Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc09g018020.3.1
CDS Infomation	Expansin (AHRD V3.3 *** G4XZW3_9GENT)
Sequence	ATGGCTATTGAATATCATCATTTGCCATTTCTATTCCTTGTTTTTCTTGCATGTGTACAA CACTCTTATGAACTCGGAGTTTATACTGGTTGGAAGAATGCTCATGCAACATTCTACGGT GGTTCTGATGCTTCCGGCACCATGGGAGGAGCATGTGGATACGGAAACTTGTACAGCCAA GGTTATGGTACAAATACTGCAGCTTTGAGCACTTCACTGTTTAATAGTGGGTTGAGTTGT GGATCTTGCTATGAACTCAAGTGCAATGTCAATGCTGACCCTCGATGGTGTCGACGTGGA ACTATTACTGTCACGGCTACTAACTTTTGCCCACCAAACTATGCCCTGGCTAATAACAAT GGTGGCTGGTGTAATCCTCCTCTTAGACACTTTGATTTGGCTCAGCCTGCTTTTTTAAAA ATTGCTCTATATAGAGCTGGCATTGTCCCTGTCATCTATAGAAGGGTCCCTTGCATGAAG AAAGGAGGAATGAGATTCACCATTAATGGTCATTCCTACTTCAACCTAGTGTTGATAACA AACGTTGGAGGTGCAGGAGACATTCGATCAGTGTCCATAAAGGGATCAAAAACAGGGTGG CAAAAGATGTCACGAAATTGGGGTCAAAATTGGCAGAGTCATTCATACCTTAATGGCCAA AGTCTTTCTTTCAAAGTAATAGCTAGTGATGGAAGGATAGTCACTACTTACAATGTTGCT CCAACTAATTGGCAATTTGGACAAACTTTTCAAGGAGGTCAATTCTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc09g018020.3.1
PEP Infomation	Expansin (AHRD V3.3 *** G4XZW3_9GENT)
Sequence	MAIEYHHLPFLFLVFLACVQHSYELGVYTGWKNAHATFYGGSDASGTMGGACGYGNLYSQ GYGTNTAALSTSLFNSGLSCGSCYELKCNVNADPRWCRRGTITVTATNFCPPNYALANNN GGWCNPPLRHFDLAQPAFLKIALYRAGIVPVIYRRVPCMKKGGMRFTINGHSYFNLVLIT NVGGAGDIRSVSIKGSKTGWQKMSRNWGQNWQSHSYLNGQSLSFKVIASDGRIVTTYNVA PTNWQFGQTFQGGQF*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc09g018020.3.1
Transcript Infomation	Expansin (AHRD V3.3 *** G4XZW3_9GENT)
Sequence	CAACAAAAAGGTGTCATTCAAGTCTAATATAACTTGTTCTAACCGAATGAAGATGATAAA ACCTCAAACAAAAAATGATAAGTTGTCAAAAGAATTCATGGGGGCCGACCCACAGGTGGA GGGGTCCTGCTAGAGTAGCTAGGGAGCAAAATAAAACGGGCTAATAAGAGTTTATTTAAT AACACTATAAATAGCAATGGATTAGCCTCATTTCCTTGTACCTCAATTTCCCAACCATAT TCAATCCTCCTCCAATTTAAGTAATTAACTAGTACAACACCATTCACCACCAAAATTAAA ATGGCTATTGAATATCATCATTTGCCATTTCTATTCCTTGTTTTTCTTGCATGTGTACAA CACTCTTATGAACTCGGAGTTTATACTGGTTGGAAGAATGCTCATGCAACATTCTACGGT GGTTCTGATGCTTCCGGCACCATGGGAGGAGCATGTGGATACGGAAACTTGTACAGCCAA GGTTATGGTACAAATACTGCAGCTTTGAGCACTTCACTGTTTAATAGTGGGTTGAGTTGT GGATCTTGCTATGAACTCAAGTGCAATGTCAATGCTGACCCTCGATGGTGTCGACGTGGA ACTATTACTGTCACGGCTACTAACTTTTGCCCACCAAACTATGCCCTGGCTAATAACAAT GGTGGCTGGTGTAATCCTCCTCTTAGACACTTTGATTTGGCTCAGCCTGCTTTTTTAAAA ATTGCTCTATATAGAGCTGGCATTGTCCCTGTCATCTATAGAAGGGTCCCTTGCATGAAG AAAGGAGGAATGAGATTCACCATTAATGGTCATTCCTACTTCAACCTAGTGTTGATAACA AACGTTGGAGGTGCAGGAGACATTCGATCAGTGTCCATAAAGGGATCAAAAACAGGGTGG CAAAAGATGTCACGAAATTGGGGTCAAAATTGGCAGAGTCATTCATACCTTAATGGCCAA AGTCTTTCTTTCAAAGTAATAGCTAGTGATGGAAGGATAGTCACTACTTACAATGTTGCT CCAACTAATTGGCAATTTGGACAAACTTTTCAAGGAGGTCAATTCTAAGACAAAGTTAAT TACTCCATATGTTCTAAGACATGAATTTAATTCAAGGGGTCTTCATTTTTCAAACAATAT GTATGAAGTTATTTGTCACACAAAAAAAATAATTTAAGATGATAATCAAAAGTGTCTACC ACTCTGTTGATTTATCGTCACACAAATATACAAGCACTTGGCAGGAATTACAACAAATGA AACAAGTTGGCATTTATTATGTAGAAGTGTGTTTATGTCATCTAATGTTAATTAATGTGA ATATATTACTATTACGTCG