Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc09g011070.1.1
CDS Infomation	clade XI lectin receptor kinase
Sequence	ATGGTTTATAGTTGTCTTGTACTACTCTGTTCATTCATTTCCTTTTCAATCCTAGCTTCA TCTCAGCAACTTGATGGCTTCATTTATACAAGATTCAATGAACCAAACAATAACATTACC TTAAGTGGAGCTGCTGAGATTAGCCAAAATGGATTCATTCAACTAACCAATGAAACAAGT AGATTAATGGGGCATGCTTTCTATTCTTCACCTTTTCAGTTCAAGAACTCAACTAATGGC AGTGCTTTTTCATTTTCAACATGTTTTGCTCTTGCTATAGTCCCTGAATATCCAAAACTT GGTGGTCATGGACTTGCTTTTACTATTTCTCAGTCTAATGATTTCAGCACAGCTCTTCCA AGTCAGTATCTTGGCTTACTAAATGCTACTGATGTTGGTAACTTCTCAAATTACATACTT GCTGTTGAATTTGATACAGTACAAGATTTTGAGTTTGGGGATATTAATGATAATCATGTT GGTATAAACATTAATAGTTTAAGGTCTAATATGTCTGCTAAAGCATCTTACTTTGATGAT GATTTGGTAAAACAAGATCTGAATCTCAAATGTGGTAAAGTTATATTGGCATGGGTTGAT TATGATTCTGTTACAAACTTGGTTAATGTTACACTTTCAAGATTTGCTAAAAAACCAAAG TTGCCACTTTTCTCTTATCATATAGATCTCTCTCCATTTCTCAAAGAAAATATGTATGTT GGTTTTTCTGCTTCAACTGGTTTGCTTGCAAGTTCACATTATGTTTTTGGTTGGAGCTTT AAGTTGAATGGCGAAGCGAAATTTCTAGACTTGGATTTACTTCCATCATTGCCTGGTCTC AAGAAGAAGCACAGTGGCGTAATTGTAGCTATCTCGGTTATAGTTGTTGTTTTGGTTTTG ATTGGTATATTAGTTGCTATTTATTTAGTTAGGAGATTCAAGAATGCTGATGTTATAGAG TCTTGGGAGCTTGAGGTTGGTCCTCATAGATACTCTTATGAAGAACTTAAGCAAGCTACT AGAAGTTTTAAGGATAGTGAGCTTCTTGGGTTTGGGGGATTTGGTAAAGTTTACAAGGGT GTTTTACAAAGTTCGAATATGGAAATAGCTGTGAAGCGTATTTCACATGAATCTAAACAA GGCTTACGCGAATTTGTGTCTGAAATATCTAGCATTGGAAGACTCCGCCATAGGAATTTG GTTCAATTAGTAGGTTGGTGTAGACGTCGTGGTGACCTTTTACTTGTGTATGATTTTATG CCAAATGGAAGTTTGGACAATTTCTTGTTCGAAAAACCTAGAATGTTGTTGACATGGGAG CAAAGGTTCAAAATCATCAAAGGGGTTGCTTCTGGTTTACTATACTTACATGAAGGTTAT GAACAAGTTGTGGTGCATCGAGACGTTAAGGCTAGTAATGTGCTACTAGATGGAGAGTTA AATGGCAGGCTTGGAGATTTTGGACTAGCAAGATTATATGAGCACGGATCAAACCCGGGC ACGACTAGGGTGGTAGGCACATTGGGGTACCTTGCACCGGAATTACCAAGAACAGGACGA GCTACTGAAAAATCCGATGTTTTTGCCTTTGGTGCGTTGTTGCTTGAAGTGGTATGTGGA CGTAGACCGATTGATTCAAAGGTGGGGCCAGAGGAATTAGTTCTAGTAGACATGGTGTGG AACAAATGGAGAGAGGGGAAAATTCTTGATGTTATAGACAAGAGATTGAAAGGTGAGTTC AATGAAAGTGAAGTTGTGATGGTGTTGAAATTAGGACTAATGTGTTCAAACAATGAGGCG TCGTCTCGACCTAGCATGAGACAAGTGATGAGTTACTTGGAAGGTGAAGCTGATATACCT GATGCTCCAATGGCTCCTGGTGATTATAATGGAGGATTTGGATTCGAAGAAAACGAATGT ATGCATTCTTTAGCATCTTCAAGAGGACATACATCATGTTTGGCTAATGGAAATGTTGAT GGTACATTTGTTTCTGTTTCTACTGCACCACTTTCATGTTTATTTACTGATGAGTTGCCT AGGTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc09g011070.1.1
PEP Infomation	clade XI lectin receptor kinase
