Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc09g075170.1.1
CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT3G62890.1)
Sequence

ATGAAGATATCAACCAGAAAGCTCATATCTTTAAGGCACCCTTCTCTCAATCTATGGCAT
CGAACTGTCGATTGTTTCACTTGGAATACTCTGATCAGAGCCTATGTTCAACGAACTCAT
CAACCTTCAAGCCCCACCCATACCCCACTCTCCATCTTCCTCCGAATGCGCTTCCATGGC
GTCCATATTGATTACTACACCTTCCCTTTTCTCCTCCAGTCCGTCCATTCTCCACTACAC
CTCCAATTGGGACGATCCATTCACTCACAAGTTCTTATTTTCGGTTTTTCATCCGACCCA
TTTGTCCAAACTTCGCTAATCAGTATGTACACTGCTTGCGGCGATGTGGGTTCTGCACGG
GAGGTGTTTGATGAAATGTCTCAACGAGACTTGCCTGCGTGGAATTCTATTGTGAATGCG
AATGTGAAAGCAGGTTTGCTTAGTGTTGCGCGTGAACTGTTTGTTAAAATGCCTAGTAGA
AATGTTGTGTCTTGGAGTAGTATGTTGGATGGTTATGTGAGGTGGGGTAAGTGTGAAGAA
GCATTGGAGTTGTTTAATCAGATGATGAAGGAAAATGAAGTTATGCCTAATGAGTATACC
ATGGCTATTTTGCTTGCGGCGTGTGAGCAGTTGGGTTCACTTGAGCATGGGAAATGGGCT
CATGCTTGTGTTTACAAGCTTGGGATGGAGATAAATGTTGTACTTGGCACTTCGTTGATT
GAGATGTATGCTAAATGTGGGAGTATAGTCCGGGCAAGATTAGTTTTTGAAAATTTGGGT
CCGAAGAAGGATGTAATGGCTTGGAATGCCATGATCTCAGGTCTTGCGAAACATGGATAC
TGGGAAGATTGTCTCTGTTTGTTTTCAAATATGGTTGATAGCGGAGTAACACCTGATGAT
ATCACGTTCTTAGGTGTTCTTTCTGCTTGTGTACATGGAGGATTGGTGAGTCAAGGGAAG
GACATGTTTGAGAGGATGAGTAAAGAGTTTGGTATTTCGCCTTCAGTTCAGCACTATGGT
TGTATGATTGACCTTTATGGCAAAGCTGGTTTGATCGATGAAGCGTGGGATCTTCTGAAT
ACAATGCCTATGGAACCAGGTGTGCTTATTTGGGGAGCTCTTCTTAGTGGAGCTAGGATG
TGTGGAGATATTGAAACATGTGAGATTGCACTCAACAAAATAATAGAGCAAGATCCCACA
AATAGTGCAGCTTATGTTCTTCTCTCCAATGTCTACGCTAAGATGGGTAGGTGGAAAGAT
GCTGGGGACATCAGAAACGTTATGGAGACGAAGAAGGTACATAAAGTTCCTGGGCGTAGT
TCTATAGAGATCAATGCAAATATCCAGTAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc09g075170.1.1
PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT3G62890.1)
Sequence

MKISTRKLISLRHPSLNLWHRTVDCFTWNTLIRAYVQRTHQPSSPTHTPLSIFLRMRFHG
VHIDYYTFPFLLQSVHSPLHLQLGRSIHSQVLIFGFSSDPFVQTSLISMYTACGDVGSAR
EVFDEMSQRDLPAWNSIVNANVKAGLLSVARELFVKMPSRNVVSWSSMLDGYVRWGKCEE
ALELFNQMMKENEVMPNEYTMAILLAACEQLGSLEHGKWAHACVYKLGMEINVVLGTSLI
EMYAKCGSIVRARLVFENLGPKKDVMAWNAMISGLAKHGYWEDCLCLFSNMVDSGVTPDD
ITFLGVLSACVHGGLVSQGKDMFERMSKEFGISPSVQHYGCMIDLYGKAGLIDEAWDLLN
TMPMEPGVLIWGALLSGARMCGDIETCEIALNKIIEQDPTNSAAYVLLSNVYAKMGRWKD
AGDIRNVMETKKVHKVPGRSSIEINANIQ*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc09g075170.1.1
Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT3G62890.1)
Sequence

ATGAAGATATCAACCAGAAAGCTCATATCTTTAAGGCACCCTTCTCTCAATCTATGGCAT
CGAACTGTCGATTGTTTCACTTGGAATACTCTGATCAGAGCCTATGTTCAACGAACTCAT
CAACCTTCAAGCCCCACCCATACCCCACTCTCCATCTTCCTCCGAATGCGCTTCCATGGC
GTCCATATTGATTACTACACCTTCCCTTTTCTCCTCCAGTCCGTCCATTCTCCACTACAC
CTCCAATTGGGACGATCCATTCACTCACAAGTTCTTATTTTCGGTTTTTCATCCGACCCA
TTTGTCCAAACTTCGCTAATCAGTATGTACACTGCTTGCGGCGATGTGGGTTCTGCACGG
GAGGTGTTTGATGAAATGTCTCAACGAGACTTGCCTGCGTGGAATTCTATTGTGAATGCG
AATGTGAAAGCAGGTTTGCTTAGTGTTGCGCGTGAACTGTTTGTTAAAATGCCTAGTAGA
AATGTTGTGTCTTGGAGTAGTATGTTGGATGGTTATGTGAGGTGGGGTAAGTGTGAAGAA
GCATTGGAGTTGTTTAATCAGATGATGAAGGAAAATGAAGTTATGCCTAATGAGTATACC
ATGGCTATTTTGCTTGCGGCGTGTGAGCAGTTGGGTTCACTTGAGCATGGGAAATGGGCT
CATGCTTGTGTTTACAAGCTTGGGATGGAGATAAATGTTGTACTTGGCACTTCGTTGATT
GAGATGTATGCTAAATGTGGGAGTATAGTCCGGGCAAGATTAGTTTTTGAAAATTTGGGT
CCGAAGAAGGATGTAATGGCTTGGAATGCCATGATCTCAGGTCTTGCGAAACATGGATAC
TGGGAAGATTGTCTCTGTTTGTTTTCAAATATGGTTGATAGCGGAGTAACACCTGATGAT
ATCACGTTCTTAGGTGTTCTTTCTGCTTGTGTACATGGAGGATTGGTGAGTCAAGGGAAG
GACATGTTTGAGAGGATGAGTAAAGAGTTTGGTATTTCGCCTTCAGTTCAGCACTATGGT
TGTATGATTGACCTTTATGGCAAAGCTGGTTTGATCGATGAAGCGTGGGATCTTCTGAAT
ACAATGCCTATGGAACCAGGTGTGCTTATTTGGGGAGCTCTTCTTAGTGGAGCTAGGATG
TGTGGAGATATTGAAACATGTGAGATTGCACTCAACAAAATAATAGAGCAAGATCCCACA
AATAGTGCAGCTTATGTTCTTCTCTCCAATGTCTACGCTAAGATGGGTAGGTGGAAAGAT
GCTGGGGACATCAGAAACGTTATGGAGACGAAGAAGGTACATAAAGTTCCTGGGCGTAGT
TCTATAGAGATCAATGCAAATATCCAGTAG