Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc09g064230.2.1
CDS Infomation	C2 domain-containing family protein (AHRD V3.3 *** B9GRA8_POPTR)
Sequence	ATGAACAATGGTAAAGAAAAATTGGTTGTAGAAGTGGTGGCAGCTCATAACTTGATGCCA AAAGATGGTGAAGGTTCATCGTCACCATTTGTAGAAGTTGAGTTTGAGAATCAGAGACAA AGAACACAAGTAAAAATGAGAGATTTAAACCCTGTTTGGAATGAAAAGCTTGTGTTTCAT GTGAATGATGCTGCTGATCTTCCTTATCGGACGATTGAAGTGAATGTTTTTAACGAGAAA AGGTCAAACACAAGCAGAAATTTTCTGGGTCGAGCTCGGGTTTCTGGGTCAAGCATTGCT AAAGAAGGGGAAGAAATAGCGCAGCTTTATACACTTGATAAAAGGAGTCTTTTTTCTCAT GTACGCGGTGAGTTGAGTTTGAAGATTTATTTATCAACAACAGAGCAAGTAAACTTTCAA AACCAGAACCATTCAAAGCCAGTGGAGTCAGTTCCAGGTGATATTAAGCCTGTTGTTATT ACTAGTGTTCCTGGACCTATTATTCCGGCTGTGACTGGTGGTGGTGGGGTTGGTCTGTAC ACTTCTGGGCAAGGTGAGTTTTCTCTGAAAGAAACAAGTCCACATCTTGGTGGTAAGGAC AAGACTAACTCAACATATGACTTGGTGGAACAAATGCAGTATTTGTATGTTAGAGTTGTT AAGGCTAAGGATTTTTCTGTTTTTGGTGTTGGGGGTGGGGGTGAGCTTGTAGCTGAGGTG AAACTTGGTAACTACAGAGGGATTACTAAAAGGGTTTTTTCAAATCATGCTGAATGGGAC CAAGTTTTTGCCTTTTCAAAAGATAGTGTACAGTCCTCTGTGGTGGAGATCTTTGTGAAG GAAAATAACAAAGATGACTTCTTGGGTCGTGTTTGGTTTGATTTGAATGAGGTGCCTAAA CGAGTTCCGCCCGATAGTCAGTTGGCTCCACAATGGTATAGAATGGAAGACAAGAAAGGT GACAAGTCTAAAGGTGGTGAACTTATGGTTGCCATATGGTTTGGTACTCAAGCTGATGAA GCCTTTGCTGAGGCTTGGCATTCTAAAGCAGCAAATGTGCATTTTGATGGTTTGTGTTCT ATCAAGTCTAAAGTGTATCTGTCGCCTAAGCTTTGGTATTTACGGGTTGGGGTTATTGAA GCACAAGATATTGTTATGGGGGAGAAAGGGTCATCAATTATGAGATACCCTGAACTTTTT GCTAAAGTTCAAGTTGGGAATCAGGTTCTGAGGACTAGAGTTTCTCCTCCTGCTGCTACT AGAAGCCTTACAAATCCTTTCTGGAATGAGGACTTAATGTTTGTGGTTGCTGAGCCATTT GAAGACTTCTTGCTTGTTTCGATTGAGGATAGACTTGCTCCCAACAGAGAGGAAGTTGTG GCGAGGGTTCTTTTGCCTGTTTCAAGCCTAGAAAGGCGCCTAAACGAGAAGCCAGTGATT TCGAGGTGGTTCAATCTTGATACTCATTTAAGCAATGCAAATGATCCCAAAGCTGTGGTT AGATTTGCCTCACGGATTCACCTCCGCGCTTCACTTGATGGAGGTTACCATGTGCTTGAT GAGGCAACAATGTACATCAGTGATGTTAGACCAACAGCAAAACAGTTGTGGAAGCCCCAC