Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc09g072790.3.1

CDS Infomation

RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein (AHRD V3.3 *-* AT5G55550.6)

Sequence

ATGGATTCCGATGAAGGAAAGCTGTTTGTTGGTGGATTAGGATGGGATATTAAGGAAGAT
AAGCTAAGAGACTATTTTACCCATTATGGACAAGTTACCCATGCCATAATCATGCGTGAC
AGGGTTACTGGCTTATCGAGAGGATTCGCGTTTGTTGTCTTCTCCGATCCTTCTGTTATT
GATGCCATTCTTCAGGAGAAACACACTATTGATGGCCGTCCGGTTGAAGCTAAGAGGGCT
TTACCAAGAGCACAACAGCAGAGTTTGAGATCGCGACTTCCTCATGCCAGTGAAGATACA
AGACTGGTAATGCGCAATCTCAACAACAGAACGAGAAAAATATTTGTGGGTGGGCTACCT
TCATCCCTTACTGAAGAAGAGTTTTGCCAGTACTTCCAAGATTATGGTAATGTGACAGAT
AAAGTAATTATGTTTGACCCAAACACTGGTCGCCCGCGAGGATTCGGTTTCATCACCTTT
GACTCAGAAGATGCTGTTGATAGAGTTCTTCATAAAACCTTTCATGAACTGAAAAATAGG
ATAGTGGAGGTAAAACGTGCCCTGCCAAAAGAAGCAAATCCCGCTGGCAATAATTATGGT
GGAGGTTACCCGGGTTATGGTTCTTCTGATCCCATTAGGTTCCCACAGCCTGCTTTTTGT
GGTTACACTCCCTATAACAGCTATGGAGCTCTGAATTATGGTTATGGTTATGGTTATGAT
CCTTATACTTTCTACGGTGGGGCAGCTAGAGTATATATGAATCCATCTTTGGCCAGCATT
GTTTATGGTAACAGCTTGCCTGGTGCCACAAGAAACCAGTGGAGCAGCCAGAATCTTGGG
CATGGTGATTTCTATAATTTAAATGCAAGTTATGGCGCTTCTAGTTCGTTGGGTGCTTCA
TCCACTCGTGGTGTTATTTTGTCATCAACTAGTACATCTCAGGGTCATGCTTCTCAAAAC
AATAATCAGGGGAATGGTTGCAGTATGTACACAGAAAATGAAGGTCCTATCACTGATTCT
GATGGTAACGAGACTGGTGATAGGCATACAGGTAGTGCTCCTCCAAACAGCAGCAGTGGT
GAGGCAACTACCCATGCAAATGGGTGCAGTACCACAACAACAGTCTTTGACAGCAGTACT
GGTTCTCCAGGGTTTCCTGATGCAGTTTTAGTTTCCGATAAGTAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc09g072790.3.1

PEP Infomation

RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein (AHRD V3.3 *-* AT5G55550.6)

Sequence

MDSDEGKLFVGGLGWDIKEDKLRDYFTHYGQVTHAIIMRDRVTGLSRGFAFVVFSDPSVI
DAILQEKHTIDGRPVEAKRALPRAQQQSLRSRLPHASEDTRLVMRNLNNRTRKIFVGGLP
SSLTEEEFCQYFQDYGNVTDKVIMFDPNTGRPRGFGFITFDSEDAVDRVLHKTFHELKNR
IVEVKRALPKEANPAGNNYGGGYPGYGSSDPIRFPQPAFCGYTPYNSYGALNYGYGYGYD
PYTFYGGAARVYMNPSLASIVYGNSLPGATRNQWSSQNLGHGDFYNLNASYGASSSLGAS
STRGVILSSTSTSQGHASQNNNQGNGCSMYTENEGPITDSDGNETGDRHTGSAPPNSSSG
EATTHANGCSTTTTVFDSSTGSPGFPDAVLVSDK*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc09g072790.3.1

Transcript Infomation

RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein (AHRD V3.3 *-* AT5G55550.6)