Sequence	MVYSCLVLLCSFISFSILASSQQLDGFIYTRFNEPNNNITLSGAAEISQNGFIQLTNETS RLMGHAFYSSPFQFKNSTNGSAFSFSTCFALAIVPEYPKLGGHGLAFTISQSNDFSTALP SQYLGLLNATDVGNFSNYILAVEFDTVQDFEFGDINDNHVGININSLRSNMSAKASYFDD DLVKQDLNLKCGKVILAWVDYDSVTNLVNVTLSRFAKKPKLPLFSYHIDLSPFLKENMYV GFSASTGLLASSHYVFGWSFKLNGEAKFLDLDLLPSLPGLKKKHSGVIVAISVIVVVLVL IGILVAIYLVRRFKNADVIESWELEVGPHRYSYEELKQATRSFKDSELLGFGGFGKVYKG VLQSSNMEIAVKRISHESKQGLREFVSEISSIGRLRHRNLVQLVGWCRRRGDLLLVYDFM PNGSLDNFLFEKPRMLLTWEQRFKIIKGVASGLLYLHEGYEQVVVHRDVKASNVLLDGEL NGRLGDFGLARLYEHGSNPGTTRVVGTLGYLAPELPRTGRATEKSDVFAFGALLLEVVCG RRPIDSKVGPEELVLVDMVWNKWREGKILDVIDKRLKGEFNESEVVMVLKLGLMCSNNEA SSRPSMRQVMSYLEGEADIPDAPMAPGDYNGGFGFEENECMHSLASSRGHTSCLANGNVD GTFVSVSTAPLSCLFTDELPR*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc09g011070.1.1
Transcript Infomation	clade XI lectin receptor kinase
Sequence	ATGGTTTATAGTTGTCTTGTACTACTCTGTTCATTCATTTCCTTTTCAATCCTAGCTTCA TCTCAGCAACTTGATGGCTTCATTTATACAAGATTCAATGAACCAAACAATAACATTACC TTAAGTGGAGCTGCTGAGATTAGCCAAAATGGATTCATTCAACTAACCAATGAAACAAGT AGATTAATGGGGCATGCTTTCTATTCTTCACCTTTTCAGTTCAAGAACTCAACTAATGGC AGTGCTTTTTCATTTTCAACATGTTTTGCTCTTGCTATAGTCCCTGAATATCCAAAACTT GGTGGTCATGGACTTGCTTTTACTATTTCTCAGTCTAATGATTTCAGCACAGCTCTTCCA AGTCAGTATCTTGGCTTACTAAATGCTACTGATGTTGGTAACTTCTCAAATTACATACTT GCTGTTGAATTTGATACAGTACAAGATTTTGAGTTTGGGGATATTAATGATAATCATGTT GGTATAAACATTAATAGTTTAAGGTCTAATATGTCTGCTAAAGCATCTTACTTTGATGAT GATTTGGTAAAACAAGATCTGAATCTCAAATGTGGTAAAGTTATATTGGCATGGGTTGAT TATGATTCTGTTACAAACTTGGTTAATGTTACACTTTCAAGATTTGCTAAAAAACCAAAG TTGCCACTTTTCTCTTATCATATAGATCTCTCTCCATTTCTCAAAGAAAATATGTATGTT GGTTTTTCTGCTTCAACTGGTTTGCTTGCAAGTTCACATTATGTTTTTGGTTGGAGCTTT AAGTTGAATGGCGAAGCGAAATTTCTAGACTTGGATTTACTTCCATCATTGCCTGGTCTC AAGAAGAAGCACAGTGGCGTAATTGTAGCTATCTCGGTTATAGTTGTTGTTTTGGTTTTG ATTGGTATATTAGTTGCTATTTATTTAGTTAGGAGATTCAAGAATGCTGATGTTATAGAG TCTTGGGAGCTTGAGGTTGGTCCTCATAGATACTCTTATGAAGAACTTAAGCAAGCTACT AGAAGTTTTAAGGATAGTGAGCTTCTTGGGTTTGGGGGATTTGGTAAAGTTTACAAGGGT GTTTTACAAAGTTCGAATATGGAAATAGCTGTGAAGCGTATTTCACATGAATCTAAACAA GGCTTACGCGAATTTGTGTCTGAAATATCTAGCATTGGAAGACTCCGCCATAGGAATTTG GTTCAATTAGTAGGTTGGTGTAGACGTCGTGGTGACCTTTTACTTGTGTATGATTTTATG CCAAATGGAAGTTTGGACAATTTCTTGTTCGAAAAACCTAGAATGTTGTTGACATGGGAG CAAAGGTTCAAAATCATCAAAGGGGTTGCTTCTGGTTTACTATACTTACATGAAGGTTAT GAACAAGTTGTGGTGCATCGAGACGTTAAGGCTAGTAATGTGCTACTAGATGGAGAGTTA AATGGCAGGCTTGGAGATTTTGGACTAGCAAGATTATATGAGCACGGATCAAACCCGGGC ACGACTAGGGTGGTAGGCACATTGGGGTACCTTGCACCGGAATTACCAAGAACAGGACGA GCTACTGAAAAATCCGATGTTTTTGCCTTTGGTGCGTTGTTGCTTGAAGTGGTATGTGGA CGTAGACCGATTGATTCAAAGGTGGGGCCAGAGGAATTAGTTCTAGTAGACATGGTGTGG AACAAATGGAGAGAGGGGAAAATTCTTGATGTTATAGACAAGAGATTGAAAGGTGAGTTC AATGAAAGTGAAGTTGTGATGGTGTTGAAATTAGGACTAATGTGTTCAAACAATGAGGCG TCGTCTCGACCTAGCATGAGACAAGTGATGAGTTACTTGGAAGGTGAAGCTGATATACCT GATGCTCCAATGGCTCCTGGTGATTATAATGGAGGATTTGGATTCGAAGAAAACGAATGT ATGCATTCTTTAGCATCTTCAAGAGGACATACATCATGTTTGGCTAATGGAAATGTTGAT GGTACATTTGTTTCTGTTTCTACTGCACCACTTTCATGTTTATTTACTGATGAGTTGCCT AGGTAG