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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc09g008380.3.1

CDS Infomation

Pectate lyase (AHRD V3.3 *** K4CQM6_SOLLC)

Sequence

ATGTTTCAAATAAGCTACATTGTGGTTTTCTTGATTTTAACTTCATTTTTTCCTTTAGGT
TTTGGGATTTTCTTGAATGTTACTACTCTTCCTGGTCAACATCCTGATCCTGAATCTGTT
GCTCTTGAAGTTAATAGGAAAGTGAATGCATCACTCTCAATTTTCCAATCAAGAAGAAAA
ATGTTGTCCTACACACAATCCTCTTGTCAAACGGGTAACCCTATCGATGATTGTTGGCGA
TGTGACCATAGTTGGCAATTAAATCGCCAAAGACTAGCCGATTGTGCCATCGGGTTCGGT
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GACCCCGTGGACCCGCCACCTGGCACTCTCCGATACGGGGTCATCCAAGAGGAACCGTTG
TGGATAGTTTTCTCAGCTAGTATGGAGATTAAACTCTCGGAAGAGCTCATATTCAACTCG
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GGCGATACGAACGTACGTTCGAGCCCTACACATTTCGGATACCGAGGCAAGTCGGACGGG
GACGGGATCTCGATTTTCGGGTCCCGAGACATATGGATAGATCATTGTTCATTGTCCAAT
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AGAAATTGGAATTGGAGAAGTGAAGGGGATGTAATGGCAAATGGAGCATACTTTGTGGCC
TCTGGTGAAGAAGTTGAAATTAAATATGAAAAAGCTTATAGTGTGGAGCCAAAATCTGCT
GATTTTATTGACCAAATTACTTTAAATGCTGGTGTTCTTATTCACAGGGGTAGCAACAGT
GGAAAATGGACGGCTACCACCAACAATGACACCGAATCCGCCGGAGACGACGGTGGAGGG
GAAGATCTCGTGGCGATTTCCGGTGACTCCGACGACGATTATGGTGGTGATGAAGAGTCT
AGAAGCTCAACAATTTACTCTAATTTCTCCTTGCTATTTAATTTACTAATGGCATTGTTA
GCCTTATTGTAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc09g008380.3.1

PEP Infomation

Pectate lyase (AHRD V3.3 *** K4CQM6_SOLLC)

Sequence

MFQISYIVVFLILTSFFPLGFGIFLNVTTLPGQHPDPESVALEVNRKVNASLSIFQSRRK
MLSYTQSSCQTGNPIDDCWRCDHSWQLNRQRLADCAIGFGQYALGGKGGRYYVVTSSSDP
DPVDPPPGTLRYGVIQEEPLWIVFSASMEIKLSEELIFNSHKTLDGRGVNVHITGGGCIT
LQYISNVIIHNIHVHHCYESGDTNVRSSPTHFGYRGKSDGDGISIFGSRDIWIDHCSLSN
CKDGLIDVVMGSTGITISNNHFSHHNEVMLLGHNDDYLPDSGMQVTISFNHFGKKLIQRM
PRCRRGYIHVVNNDFTRWEMYAIGGSGNPTINSQGNRYIAPFDPFAKEVTKRVDTDEGKW
RNWNWRSEGDVMANGAYFVASGEEVEIKYEKAYSVEPKSADFIDQITLNAGVLIHRGSNS
GKWTATTNNDTESAGDDGGGEDLVAISGDSDDDYGGDEESRSSTIYSNFSLLFNLLMALL
ALL*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc09g008380.3.1

Transcript Infomation

Pectate lyase (AHRD V3.3 *** K4CQM6_SOLLC)