ATTGGAGTTCTCGAGGTTGGGGTTTTGGGAGCTACCAATCTCGTGCCAATGAAAATGAAA GAAGGCAAGGGTGTCTCTGTAGATGCGTATTGTGTTGCAAAGTATGGGCAGAAATGGGTC CGAACTAGGACTGTGGTGGACAGCTTATCTCCTAAATGGAATGAACAATATACTTGGGAA GTCTTTGACCCTTGCACTGTTATCACTATTGGGGTGTTTGATAATTCTCGTGTAGACAAG AATATGGCTAACCCTGTGGCTGGAAATCGGGACTCTCGAATTGGGAAGGTTAGGATCAGG CTATCAACTCTTGAATCAGATAGAGTTTATACTCATGCATATCCACTCTTGATGCTGCAT CCCTCTGGGGTGAAAAAAATGGGGGAGCTTCATTTGGCTGTCAGGTTTTCATGTGCTAAC ATGGTGAATATGCTTCATATGTATTCCATGCCGTTGCTTCCAAAGATGCATTATGTTCAT CCCTTGTCTGTTAGTCAGTTAGACAGCTTGAGGCATCAAGCTATGAATGTGGTGGCAACA AGGCTTAGTCGATCCGAGCCACCTTTGGGAAGAGAAGTGGTGGAGTACATGCTCGATCAT GATTCTCATATGTGGAGCATGAGAAAGAGCAAAGCAAATTTCTTTAGGCTAACAAATGTG GTTTCTTGGTTTGTTATTATGAGCAGATTTCTAGAGTCTGCGCGCAATTGGCATAAGCCA ATGCACTCTGCATTAGCACTGATTGCCTTTACCATTCTTGTATTGGTGCCTGAGCTCATC ATCCCTTGTGTACTACTCAACTTGGCTGCAGTAGGACTATGGCGTTACAGGTCACGCCCA CGCCACCCTCCTCATATGGACACTCGACTCTCATATGCAGAGAGTGTTTATCCAGATGAA TTGGACGAGGAGTTTGATTCATTCCCTACCAGCAGAAATGCAGAAATCGTTCGAATGAGA TATGACAGACTGAGGAGTGTGGCTGGTAGAATTCAAACTGTGGTTGGTGATATGGCAACT CAAGGGGAGAGATTTCAGGCATTGTTAAGCTGGAGGGATCCAAGAGCAACATTCTTGTTT GTAATATTCTGCTTCTTTGCTGCCTTTTTCTTCTATTTGGTGCCAATCAAATGGGTGGTA GCTCTTTGGGGTTTGTATTATTTGAGACCCCCTAGGTTCAGGAACAGGTTGCCATCCAGT GCTGTATGTTTCTTGAAGAGGCTGCCTACCAGGGCAGATAGCATGTTGTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc09g064230.2.1
PEP Infomation	C2 domain-containing family protein (AHRD V3.3 *** B9GRA8_POPTR)
Sequence	MNNGKEKLVVEVVAAHNLMPKDGEGSSSPFVEVEFENQRQRTQVKMRDLNPVWNEKLVFH VNDAADLPYRTIEVNVFNEKRSNTSRNFLGRARVSGSSIAKEGEEIAQLYTLDKRSLFSH VRGELSLKIYLSTTEQVNFQNQNHSKPVESVPGDIKPVVITSVPGPIIPAVTGGGGVGLY TSGQGEFSLKETSPHLGGKDKTNSTYDLVEQMQYLYVRVVKAKDFSVFGVGGGGELVAEV KLGNYRGITKRVFSNHAEWDQVFAFSKDSVQSSVVEIFVKENNKDDFLGRVWFDLNEVPK RVPPDSQLAPQWYRMEDKKGDKSKGGELMVAIWFGTQADEAFAEAWHSKAANVHFDGLCS IKSKVYLSPKLWYLRVGVIEAQDIVMGEKGSSIMRYPELFAKVQVGNQVLRTRVSPPAAT