Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc09g010070.1.1
CDS Infomation	Pentatricopeptide repeat superfamily protein (AHRD V3.3 *** A0A061F1A8_THECC)
Sequence	ATGTTCAAATCCAAAACCCCAAAGATTTTTCCTTCCAAATATGCAAAACTTTGTTATTCT TCAGCTCCCTCTATAGCTGCTGAGGCCAACACTCATCATCAACTAGTTGTTGAACAAACA CCAATTTCACAATTTTCTCATTATTTTGATCCAAGATTCTATCTTTCTCAACTTATAAAG TGTAAAAATCTTTATCAAGTAAAACAAGTTCATGCTTCAATAACAACTAATGGATTTCTT GAAAATCTAATGGTTGCTAATAAACTTCTATACATATATTGTATGCACAAGTCTTTAGAT GATTCATATGCTTTGTTTTGTAGATTTAATGAGAAAAATGCTGTTTCTTGGAGTGTTATG GTTGGTGGGTATGCTAAAGCTGGAGACTTTATGAACTGTTTTAGTATTTTTAAGGAGTAT TTAAGATCTGGGGTTAGACCTGATACTTATACTTTGCCTTTTGTTATAAGGGTTTGTAGA GATACAATGGATCTAACAATGGGTAGATTGATTCATAATGTTGTTTACAAATGTGGGTTG CTGTTAGATAACTTTGTTGTTGCAGCACTTGTTGATATGTATTCGAAATGTAAGGTAATT GGGGATGCAAAGCAACTGTTTGATGGAATGCCTAAGAGGGATGTTGTGACTTGGACGGTT ATGATTGGGGCGTGTACGGAGTGTGGGGATGCGACTGAGGCTTTAGTTTTGTTTGATCAA ATGAGGGAGGAAGGAGTTGTTCCGGATAAAGTTGTTTTGGTAAATGTAGTTAATGCTTGT GCAAAGATAGGGGCGATGCATAAGGCTAAGTTAGTACATGAATATATAGTGAAGAACAAG TTTTCTTTCGATGTTATCTTGGGGACAGCGATGGTTGACATGTATGCTAAATGTGGATCG ATTGATGTTGCTAGGGAAGTGTTTGATGGTTTGAGAGAAAAGAATGTTATAACTTGGAGT GCGATGATAGCAGCTTATGGTTATCATGGCCAAGGAAACAAAGCTGTTGATATGTTCCCT ATGATGTTAAGGACGGGGATATTGCCTAACAAGATCACATTTGTTTCTCTTCTTTATGCG TGTAGTCATAGCGGGCTGGTTGAAGAAGGTAAACAACTTTTCAATTCTATGCAGAAAGAG TACGGAGTGAAGCCTGATATCAAACATTTCACTTGTATGGTGGACCTCTTGGGCCGCGCT GGGAAAATTGACGAGTCCTTAAAGTTAATAGAGGATATGGCTGTTGAAAAAGATGAAGGG CTTTGGGGGGCATTACTTGGAGCATGCAGAATTCATGGCTGTGTAGAGCTTGCCGAAATG GCAGCAAAATCGTTGATTGAACTGCAACCTGAAAACGCAGGGCACTACGTCTTGCTATCA AATATATATGCTAAAGCAGGTAAGTGGCAGGATATGGCCAAGATTAGGGAGTTAATGAGC CATCAGAGATTGAAGAAAGTTCCCGGTTGGACATGGATTGAAGTTGATAACAAGATTCAT CGATTCAGCGTTGGAGACCACACCCATCCTCTATCGAAAGAGATTTATGAGAAGTTAAAG TATCTGCTCAAGGAACTAGAGATTTCTGGTTATGTTCCAGATACAAACTTTGTGTTGCAT GATGTTGATGAGGAACTTAAGCTTGGAAACCTATTCTCTCATAGTGAAAAGTTGGCTATT GCATTTGGACTCATAAGCACACCTGAACAATCCACTATTAGAATTATGAAGAACCTTAGA GTATGTGGTGACTGCCACACATTCTGTAAGTTTGTTTCTCAGGTTACAAGTAGGGTGATC ATCGTCCGCGATGCAAATCGGTTTCACCACTTCAAAGAAGGTGCCTGTTCTTGCAAAGAT TACTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc09g010070.1.1
PEP Infomation	Pentatricopeptide repeat superfamily protein (AHRD V3.3 *** A0A061F1A8_THECC)