Sequence

AGAAGTGAATTTTACCCTTCTTTTTTTCCCCAAAATATATATAATAATATAAGAAGTGAA
TTTTACCCTTTTTTCTTCTTCCAATATATATATATATAATAATATAAGAAGTGAATTTTA
CCCTTTTTTCTTCTTCCAAAATATATATAATAATATAAGAATTGAATTTTACCCTTCCAT
GATACCATAAAGTTGTTATTCAAAATTGTCTCCAATTCCTAGAGAGGATGTGACAAGTGT
AATTATTACTATTATTATAACAAAAAAAAAATAATGTTATTAAAGACATAAGTCAGTTAT
ACATGGCCCTCAAATTAGGAATTGAGTGGTCCATTATAATATAAATAATTTTTTTAGTTT
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TTGAGACTATACTTTTTCATCCTTTTTTTATCTTCTAAGTACTCTTTTTATTGGATTGCC
CTTGATGGGGGTGGTAGGAGGAGGGGGGAGTTGATTTTGGGACGTTGAGTTGGGATATTT
TAAACGTTATGAGATGATTTGAATAAAAACGTAATATTACATCATGCTAAGAGTATATTT
AATCTGAACTAGTCCAACGATTAATATCGAGTTGCTAGTTTTTTTTCTTAAAATAATTAT
ATACAGATGACACAGAATGATAAACTAAATACAAAATGTAGTAATATTCAAAGCATCACA
CGTTCACGTAGAACTTTAAAAAATAAATCACACGATAAAAGTAATAAAACATAAACAGTC
TAGCTATCATGACACAAATAGAATCGATGATTCAAACACGTGACGTAAATCATACAAATA
CAAACATAATATAGATAGTCTATCCTAACACAAACATCGTTAATTACTTCCACTCCTCAA
AATAGTAACTTATACATACATCACAAACGAAAATAACTTTATCGTTAATCGAAAAAGAAA
GAAAACCCTCTATTTTCTTTTTCCACTATTAAATCATGAGTGAATCCAGGGTAAGAGATT
CTCTTAAACAATGACACTATAAAATCATGTTAGAAAGTAGTAGAAAAAATACATATAACA
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ATGCAGCTAACTCACTAACCCTAAAAACACACAAAAAAAAAGAAAAAAAACACTCAAATA
TTATTGTAGAAAATATGTTTCAAATAAGCTACATTGTGGTTTTCTTGATTTTAACTTCAT
TTTTTCCTTTAGGTTTTGGGATTTTCTTGAATGTTACTACTCTTCCTGGTCAACATCCTG
ATCCTGAATCTGTTGCTCTTGAAGTTAATAGGAAAGTGAATGCATCACTCTCAATTTTCC
AATCAAGAAGAAAAATGTTGTCCTACACACAATCCTCTTGTCAAACGGGTAACCCTATCG
ATGATTGTTGGCGATGTGACCATAGTTGGCAATTAAATCGCCAAAGACTAGCCGATTGTG
CCATCGGGTTCGGTCAATACGCCCTCGGTGGCAAAGGCGGTCGTTACTACGTGGTCACGT
CATCCTCGGACCCGGACCCCGTGGACCCGCCACCTGGCACTCTCCGATACGGGGTCATCC
AAGAGGAACCGTTGTGGATAGTTTTCTCAGCTAGTATGGAGATTAAACTCTCGGAAGAGC
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GGGGGTGTATAACGTTACAATATATCTCAAACGTTATAATCCACAACATACACGTACATC
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GTTCATTGTCCAATTGTAAAGATGGATTGATTGATGTAGTTATGGGGTCAACGGGGATAA
CAATATCAAATAATCATTTTTCACATCACAATGAGGTAATGTTATTGGGACATAATGATG
ATTATTTGCCAGATTCAGGTATGCAAGTCACAATATCATTTAATCATTTTGGTAAAAAAT
TAATTCAAAGAATGCCAAGGTGTAGAAGAGGATATATTCATGTTGTCAATAATGATTTTA
CAAGATGGGAAATGTATGCAATTGGTGGAAGTGGAAACCCTACAATCAACAGCCAAGGGA
ATAGATATATTGCACCCTTTGACCCTTTTGCTAAAGAGGTAACAAAAAGAGTGGATACTG
ATGAAGGAAAATGGAGAAATTGGAATTGGAGAAGTGAAGGGGATGTAATGGCAAATGGAG
CATACTTTGTGGCCTCTGGTGAAGAAGTTGAAATTAAATATGAAAAAGCTTATAGTGTGG
AGCCAAAATCTGCTGATTTTATTGACCAAATTACTTTAAATGCTGGTGTTCTTATTCACA
GGGGTAGCAACAGTGGAAAATGGACGGCTACCACCAACAATGACACCGAATCCGCCGGAG
ACGACGGTGGAGGGGAAGATCTCGTGGCGATTTCCGGTGACTCCGACGACGATTATGGTG
GTGATGAAGAGTCTAGAAGCTCAACAATTTACTCTAATTTCTCCTTGCTATTTAATTTAC
TAATGGCATTGTTAGCCTTATTGTAGTCTTCAAAAAAAAATTAAAAGACATTTAAAAAAA
AAAAAGGAAAACAAATTGTCCTTTTTTTTGT