Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc09g031940.1.1
CDS Infomation	Protein RETICULATA-RELATED 3, chloroplastic (AHRD V3.3 *** RER3_ARATH)
Sequence	ATGTCGGCGGTGGTTCAGCTTCGCTGCTCTTCACTTCCAGCCCACTATCACTATCAAACT CTTTACTTTTCTGCTGTCAAACCCTCATTTTCAGACAACAGCTGCGTCAGAAATCTCAGC TTTAACCCATTAACTACCAGCCATGTGGGTTCTAAACAATTGCTTATTAAGTATCAAGTT CCTTGTGCTGGGTGGGGTGGTGGTGATGGAGGAAGCATTGGCATTGGTGGTGGTGGCGGT GGTGATGGGGATTCGGGTGATGGGGGACATTCAGATGATTCCTTGAACAGTTTTGGACCA ATTGGTGCTTTTGTTAATGGCTGGAGATCTAGGGTTGCTGCGGATCCACAATTCCCTTTT AAGGTTCTTATGGAGGAATTGGTTGGTGTCACTTCTGCTGTCATAGGAGACATGGCATCA CGTCCTAACTTTGGCCTTAATGAATTGGATTTTGTGTTTTCCACACTTGTCGTTGGTTCC ATTTTGAATTTTGTGTTGATGTATATATTGGCACCAACAGCATCTGTTTCTAGTCGAGCC CTGCCTTCAATTTTCGCCAGTTGCCCACCAAGTCACATGTTTGAGCCTGGGGCTTACAGT TTATTCAGTAGGGTTGGGACATTGGTCTACAAAGGAACTCTCTTTGCTGCAGTTGGATTT GCTGCTGGACTTGTTGGAACTGCAATTTCTAATGGCTTAATCAAGATAAGGAACAACATG GATCCTAATTTTGAGACCCCAAATAAGCCCCCTCCAACACTTCTAAATGCTGGAACATGG GCAACTCATATGGGTGTCAGCAGTAATTTAAGATACCAAACGCTTAATGGAATTGAGTTC TTGCTAGACAAAGCTCTTCCTCCAGTTGTTTTTAAAACGTCCGTTGTGGTTTTGAGATGC TTGAATAATGTTCTTGGGGGAATGTCATTTGTCATGTTGGCAAGGCTGACTGGTTCTCAG AGTGTAGATAAAGGGGAGCTAGTTACTGTGAAAGATGATGGAATAAAGGTAGAGAAAGAG AGGTTGCTGAATCAGAGCGACAACATACAAACTGGTCATTCTGTTTTAAAGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc09g031940.1.1
PEP Infomation	Protein RETICULATA-RELATED 3, chloroplastic (AHRD V3.3 *** RER3_ARATH)
Sequence	MSAVVQLRCSSLPAHYHYQTLYFSAVKPSFSDNSCVRNLSFNPLTTSHVGSKQLLIKYQV PCAGWGGGDGGSIGIGGGGGGDGDSGDGGHSDDSLNSFGPIGAFVNGWRSRVAADPQFPF KVLMEELVGVTSAVIGDMASRPNFGLNELDFVFSTLVVGSILNFVLMYILAPTASVSSRA LPSIFASCPPSHMFEPGAYSLFSRVGTLVYKGTLFAAVGFAAGLVGTAISNGLIKIRNNM DPNFETPNKPPPTLLNAGTWATHMGVSSNLRYQTLNGIEFLLDKALPPVVFKTSVVVLRC LNNVLGGMSFVMLARLTGSQSVDKGELVTVKDDGIKVEKERLLNQSDNIQTGHSVLK*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc09g031940.1.1
Transcript Infomation	Protein RETICULATA-RELATED 3, chloroplastic (AHRD V3.3 *** RER3_ARATH)
Sequence	ATGTCGGCGGTGGTTCAGCTTCGCTGCTCTTCACTTCCAGCCCACTATCACTATCAAACT CTTTACTTTTCTGCTGTCAAACCCTCATTTTCAGACAACAGCTGCGTCAGAAATCTCAGC TTTAACCCATTAACTACCAGCCATGTGGGTTCTAAACAATTGCTTATTAAGTATCAAGTT CCTTGTGCTGGGTGGGGTGGTGGTGATGGAGGAAGCATTGGCATTGGTGGTGGTGGCGGT GGTGATGGGGATTCGGGTGATGGGGGACATTCAGATGATTCCTTGAACAGTTTTGGACCA ATTGGTGCTTTTGTTAATGGCTGGAGATCTAGGGTTGCTGCGGATCCACAATTCCCTTTT AAGGTTCTTATGGAGGAATTGGTTGGTGTCACTTCTGCTGTCATAGGAGACATGGCATCA CGTCCTAACTTTGGCCTTAATGAATTGGATTTTGTGTTTTCCACACTTGTCGTTGGTTCC ATTTTGAATTTTGTGTTGATGTATATATTGGCACCAACAGCATCTGTTTCTAGTCGAGCC CTGCCTTCAATTTTCGCCAGTTGCCCACCAAGTCACATGTTTGAGCCTGGGGCTTACAGT TTATTCAGTAGGGTTGGGACATTGGTCTACAAAGGAACTCTCTTTGCTGCAGTTGGATTT GCTGCTGGACTTGTTGGAACTGCAATTTCTAATGGCTTAATCAAGATAAGGAACAACATG GATCCTAATTTTGAGACCCCAAATAAGCCCCCTCCAACACTTCTAAATGCTGGAACATGG GCAACTCATATGGGTGTCAGCAGTAATTTAAGATACCAAACGCTTAATGGAATTGAGTTC TTGCTAGACAAAGCTCTTCCTCCAGTTGTTTTTAAAACGTCCGTTGTGGTTTTGAGATGC TTGAATAATGTTCTTGGGGGAATGTCATTTGTCATGTTGGCAAGGCTGACTGGTTCTCAG AGTGTAGATAAAGGGGAGCTAGTTACTGTGAAAGATGATGGAATAAAGGTAGAGAAAGAG AGGTTGCTGAATCAGAGCGACAACATACAAACTGGTCATTCTGTTTTAAAGTGA