Sequence	MFKSKTPKIFPSKYAKLCYSSAPSIAAEANTHHQLVVEQTPISQFSHYFDPRFYLSQLIK CKNLYQVKQVHASITTNGFLENLMVANKLLYIYCMHKSLDDSYALFCRFNEKNAVSWSVM VGGYAKAGDFMNCFSIFKEYLRSGVRPDTYTLPFVIRVCRDTMDLTMGRLIHNVVYKCGL LLDNFVVAALVDMYSKCKVIGDAKQLFDGMPKRDVVTWTVMIGACTECGDATEALVLFDQ MREEGVVPDKVVLVNVVNACAKIGAMHKAKLVHEYIVKNKFSFDVILGTAMVDMYAKCGS IDVAREVFDGLREKNVITWSAMIAAYGYHGQGNKAVDMFPMMLRTGILPNKITFVSLLYA CSHSGLVEEGKQLFNSMQKEYGVKPDIKHFTCMVDLLGRAGKIDESLKLIEDMAVEKDEG LWGALLGACRIHGCVELAEMAAKSLIELQPENAGHYVLLSNIYAKAGKWQDMAKIRELMS HQRLKKVPGWTWIEVDNKIHRFSVGDHTHPLSKEIYEKLKYLLKELEISGYVPDTNFVLH DVDEELKLGNLFSHSEKLAIAFGLISTPEQSTIRIMKNLRVCGDCHTFCKFVSQVTSRVI IVRDANRFHHFKEGACSCKDYW*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc09g010070.1.1
Transcript Infomation	Pentatricopeptide repeat superfamily protein (AHRD V3.3 *** A0A061F1A8_THECC)
Sequence	ATGTTCAAATCCAAAACCCCAAAGATTTTTCCTTCCAAATATGCAAAACTTTGTTATTCT TCAGCTCCCTCTATAGCTGCTGAGGCCAACACTCATCATCAACTAGTTGTTGAACAAACA CCAATTTCACAATTTTCTCATTATTTTGATCCAAGATTCTATCTTTCTCAACTTATAAAG TGTAAAAATCTTTATCAAGTAAAACAAGTTCATGCTTCAATAACAACTAATGGATTTCTT GAAAATCTAATGGTTGCTAATAAACTTCTATACATATATTGTATGCACAAGTCTTTAGAT GATTCATATGCTTTGTTTTGTAGATTTAATGAGAAAAATGCTGTTTCTTGGAGTGTTATG GTTGGTGGGTATGCTAAAGCTGGAGACTTTATGAACTGTTTTAGTATTTTTAAGGAGTAT TTAAGATCTGGGGTTAGACCTGATACTTATACTTTGCCTTTTGTTATAAGGGTTTGTAGA GATACAATGGATCTAACAATGGGTAGATTGATTCATAATGTTGTTTACAAATGTGGGTTG CTGTTAGATAACTTTGTTGTTGCAGCACTTGTTGATATGTATTCGAAATGTAAGGTAATT GGGGATGCAAAGCAACTGTTTGATGGAATGCCTAAGAGGGATGTTGTGACTTGGACGGTT ATGATTGGGGCGTGTACGGAGTGTGGGGATGCGACTGAGGCTTTAGTTTTGTTTGATCAA ATGAGGGAGGAAGGAGTTGTTCCGGATAAAGTTGTTTTGGTAAATGTAGTTAATGCTTGT GCAAAGATAGGGGCGATGCATAAGGCTAAGTTAGTACATGAATATATAGTGAAGAACAAG TTTTCTTTCGATGTTATCTTGGGGACAGCGATGGTTGACATGTATGCTAAATGTGGATCG ATTGATGTTGCTAGGGAAGTGTTTGATGGTTTGAGAGAAAAGAATGTTATAACTTGGAGT GCGATGATAGCAGCTTATGGTTATCATGGCCAAGGAAACAAAGCTGTTGATATGTTCCCT ATGATGTTAAGGACGGGGATATTGCCTAACAAGATCACATTTGTTTCTCTTCTTTATGCG TGTAGTCATAGCGGGCTGGTTGAAGAAGGTAAACAACTTTTCAATTCTATGCAGAAAGAG TACGGAGTGAAGCCTGATATCAAACATTTCACTTGTATGGTGGACCTCTTGGGCCGCGCT GGGAAAATTGACGAGTCCTTAAAGTTAATAGAGGATATGGCTGTTGAAAAAGATGAAGGG CTTTGGGGGGCATTACTTGGAGCATGCAGAATTCATGGCTGTGTAGAGCTTGCCGAAATG GCAGCAAAATCGTTGATTGAACTGCAACCTGAAAACGCAGGGCACTACGTCTTGCTATCA AATATATATGCTAAAGCAGGTAAGTGGCAGGATATGGCCAAGATTAGGGAGTTAATGAGC CATCAGAGATTGAAGAAAGTTCCCGGTTGGACATGGATTGAAGTTGATAACAAGATTCAT CGATTCAGCGTTGGAGACCACACCCATCCTCTATCGAAAGAGATTTATGAGAAGTTAAAG TATCTGCTCAAGGAACTAGAGATTTCTGGTTATGTTCCAGATACAAACTTTGTGTTGCAT GATGTTGATGAGGAACTTAAGCTTGGAAACCTATTCTCTCATAGTGAAAAGTTGGCTATT GCATTTGGACTCATAAGCACACCTGAACAATCCACTATTAGAATTATGAAGAACCTTAGA GTATGTGGTGACTGCCACACATTCTGTAAGTTTGTTTCTCAGGTTACAAGTAGGGTGATC ATCGTCCGCGATGCAAATCGGTTTCACCACTTCAAAGAAGGTGCCTGTTCTTGCAAAGAT TACTGGTGA