCLLGGLNRLMKDTG
HLTTEDSSSEEELCEGLLL*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc09g082400.2.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein, putative (AHRD V3.3 *** B9SPW3_RICCO)

Sequence

AAAATGAATGAAAGTTCAACTCGAAGGGATGAAAACAAATAGATGATCCTTGATGTAAAA
CCATAGTTAATAGAAACTCCTTTATATTTTTTTGGGCTCATTTGGTAGAAGGGATAAAAA
ATAATTAATTTTAGGATTAGTTCATGTCATGTTTAGTTATATATATATCATGAGATTGTA
GTGTTATGATATTCCATATTATGAGTGAGATGACTAATTTCGAGATAATTAGTCTTGAAA
TAACTTGTTAGTTAATGACTCTCTTATCTATGTCATTAGTGAATTGAAAGGGATAGTCTC
ATCAATGTATCAAATCTCAATTTCTACTCTAAATTGCTTTATTCTAATGCCATATTAGGA
ATATCTTCAAGTGTGTAACAATCAAAAGCTTTATGCCATATTAGGAATATCTTCAAGTGT
GTAACAATCAAAAGCTTTTTTCAGGGGTAGATTGGCTAAATATCAATCTTTTTAAGCTGT
TACAGACTGTTGTTGGTATTGCAAATGTGCCACAATCTTGTTCTTACTCATTATAGTTTA
TGCCCTCTAGCTTTAGTGTGCAACGCAGTAACCTTCTTCTTTCCCAAATTCAGAAGTTCA
TACCTAAAAAGTGGACAAGTGTAAGAGAATCAAACACCCGAAAAAACTGTGGCCAAACCT
TGCTGTGTAGCTCACATGAATGTATTTCAGGGCCTTGTAAAGGAAGTAATGAATCAATGG
TGGATTGCTTACTGACAACCTTGAAGGACTTTGCAGGCCAAGGCCACATATGCAAAGCCT
TTAGAACCTTTTCTCTAATACGGACTCATGTCTCTTCTCAAACCCCTTGTGATCTTGTTA
TACAGTCATTATCATCTCTTTTATTATGTTGTACTAATAGCAAGTCACTCTCTGAAGGGA
AACAAATTCATGCATGCATTATTAATTTGGGCATTGCACATAGTTGGAATTTGGTGCCGA
GGATAATCACCTTTTATACGACCTCTGGTTTAGTTGATGATGCTCATGTAATTGCTGAAA
CTTCAAATATCTTGCACCCGCTTCCTTGGAATCTCCTTATTTCTTCTTATGTTAAAAAGC
GGCAAAATGAGGAGGCATTCTCTGCCTATAGGCAGATGGTGAATAGAGGTATAAGACCTG
ATGATTTCACTTATCCGTCTGTTCTTAAGGCCTGTGGTGAACAACTAAATCTTGCTTTTG
GCCGTGATATTCACAACTCTATAGATGCTAGTTTACTAGAGCATAACTTGTTTGTCCAGA
ATGCTTTAGTTTCTATGTATGCAAAGTGTGGGGAAGTGGATGTTGCACATGATATATTTG
AAAGGATGCCAGTTAAGGATGCAGTTTCTTGGAATTCGATGATCTCTGGTTATGCTTCCA
AAGGTAGGTGGAGTAAAGCTTTTGAGATTTTTGATAGAATGAGGGCTACTGATGCTGAAT
TCGATATTATTACTTGGAACACCATAGCTGGAGGTTGCTTGAAGACAGGTAACTTTGTTG
GGGCTCTTAAATTGTTATCTCAAATGAGAACTTGTGGAATTCAGCTAGAAACTGTGGCAA
CACTTATTGGCTTGGGTGCATGTTCCCACACTGGTTTGTTAGAAATTGGAAAACAGATTC
ATGGCTTAGTGATCCGAAGTCACCTTGATGATTTTGATAATGTAAGAAATGCTTTAATCA
ATATGTATGCCAGATGCAAGGCACTCAAGCAGGCACATCTTTTGTTTCAGTTTGTTGACT
CTAAGACTGTAATTACTTGGAATACAATCATATCTGGCTTTGCACATTGGGACAGGTCTG
AGGAAACTTCCTTTCTTTTCCGAGAAATGCTGCTTTCTGGTGTTGAGCCGAATTATATCA
CTATAGCAGGCATTCTTCCCCTGTGTGCTAGGGTGGCAAATTTACAACATGGTAAAGAAT
TTCACTGCTATCTTACAAGACGTGAAGGGTTTGAGGAATATTTGCTCTTGTGGAATTCTC
TTGTGGATATGTATGCAAGATCTGGAAAGGTATTAGCAGCCAGAAAATTATTTAATTTGA
TGAGCAAGAAAGATGCAGTTACCTACACTTCGCTGATAGCAGGATATGGTATTCAAGGTG
AAGGAAGAGAAGCAATTGAACTATTTAATGAAATGATAAGGCTCCACATAAAACCAGACC
ATGTGACCATGGTTGCTGCTTTGTCAGCCTGTAGTCATTCAGGCCTTGTGATGCAGGGCC
AGAAACTATTTGAACAGATGCAAAGTACTTATGGTATAAATCCTCATTTGCAACACTTCT
CTTGCATGGTTGACCTCTTTGGTAGGGCTGGTCTACTTAAAAAAGCAAAGGAAATCATTA
TAAAGATGCCTTTTGAGCCGACACCTGAAATGTGGGCAACTCTCCTTGGAGCATGTAGGA
TTCATAGGAATACTGAGATAGGAGAGTGGGCAGCCGAGAAACTGCTGGAGCTGAGGCCTG
ATAAGCCTGGATACTATGTGTTGATTGCTAATATGTATGCAGATGCTGGGCGTTGGAACA
AACTGGCAAAAGTGAGGACCGTCATGCGAGATTTTGGTGTAAGAAAGTCTCCAGGATGTG
CTTGGGTTGATACTGGTTCTGGCTTTTCCCCCTTTTTGGTTTCAGATACCTCCAGTGGCC
AAACAAATGAAATTTACTGTCTACTGGGAGGACTGAATAGGCTAATGAAAGACACTGGTC
ATTTGACTACAGAGGATTCGTCTTCCGAAGAAGAACTTTGTGAAGGACTTCTTTTGTAG