Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc09g075080.3.1

CDS Infomation

Phytochrome A-associated F-box protein, putative (AHRD V3.3 *** B9SAQ8_RICCO)

Sequence

ATGTCGAATTCATGTATGGTTGATGGATTTTTCTCAAAACTATCAGAGGATTTGATTCTC
AATATATTTTTCAAGCTAGAAGATGATCCAAGGAACTGGGCTCGTTTATCTTGTGTTTCA
ACGAAATTTGCATTTCTGATTCATACTATTTGTTACAAATCGAAATGCTCTGCAACTATT
CCTTCGGTTGTTTCCGATCTAGTAAGTTCGACGTCTTCGTGTCCTCCAGGTGGGTGGTCT
TCACTTTACAAGCTAGCTGTATGCTGTCCGGGTCTTCATCAAGCTGGTGTTCTTCTGGAG
AATTCTGATTTTGGGCTTGAACGTGAAATTGGTCCGGATGAGAGTTATTCGGGTCGGGTT
TTCCCTAAAGCTGAGCTGATTCCTTCTTCATCGAGTAATAATAATAATCGGTGTGATTCT
GGTGAAGTTGTTGATTGTGGTTGGTCTTTGTTTGATGATCTTATGTTTGATACTGTTTAT
GATGCTTCTGAATCGAGTTCAAATCAGATTGAGGTCGTCGAGGAGGAACCCACAAGCTTT
GTGGTGAATCCCACAAGGCTTTCGAAGAGGCGAAAAATTTACAGATCGCCTTGTTCACAT
TTGGCTTCTGGTGTATGGAATTTGAGCCGTGAGCAGGGAAATAAGCTACTAGCGAGTAGA
TTCAAAGGGGATTGCTTGTACATATGTGATTGGCCTGGTTGTATTCACATGGAGGAGAAG
AGGAATTACATGCTATTTCGTGGGATTTTCAAGAATTTCAAGCAGTCAAGGGTATGGAGG
ACGATTAATGATGGCAATAGGAAGATCGATCTGAATTGTGCATTTTGCTCATCGAAACAG
ACGTGGGATCTGCATTCAGCCTTCTGTTTGAGGAGGTATTTCGGGTACCATGATGATGGA
GAACCAGTTGTTCGAGCTTATGTCTGTGAGAATGGCCATGTTTCTGGAGCATGGACTGAT
TGGCCATTGTATACTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc09g075080.3.1

PEP Infomation

Phytochrome A-associated F-box protein, putative (AHRD V3.3 *** B9SAQ8_RICCO)

Sequence

MSNSCMVDGFFSKLSEDLILNIFFKLEDDPRNWARLSCVSTKFAFLIHTICYKSKCSATI
PSVVSDLVSSTSSCPPGGWSSLYKLAVCCPGLHQAGVLLENSDFGLEREIGPDESYSGRV
FPKAELIPSSSSNNNNRCDSGEVVDCGWSLFDDLMFDTVYDASESSSNQIEVVEEEPTSF
VVNPTRLSKRRKIYRSPCSHLASGVWNLSREQGNKLLASRFKGDCLYICDWPGCIHMEEK
RNYMLFRGIFKNFKQSRVWRTINDGNRKIDLNCAFCSSKQTWDLHSAFCLRRYFGYHDDG
EPVVRAYVCENGHVSGAWTDWPLYT*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc09g075080.3.1

Transcript Infomation

Phytochrome A-associated F-box protein, putative (AHRD V3.3 *** B9SAQ8_RICCO)

