Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc09g065120.3.1
CDS Infomation	Preprotein translocase subunit SecY (AHRD V3.3 *** A0A072U218_MEDTR)
Sequence	ATGGAAGCCGCTATTCTCTGTTCTTATACACCGCTTTCCACAACGGCGGACCTTAGGATT CGAGGAAAGTTTGCTGGATGTAATCTCCACTTCTATAATTTGCCACTGAACAGAATACAC ATTCCTCTCAAGTTAAAATTTTCTGAATCGAGTAGAAGGCACTTTTCTTCACGCAAGGGG CTGATATTGTCTCATGGAAAGAAAGAATTGTCCAGCTATTTCACCCATCAACTTTCAAGC GACTATACAAGTATCAGGGCAGCATCAGGAGAAACACTACATTATGGACAGTCTTCATCA GTGAGTGAAGATGAGGGAGTGTCACTAACATCTACAGATGCCAACGAATGTGTGTCTTTG CAGCCTAAGCAGAAGCAATTTAGAAATAGATTCTTGAACTTTGTAAGACTGGGTTCCGTT GTTGATAATGCTGCTGAGTCTTTTTTCAAGAGTGAGATAAGGAGAAGGCTGTTTATGACT GCCATCTTAATTGTCATTAGTCGTATAGGATATTTCATTCCTCTTCCAGGATTTGACAGG AGGTTGATTCCAGAAGACTATCTCAGCTTTGTCTCGAAATCAGTTGATCAACTGGGTGAT TCCACTCCAGAACTTAAACTTTCTCTTTTCCAACTTGGGGTCAGTCCTCAGATAGCGGCA TCCATTCTTATGCAGGTATTATGTCACGTTCTTCCTTCTTTAGTGAAGCTGAGAAAAGAG GGCTTAGATGGGCATGAGAAGATCAAGGGTTATATATGGTGGATCTCGCTTGGTTTTGCA ATTTTGGAAGCTCTTATTCTCTCTTGTCACTCACTTCCATATTCAATATATGCTGCCAAT CATAGGGTTAAGCATGTGTTCATGACTATGTCTCTTTTAGTTTCTGGTGCAATGACTATG TCATGGATCTGCGACAAAATAACAGAGTCTGGATTTGGTCAAGGATCAACTTTGATTATT TGTGTGGGCATTTTGACTGGCTATACAGATACATTGCAGAAAATGTTAACTCAAATATCA GAAAGTAGTGGGAACTGGTGGCTCTATGTACTTGGAGTACTGGGTGTTTTTACTGTCGTT ACAATGTGGGCTGTCGTTGTGAGTGAAGGGTGCCGGAAAGTTAAGCTGCAGTATTATGGT TTCAGAGTTGCTTCTGGTGCAAGAGAAGATTCTCTAGTTCCAGCCGTGGAGCCTTATATC CCATTCAACATAAATCCAGCAGGAATGCAGCCTATCCTTGTTACCTCTTATCTGTTGGCA CTTCCCGGCATTCTTGCAAGTCTTCTTGGTTCAAGGTTTTGGGAACACATTAGAGACGCT TTGAATCCTGACACTTCACATGGCGCAGATCCATGGGTTTACTATACAGTTTATGCTTTC TTTGTCTTTCTCTTCAACATATTTGACATTCTCTTGCCAAAAGAAATTGCTGATTACTTA AACAAGATAGGTGCTAGAATTCCGAGTATAAAGCCTGGAAAAGCCACAATTGCATATTTG ACAAAGATTCAAGCTTCAACGCGATTCTGGGGTGGTCTGTTATTAAGTGTTTTGGCGACT ACATCCTCCATTCTAGACCATTATTTGCGGCGCATCAATGAAGGATATGCAATAGGATTG ACATCAGTGCTAATAATTGTAGGTTCAATTATTGAATTGAGAAGATCTTATCAAGCATAT AATGTAATGCCAAGTCTAAGTATGGCTTTGAAGCGTTATGGTGTATGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc09g065120.3.1
PEP Infomation	Preprotein translocase subunit SecY (AHRD V3.3 *** A0A072U218_MEDTR)