RSLTNPFWNEDLMFVVAEPFEDFLLVSIEDRLAPNREEVVARVLLPVSSLERRLNEKPVI SRWFNLDTHLSNANDPKAVVRFASRIHLRASLDGGYHVLDEATMYISDVRPTAKQLWKPH IGVLEVGVLGATNLVPMKMKEGKGVSVDAYCVAKYGQKWVRTRTVVDSLSPKWNEQYTWE VFDPCTVITIGVFDNSRVDKNMANPVAGNRDSRIGKVRIRLSTLESDRVYTHAYPLLMLH PSGVKKMGELHLAVRFSCANMVNMLHMYSMPLLPKMHYVHPLSVSQLDSLRHQAMNVVAT RLSRSEPPLGREVVEYMLDHDSHMWSMRKSKANFFRLTNVVSWFVIMSRFLESARNWHKP MHSALALIAFTILVLVPELIIPCVLLNLAAVGLWRYRSRPRHPPHMDTRLSYAESVYPDE LDEEFDSFPTSRNAEIVRMRYDRLRSVAGRIQTVVGDMATQGERFQALLSWRDPRATFLF VIFCFFAAFFFYLVPIKWVVALWGLYYLRPPRFRNRLPSSAVCFLKRLPTRADSML*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc09g064230.2.1
Transcript Infomation	C2 domain-containing family protein (AHRD V3.3 *** B9GRA8_POPTR)
Sequence	ATGAACAATGGTAAAGAAAAATTGGTTGTAGAAGTGGTGGCAGCTCATAACTTGATGCCA AAAGATGGTGAAGGTTCATCGTCACCATTTGTAGAAGTTGAGTTTGAGAATCAGAGACAA AGAACACAAGTAAAAATGAGAGATTTAAACCCTGTTTGGAATGAAAAGCTTGTGTTTCAT GTGAATGATGCTGCTGATCTTCCTTATCGGACGATTGAAGTGAATGTTTTTAACGAGAAA AGGTCAAACACAAGCAGAAATTTTCTGGGTCGAGCTCGGGTTTCTGGGTCAAGCATTGCT AAAGAAGGGGAAGAAATAGCGCAGCTTTATACACTTGATAAAAGGAGTCTTTTTTCTCAT GTACGCGGTGAGTTGAGTTTGAAGATTTATTTATCAACAACAGAGCAAGTAAACTTTCAA AACCAGAACCATTCAAAGCCAGTGGAGTCAGTTCCAGGTGATATTAAGCCTGTTGTTATT ACTAGTGTTCCTGGACCTATTATTCCGGCTGTGACTGGTGGTGGTGGGGTTGGTCTGTAC ACTTCTGGGCAAGGTGAGTTTTCTCTGAAAGAAACAAGTCCACATCTTGGTGGTAAGGAC AAGACTAACTCAACATATGACTTGGTGGAACAAATGCAGTATTTGTATGTTAGAGTTGTT AAGGCTAAGGATTTTTCTGTTTTTGGTGTTGGGGGTGGGGGTGAGCTTGTAGCTGAGGTG AAACTTGGTAACTACAGAGGGATTACTAAAAGGGTTTTTTCAAATCATGCTGAATGGGAC CAAGTTTTTGCCTTTTCAAAAGATAGTGTACAGTCCTCTGTGGTGGAGATCTTTGTGAAG GAAAATAACAAAGATGACTTCTTGGGTCGTGTTTGGTTTGATTTGAATGAGGTGCCTAAA CGAGTTCCGCCCGATAGTCAGTTGGCTCCACAATGGTATAGAATGGAAGACAAGAAAGGT GACAAGTCTAAAGGTGGTGAACTTATGGTTGCCATATGGTTTGGTACTCAAGCTGATGAA GCCTTTGCTGAGGCTTGGCATTCTAAAGCAGCAAATGTGCATTTTGATGGTTTGTGTTCT