Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc09g061760.1.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein, putative (AHRD V3.3 *** A0A061DKY9_THECC)

Sequence

ATGAACAAATCCTTTAAACTCTCTATCCCTTGTAGTTGCAATAAGCGAATTTATGGAGCA
TTTCTCACCACTCAATCACAACCACTATTAACCATTCCTGTCCCAACACAAGAAAACATC
ACCCGTTTAATTTTGGAACAAAAAACTGCAAATCAAGCTCTTCAAACCTTTAGATGGGCC
TCTAACATTAGCAATTTCACTCACAATCACTCCACCTACAGAGCTATAATCCACAAGCTC
TGCAATTTTCGGCGTTTTGATTGTGTCCACCACTTGCTCAACGAAATGCCTAGCTCAATT
GGGTCAACTCCAGATGAGGATATCTTTGTTACCATTGTACGTGGTCTTGGTCGTGCTGGA
ATGATTAAACAACTCATTAAAATTCCTGAATTGGTGTCCAAATTTGAAAAGAAACCGACC
CTGAAGCTCTATAATGCGATTCTTGATGTTCTTGTAAAGGAAGATATAGACATTGCTAGA
GCGTTTTATAGGATTAAAATGATGGGAAATGGTATTCAGGGGGATCATTATACTTATGGG
ATTTTGATGAAAGGACTTTGCTTGACTAATAGGATTGGTGATGGGTTTAAGCTTCTTCAA
GTGATGAAAACTTGTGGCATTACACCAAATACTGTGATTTACAATACACTTATACATGCA
CTCTGCAAGAATGGGAAGGTAGGGAGAGCAAGGAGTTTGATGAGAGATTTGGTTGAACCA
AGTGACGTGACTTTTAACATTTTGATATCTGCATATTGTGGAGAGGGTAGTTTAGTACAG
GCTTTGGTGATGCTGGAAAAGAGCTTTAGTAAAGGGTATATTCCTGATGTTATTACAGTG
ACTAAAGTTGTGGGTCTTCTTTGTAACAACGGACGTGTTTCAGAGGCAGTGGAATTACTA
GAAAGAGTTGAGGAAAGAGGAGGTATTGTTGATGTTGTGGCTTATAACACGTTGATTAAT
GGGTTTTGTAGATTAGGGAAAGTGAAAGTTGGCTGTCGTCTTTTGAAGGAGATGGAGTTG
AAAGGGTGCATGCCAAATGCAGATACCTATAATGGCTTGATATCTGGCCTTTGTGAATCC
AAGATGTTGGATTTGGCACTTGAAATGTTAAATGAAATGAAGAGGGTTGGGATAAATTGG
AATTTTGTCACGTACGGTACTCTTATCCATGGGTTGTGTTCGGGTGGGAGAGTGGAAAAT
GGATTAAAGATCTTGGAAGTAATGAAAGATGATAAAGGAGTTTCAACAGTACATATTAGT
CCGTATAATAATGTTATATATGGGTTTTACAAGGAAAATCGTTTGGAAGAAGCACTTGTA
TTTCTATGGAAGATGGAAAATTTGTTTCCACGAGCTGTGGATAGGAGTGTGAGAATACTT
GGTTTCTGTGAAAATGGCAACATTGATGAAGCAAGGAAGGTCTATGATCAGATGGTCAAG
GAGGGTGTTATGCCAAGTGCTCTTGTTTATGCAAACTTAGTTAGTGGATATTGTAGCAAA
GAATGTATAAAAGGAGCATTTGATCTGATGAACGAGATGATTGAACGTGGTTATCTTCCA
GTTGCATACACATTCAATGATGTGATAATTTTGCTTTGCAAGCAGGGTAAAGTTGGAAAG
GCGTCTAAGTTGATGGAGAACATTAAAGGTAGAGGCTGCTTGCTGGACTCTGGAAGTTAC
GGTCCGTTCATTGATGTCTTCTGTAGTAGAGGAGATTTCCACAAAGCGTATATGTTCTTT
CTGCAAATGGTAGAAAAGAGTATAGTTCCTGATTGCCATTCATGGAATATGTTACTTGTG
TGCCTTTGTCAACAAACAACTTGGATAGAAGGCAATAACAAGACTTGCCATTTAACTAGC
CAATTGCAGGCCATAATACAAACATGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc09g061760.1.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein, putative (AHRD V3.3 *** A0A061DKY9_THECC)