Sequence	MEAAILCSYTPLSTTADLRIRGKFAGCNLHFYNLPLNRIHIPLKLKFSESSRRHFSSRKG LILSHGKKELSSYFTHQLSSDYTSIRAASGETLHYGQSSSVSEDEGVSLTSTDANECVSL QPKQKQFRNRFLNFVRLGSVVDNAAESFFKSEIRRRLFMTAILIVISRIGYFIPLPGFDR RLIPEDYLSFVSKSVDQLGDSTPELKLSLFQLGVSPQIAASILMQVLCHVLPSLVKLRKE GLDGHEKIKGYIWWISLGFAILEALILSCHSLPYSIYAANHRVKHVFMTMSLLVSGAMTM SWICDKITESGFGQGSTLIICVGILTGYTDTLQKMLTQISESSGNWWLYVLGVLGVFTVV TMWAVVVSEGCRKVKLQYYGFRVASGAREDSLVPAVEPYIPFNINPAGMQPILVTSYLLA LPGILASLLGSRFWEHIRDALNPDTSHGADPWVYYTVYAFFVFLFNIFDILLPKEIADYL NKIGARIPSIKPGKATIAYLTKIQASTRFWGGLLLSVLATTSSILDHYLRRINEGYAIGL TSVLIIVGSIIELRRSYQAYNVMPSLSMALKRYGV*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc09g065120.3.1
Transcript Infomation	Preprotein translocase subunit SecY (AHRD V3.3 *** A0A072U218_MEDTR)
Sequence	TATTGAGTTGGCACAAATGCGTGATGGCACGCATAAAGGAAGCGTAAAACATAAAATTTT AGACAAAAAATATTTTTTATTCTTTTTAAAAATAGATAAAAACTAATAAAAATAATTTCT TTTTTTCAGTTCTTTCTTCTTTAATTTCCCACCCACCCTTGACCCATTCCCATTTTTTTT TTCTTTCTACTCTCAAACCCCCATTTCTCTTCCTTCTCCCCTTTCCGTTCCTTTACAATT CTTGTTTCTCTCTTCTTCTTCTTCACATTTTCTCCCTATCGGATAGTAGATTTATATTTT CTTTTTATTTTTTGAGGCAATTATAATCCATAAAGTGATAAAAATTTAATAATCTTGAAA AATAAAAAGTGATTATTGAATGTCTTTGTGAAATTAGGTGAAATTTGTTATGTAAAATAA TATTAGAGTATATTGATGTATTTTAATGGCTATTTGTTAACATCAATGAGAAAAAGAAAT TTATGATAGTTCAAGTTGTAGATGTGAATATTGGCAAAAAAAAATACGATTGAAAGTTGT GAATGAAAAAATTTTTGGAAAAGAAAATGGAATGATAATGTTAGCTATTTAAGAATGTAA TGATACTACTGAAAATGAAAAGTTCCGGTGGTATCTCAAATGTAAAAAAATGGAGAGAGG TGAATTTATGAAAGAGGAATGAAGTGAAAAAGAAAGAAAAATCAATCTTTTTTTTAAAAA AAATCATAAGAAATGAAGAGTCATTTAAAATGTGACATGGACAATGATATGTCATTTTTG TCAAGTGTTTGAAGTTCACACAGCGAAAGAGAATGGTCCATAATACAAACTTATCTATAG ATCATTCTGTCTTTTTTTAATTAAAATACCAAAATCCATAGCTAAACATCAAATCAAAGA ATTAAACTTTTCTTTTAAATATACCCACCTGATTATAAATGTGACTTTTCAAAAGAAGTC CTGACTCTAAACTTCCACATTCCCCCCCCCCCCACCCCAACTCACTGTAACTATCTCCAA CCCTTTTTCCTCAACCCTTTACCAAATTTTCGGGGCTTTTTTCTCCAACTAAACAATGAA GAATGAGCGGATATTTATAAGGGGAGATTTAGGGCAGAAAGAGGGGGAAACCGATTGAAT TTGAATTTCAAATTTGAATTCTCTTTAAGGAATAAGGTTACCAGCTCGAAAAATTGTATA CCTCTTCAGCAGACTAATAATCGCAGTCGTTCGATTTCTAATGAGAGGACAAAGGCGATG GGATATCTCGACACCTGGATTCCGTGCAAACGGATAAGGAGAGAGGGAGAGGACGACGCC CTAGGCTGCTAGACTCACGCTCTGATTTTCATTTGGAGTTGGACGCGATTTTTTTCGTTA