Sequence

ATGCTCAACATAACTTACTTACCAAAAAATTAATTTAGCCCTAAAAAAATAAATATAAAA
CGATCTTTGATAAAACAAACTAACAACCAGGCACTGAAAATCATCTTCACACATTCCACA
AACCTACAAAAAGGCTTTTCTACCTCTTTTGCCCACAAAAATCACTAACCAAATTCTCAT
TCTTGAATTTGTTACAACTTACAAGTGTTTTTGCTGATAAATTTGGTGTTTAATTCCATT
GGATTGAGCAAGGGGTTTGATTCTATTCATCTTTTTTTAGATGTCGAATTCATGTATGGT
TGATGGATTTTTCTCAAAACTATCAGAGGATTTGATTCTCAATATATTTTTCAAGCTAGA
AGATGATCCAAGGAACTGGGCTCGTTTATCTTGTGTTTCAACGAAATTTGCATTTCTGAT
TCATACTATTTGTTACAAATCGAAATGCTCTGCAACTATTCCTTCGGTTGTTTCCGATCT
AGTAAGTTCGACGTCTTCGTGTCCTCCAGGTGGGTGGTCTTCACTTTACAAGCTAGCTGT
ATGCTGTCCGGGTCTTCATCAAGCTGGTGTTCTTCTGGAGAATTCTGATTTTGGGCTTGA
ACGTGAAATTGGTCCGGATGAGAGTTATTCGGGTCGGGTTTTCCCTAAAGCTGAGCTGAT
TCCTTCTTCATCGAGTAATAATAATAATCGGTGTGATTCTGGTGAAGTTGTTGATTGTGG
TTGGTCTTTGTTTGATGATCTTATGTTTGATACTGTTTATGATGCTTCTGAATCGAGTTC
AAATCAGATTGAGGTCGTCGAGGAGGAACCCACAAGCTTTGTGGTGAATCCCACAAGGCT
TTCGAAGAGGCGAAAAATTTACAGATCGCCTTGTTCACATTTGGCTTCTGGTGTATGGAA
TTTGAGCCGTGAGCAGGGAAATAAGCTACTAGCGAGTAGATTCAAAGGGGATTGCTTGTA
CATATGTGATTGGCCTGGTTGTATTCACATGGAGGAGAAGAGGAATTACATGCTATTTCG
TGGGATTTTCAAGAATTTCAAGCAGTCAAGGGTATGGAGGACGATTAATGATGGCAATAG
GAAGATCGATCTGAATTGTGCATTTTGCTCATCGAAACAGACGTGGGATCTGCATTCAGC
CTTCTGTTTGAGGAGGTATTTCGGGTACCATGATGATGGAGAACCAGTTGTTCGAGCTTA
TGTCTGTGAGAATGGCCATGTTTCTGGAGCATGGACTGATTGGCCATTGTATACTTGAAT
AGGTTCTATATCAATTATGGGGTAATCGTGTTAACTTGAACTGATATTTTGGTGTTTCTG
TGACTAGCATTTGGTTATTGTTTGCCATTTTAGGCTGTTTTGGGATTTATCTATATTGTG
ATTGTTCACAATAGTTTCTGCCATATTTGCATTATAGAGTGTAACAGATGAAGTATTTAT
ATTTATTTGAGTTCTTCTTCAGTTGATTCTTCTACTTATAGTGAATGTGAAATCCCGTTG
AATGGTTGTTGTTCAGGAAGCTAATTTTCATTTTCGATTGAGAAAATGGTGGGCCTAATG
AGCTTCTCCATTGTCGTCTCTTTGCTTTGCTTTCATATATTCCATCATTCGGAATGAAGG
GAGCAGTAGTCATTTCATTTGGGGAAGAGAGAGAAAATTGTTCTGTTGAAGCTCGACCTT
ATGATCTGAAATGAGTCATAGCGATGAAACACTTAGCTCACGATCCAAAACCTATCTCCA
CTCCAAGCTCAGTTAACGTTTAACCTGATCCGTCATGTTTGGAGTTATTGTGTGATACTG
ACGCTATATAAAAGGCTGCTATTATGAAACTTAATGACGGTTAGGAGCTTGTTTGGATGT
GCTTATAGTTTATTCATCAAAAGTCATAAG