Sequence

MNKSFKLSIPCSCNKRIYGAFLTTQSQPLLTIPVPTQENITRLILEQKTANQALQTFRWA
SNISNFTHNHSTYRAIIHKLCNFRRFDCVHHLLNEMPSSIGSTPDEDIFVTIVRGLGRAG
MIKQLIKIPELVSKFEKKPTLKLYNAILDVLVKEDIDIARAFYRIKMMGNGIQGDHYTYG
ILMKGLCLTNRIGDGFKLLQVMKTCGITPNTVIYNTLIHALCKNGKVGRARSLMRDLVEP
SDVTFNILISAYCGEGSLVQALVMLEKSFSKGYIPDVITVTKVVGLLCNNGRVSEAVELL
ERVEERGGIVDVVAYNTLINGFCRLGKVKVGCRLLKEMELKGCMPNADTYNGLISGLCES
KMLDLALEMLNEMKRVGINWNFVTYGTLIHGLCSGGRVENGLKILEVMKDDKGVSTVHIS
PYNNVIYGFYKENRLEEALVFLWKMENLFPRAVDRSVRILGFCENGNIDEARKVYDQMVK
EGVMPSALVYANLVSGYCSKECIKGAFDLMNEMIERGYLPVAYTFNDVIILLCKQGKVGK
ASKLMENIKGRGCLLDSGSYGPFIDVFCSRGDFHKAYMFFLQMVEKSIVPDCHSWNMLLV
CLCQQTTWIEGNNKTCHLTSQLQAIIQT*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc09g061760.1.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein, putative (AHRD V3.3 *** A0A061DKY9_THECC)

Sequence

ATGAACAAATCCTTTAAACTCTCTATCCCTTGTAGTTGCAATAAGCGAATTTATGGAGCA
TTTCTCACCACTCAATCACAACCACTATTAACCATTCCTGTCCCAACACAAGAAAACATC
ACCCGTTTAATTTTGGAACAAAAAACTGCAAATCAAGCTCTTCAAACCTTTAGATGGGCC
TCTAACATTAGCAATTTCACTCACAATCACTCCACCTACAGAGCTATAATCCACAAGCTC
TGCAATTTTCGGCGTTTTGATTGTGTCCACCACTTGCTCAACGAAATGCCTAGCTCAATT
GGGTCAACTCCAGATGAGGATATCTTTGTTACCATTGTACGTGGTCTTGGTCGTGCTGGA
ATGATTAAACAACTCATTAAAATTCCTGAATTGGTGTCCAAATTTGAAAAGAAACCGACC
CTGAAGCTCTATAATGCGATTCTTGATGTTCTTGTAAAGGAAGATATAGACATTGCTAGA
GCGTTTTATAGGATTAAAATGATGGGAAATGGTATTCAGGGGGATCATTATACTTATGGG
ATTTTGATGAAAGGACTTTGCTTGACTAATAGGATTGGTGATGGGTTTAAGCTTCTTCAA
GTGATGAAAACTTGTGGCATTACACCAAATACTGTGATTTACAATACACTTATACATGCA
CTCTGCAAGAATGGGAAGGTAGGGAGAGCAAGGAGTTTGATGAGAGATTTGGTTGAACCA
AGTGACGTGACTTTTAACATTTTGATATCTGCATATTGTGGAGAGGGTAGTTTAGTACAG
GCTTTGGTGATGCTGGAAAAGAGCTTTAGTAAAGGGTATATTCCTGATGTTATTACAGTG
ACTAAAGTTGTGGGTCTTCTTTGTAACAACGGACGTGTTTCAGAGGCAGTGGAATTACTA
GAAAGAGTTGAGGAAAGAGGAGGTATTGTTGATGTTGTGGCTTATAACACGTTGATTAAT
GGGTTTTGTAGATTAGGGAAAGTGAAAGTTGGCTGTCGTCTTTTGAAGGAGATGGAGTTG
AAAGGGTGCATGCCAAATGCAGATACCTATAATGGCTTGATATCTGGCCTTTGTGAATCC
AAGATGTTGGATTTGGCACTTGAAATGTTAAATGAAATGAAGAGGGTTGGGATAAATTGG
AATTTTGTCACGTACGGTACTCTTATCCATGGGTTGTGTTCGGGTGGGAGAGTGGAAAAT
GGATTAAAGATCTTGGAAGTAATGAAAGATGATAAAGGAGTTTCAACAGTACATATTAGT
CCGTATAATAATGTTATATATGGGTTTTACAAGGAAAATCGTTTGGAAGAAGCACTTGTA
TTTCTATGGAAGATGGAAAATTTGTTTCCACGAGCTGTGGATAGGAGTGTGAGAATACTT
GGTTTCTGTGAAAATGGCAACATTGATGAAGCAAGGAAGGTCTATGATCAGATGGTCAAG
GAGGGTGTTATGCCAAGTGCTCTTGTTTATGCAAACTTAGTTAGTGGATATTGTAGCAAA
GAATGTATAAAAGGAGCATTTGATCTGATGAACGAGATGATTGAACGTGGTTATCTTCCA
GTTGCATACACATTCAATGATGTGATAATTTTGCTTTGCAAGCAGGGTAAAGTTGGAAAG
GCGTCTAAGTTGATGGAGAACATTAAAGGTAGAGGCTGCTTGCTGGACTCTGGAAGTTAC
GGTCCGTTCATTGATGTCTTCTGTAGTAGAGGAGATTTCCACAAAGCGTATATGTTCTTT
CTGCAAATGGTAGAAAAGAGTATAGTTCCTGATTGCCATTCATGGAATATGTTACTTGTG
TGCCTTTGTCAACAAACAACTTGGATAGAAGGCAATAACAAGACTTGCCATTTAACTAGC
CAATTGCAGGCCATAATACAAACATGA