TTTATGACCACTCATAAGCATAAACCCACACGAATATTTTTTTCTTTGCTATTTATGCCC CTAAAACCCACGCACTAATATTTTTCTCCAGTCGGTCTTCTATCTTTGTGACCTTTCTTG CTCGGCTATCTCTCACTCTCAACAAAAATACAAGCCAGAGAGAGCTTCTCTCTTCGTGTT TGGAGTGAGTTGTCGAGCTCCTTTTACCTCTCAGTTCCATAACTGAACCTCCGTCGATTG CCAAGTGCGACGTTTTCAGGGGTTTGTACCCTTCATTTTAATCTTTACCTTTTTTTTTTG GACTATTTGACATCCTATATTGGAAAAGCAATGAGATAAGGATTTGAGCAATTTTGATTT CGGAGCTCAAGGTTTAGAGATTCAAGTTCTGCCATGGAAGCCGCTATTCTCTGTTCTTAT ACACCGCTTTCCACAACGGCGGACCTTAGGATTCGAGGAAAGTTTGCTGGATGTAATCTC CACTTCTATAATTTGCCACTGAACAGAATACACATTCCTCTCAAGTTAAAATTTTCTGAA TCGAGTAGAAGGCACTTTTCTTCACGCAAGGGGCTGATATTGTCTCATGGAAAGAAAGAA TTGTCCAGCTATTTCACCCATCAACTTTCAAGCGACTATACAAGTATCAGGGCAGCATCA GGAGAAACACTACATTATGGACAGTCTTCATCAGTGAGTGAAGATGAGGGAGTGTCACTA ACATCTACAGATGCCAACGAATGTGTGTCTTTGCAGCCTAAGCAGAAGCAATTTAGAAAT AGATTCTTGAACTTTGTAAGACTGGGTTCCGTTGTTGATAATGCTGCTGAGTCTTTTTTC AAGAGTGAGATAAGGAGAAGGCTGTTTATGACTGCCATCTTAATTGTCATTAGTCGTATA GGATATTTCATTCCTCTTCCAGGATTTGACAGGAGGTTGATTCCAGAAGACTATCTCAGC TTTGTCTCGAAATCAGTTGATCAACTGGGTGATTCCACTCCAGAACTTAAACTTTCTCTT TTCCAACTTGGGGTCAGTCCTCAGATAGCGGCATCCATTCTTATGCAGGTATTATGTCAC GTTCTTCCTTCTTTAGTGAAGCTGAGAAAAGAGGGCTTAGATGGGCATGAGAAGATCAAG GGTTATATATGGTGGATCTCGCTTGGTTTTGCAATTTTGGAAGCTCTTATTCTCTCTTGT CACTCACTTCCATATTCAATATATGCTGCCAATCATAGGGTTAAGCATGTGTTCATGACT ATGTCTCTTTTAGTTTCTGGTGCAATGACTATGTCATGGATCTGCGACAAAATAACAGAG TCTGGATTTGGTCAAGGATCAACTTTGATTATTTGTGTGGGCATTTTGACTGGCTATACA GATACATTGCAGAAAATGTTAACTCAAATATCAGAAAGTAGTGGGAACTGGTGGCTCTAT GTACTTGGAGTACTGGGTGTTTTTACTGTCGTTACAATGTGGGCTGTCGTTGTGAGTGAA GGGTGCCGGAAAGTTAAGCTGCAGTATTATGGTTTCAGAGTTGCTTCTGGTGCAAGAGAA GATTCTCTAGTTCCAGCCGTGGAGCCTTATATCCCATTCAACATAAATCCAGCAGGAATG CAGCCTATCCTTGTTACCTCTTATCTGTTGGCACTTCCCGGCATTCTTGCAAGTCTTCTT GGTTCAAGGTTTTGGGAACACATTAGAGACGCTTTGAATCCTGACACTTCACATGGCGCA GATCCATGGGTTTACTATACAGTTTATGCTTTCTTTGTCTTTCTCTTCAACATATTTGAC ATTCTCTTGCCAAAAGAAATTGCTGATTACTTAAACAAGATAGGTGCTAGAATTCCGAGT ATAAAGCCTGGAAAAGCCACAATTGCATATTTGACAAAGATTCAAGCTTCAACGCGATTC TGGGGTGGTCTGTTATTAAGTGTTTTGGCGACTACATCCTCCATTCTAGACCATTATTTG CGGCGCATCAATGAAGGATATGCAATAGGATTGACATCAGTGCTAATAATTGTAGGTTCA ATTATTGAATTGAGAAGATCTTATCAAGCATATAATGTAATGCCAAGTCTAAGTATGGCT TTGAAGCGTTATGGTGTATGA