ATCAAGTCTAAAGTGTATCTGTCGCCTAAGCTTTGGTATTTACGGGTTGGGGTTATTGAA GCACAAGATATTGTTATGGGGGAGAAAGGGTCATCAATTATGAGATACCCTGAACTTTTT GCTAAAGTTCAAGTTGGGAATCAGGTTCTGAGGACTAGAGTTTCTCCTCCTGCTGCTACT AGAAGCCTTACAAATCCTTTCTGGAATGAGGACTTAATGTTTGTGGTTGCTGAGCCATTT GAAGACTTCTTGCTTGTTTCGATTGAGGATAGACTTGCTCCCAACAGAGAGGAAGTTGTG GCGAGGGTTCTTTTGCCTGTTTCAAGCCTAGAAAGGCGCCTAAACGAGAAGCCAGTGATT TCGAGGTGGTTCAATCTTGATACTCATTTAAGCAATGCAAATGATCCCAAAGCTGTGGTT AGATTTGCCTCACGGATTCACCTCCGCGCTTCACTTGATGGAGGTTACCATGTGCTTGAT GAGGCAACAATGTACATCAGTGATGTTAGACCAACAGCAAAACAGTTGTGGAAGCCCCAC ATTGGAGTTCTCGAGGTTGGGGTTTTGGGAGCTACCAATCTCGTGCCAATGAAAATGAAA GAAGGCAAGGGTGTCTCTGTAGATGCGTATTGTGTTGCAAAGTATGGGCAGAAATGGGTC CGAACTAGGACTGTGGTGGACAGCTTATCTCCTAAATGGAATGAACAATATACTTGGGAA GTCTTTGACCCTTGCACTGTTATCACTATTGGGGTGTTTGATAATTCTCGTGTAGACAAG AATATGGCTAACCCTGTGGCTGGAAATCGGGACTCTCGAATTGGGAAGGTTAGGATCAGG CTATCAACTCTTGAATCAGATAGAGTTTATACTCATGCATATCCACTCTTGATGCTGCAT CCCTCTGGGGTGAAAAAAATGGGGGAGCTTCATTTGGCTGTCAGGTTTTCATGTGCTAAC ATGGTGAATATGCTTCATATGTATTCCATGCCGTTGCTTCCAAAGATGCATTATGTTCAT CCCTTGTCTGTTAGTCAGTTAGACAGCTTGAGGCATCAAGCTATGAATGTGGTGGCAACA AGGCTTAGTCGATCCGAGCCACCTTTGGGAAGAGAAGTGGTGGAGTACATGCTCGATCAT GATTCTCATATGTGGAGCATGAGAAAGAGCAAAGCAAATTTCTTTAGGCTAACAAATGTG GTTTCTTGGTTTGTTATTATGAGCAGATTTCTAGAGTCTGCGCGCAATTGGCATAAGCCA ATGCACTCTGCATTAGCACTGATTGCCTTTACCATTCTTGTATTGGTGCCTGAGCTCATC ATCCCTTGTGTACTACTCAACTTGGCTGCAGTAGGACTATGGCGTTACAGGTCACGCCCA CGCCACCCTCCTCATATGGACACTCGACTCTCATATGCAGAGAGTGTTTATCCAGATGAA TTGGACGAGGAGTTTGATTCATTCCCTACCAGCAGAAATGCAGAAATCGTTCGAATGAGA TATGACAGACTGAGGAGTGTGGCTGGTAGAATTCAAACTGTGGTTGGTGATATGGCAACT CAAGGGGAGAGATTTCAGGCATTGTTAAGCTGGAGGGATCCAAGAGCAACATTCTTGTTT GTAATATTCTGCTTCTTTGCTGCCTTTTTCTTCTATTTGGTGCCAATCAAATGGGTGGTA GCTCTTTGGGGTTTGTATTATTTGAGACCCCCTAGGTTCAGGAACAGGTTGCCATCCAGT GCTGTATGTTTCTTGAAGAGGCTGCCTACCAGGGCAGATAGCATGTTGTAA