Sequence

TCGTGGCATTAACATGTGACACCATACTATAAAAAAAGAAACAAATATATTCGTAAAAGA
AAAATAAAATAAAATAGAATTGGTTAGGTTAGTAATGTATTTATTTAACCATTTAACACA
CACAAAAAAGTATTGCAGTTTCAGTTAGAATACGATTTTGAAGTGTGATTCCCAAATCTG
CCCTAAATCTGGAAAAAGAATTGTTCAATTTGATTTTTTTGATCTTCATTTTCCCCAACC
CTAGCGATGAATTCCACAAAAGCTTTGTTTACCCACAGAAAATACATACGTAAACTGTAA
CATTACACAGCAGAAGAGAGATTTTTTTCTTTTTGTTGTTGTTGTTGTTTTTCAGAATTT
GAAGAAGATGGATTCCGATGAAGGAAAGCTGTTTGTTGGTGGATTAGGATGGGATATTAA
GGAAGATAAGCTAAGAGACTATTTTACCCATTATGGACAAGTTACCCATGCCATAATCAT
GCGTGACAGGGTTACTGGCTTATCGAGAGGATTCGCGTTTGTTGTCTTCTCCGATCCTTC
TGTTATTGATGCCATTCTTCAGGAGAAACACACTATTGATGGCCGTCCGGTTGAAGCTAA
GAGGGCTTTACCAAGAGCACAACAGCAGAGTTTGAGATCGCGACTTCCTCATGCCAGTGA
AGATACAAGACTGGTAATGCGCAATCTCAACAACAGAACGAGAAAAATATTTGTGGGTGG
GCTACCTTCATCCCTTACTGAAGAAGAGTTTTGCCAGTACTTCCAAGATTATGGTAATGT
GACAGATAAAGTAATTATGTTTGACCCAAACACTGGTCGCCCGCGAGGATTCGGTTTCAT
CACCTTTGACTCAGAAGATGCTGTTGATAGAGTTCTTCATAAAACCTTTCATGAACTGAA
AAATAGGATAGTGGAGGTAAAACGTGCCCTGCCAAAAGAAGCAAATCCCGCTGGCAATAA
TTATGGTGGAGGTTACCCGGGTTATGGTTCTTCTGATCCCATTAGGTTCCCACAGCCTGC
TTTTTGTGGTTACACTCCCTATAACAGCTATGGAGCTCTGAATTATGGTTATGGTTATGG
TTATGATCCTTATACTTTCTACGGTGGGGCAGCTAGAGTATATATGAATCCATCTTTGGC
CAGCATTGTTTATGGTAACAGCTTGCCTGGTGCCACAAGAAACCAGTGGAGCAGCCAGAA
TCTTGGGCATGGTGATTTCTATAATTTAAATGCAAGTTATGGCGCTTCTAGTTCGTTGGG
TGCTTCATCCACTCGTGGTGTTATTTTGTCATCAACTAGTACATCTCAGGGTCATGCTTC
TCAAAACAATAATCAGGGGAATGGTTGCAGTATGTACACAGAAAATGAAGGTCCTATCAC
TGATTCTGATGGTAACGAGACTGGTGATAGGCATACAGGTAGTGCTCCTCCAAACAGCAG
CAGTGGTGAGGCAACTACCCATGCAAATGGGTGCAGTACCACAACAACAGTCTTTGACAG
CAGTACTGGTTCTCCAGGGTTTCCTGATGCAGTTTTAGTTTCCGATAAGTAAGAAATTCC
GGTTTATTGTGGTTAGACTGAGGGGAATACTAACAGCACTAACCGTATCATTATATTATC
AGCTTCTAAGACTCAATCAGAGAAAAAGTAACCCTGTTAACACCACCAGTTTGGTCACAA
TAGATCCGATGACTGGTTGAGTTACCGCAGTCTATTTATTATCGCGTAACAGTTACATTT
TTCATTAACATTCCTACAGCTGACTAGTGTTGGTTTAAACTGGTGTTACAGCGTTTTTAC
ATTCGTGCAGACGATTAGTTACATTGACATCTTCTGTTGAAGGTATTACTCCTACCTGAA
TGATTATGTTTCTTTCCTTGATCTCATACCTGAAGTAGCTATTTATGTGAAATCTAATCT
ATTCCTACAGTTGGTTACTTGAAAATGATTTTAGTTTCTACATATTGGCATAAAAAATCT
GCCTATGATAATTATTATAGAATAT