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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc09g061890.3.1
CDS Infomation

Pectate lyase (AHRD V3.3 *** M1BAL5_SOLTU)
Sequence

ATGGCGATTTATTGGAGATCGTGTCTCTCTCTTTCTGCATTGCTAATTTTGGTGCTACTA
GTCATCAATGTCAACCCCAGTCACAGTGCTGAAGAAGCAGAGCAATTCCAGAGCTTAAAG
AACTTGACAATGACGAATAGTTTAAGCGAAGAAAATGTACCAAACCATGAACATGCTGTA
GATGATCCAGAAAAGGTGGTTTCAATGGTAGATATGAGCATTAAGAATAGTACAGAGAGG
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AATGCTATTGGTGGCCGTGATGGCAAGTACTATGTTGTCACTGACCCAAACGATGATGAC
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GCTGATGGCCTAATCGACGCGATAATGGGATCAACTGCTATTACCATCTCCAACAATTAT
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GCCAACCCTTTTGCCAAACAGGTGACACATAGAGTGGAGCAATCAGATGTGTGGAAGCAT
TGGAACTGGAGATCAGAGGGAGACCTTATGCTTAATGGAGCCTTCTTTACGCCATCTGGA
CACGGTGCTGCAGCCAGCTATGCTAGGGCTTCAAGCTTAGCAGCAAAGGCCTCTTCCCTG
GTTGGCACTCTTACTTCAAATGCTGGTGCACTTACATGTCGCAGGGGCTACCAATGTTAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc09g061890.3.1
PEP Infomation

Pectate lyase (AHRD V3.3 *** M1BAL5_SOLTU)
Sequence

MAIYWRSCLSLSALLILVLLVINVNPSHSAEEAEQFQSLKNLTMTNSLSEENVPNHEHAV
DDPEKVVSMVDMSIKNSTERRKLGFFSCGTGNPIDDCWRCDRNWQRNRKRLADCAIGFGR
NAIGGRDGKYYVVTDPNDDDPVNPRPGTLRHAVIQDRPLWIVFKRDMVITLKQELIMNSF
KTIDGRGVNVHIANGACITVQFVTNIIIHGINIHDCKPTGNAMVRSSPSHFGWRTIADGD
GISIFGSSHIWVDHNSLANCADGLIDAIMGSTAITISNNYFTHHNEVMLLGHSDSYVRDK
IMQVTIAYNHFGEGLIQRMPRCRHGYFHVVNNDYTHWEMYAIGGSASPTINSQGNRYLAP
ANPFAKQVTHRVEQSDVWKHWNWRSEGDLMLNGAFFTPSGHGAAASYARASSLAAKASSL
VGTLTSNAGALTCRRGYQC*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc09g061890.3.1
Transcript Infomation

Pectate lyase (AHRD V3.3 *** M1BAL5_SOLTU)
Sequence

CCCCGACTCAATTTCACTCACATTTTTATAGAGAGAGCTCTGTTTTTTTATTTCTCCAAT
GGCGATTTATTGGAGATCGTGTCTCTCTCTTTCTGCATTGCTAATTTTGGTGCTACTAGT
CATCAATGTCAACCCCAGTCACAGTGCTGAAGAAGCAGAGCAATTCCAGAGCTTAAAGAA
CTTGACAATGACGAATAGTTTAAGCGAAGAAAATGTACCAAACCATGAACATGCTGTAGA
TGATCCAGAAAAGGTGGTTTCAATGGTAGATATGAGCATTAAGAATAGTACAGAGAGGAG
GAAATTGGGTTTTTTCTCATGTGGAACTGGAAATCCTATTGATGATTGTTGGCGTTGTGA
CCGTAATTGGCAACGTAACCGCAAGCGCCTAGCTGATTGTGCTATTGGATTCGGACGTAA
TGCTATTGGTGGCCGTGATGGCAAGTACTATGTTGTCACTGACCCAAACGATGATGACCC
TGTAAATCCCAGACCTGGAACACTTCGTCATGCTGTAATTCAGGACAGACCGTTGTGGAT
TGTGTTTAAACGAGATATGGTTATTACACTTAAACAAGAGCTAATTATGAACAGTTTCAA
GACAATTGATGGCCGTGGTGTCAATGTTCATATTGCCAATGGGGCTTGTATAACCGTCCA
ATTTGTTACTAATATTATTATTCATGGCATCAATATTCATGATTGTAAACCAACTGGTAA
CGCCATGGTACGTAGTTCACCAAGTCACTTTGGATGGAGGACAATTGCTGATGGAGATGG
CATTTCCATTTTTGGGTCTAGCCATATTTGGGTTGATCACAACTCTCTTGCTAACTGTGC
TGATGGCCTAATCGACGCGATAATGGGATCAACTGCTATTACCATCTCCAACAATTATTT
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CATTGGTGGCAGCGCGTCTCCTACGATAAACAGCCAAGGCAACAGATATCTCGCTCCGGC
CAACCCTTTTGCCAAACAGGTGACACATAGAGTGGAGCAATCAGATGTGTGGAAGCATTG
GAACTGGAGATCAGAGGGAGACCTTATGCTTAATGGAGCCTTCTTTACGCCATCTGGACA
CGGTGCTGCAGCCAGCTATGCTAGGGCTTCAAGCTTAGCAGCAAAGGCCTCTTCCCTGGT
TGGCACTCTTACTTCAAATGCTGGTGCACTTACATGTCGCAGGGGCTACCAATGTTAATG
TCTAAGACATTGACACAACCACATATTACCTTTACCTGTCCCGTGAAATTGTCGTGTAAT
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ATCTGTGGAACAGGTGTTGAAGTGTTGTACCCTACACATTACATTTCTCCTTAGTCATTC
CCTTTCTCTCCTACCACGTTTGCTTAAAATCTGATCACCAACTACTTCTCTTGCTTACGG
TTGATAGGAAACCGACCTTTTTCTTCCCTCTCCTCTTGATATGGAGCATTCAGAAACATA
GTACCAAAGAGATTGCAGAAAACATGCACAATAAAAAGAAGAAGACAATGAAAGCTGATT
TTTCTGGTTTATTGTTAAACATGTTTAGCATTAAGTGTTGAAACTGGCATCTTATATAAT
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CCCTCTGTTTAATTTTCCATAAATATCACCAAAAGTTGAGTTATTATGATGACAATTACA
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TAATATTGGATTCTATTGAGATCACAGCACAGGGGGCTGCATCCACCACGATATGGATGC
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TCCCATTTTCTTTCCCATGAGTATCTTCCAGGCTGCATACAGCCATGTGAAAGTACTTCA
TCATGAGTCCGACATCAAAACAGACACTTTTTGAATCATAAATACCAAAAGGAACTTCTC
TCTAAAAACACACATCAAAACAGACAATTCAGCCATTTGAAACTAGATAATAAAGTATTC
ATATCAAATTGGCTTTAATAATTTCTCATTTTCACCACAGTTATCCAAATGAAATGTTAA
TTCAAGCAATAACATTATTATCAAGGAAATTTCTAATCTAAATAAAATAAAACCAAGTCT
AGATAGACCATACTACTACTAGTTCATATTCAAATTCAAGTCAACCATTTCTCGACTCTT
ATAAACTCTATGCAATTTTAACATCAATTAATATGCTTCAACTAGACACTGGTGCCACAA
CTCCTCAAGCGACAGTGAAAAAAACGTCATCCTGAAGGCATCTTAGATCATGTTT